Jupyter QtConsole 5.5.2 Current ChimeraX session available as 'session'. Python 3.11.4 (tags/v3.11.4:d2340ef, Jun 7 2023, 05:45:37) [MSC v.1934 64 bit (AMD64)] Type 'copyright', 'credits' or 'license' for more information IPython 8.26.0 -- An enhanced Interactive Python. Type '?' for help. import mrcfile path_to_map = 'C:\Users\luod\Downloads\emd_40589.map' Cell In[2], line 1 path_to_map = 'C:\Users\luod\Downloads\emd_40589.map' ^ SyntaxError: (unicode error) 'unicodeescape' codec can't decode bytes in position 2-3: truncated \UXXXXXXXX escape path_to_map = r'C:\Users\luod\Downloads\emd_40589.map' path_to_map = r'C:\Users\luod\Downloads\emd_40589.map\emd_40589.map' try: with mrcfile.open(path_to_map, mode='r') as mrc: print("Header info:", mrc.header) print("Data shape:", mrc.data.shape) except Exception as e: print("Caught exception:", e) Header info: (400, 400, 400, 2, 0, 0, 0, 400, 400, 400, (334., 334., 334.), (90., 90., 90.), 1, 2, 3, -14.0112505, 21.881187, 0.01375722, 1, 0, b'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00', b'', 0, b'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00', (0., 0., 0.), b'MAP ', [68, 65, 0, 0], 0.38660434, 1, [b'::::EMDATABANK.org::::EMD-40589:::: ', b' ', b' ', b' ', b' ', b' ', b' ', b' ', b' ', b' ']) Data shape: (400, 400, 400) path_to_map = '"C:\Users\luod\Downloads\emd_40589.map\emd_40589.map' Cell In[6], line 1 path_to_map = '"C:\Users\luod\Downloads\emd_40589.map\emd_40589.map' ^ SyntaxError: (unicode error) 'unicodeescape' codec can't decode bytes in position 3-4: truncated \UXXXXXXXX escape path_to_map = '"C:\\Users\\luod\\Downloads\\emd_40589.map\\emd_40589.map' try: with mrcfile.open(path_to_map, mode='r') as mrc: print("Header info:", mrc.header) print("Data shape:", mrc.data.shape) except Exception as e: print("Caught exception:", e) Caught exception: [Errno 22] Invalid argument: '"C:\\Users\\luod\\Downloads\\emd_40589.map\\emd_40589.map' path_to_map = '"C:\\Users\\luod\\Downloads\\emd_40589.map\\emd_40589.map"' try: with mrcfile.open(path_to_map, mode='r') as mrc: print("Header info:", mrc.header) print("Data shape:", mrc.data.shape) except Exception as e: print("Caught exception:", e) Caught exception: [Errno 22] Invalid argument: '"C:\\Users\\luod\\Downloads\\emd_40589.map\\emd_40589.map"' path_to_map = "C:\\Users\\luod\\Downloads\\emd_40589.map\\emd_40589.map" try: with mrcfile.open(path_to_map, mode='r') as mrc: print("Header info:", mrc.header) print("Data shape:", mrc.data.shape) except Exception as e: print("Caught exception:", e) Header info: (400, 400, 400, 2, 0, 0, 0, 400, 400, 400, (334., 334., 334.), (90., 90., 90.), 1, 2, 3, -14.0112505, 21.881187, 0.01375722, 1, 0, b'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00', b'', 0, b'\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00', (0., 0., 0.), b'MAP ', [68, 65, 0, 0], 0.38660434, 1, [b'::::EMDATABANK.org::::EMD-40589:::: ', b' ', b' ', b' ', b' ', b' ', b' ', b' ', b' ', b' ']) Data shape: (400, 400, 400)