Changes between Initial Version and Version 1 of Ticket #14685


Ignore:
Timestamp:
Mar 1, 2024, 11:29:43 AM (21 months ago)
Author:
Eric Pettersen
Comment:

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified

  • Ticket #14685

    • Property Cc Tom Goddard added
    • Property Component Unassigned → Core
    • Property Owner set to Eric Pettersen
    • Property Platform → all
    • Property Project → ChimeraX
    • Property Status new → accepted
    • Property Summary ChimeraX bug report submission → Crash in garbage collection

  • Ticket #14685 – Description

    initial v1  
    852852    "name" : "QtNetwork.abi3.so"
    853853  },
    854   {
    855     "source" : "P",
    856     "arch" : "x86_64",
    857     "base" : 4502888448,
    858     "size" : 32768,
    859     "uuid" : "4125538e-4145-3504-8c4c-eecafa43ae17",
    860     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/QtWebChannel.abi3.so",
    861     "name" : "QtWebChannel.abi3.so"
    862   },
    863   {
    864     "source" : "P",
    865     "arch" : "x86_64",
    866     "base" : 4567584768,
    867     "size" : 65536,
    868     "uuid" : "31527197-e015-3323-9b1e-d89a57f4122b",
    869     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/QtWebEngineWidgets.abi3.so",
    870     "name" : "QtWebEngineWidgets.abi3.so"
    871   },
    872   {
    873     "source" : "P",
    874     "arch" : "x86_64",
    875     "base" : 4976803840,
    876     "size" : 81920,
    877     "uuid" : "be9b28e7-5ac2-3b5d-9c1e-9cb326210166",
    878     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtWebEngineWidgets.framework\/Versions\/A\/QtWebEngineWidgets",
    879     "name" : "QtWebEngineWidgets"
    880   },
    881   {
    882     "source" : "P",
    883     "arch" : "x86_64",
    884     "base" : 4977143808,
    885     "size" : 311296,
    886     "uuid" : "4a13ff65-e0b7-341f-ac9d-bb5df92cb106",
    887     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtPrintSupport.framework\/Versions\/A\/QtPrintSupport",
    888     "name" : "QtPrintSupport"
    889   },
    890   {
    891     "source" : "P",
    892     "arch" : "x86_64",
    893     "base" : 5278306304,
    894     "size" : 165052416,
    895     "uuid" : "4aa1de3e-464c-340c-ab61-bcd39bfc7658",
    896     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtWebEngineCore.framework\/Versions\/A\/QtWebEngineCore",
    897     "name" : "QtWebEngineCore"
    898   },
    899   {
    900     "source" : "P",
    901     "arch" : "x86_64",
    902     "base" : 5103341568,
    903     "size" : 4079616,
    904     "uuid" : "e586fcd9-f4b6-3610-a075-167f962121c5",
    905     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtQuick.framework\/Versions\/A\/QtQuick",
    906     "name" : "QtQuick"
    907   },
    908   {
    909     "source" : "P",
    910     "arch" : "x86_64",
    911     "base" : 4978814976,
    912     "size" : 425984,
    913     "uuid" : "3081c960-3da0-328b-8a70-a5cc2464636c",
    914     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtOpenGL.framework\/Versions\/A\/QtOpenGL",
    915     "name" : "QtOpenGL"
    916   },
    917   {
    918     "source" : "P",
    919     "arch" : "x86_64",
    920     "base" : 5035012096,
    921     "size" : 557056,
    922     "uuid" : "b83cee7d-31bd-3264-99ce-afa3bf6692c5",
    923     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtQmlModels.framework\/Versions\/A\/QtQmlModels",
    924     "name" : "QtQmlModels"
    925   },
    926   {
    927     "source" : "P",
    928     "arch" : "x86_64",
    929     "base" : 5034270720,
    930     "size" : 212992,
    931     "uuid" : "795a00a0-138d-33c2-b582-5fd530b0c678",
    932     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtWebChannel.framework\/Versions\/A\/QtWebChannel",
    933     "name" : "QtWebChannel"
    934   },
    935   {
    936     "source" : "P",
    937     "arch" : "x86_64",
    938     "base" : 5116514304,
    939     "size" : 4079616,
    940     "uuid" : "b140050b-a3f5-340b-a110-d1c01906c469",
    941     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtQml.framework\/Versions\/A\/QtQml",
    942     "name" : "QtQml"
    943   },
    944   {
    945     "source" : "P",
    946     "arch" : "x86_64",
    947     "base" : 5038379008,
    948     "size" : 1261568,
    949     "uuid" : "f402edbd-ac12-3e53-a2f4-e1d6932ab755",
    950     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtNetwork.framework\/Versions\/A\/QtNetwork",
    951     "name" : "QtNetwork"
    952   },
    953   {
    954     "source" : "P",
    955     "arch" : "x86_64",
    956     "base" : 5042049024,
    957     "size" : 491520,
    958     "uuid" : "92f7a6de-79af-3b2f-8548-97e6556c3d1a",
    959     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtPositioning.framework\/Versions\/A\/QtPositioning",
    960     "name" : "QtPositioning"
    961   },
    962   {
    963     "source" : "P",
    964     "arch" : "x86_64",
    965     "base" : 4503060480,
    966     "size" : 81920,
    967     "uuid" : "5b40aee8-76af-3deb-9c1b-90894adda30a",
    968     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtQuickWidgets.framework\/Versions\/A\/QtQuickWidgets",
    969     "name" : "QtQuickWidgets"
    970   },
    971   {
    972     "source" : "P",
    973     "arch" : "x86_64",
    974     "base" : 5096218624,
    975     "size" : 1474560,
    976     "uuid" : "86bbe80d-1a98-3bdb-b3c7-eee8ee9c9f07",
    977     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/QtGui.abi3.so",
    978     "name" : "QtGui.abi3.so"
    979   },
    980   {
    981     "source" : "P",
    982     "arch" : "x86_64",
    983     "base" : 5047238656,
    984     "size" : 2801664,
    985     "uuid" : "babd94e3-ec19-3110-ab5b-11c39432d8c5",
    986     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/QtWidgets.abi3.so",
    987     "name" : "QtWidgets.abi3.so"
    988   },
    989   {
    990     "source" : "P",
    991     "arch" : "x86_64",
    992     "base" : 5061074944,
    993     "size" : 4964352,
    994     "uuid" : "f36760e5-d1e7-3a93-ae8c-1c3e55e3fc35",
    995     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtWidgets.framework\/Versions\/A\/QtWidgets",
    996     "name" : "QtWidgets"
    997   },
    998   {
    999     "source" : "P",
    1000     "arch" : "x86_64",
    1001     "base" : 5076353024,
    1002     "size" : 6979584,
    1003     "uuid" : "49d915f7-1c6d-3bbd-b96f-064260e7d998",
    1004     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtGui.framework\/Versions\/A\/QtGui",
    1005     "name" : "QtGui"
    1006   },
    1007   {
    1008     "source" : "P",
    1009     "arch" : "x86_64",
    1010     "base" : 4972924928,
    1011     "size" : 573440,
    1012     "uuid" : "b80d4b57-c2b5-329a-8f0b-fa6745f22ad0",
    1013     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtDBus.framework\/Versions\/A\/QtDBus",
    1014     "name" : "QtDBus"
    1015   },
    1016   {
    1017     "source" : "P",
    1018     "arch" : "x86_64",
    1019     "base" : 4507414528,
    1020     "size" : 98304,
    1021     "uuid" : "17a32d1b-857d-3264-9bf6-9192cca7beb2",
    1022     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/sip.cpython-311-darwin.so",
    1023     "name" : "sip.cpython-311-darwin.so"
    1024   },
    1025   {
    1026     "source" : "P",
    1027     "arch" : "x86_64",
    1028     "base" : 4980461568,
    1029     "size" : 1589248,
    1030     "uuid" : "2be8100b-aa99-3117-95ff-0200ddc4032f",
    1031     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/QtCore.abi3.so",
    1032     "name" : "QtCore.abi3.so"
    1033   },
    1034   {
    1035     "source" : "P",
    1036     "arch" : "x86_64",
    1037     "base" : 4988215296,
    1038     "size" : 5259264,
    1039     "uuid" : "35b47b1c-6952-3d39-a5e7-711f3ca228f2",
    1040     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/PyQt6\/Qt6\/lib\/QtCore.framework\/Versions\/A\/QtCore",
    1041     "name" : "QtCore"
    1042   },
    1043   {
    1044     "source" : "P",
    1045     "arch" : "x86_64",
    1046     "base" : 4502392832,
    1047     "size" : 147456,
    1048     "uuid" : "2c719e3d-a419-3692-a578-2819f3d838f6",
    1049     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/chimerax\/geometry\/_geometry.cpython-311-darwin.so",
    1050     "name" : "_geometry.cpython-311-darwin.so"
    1051   },
    1052   {
    1053     "source" : "P",
    1054     "arch" : "x86_64",
    1055     "base" : 4458225664,
    1056     "size" : 16384,
    1057     "uuid" : "f68fca4b-5b9f-3986-91bf-f334ea86eead",
    1058     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_opcode.cpython-311-darwin.so",
    1059     "name" : "_opcode.cpython-311-darwin.so"
    1060   },
    1061   {
    1062     "source" : "P",
    1063     "arch" : "x86_64",
    1064     "base" : 4503396352,
    1065     "size" : 589824,
    1066     "uuid" : "c0f2136b-dde6-3728-92f0-57d0f47098f1",
    1067     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/random\/_generator.cpython-311-darwin.so",
    1068     "name" : "_generator.cpython-311-darwin.so"
    1069   },
    1070   {
    1071     "source" : "P",
    1072     "arch" : "x86_64",
    1073     "base" : 4486438912,
    1074     "size" : 32768,
    1075     "uuid" : "c5fdf54a-82e5-35a0-a1f6-b53c802ba054",
    1076     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/random\/_sfc64.cpython-311-darwin.so",
    1077     "name" : "_sfc64.cpython-311-darwin.so"
    1078   },
    1079   {
    1080     "source" : "P",
    1081     "arch" : "x86_64",
    1082     "base" : 4486144000,
    1083     "size" : 65536,
    1084     "uuid" : "aa144ed2-2766-3453-8242-ba1c7a85b8be",
    1085     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/random\/_pcg64.cpython-311-darwin.so",
    1086     "name" : "_pcg64.cpython-311-darwin.so"
    1087   },
    1088   {
    1089     "source" : "P",
    1090     "arch" : "x86_64",
    1091     "base" : 4482351104,
    1092     "size" : 49152,
    1093     "uuid" : "295d00ff-9980-30db-b256-d03255300066",
    1094     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/random\/_philox.cpython-311-darwin.so",
    1095     "name" : "_philox.cpython-311-darwin.so"
    1096   },
    1097   {
    1098     "source" : "P",
    1099     "arch" : "x86_64",
    1100     "base" : 4485869568,
    1101     "size" : 65536,
    1102     "uuid" : "ef897ac7-3b50-30b3-90dd-67ed8d383413",
    1103     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/random\/_mt19937.cpython-311-darwin.so",
    1104     "name" : "_mt19937.cpython-311-darwin.so"
    1105   },
    1106   {
    1107     "source" : "P",
    1108     "arch" : "x86_64",
    1109     "base" : 4501143552,
    1110     "size" : 344064,
    1111     "uuid" : "28fb5ca7-d743-37b2-ada0-3e2f189421cc",
    1112     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/random\/_bounded_integers.cpython-311-darwin.so",
    1113     "name" : "_bounded_integers.cpython-311-darwin.so"
    1114   },
    1115   {
    1116     "source" : "P",
    1117     "arch" : "x86_64",
    1118     "base" : 4465618944,
    1119     "size" : 32768,
    1120     "uuid" : "350317ec-40ef-3786-8235-1f4a252e2bdf",
    1121     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_blake2.cpython-311-darwin.so",
    1122     "name" : "_blake2.cpython-311-darwin.so"
    1123   },
    1124   {
    1125     "source" : "P",
    1126     "arch" : "x86_64",
    1127     "base" : 4484796416,
    1128     "size" : 32768,
    1129     "uuid" : "a5bc2ee2-086d-3ee9-8f96-3f9a55d29897",
    1130     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_hashlib.cpython-311-darwin.so",
    1131     "name" : "_hashlib.cpython-311-darwin.so"
    1132   },
    1133   {
    1134     "source" : "P",
    1135     "arch" : "x86_64",
    1136     "base" : 4554989568,
    1137     "size" : 2260992,
    1138     "uuid" : "8365300e-480c-3c4d-9ca6-539638c6704e",
    1139     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/libcrypto.1.1.dylib",
    1140     "name" : "libcrypto.1.1.dylib"
    1141   },
    1142   {
    1143     "source" : "P",
    1144     "arch" : "x86_64",
    1145     "base" : 4485115904,
    1146     "size" : 196608,
    1147     "uuid" : "af2bead6-eea9-3b15-bc85-d48eae168228",
    1148     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/random\/_common.cpython-311-darwin.so",
    1149     "name" : "_common.cpython-311-darwin.so"
    1150   },
    1151   {
    1152     "source" : "P",
    1153     "arch" : "x86_64",
    1154     "base" : 4482625536,
    1155     "size" : 131072,
    1156     "uuid" : "6edf4fc8-aedc-3490-8d35-cea9228e02b1",
    1157     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/random\/bit_generator.cpython-311-darwin.so",
    1158     "name" : "bit_generator.cpython-311-darwin.so"
    1159   },
    1160   {
    1161     "source" : "P",
    1162     "arch" : "x86_64",
    1163     "base" : 4483211264,
    1164     "size" : 475136,
    1165     "uuid" : "540847df-9827-358d-99cf-88c3e8d2b851",
    1166     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/random\/mtrand.cpython-311-darwin.so",
    1167     "name" : "mtrand.cpython-311-darwin.so"
    1168   },
    1169   {
    1170     "source" : "P",
    1171     "arch" : "x86_64",
    1172     "base" : 4458352640,
    1173     "size" : 81920,
    1174     "uuid" : "98efd1f3-eca0-387f-bcde-bddf9588e58b",
    1175     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/fft\/_pocketfft_internal.cpython-311-darwin.so",
    1176     "name" : "_pocketfft_internal.cpython-311-darwin.so"
    1177   },
    1178   {
    1179     "source" : "P",
    1180     "arch" : "x86_64",
    1181     "base" : 4480823296,
    1182     "size" : 131072,
    1183     "uuid" : "b1cb953c-267f-3883-a539-bdcd0ec454a9",
    1184     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/linalg\/_umath_linalg.cpython-311-darwin.so",
    1185     "name" : "_umath_linalg.cpython-311-darwin.so"
    1186   },
    1187   {
    1188     "source" : "P",
    1189     "arch" : "x86_64",
    1190     "base" : 4465250304,
    1191     "size" : 81920,
    1192     "uuid" : "14c5a954-5a10-341d-930e-646b8183499c",
    1193     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_ctypes.cpython-311-darwin.so",
    1194     "name" : "_ctypes.cpython-311-darwin.so"
    1195   },
    1196   {
    1197     "source" : "P",
    1198     "arch" : "x86_64",
    1199     "base" : 4463824896,
    1200     "size" : 81920,
    1201     "uuid" : "639e25c9-cea2-3d74-b5c2-849e946bcc2a",
    1202     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/core\/_multiarray_tests.cpython-311-darwin.so",
    1203     "name" : "_multiarray_tests.cpython-311-darwin.so"
    1204   },
    1205   {
    1206     "source" : "P",
    1207     "arch" : "x86_64",
    1208     "base" : 4455329792,
    1209     "size" : 16384,
    1210     "uuid" : "b62770cf-9a42-3e1b-8e2d-bc816ac0e837",
    1211     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_contextvars.cpython-311-darwin.so",
    1212     "name" : "_contextvars.cpython-311-darwin.so"
    1213   },
    1214   {
    1215     "source" : "P",
    1216     "arch" : "x86_64",
    1217     "base" : 4462387200,
    1218     "size" : 114688,
    1219     "uuid" : "6078491a-679a-38fb-99f9-93212e36864a",
    1220     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_pickle.cpython-311-darwin.so",
    1221     "name" : "_pickle.cpython-311-darwin.so"
    1222   },
    1223   {
    1224     "source" : "P",
    1225     "arch" : "x86_64",
    1226     "base" : 4487163904,
    1227     "size" : 4931584,
    1228     "uuid" : "2b00c859-0a9f-3caf-b744-6c2225d80f2b",
    1229     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/core\/_multiarray_umath.cpython-311-darwin.so",
    1230     "name" : "_multiarray_umath.cpython-311-darwin.so"
    1231   },
    1232   {
    1233     "source" : "P",
    1234     "arch" : "x86_64",
    1235     "base" : 4568059904,
    1236     "size" : 64094208,
    1237     "uuid" : "9d768904-ac4b-327d-8126-cec11a08b966",
    1238     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/.dylibs\/libopenblas64_.0.dylib",
    1239     "name" : "libopenblas64_.0.dylib"
    1240   },
    1241   {
    1242     "source" : "P",
    1243     "arch" : "x86_64",
    1244     "base" : 4507934720,
    1245     "size" : 6565888,
    1246     "uuid" : "ae37c55e-f850-3cf7-86e4-bbd86809bc1d",
    1247     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/.dylibs\/libgfortran.5.dylib",
    1248     "name" : "libgfortran.5.dylib"
    1249   },
    1250   {
    1251     "source" : "P",
    1252     "arch" : "x86_64",
    1253     "base" : 4461633536,
    1254     "size" : 319488,
    1255     "uuid" : "a1783d23-d187-3d92-ade7-2a80619e7485",
    1256     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/.dylibs\/libquadmath.0.dylib",
    1257     "name" : "libquadmath.0.dylib"
    1258   },
    1259   {
    1260     "source" : "P",
    1261     "arch" : "x86_64",
    1262     "base" : 4457955328,
    1263     "size" : 69632,
    1264     "uuid" : "6d59656e-a224-3642-80b9-ca07ca06e7c1",
    1265     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/numpy\/.dylibs\/libgcc_s.1.1.dylib",
    1266     "name" : "libgcc_s.1.1.dylib"
    1267   },
    1268   {
    1269     "source" : "P",
    1270     "arch" : "x86_64",
    1271     "base" : 4456751104,
    1272     "size" : 32768,
    1273     "uuid" : "c77a08cd-9e75-30d9-84cc-a69845c1c3ec",
    1274     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_json.cpython-311-darwin.so",
    1275     "name" : "_json.cpython-311-darwin.so"
    1276   },
    1277   {
    1278     "source" : "P",
    1279     "arch" : "x86_64",
    1280     "base" : 4456652800,
    1281     "size" : 16384,
    1282     "uuid" : "968f7d44-5fa3-31d9-8b22-92eb2206cc84",
    1283     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/chimerax\/arrays\/_arrays.cpython-311-darwin.so",
    1284     "name" : "_arrays.cpython-311-darwin.so"
    1285   },
    1286   {
    1287     "source" : "P",
    1288     "arch" : "x86_64",
    1289     "base" : 4458741760,
    1290     "size" : 1130496,
    1291     "uuid" : "248383d9-36c6-3353-bbce-8dcc6b4ce8f7",
    1292     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/site-packages\/chimerax\/arrays\/lib\/libarrays.dylib",
    1293     "name" : "libarrays.dylib"
    1294   },
    1295   {
    1296     "source" : "P",
    1297     "arch" : "x86_64",
    1298     "base" : 4455464960,
    1299     "size" : 32768,
    1300     "uuid" : "fab56287-4c23-300d-9887-cd45a5f7d3a7",
    1301     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/select.cpython-311-darwin.so",
    1302     "name" : "select.cpython-311-darwin.so"
    1303   },
    1304   {
    1305     "source" : "P",
    1306     "arch" : "x86_64",
    1307     "base" : 4455010304,
    1308     "size" : 16384,
    1309     "uuid" : "463cc059-41c7-330e-b20b-05cb0fdcad11",
    1310     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_posixsubprocess.cpython-311-darwin.so",
    1311     "name" : "_posixsubprocess.cpython-311-darwin.so"
    1312   },
    1313   {
    1314     "source" : "P",
    1315     "arch" : "x86_64",
    1316     "base" : 4455165952,
    1317     "size" : 16384,
    1318     "uuid" : "57e65ad6-c0ea-38d8-a056-41ad88aa2610",
    1319     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/fcntl.cpython-311-darwin.so",
    1320     "name" : "fcntl.cpython-311-darwin.so"
    1321   },
    1322   {
    1323     "source" : "P",
    1324     "arch" : "x86_64",
    1325     "base" : 4453027840,
    1326     "size" : 32768,
    1327     "uuid" : "3cd6c3fb-9fe0-3b14-a169-570d6d72caba",
    1328     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_struct.cpython-311-darwin.so",
    1329     "name" : "_struct.cpython-311-darwin.so"
    1330   },
    1331   {
    1332     "source" : "P",
    1333     "arch" : "x86_64",
    1334     "base" : 4453220352,
    1335     "size" : 32768,
    1336     "uuid" : "e99b9ab9-9e03-3a38-ad6e-92f4c11a0ccd",
    1337     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/binascii.cpython-311-darwin.so",
    1338     "name" : "binascii.cpython-311-darwin.so"
    1339   },
    1340   {
    1341     "source" : "P",
    1342     "arch" : "x86_64",
    1343     "base" : 4448247808,
    1344     "size" : 32768,
    1345     "uuid" : "4857358d-b2e1-3822-aebb-06a8878b427d",
    1346     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_sha512.cpython-311-darwin.so",
    1347     "name" : "_sha512.cpython-311-darwin.so"
    1348   },
    1349   {
    1350     "source" : "P",
    1351     "arch" : "x86_64",
    1352     "base" : 4452917248,
    1353     "size" : 16384,
    1354     "uuid" : "e0374123-b7f9-38e5-b11f-58349af543a6",
    1355     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_random.cpython-311-darwin.so",
    1356     "name" : "_random.cpython-311-darwin.so"
    1357   },
    1358   {
    1359     "source" : "P",
    1360     "arch" : "x86_64",
    1361     "base" : 4452814848,
    1362     "size" : 16384,
    1363     "uuid" : "f286872f-bf81-34a6-87be-7d1797853da1",
    1364     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_bisect.cpython-311-darwin.so",
    1365     "name" : "_bisect.cpython-311-darwin.so"
    1366   },
    1367   {
    1368     "source" : "P",
    1369     "arch" : "x86_64",
    1370     "base" : 4453392384,
    1371     "size" : 196608,
    1372     "uuid" : "c1616b8c-e517-3843-9946-07100812a3fa",
    1373     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_lzma.cpython-311-darwin.so",
    1374     "name" : "_lzma.cpython-311-darwin.so"
    1375   },
    1376   {
    1377     "source" : "P",
    1378     "arch" : "x86_64",
    1379     "base" : 4450017280,
    1380     "size" : 16384,
    1381     "uuid" : "5264b516-4f77-3211-bbb5-8720cd62f60a",
    1382     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_bz2.cpython-311-darwin.so",
    1383     "name" : "_bz2.cpython-311-darwin.so"
    1384   },
    1385   {
    1386     "source" : "P",
    1387     "arch" : "x86_64",
    1388     "base" : 4449853440,
    1389     "size" : 32768,
    1390     "uuid" : "2e40ac09-b4c6-3504-a3e2-a3913e730146",
    1391     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/zlib.cpython-311-darwin.so",
    1392     "name" : "zlib.cpython-311-darwin.so"
    1393   },
    1394   {
    1395     "source" : "P",
    1396     "arch" : "x86_64",
    1397     "base" : 4449755136,
    1398     "size" : 16384,
    1399     "uuid" : "aacd4a54-a0d7-3ca3-946c-75e1b46b8800",
    1400     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_typing.cpython-311-darwin.so",
    1401     "name" : "_typing.cpython-311-darwin.so"
    1402   },
    1403   {
    1404     "source" : "P",
    1405     "arch" : "x86_64",
    1406     "base" : 4451471360,
    1407     "size" : 65536,
    1408     "uuid" : "bce0a7e8-5fe0-3b22-a86a-efce56d39c06",
    1409     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/_datetime.cpython-311-darwin.so",
    1410     "name" : "_datetime.cpython-311-darwin.so"
    1411   },
    1412   {
    1413     "source" : "P",
    1414     "arch" : "x86_64",
    1415     "base" : 4448493568,
    1416     "size" : 49152,
    1417     "uuid" : "e72184af-f88a-3d22-985d-ba7ae840d7bb",
    1418     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/lib\/python3.11\/lib-dynload\/math.cpython-311-darwin.so",
    1419     "name" : "math.cpython-311-darwin.so"
    1420   },
    1421   {
    1422     "source" : "P",
    1423     "arch" : "x86_64",
    1424     "base" : 4465774592,
    1425     "CFBundleShortVersionString" : "3.11.2, (c) 2001-2023 Python Software Foundation.",
    1426     "CFBundleIdentifier" : "org.python.python",
    1427     "size" : 4079616,
    1428     "uuid" : "24670b23-d78a-3eaa-bca8-22faf877f190",
    1429     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/Library\/Frameworks\/Python.framework\/Versions\/3.11\/Python",
    1430     "name" : "Python",
    1431     "CFBundleVersion" : "3.11.2"
    1432   },
    1433   {
    1434     "source" : "P",
    1435     "arch" : "arm64",
    1436     "base" : 140703127601152,
    1437     "size" : 196608,
    1438     "uuid" : "3ba12577-21cf-3270-ac4e-4a558236468e",
    1439     "path" : "\/usr\/libexec\/rosetta\/runtime",
    1440     "name" : "runtime"
    1441   },
    1442   {
    1443     "source" : "P",
    1444     "arch" : "arm64",
    1445     "base" : 4440842240,
    1446     "size" : 344064,
    1447     "uuid" : "79539977-1142-3b0b-9ecc-fac485d91d33",
    1448     "path" : "\/Library\/Apple\/*\/libRosettaRuntime",
    1449     "name" : "libRosettaRuntime"
    1450   },
    1451   {
    1452     "source" : "P",
    1453     "arch" : "x86_64",
    1454     "base" : 4306485248,
    1455     "CFBundleShortVersionString" : "1.7.1",
    1456     "CFBundleIdentifier" : "edu.ucsf.cgl.ChimeraX",
    1457     "size" : 16384,
    1458     "uuid" : "194a3167-3db5-3029-8d22-1d742b826bb9",
    1459     "path" : "\/Applications\/ChimeraX-1.7.1.app\/Contents\/MacOS\/ChimeraX",
    1460     "name" : "ChimeraX",
    1461     "CFBundleVersion" : "1.7.1.0"
    1462   },
    1463   {
    1464     "size" : 0,
    1465     "source" : "A",
    1466     "base" : 0,
    1467     "uuid" : "00000000-0000-0000-0000-000000000000"
    1468   },
    1469   {
    1470     "source" : "P",
    1471     "arch" : "x86_64",
    1472     "base" : 140703268298752,
    1473     "size" : 241656,
    1474     "uuid" : "3e22fb41-20e3-3568-a00b-d8e901e333bf",
    1475     "path" : "\/usr\/lib\/system\/libsystem_kernel.dylib",
    1476     "name" : "libsystem_kernel.dylib"
    1477   },
    1478   {
    1479     "source" : "P",
    1480     "arch" : "x86_64",
    1481     "base" : 140703268540416,
    1482     "size" : 49152,
    1483     "uuid" : "0f6c8ecc-a9bd-39c6-9f41-a8b9159201eb",
    1484     "path" : "\/usr\/lib\/system\/libsystem_pthread.dylib",
    1485     "name" : "libsystem_pthread.dylib"
    1486   },
    1487   {
    1488     "source" : "P",
    1489     "arch" : "x86_64",
    1490     "base" : 140703267119104,
    1491     "size" : 557056,
    1492     "uuid" : "6f840a77-9f88-3da8-83ac-98e4892282d0",
    1493     "path" : "\/usr\/lib\/system\/libsystem_c.dylib",
    1494     "name" : "libsystem_c.dylib"
    1495   },
    1496   {
    1497     "source" : "P",
    1498     "arch" : "x86_64",
    1499     "base" : 140703268741120,
    1500     "size" : 40960,
    1501     "uuid" : "20d7a65a-313d-3aa7-b0d4-a39261e1b00a",
    1502     "path" : "\/usr\/lib\/system\/libsystem_platform.dylib",
    1503     "name" : "libsystem_platform.dylib"
    1504   },
    1505   {
    1506     "source" : "P",
    1507     "arch" : "x86_64",
    1508     "base" : 140703325245440,
    1509     "CFBundleShortVersionString" : "6.9",
    1510     "CFBundleIdentifier" : "com.apple.AppKit",
    1511     "size" : 21098487,
    1512     "uuid" : "660b78d6-113f-3abd-8969-a6cb84fff752",
    1513     "path" : "\/System\/Library\/Frameworks\/AppKit.framework\/Versions\/C\/AppKit",
    1514     "name" : "AppKit",
    1515     "CFBundleVersion" : "2487.40.107"
    1516   },
    1517   {
    1518     "source" : "P",
    1519     "arch" : "x86_64",
    1520     "base" : 140703373795328,
    1521     "CFBundleShortVersionString" : "1.22",
    1522     "CFBundleIdentifier" : "com.apple.HIServices",
    1523     "size" : 376825,
    1524     "uuid" : "07a2f3d1-7698-32ec-a5cb-a03d12d4e325",
    1525     "path" : "\/System\/Library\/Frameworks\/ApplicationServices.framework\/Versions\/A\/Frameworks\/HIServices.framework\/Versions\/A\/HIServices",
    1526     "name" : "HIServices"
    1527   },
    1528   {
    1529     "source" : "P",
    1530     "arch" : "x86_64",
    1531     "base" : 140703268958208,
    1532     "CFBundleShortVersionString" : "6.9",
    1533     "CFBundleIdentifier" : "com.apple.CoreFoundation",
    1534     "size" : 4825085,
    1535     "uuid" : "c1543df7-9f35-3262-b971-4326095ab776",
    1536     "path" : "\/System\/Library\/Frameworks\/CoreFoundation.framework\/Versions\/A\/CoreFoundation",
    1537     "name" : "CoreFoundation",
    1538     "CFBundleVersion" : "2303"
    1539   },
    1540   {
    1541     "source" : "P",
    1542     "arch" : "x86_64",
    1543     "base" : 140703451418624,
    1544     "CFBundleShortVersionString" : "2.1.1",
    1545     "CFBundleIdentifier" : "com.apple.HIToolbox",
    1546     "size" : 2736117,
    1547     "uuid" : "4cd47f03-ed80-3f2a-bbdf-d7af11cb4ccb",
    1548     "path" : "\/System\/Library\/Frameworks\/Carbon.framework\/Versions\/A\/Frameworks\/HIToolbox.framework\/Versions\/A\/HIToolbox",
    1549     "name" : "HIToolbox"
    1550   },
    1551   {
    1552     "source" : "P",
    1553     "arch" : "x86_64",
    1554     "base" : 140703284797440,
    1555     "CFBundleShortVersionString" : "6.9",
    1556     "CFBundleIdentifier" : "com.apple.Foundation",
    1557     "size" : 12812276,
    1558     "uuid" : "6589cc92-b39e-392c-808b-b20538f9312f",
    1559     "path" : "\/System\/Library\/Frameworks\/Foundation.framework\/Versions\/C\/Foundation",
    1560     "name" : "Foundation",
    1561     "CFBundleVersion" : "2303"
    1562   }
    1563 ],
    1564   "sharedCache" : {
    1565   "base" : 140703264129024,
    1566   "size" : 21474836480,
    1567   "uuid" : "7fa563c2-7726-366b-b2f5-1c64013c6b55"
    1568 },
    1569   "legacyInfo" : {
    1570   "threadTriggered" : {
    1571     "name" : "CrBrowserMain",
    1572     "queue" : "com.apple.main-thread"
    1573   }
    1574 },
    1575   "logWritingSignature" : "d07b4cbc81752b5707f4c0c668c6a7f460f72934",
    1576   "trialInfo" : {
    1577   "rollouts" : [
    1578     {
    1579       "rolloutId" : "6434420a89ec2e0a7a38bf5a",
    1580       "factorPackIds" : {
    1581 
    1582       },
    1583       "deploymentId" : 240000011
    1584     },
    1585     {
    1586       "rolloutId" : "64b21a7351cbb02ce3442e4e",
    1587       "factorPackIds" : {
    1588         "REMINDERS_GROCERY" : "65542c604a6560536bdb1d22"
    1589       },
    1590       "deploymentId" : 240000032
    1591     }
    1592   ],
    1593   "experiments" : [
    1594 
    1595   ]
    1596 },
    1597   "reportNotes" : [
    1598   "PC register does not match crashing frame (0x0 vs 0x7FF898AEEA78)"
    1599 ]
    1600 }
    1601 ===== Log before crash start =====
    1602 Startup Messages 
    1603 --- 
    1604 warning | Replacing fetcher for 'pdb_nmr' and format NMRSTAR from NMRSTAR
    1605 bundle with that from NMRSTAR bundle 
    1606  
    1607 UCSF ChimeraX version: 1.7.1 (2024-01-23) 
    1608 © 2016-2023 Regents of the University of California. All rights reserved. 
    1609 How to cite UCSF ChimeraX 
    1610 
    1611 > open "/Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1612 > JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1613 > NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_1.pdb"
    1614 
    1615 Summary of feedback from opening
    1616 /Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1617 JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1618 NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_1.pdb 
    1619 --- 
    1620 warnings | Ignored bad PDB record found on line 4457 
    1621 # All scores below are weighted scores, not raw scores. 
    1622  
    1623 Ignored bad PDB record found on line 4458 
    1624 #BEGIN_POSE_ENERGIES_TABLE 65de3735983d8_P3_0032.pdb 
    1625  
    1626 Ignored bad PDB record found on line 4459 
    1627 label fa_atr fa_rep fa_sol fa_intra_rep pro_close fa_pair hbond_sr_bb
    1628 hbond_lr_bb hbond_bb_sc hbond_sc dslf_ss_dst dslf_cs_ang dslf_ss_dih
    1629 dslf_ca_dih rama omega fa_dun p_aa_pp ref total 
    1630  
    1631 Ignored bad PDB record found on line 4460 
    1632 weights 0.8 0.44 0.65 0.004 1 0.49 0.585 1.17 1.17 1.1 1 1 1 1 0.2 0.5 0.56
    1633 0.32 1 NA 
    1634  
    1635 Ignored bad PDB record found on line 4461 
    1636 pose -1056.71 98.64 536.028 2.12151 0.768886 -23.8749 -55.3316 -125.482
    1637 -34.1537 -29.87 -7.18622 0.471925 0.582952 0.100131 -13.6407 62.184 195.328
    1638 -26.1985 -60.94 -537.166 
    1639  
    1640 302 messages similar to the above omitted 
    1641  
    1642 Chain information for A11_APL1_1.pdb #1 
    1643 --- 
    1644 Chain | Description 
    1645 A | No description available 
    1646 B | No description available 
    1647  
    1648 
    1649 > open "/Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1650 > JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1651 > NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_2.pdb"
    1652 
    1653 Summary of feedback from opening
    1654 /Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1655 JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1656 NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_2.pdb 
    1657 --- 
    1658 warnings | Ignored bad PDB record found on line 4457 
    1659 # All scores below are weighted scores, not raw scores. 
    1660  
    1661 Ignored bad PDB record found on line 4458 
    1662 #BEGIN_POSE_ENERGIES_TABLE 65de3735983d8_P4_0037.pdb 
    1663  
    1664 Ignored bad PDB record found on line 4459 
    1665 label fa_atr fa_rep fa_sol fa_intra_rep pro_close fa_pair hbond_sr_bb
    1666 hbond_lr_bb hbond_bb_sc hbond_sc dslf_ss_dst dslf_cs_ang dslf_ss_dih
    1667 dslf_ca_dih rama omega fa_dun p_aa_pp ref total 
    1668  
    1669 Ignored bad PDB record found on line 4460 
    1670 weights 0.8 0.44 0.65 0.004 1 0.49 0.585 1.17 1.17 1.1 1 1 1 1 0.2 0.5 0.56
    1671 0.32 1 NA 
    1672  
    1673 Ignored bad PDB record found on line 4461 
    1674 pose -1056.84 102.292 532.643 2.12408 0.767531 -24.0984 -55.3316 -125.482
    1675 -31.6138 -28.7656 -7.16882 0.463969 0.562563 0.100104 -13.85 62.4658 195.315
    1676 -25.9759 -60.94 -533.328 
    1677  
    1678 302 messages similar to the above omitted 
    1679  
    1680 Chain information for A11_APL1_2.pdb #2 
    1681 --- 
    1682 Chain | Description 
    1683 A | No description available 
    1684 B | No description available 
    1685  
    1686 
    1687 > open "/Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1688 > JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1689 > NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_3.pdb"
    1690 
    1691 Summary of feedback from opening
    1692 /Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1693 JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1694 NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_3.pdb 
    1695 --- 
    1696 warnings | Ignored bad PDB record found on line 4457 
    1697 # All scores below are weighted scores, not raw scores. 
    1698  
    1699 Ignored bad PDB record found on line 4458 
    1700 #BEGIN_POSE_ENERGIES_TABLE 65de3735983d8_P3_0005.pdb 
    1701  
    1702 Ignored bad PDB record found on line 4459 
    1703 label fa_atr fa_rep fa_sol fa_intra_rep pro_close fa_pair hbond_sr_bb
    1704 hbond_lr_bb hbond_bb_sc hbond_sc dslf_ss_dst dslf_cs_ang dslf_ss_dih
    1705 dslf_ca_dih rama omega fa_dun p_aa_pp ref total 
    1706  
    1707 Ignored bad PDB record found on line 4460 
    1708 weights 0.8 0.44 0.65 0.004 1 0.49 0.585 1.17 1.17 1.1 1 1 1 1 0.2 0.5 0.56
    1709 0.32 1 NA 
    1710  
    1711 Ignored bad PDB record found on line 4461 
    1712 pose -1056.68 103.617 533.74 2.13623 0.768514 -23.8197 -55.3316 -125.482
    1713 -31.7056 -30.98 -7.21142 0.452653 0.592644 0.100121 -13.0653 62.2632 194.756
    1714 -25.9632 -60.94 -532.747 
    1715  
    1716 302 messages similar to the above omitted 
    1717  
    1718 Chain information for A11_APL1_3.pdb #3 
    1719 --- 
    1720 Chain | Description 
    1721 A | No description available 
    1722 B | No description available 
    1723  
    1724 
    1725 > open "/Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1726 > JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1727 > NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_4.pdb"
    1728 
    1729 Summary of feedback from opening
    1730 /Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1731 JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1732 NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_4.pdb 
    1733 --- 
    1734 warnings | Ignored bad PDB record found on line 4457 
    1735 # All scores below are weighted scores, not raw scores. 
    1736  
    1737 Ignored bad PDB record found on line 4458 
    1738 #BEGIN_POSE_ENERGIES_TABLE 65de3735983d8_P4_0010.pdb 
    1739  
    1740 Ignored bad PDB record found on line 4459 
    1741 label fa_atr fa_rep fa_sol fa_intra_rep pro_close fa_pair hbond_sr_bb
    1742 hbond_lr_bb hbond_bb_sc hbond_sc dslf_ss_dst dslf_cs_ang dslf_ss_dih
    1743 dslf_ca_dih rama omega fa_dun p_aa_pp ref total 
    1744  
    1745 Ignored bad PDB record found on line 4460 
    1746 weights 0.8 0.44 0.65 0.004 1 0.49 0.585 1.17 1.17 1.1 1 1 1 1 0.2 0.5 0.56
    1747 0.32 1 NA 
    1748  
    1749 Ignored bad PDB record found on line 4461 
    1750 pose -1063.07 103.117 539.817 2.18448 0.767288 -24.0151 -55.3316 -125.482
    1751 -33.6227 -28.9532 -7.16781 0.478593 0.560101 0.100122 -13.5785 62.3483 194.594
    1752 -24.3727 -60.94 -532.57 
    1753  
    1754 302 messages similar to the above omitted 
    1755  
    1756 Chain information for A11_APL1_4.pdb #4 
    1757 --- 
    1758 Chain | Description 
    1759 A | No description available 
    1760 B | No description available 
    1761  
    1762 
    1763 > open "/Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1764 > JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1765 > NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_5.pdb"
    1766 
    1767 Summary of feedback from opening
    1768 /Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1769 JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1770 NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_5.pdb 
    1771 --- 
    1772 warnings | Ignored bad PDB record found on line 4457 
    1773 # All scores below are weighted scores, not raw scores. 
    1774  
    1775 Ignored bad PDB record found on line 4458 
    1776 #BEGIN_POSE_ENERGIES_TABLE 65de3735983d8_P4_0029.pdb 
    1777  
    1778 Ignored bad PDB record found on line 4459 
    1779 label fa_atr fa_rep fa_sol fa_intra_rep pro_close fa_pair hbond_sr_bb
    1780 hbond_lr_bb hbond_bb_sc hbond_sc dslf_ss_dst dslf_cs_ang dslf_ss_dih
    1781 dslf_ca_dih rama omega fa_dun p_aa_pp ref total 
    1782  
    1783 Ignored bad PDB record found on line 4460 
    1784 weights 0.8 0.44 0.65 0.004 1 0.49 0.585 1.17 1.17 1.1 1 1 1 1 0.2 0.5 0.56
    1785 0.32 1 NA 
    1786  
    1787 Ignored bad PDB record found on line 4461 
    1788 pose -1059.83 105.064 535.722 2.1457 0.769714 -24.0549 -55.3316 -125.482
    1789 -32.7947 -30.1375 -7.18133 0.472741 0.57739 0.100129 -12.7088 62.4814 194.275
    1790 -25.4869 -60.94 -532.34 
    1791  
    1792 302 messages similar to the above omitted 
    1793  
    1794 Chain information for A11_APL1_5.pdb #5 
    1795 --- 
    1796 Chain | Description 
    1797 A | No description available 
    1798 B | No description available 
    1799  
    1800 
    1801 > open "/Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1802 > JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1803 > NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_6.pdb"
    1804 
    1805 Summary of feedback from opening
    1806 /Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1807 JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1808 NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_6.pdb 
    1809 --- 
    1810 warnings | Ignored bad PDB record found on line 4457 
    1811 # All scores below are weighted scores, not raw scores. 
    1812  
    1813 Ignored bad PDB record found on line 4458 
    1814 #BEGIN_POSE_ENERGIES_TABLE 65de3735983d8_P3_0036.pdb 
    1815  
    1816 Ignored bad PDB record found on line 4459 
    1817 label fa_atr fa_rep fa_sol fa_intra_rep pro_close fa_pair hbond_sr_bb
    1818 hbond_lr_bb hbond_bb_sc hbond_sc dslf_ss_dst dslf_cs_ang dslf_ss_dih
    1819 dslf_ca_dih rama omega fa_dun p_aa_pp ref total 
    1820  
    1821 Ignored bad PDB record found on line 4460 
    1822 weights 0.8 0.44 0.65 0.004 1 0.49 0.585 1.17 1.17 1.1 1 1 1 1 0.2 0.5 0.56
    1823 0.32 1 NA 
    1824  
    1825 Ignored bad PDB record found on line 4461 
    1826 pose -1054.92 100.878 534.326 2.12041 0.769562 -23.9171 -55.3316 -125.482
    1827 -32.9038 -30.8178 -7.16123 0.499817 0.564029 0.100129 -12.3759 62.5205 195.542
    1828 -25.3912 -60.94 -531.917 
    1829  
    1830 302 messages similar to the above omitted 
    1831  
    1832 Chain information for A11_APL1_6.pdb #6 
    1833 --- 
    1834 Chain | Description 
    1835 A | No description available 
    1836 B | No description available 
    1837  
    1838 
    1839 > open "/Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1840 > JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1841 > NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_7.pdb"
    1842 
    1843 Summary of feedback from opening
    1844 /Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1845 JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1846 NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_7.pdb 
    1847 --- 
    1848 warnings | Ignored bad PDB record found on line 4457 
    1849 # All scores below are weighted scores, not raw scores. 
    1850  
    1851 Ignored bad PDB record found on line 4458 
    1852 #BEGIN_POSE_ENERGIES_TABLE 65de3735983d8_P4_0004.pdb 
    1853  
    1854 Ignored bad PDB record found on line 4459 
    1855 label fa_atr fa_rep fa_sol fa_intra_rep pro_close fa_pair hbond_sr_bb
    1856 hbond_lr_bb hbond_bb_sc hbond_sc dslf_ss_dst dslf_cs_ang dslf_ss_dih
    1857 dslf_ca_dih rama omega fa_dun p_aa_pp ref total 
    1858  
    1859 Ignored bad PDB record found on line 4460 
    1860 weights 0.8 0.44 0.65 0.004 1 0.49 0.585 1.17 1.17 1.1 1 1 1 1 0.2 0.5 0.56
    1861 0.32 1 NA 
    1862  
    1863 Ignored bad PDB record found on line 4461 
    1864 pose -1059.73 101.54 535.428 2.12268 0.769293 -23.7187 -55.3316 -125.482
    1865 -33.69 -29.0742 -7.1555 0.472781 0.561145 0.10012 -9.40336 62.7575 193.674
    1866 -24.3779 -60.94 -531.478 
    1867  
    1868 302 messages similar to the above omitted 
    1869  
    1870 Chain information for A11_APL1_7.pdb #7 
    1871 --- 
    1872 Chain | Description 
    1873 A | No description available 
    1874 B | No description available 
    1875  
    1876 
    1877 > open "/Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1878 > JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1879 > NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_8.pdb"
    1880 
    1881 Summary of feedback from opening
    1882 /Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1883 JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1884 NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_8.pdb 
    1885 --- 
    1886 warnings | Ignored bad PDB record found on line 4457 
    1887 # All scores below are weighted scores, not raw scores. 
    1888  
    1889 Ignored bad PDB record found on line 4458 
    1890 #BEGIN_POSE_ENERGIES_TABLE 65de3735983d8_P4_0023.pdb 
    1891  
    1892 Ignored bad PDB record found on line 4459 
    1893 label fa_atr fa_rep fa_sol fa_intra_rep pro_close fa_pair hbond_sr_bb
    1894 hbond_lr_bb hbond_bb_sc hbond_sc dslf_ss_dst dslf_cs_ang dslf_ss_dih
    1895 dslf_ca_dih rama omega fa_dun p_aa_pp ref total 
    1896  
    1897 Ignored bad PDB record found on line 4460 
    1898 weights 0.8 0.44 0.65 0.004 1 0.49 0.585 1.17 1.17 1.1 1 1 1 1 0.2 0.5 0.56
    1899 0.32 1 NA 
    1900  
    1901 Ignored bad PDB record found on line 4461 
    1902 pose -1063.09 101.933 539.624 2.25331 0.767543 -23.9037 -55.3316 -125.482
    1903 -33.5409 -31.0148 -7.16131 0.473818 0.560513 0.10012 -12.7849 62.9626 199.269
    1904 -26.1666 -60.94 -531.467 
    1905  
    1906 302 messages similar to the above omitted 
    1907  
    1908 Chain information for A11_APL1_8.pdb #8 
    1909 --- 
    1910 Chain | Description 
    1911 A | No description available 
    1912 B | No description available 
    1913  
    1914 
    1915 > open "/Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1916 > JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1917 > NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_9.pdb"
    1918 
    1919 Summary of feedback from opening
    1920 /Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1921 JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1922 NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_9.pdb 
    1923 --- 
    1924 warnings | Ignored bad PDB record found on line 4457 
    1925 # All scores below are weighted scores, not raw scores. 
    1926  
    1927 Ignored bad PDB record found on line 4458 
    1928 #BEGIN_POSE_ENERGIES_TABLE 65de3735983d8_P4_0027.pdb 
    1929  
    1930 Ignored bad PDB record found on line 4459 
    1931 label fa_atr fa_rep fa_sol fa_intra_rep pro_close fa_pair hbond_sr_bb
    1932 hbond_lr_bb hbond_bb_sc hbond_sc dslf_ss_dst dslf_cs_ang dslf_ss_dih
    1933 dslf_ca_dih rama omega fa_dun p_aa_pp ref total 
    1934  
    1935 Ignored bad PDB record found on line 4460 
    1936 weights 0.8 0.44 0.65 0.004 1 0.49 0.585 1.17 1.17 1.1 1 1 1 1 0.2 0.5 0.56
    1937 0.32 1 NA 
    1938  
    1939 Ignored bad PDB record found on line 4461 
    1940 pose -1059.52 101.543 537.748 2.13936 0.770434 -23.5035 -55.3316 -125.482
    1941 -33.7671 -28.7492 -7.17255 0.476396 0.565989 0.100124 -12.8 63.2953 194.761
    1942 -24.227 -60.94 -530.093 
    1943  
    1944 302 messages similar to the above omitted 
    1945  
    1946 Chain information for A11_APL1_9.pdb #9 
    1947 --- 
    1948 Chain | Description 
    1949 A | No description available 
    1950 B | No description available 
    1951  
    1952 
    1953 > open "/Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1954 > JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1955 > NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_10.pdb"
    1956 
    1957 Summary of feedback from opening
    1958 /Users/amandahuff/Library/CloudStorage/OneDrive-
    1959 JohnsHopkins/Jaffee_Lab/APL_project/KRAS_APL_models/A11
    1960 NEW/7ow4_APL1/A11_APL1_10.pdb 
    1961 --- 
    1962 warnings | Ignored bad PDB record found on line 4457 
    1963 # All scores below are weighted scores, not raw scores. 
    1964  
    1965 Ignored bad PDB record found on line 4458 
    1966 #BEGIN_POSE_ENERGIES_TABLE 65de3735983d8_P4_0011.pdb 
    1967  
    1968 Ignored bad PDB record found on line 4459 
    1969 label fa_atr fa_rep fa_sol fa_intra_rep pro_close fa_pair hbond_sr_bb
    1970 hbond_lr_bb hbond_bb_sc hbond_sc dslf_ss_dst dslf_cs_ang dslf_ss_dih
    1971 dslf_ca_dih rama omega fa_dun p_aa_pp ref total 
    1972  
    1973 Ignored bad PDB record found on line 4460 
    1974 weights 0.8 0.44 0.65 0.004 1 0.49 0.585 1.17 1.17 1.1 1 1 1 1 0.2 0.5 0.56
    1975 0.32 1 NA 
    1976  
    1977 Ignored bad PDB record found on line 4461 
    1978 pose -1053.63 104.732 533.351 2.13308 0.770563 -23.8877 -55.3316 -125.482
    1979 -31.458 -29.1638 -7.25281 0.460407 0.596591 0.100136 -13.6365 62.4501 192.271
    1980 -25.4824 -60.94 -529.404 
    1981  
    1982 302 messages similar to the above omitted 
    1983  
    1984 Chain information for A11_APL1_10.pdb #10 
    1985 --- 
    1986 Chain | Description 
    1987 A | No description available 
    1988 B | No description available 
    1989  
    1990 
    1991 > set bgColor white
    1992 
    1993 > select /A
    1994 
    1995 43500 atoms, 44120 bonds, 2760 residues, 10 models selected 
    1996 
    1997 > hide sel atoms
    1998 
    1999 > hide #!2 models
    2000 
    2001 > select add #2
    2002 
    2003 43605 atoms, 44223 bonds, 1 pseudobond, 2768 residues, 11 models selected 
    2004 
    2005 > hide #!3 models
    2006 
    2007 > hide #!4 models
    2008 
    2009 > hide #!5 models
    2010 
    2011 > hide #!6 models
    2012 
    2013 > hide #!7 models
    2014 
    2015 > hide #!8 models
    2016 
    2017 > hide #!9 models
    2018 
    2019 > hide #!10 models
    2020 
    2021 > select subtract #2
    2022 
    2023 39150 atoms, 39708 bonds, 2484 residues, 9 models selected 
    2024 
    2025 > select add #2
    2026 
    2027 43605 atoms, 44223 bonds, 1 pseudobond, 2768 residues, 11 models selected 
    2028 
    2029 > contacts /B:1 restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    2030 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    2031    
    2032    
    2033     Allowed overlap: -0.4
    2034     H-bond overlap reduction: 0.4
    2035     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    2036     Detect intra-residue contacts: False
    2037     Detect intra-molecule contacts: False
    2038    
    2039     31 contacts
    2040                 atom1                           atom2               overlap  distance
    2041     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 O    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 HH    0.243    1.837
    2042     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 O    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 CE1     0.189    2.991
    2043     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 3H   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 OH      0.172    1.928
    2044     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 1HB  A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 167 CD1   0.123    2.577
    2045     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 CA   A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2    0.096    3.084
    2046     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 1HB  A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 167 CG    -0.022    2.722
    2047     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 CB   A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 167 CD1   -0.037    3.437
    2048     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 N    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 171 OH    -0.050    2.775
    2049     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 O    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 OH    -0.077    2.657
    2050     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 1H   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 171 OH    -0.084    2.184
    2051     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 OG   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 HE1   -0.092    2.592
    2052     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 N    A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2    -0.124    2.829
    2053     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 C    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 OH      -0.128    3.328
    2054     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 HA   A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE1    -0.140    2.620
    2055     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 C    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 HH    -0.144    2.844
    2056     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 O    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 HE1     -0.144    2.624
    2057     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 N    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 OH      -0.163    2.888
    2058     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 O    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 CZ      -0.169    3.349
    2059     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 HG   A11_APL1_1.pdb #1/A ARG 163 2HB   -0.192    2.192
    2060     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 2H   A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2    -0.205    2.285
    2061     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 CA   A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 CD     -0.229    3.629
    2062     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 HA   A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2    -0.229    2.709
    2063     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 2H   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 171 OH    -0.239    2.339
    2064     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 HA   A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 CD     -0.248    2.948
    2065     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 CA   A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE1    -0.250    3.430
    2066     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 CB   A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 167 CG    -0.282    3.682
    2067     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 C    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 CZ      -0.323    3.723
    2068     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 1H   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 171 CZ    -0.333    3.033
    2069     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 3H   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 CZ      -0.334    3.034
    2070     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 C    A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2    -0.366    3.546
    2071     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 1H   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 171 CE2   -0.389    3.089
    2072    
    2073 
    2074  
    2075 31 contacts 
    2076 
    2077 > contacts /B restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    2078 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    2079    
    2080    
    2081     Allowed overlap: -0.4
    2082     H-bond overlap reduction: 0.4
    2083     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    2084     Detect intra-residue contacts: False
    2085     Detect intra-molecule contacts: False
    2086    
    2087     126 contacts
    2088                 atom1                            atom2                overlap  distance
    2089     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 O     A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 HH     0.243    1.837
    2090     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 H    A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 CG      0.225    2.475
    2091     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 O     A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 CE1      0.189    2.991
    2092     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 O    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 84 HH      0.183    1.897
    2093     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 H     A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE1     0.182    1.898
    2094     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 3HG1  A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 9 OH       0.181    2.319
    2095     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 O    A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 HG1    0.181    1.899
    2096     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 3H    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 OH       0.172    1.928
    2097     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 H    A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 OD1     0.134    1.946
    2098     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 OXT  A11_APL1_1.pdb #1/A THR 80 1HG2    0.129    2.351
    2099     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 1HB   A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 167 CD1    0.123    2.577
    2100     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 CA    A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2     0.096    3.084
    2101     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 8 O     A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 147 HE1    0.092    1.988
    2102     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 3HZ  A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 OD2     0.091    1.989
    2103     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 O     A11_APL1_1.pdb #1/A ASN 66 2HD2    0.087    1.993
    2104     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HG  A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 147 CZ2    0.062    2.638
    2105     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HD  A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 123 CE2    0.021    2.679
    2106     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 1HB   A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 167 CG     -0.022    2.722
    2107     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_1.pdb #1/A VAL 67 N       -0.027    2.652
    2108     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 CG2   A11_APL1_1.pdb #1/A MET 45 3HE     -0.030    2.730
    2109     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_1.pdb #1/A ILE 95 3HD1    -0.034    2.034
    2110     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 CB    A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 167 CD1    -0.037    3.437
    2111     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 HA   A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 3HG2   -0.043    2.043
    2112     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 H     A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 CD      -0.047    2.747
    2113     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 3HZ  A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 CG      -0.047    2.747
    2114     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 N     A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 171 OH     -0.050    2.775
    2115     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 CG   A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 147 CZ2    -0.055    3.455
    2116     A11_APL1_1.pdb #1/B GLY 7 CA    A11_APL1_1.pdb #1/A GLN 155 OE1    -0.062    3.242
    2117     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 NZ   A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 CG      -0.072    3.397
    2118     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 N    A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 OD1     -0.076    2.781
    2119     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 O     A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 OH     -0.077    2.657
    2120     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_1.pdb #1/A VAL 67 CA      -0.080    2.780
    2121     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 8 O     A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 147 NE1    -0.082    2.787
    2122     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 1H    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 171 OH     -0.084    2.184
    2123     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 NZ   A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 OD2     -0.090    2.795
    2124     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 OG    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 HE1    -0.092    2.592
    2125     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 2HB  A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 OG1    -0.095    2.595
    2126     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 CD      -0.103    2.803
    2127     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 N     A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE1     -0.108    2.813
    2128     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 N    A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 CG      -0.110    3.435
    2129     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 C    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 84 HH      -0.116    2.816
    2130     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 HB    A11_APL1_1.pdb #1/A ASN 66 1HB     -0.123    2.123
    2131     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 C    A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 HG1    -0.123    2.823
    2132     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 N     A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2     -0.124    2.829
    2133     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 C     A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 OH       -0.128    3.328
    2134     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A MET 45 3HE     -0.129    2.129
    2135     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 O     A11_APL1_1.pdb #1/A ASN 66 ND2     -0.138    2.843
    2136     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 HA    A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE1     -0.140    2.620
    2137     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A MET 45 CE      -0.142    2.842
    2138     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 C     A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 HH     -0.144    2.844
    2139     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 O     A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 HE1      -0.144    2.624
    2140     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 99 CZ      -0.147    2.847
    2141     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HE  A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 2HB     -0.150    2.150
    2142     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 N     A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 CD      -0.160    3.485
    2143     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 N     A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 OH       -0.163    2.888
    2144     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 O     A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 CZ       -0.169    3.349
    2145     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 CG1   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 9 OH       -0.179    3.379
    2146     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 8 CG2   A11_APL1_1.pdb #1/A ALA 150 CB     -0.184    3.584
    2147     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 3 HB    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 CZ     -0.187    2.887
    2148     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 HG    A11_APL1_1.pdb #1/A ARG 163 2HB    -0.192    2.192
    2149     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 8 O     A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 147 CD1    -0.193    3.373
    2150     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 CG     -0.204    2.904
    2151     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 CG2   A11_APL1_1.pdb #1/A MET 45 CE      -0.204    3.604
    2152     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 2H    A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2     -0.205    2.285
    2153     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 OXT  A11_APL1_1.pdb #1/A THR 80 CG2     -0.210    3.390
    2154     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 3 HB    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 CE2    -0.217    2.917
    2155     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 HA    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 99 OH      -0.218    2.718
    2156     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 3 CG2   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 CG     -0.220    3.620
    2157     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HG  A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 CG2    -0.224    2.924
    2158     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 CG1   A11_APL1_1.pdb #1/A ASN 66 CB      -0.226    3.626
    2159     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 CA    A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 CD      -0.229    3.629
    2160     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 HA    A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2     -0.229    2.709
    2161     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 2H    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 171 OH     -0.239    2.339
    2162     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 8 CG2   A11_APL1_1.pdb #1/A ALA 150 2HB    -0.239    2.939
    2163     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HB  A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 CG      -0.245    2.945
    2164     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 HA    A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 CD      -0.248    2.948
    2165     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 CA    A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE1     -0.250    3.430
    2166     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 8 3HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A ALA 150 CB     -0.250    2.950
    2167     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 CG   A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 147 HZ2    -0.253    2.953
    2168     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 NZ   A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 CB      -0.254    3.579
    2169     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HD  A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 123 HE2    -0.260    2.260
    2170     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_1.pdb #1/A ILE 95 1HG2    -0.268    2.268
    2171     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 O    A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 OG1    -0.272    2.852
    2172     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 O    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 84 OH      -0.274    2.854
    2173     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 CA   A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 3HG2   -0.277    2.977
    2174     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 CB    A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 167 CG     -0.282    3.682
    2175     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 NZ   A11_APL1_1.pdb #1/A ILE 95 3HD1    -0.286    2.911
    2176     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 CB    A11_APL1_1.pdb #1/A ASN 66 1HB     -0.288    2.988
    2177     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 3 CG1   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 99 CZ      -0.294    3.694
    2178     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 2HB  A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 HG1    -0.303    2.303
    2179     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 CE2      -0.309    3.009
    2180     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 99 OH      -0.310    2.810
    2181     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE1     -0.310    2.790
    2182     A11_APL1_1.pdb #1/B GLY 9 CA    A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 OD1     -0.312    3.492
    2183     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 C     A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 CZ       -0.323    3.723
    2184     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HE  A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 CB      -0.325    3.025
    2185     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 CG1   A11_APL1_1.pdb #1/A VAL 67 N       -0.330    3.655
    2186     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 1H    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 171 CZ     -0.333    3.033
    2187     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 3H    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 7 CZ       -0.334    3.034
    2188     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 CD   A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 123 CE2    -0.336    3.736
    2189     A11_APL1_1.pdb #1/B GLY 9 C     A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 OD1     -0.337    3.517
    2190     A11_APL1_1.pdb #1/B GLY 7 N     A11_APL1_1.pdb #1/A GLN 155 1HE2   -0.337    2.977
    2191     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HG  A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 1HG2   -0.339    2.339
    2192     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2     -0.341    2.821
    2193     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 CE   A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 2HB     -0.344    3.044
    2194     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 HA   A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 CG2    -0.344    3.044
    2195     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 CD1    -0.345    3.045
    2196     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 CB   A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 OG1    -0.350    3.550
    2197     A11_APL1_1.pdb #1/B GLY 9 C     A11_APL1_1.pdb #1/A TRP 147 HE1    -0.351    3.051
    2198     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 3 HB    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 CE1    -0.352    3.052
    2199     A11_APL1_1.pdb #1/B GLY 7 N     A11_APL1_1.pdb #1/A GLN 155 OE1    -0.358    3.078
    2200     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A VAL 67 HB      -0.360    2.360
    2201     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 159 CB     -0.363    3.063
    2202     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 C     A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 OE2     -0.366    3.546
    2203     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_1.pdb #1/A ASN 66 C       -0.367    3.067
    2204     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 CG   A11_APL1_1.pdb #1/A THR 143 CG2    -0.367    3.767
    2205     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 C    A11_APL1_1.pdb #1/A THR 80 1HG2    -0.367    3.067
    2206     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 O    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 84 HE2     -0.367    2.847
    2207     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 CB   A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 CG      -0.376    3.776
    2208     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 CG1   A11_APL1_1.pdb #1/A ASN 66 1HB     -0.381    3.081
    2209     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 O    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 84 CE2     -0.387    3.567
    2210     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 CE   A11_APL1_1.pdb #1/A ASP 77 CB      -0.389    3.789
    2211     A11_APL1_1.pdb #1/B SER 1 1H    A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 171 CE2    -0.389    3.089
    2212     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 1HD  A11_APL1_1.pdb #1/A TYR 123 CD2    -0.389    3.089
    2213     A11_APL1_1.pdb #1/B VAL 2 CG2   A11_APL1_1.pdb #1/A GLU 63 CD      -0.396    3.796
    2214     A11_APL1_1.pdb #1/B LYS 10 NZ   A11_APL1_1.pdb #1/A ILE 95 1HG2    -0.397    3.022
    2215    
    2216 
    2217  
    2218 126 contacts 
    2219 
    2220 > hide #!1 models
    2221 
    2222 > show #!2 models
    2223 
    2224 > contacts /B restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    2225 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    2226    
    2227    
    2228     Allowed overlap: -0.4
    2229     H-bond overlap reduction: 0.4
    2230     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    2231     Detect intra-residue contacts: False
    2232     Detect intra-molecule contacts: False
    2233    
    2234     150 contacts
    2235                 atom1                            atom2                overlap  distance
    2236     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 HH     0.246    1.834
    2237     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 H     A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE1     0.184    1.896
    2238     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 O    A11_APL1_2.pdb #2/A THR 143 HG1    0.181    1.899
    2239     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 HG    A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE2     0.179    1.901
    2240     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 HA    A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 CD      0.167    2.533
    2241     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 H    A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 CG      0.164    2.536
    2242     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CE2      0.149    2.551
    2243     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 N    A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 CG      0.137    3.188
    2244     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 C     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 OH       0.134    3.066
    2245     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 9 C     A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 147 HE1    0.126    2.574
    2246     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 HA    A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE1     0.106    2.374
    2247     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CG2   A11_APL1_2.pdb #2/A ASN 66 1HB     0.087    2.613
    2248     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE1     0.082    2.398
    2249     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 7 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A GLN 155 OE1    0.064    3.116
    2250     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 H     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 OH      0.053    2.047
    2251     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 N     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 OH       0.041    2.684
    2252     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 OH       0.038    3.162
    2253     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 H    A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 OD2     0.036    2.044
    2254     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 3HZ  A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 OD2     0.025    2.055
    2255     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 HB    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 9 OH       0.025    2.475
    2256     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 H     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 CZ      0.020    2.680
    2257     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CG2   A11_APL1_2.pdb #2/A ASN 66 CB      0.001    3.399
    2258     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 HA    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 OH      -0.001    2.501
    2259     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CG1   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CE2      -0.007    3.407
    2260     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 HA   A11_APL1_2.pdb #2/A THR 143 3HG2   -0.008    2.008
    2261     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 7 2HA   A11_APL1_2.pdb #2/A GLN 155 OE1    -0.014    2.494
    2262     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CG     -0.015    2.715
    2263     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 CZ      -0.016    2.716
    2264     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 1HD  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 123 CE2    -0.037    2.737
    2265     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 N     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 OH     -0.050    2.775
    2266     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 OH      -0.052    3.252
    2267     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 3HG1  A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE1     -0.062    2.542
    2268     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 1HB  A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 CG      -0.069    2.769
    2269     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 1HG2    -0.072    2.072
    2270     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 NZ   A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 1HG2    -0.077    2.702
    2271     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CD2      -0.086    2.786
    2272     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 OXT  A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 OD1     -0.089    3.049
    2273     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CE   A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 3HD1    -0.095    2.795
    2274     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 H     A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 CD      -0.095    2.795
    2275     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 1HD  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 123 CD2    -0.102    2.802
    2276     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 HA    A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE2     -0.104    2.584
    2277     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 3HD1    -0.126    2.126
    2278     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 HA   A11_APL1_2.pdb #2/A THR 143 CG2    -0.126    2.826
    2279     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CB    A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 167 CD1    -0.132    3.532
    2280     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 NZ   A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 OD2     -0.132    2.837
    2281     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 CG1   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 CZ      -0.133    3.533
    2282     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 HG    A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 CD      -0.137    2.837
    2283     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 2HB   A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 167 CD1    -0.144    2.844
    2284     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 C    A11_APL1_2.pdb #2/A THR 143 HG1    -0.149    2.849
    2285     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 HB    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 CE1     -0.150    2.850
    2286     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 8 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 147 CD1    -0.162    3.342
    2287     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CB    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 OH      -0.164    3.364
    2288     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 8 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 147 NE1    -0.166    2.871
    2289     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 HE1    -0.169    2.649
    2290     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE1     -0.170    3.350
    2291     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 C     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CZ       -0.172    3.572
    2292     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 C     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CE1      -0.173    3.573
    2293     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CB    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 9 OH       -0.174    3.374
    2294     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CD2    -0.183    2.883
    2295     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 CD      -0.185    3.585
    2296     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 N     A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE1     -0.196    2.901
    2297     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 2HE  A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 CG2     -0.197    2.897
    2298     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 3H    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 OH       -0.200    2.300
    2299     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 1H    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 OH     -0.200    2.300
    2300     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 2H    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 OH     -0.201    2.301
    2301     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_2.pdb #2/A ASN 66 1HB     -0.206    2.206
    2302     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 OH     -0.207    2.787
    2303     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CG2   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE1     -0.208    3.388
    2304     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 9 2HA   A11_APL1_2.pdb #2/A THR 73 CG2     -0.212    2.912
    2305     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CG   A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 147 CZ2    -0.213    3.613
    2306     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 8 CG2   A11_APL1_2.pdb #2/A ALA 150 CB     -0.214    3.614
    2307     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CB    A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE2     -0.218    3.398
    2308     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 NZ   A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 3HD1    -0.222    2.847
    2309     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 8 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 147 HE1    -0.222    2.302
    2310     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 O    A11_APL1_2.pdb #2/A THR 143 OG1    -0.223    2.803
    2311     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 9 C     A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 147 NE1    -0.224    3.549
    2312     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CE   A11_APL1_2.pdb #2/A LEU 81 1HD1    -0.226    2.926
    2313     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 N     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CZ       -0.228    3.553
    2314     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 1HG  A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 147 CZ2    -0.231    2.931
    2315     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 HA    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CE1      -0.234    2.934
    2316     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 HB    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 OH      -0.243    2.743
    2317     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 1H    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 CZ     -0.248    2.948
    2318     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 C     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 HH     -0.253    2.953
    2319     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 7 1HA   A11_APL1_2.pdb #2/A GLN 155 1HE2   -0.256    2.256
    2320     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_2.pdb #2/A ASN 66 CB      -0.256    2.956
    2321     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 N    A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 OD2     -0.257    2.962
    2322     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 CE2     -0.259    2.959
    2323     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CE1    -0.262    3.442
    2324     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 OG    A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE2     -0.264    2.844
    2325     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 OH      -0.264    2.764
    2326     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CG1   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 9 OH       -0.267    3.467
    2327     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 NZ   A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 CG2     -0.269    3.594
    2328     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 N     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 CZ     -0.276    3.601
    2329     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 H     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 CE1     -0.278    2.978
    2330     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CG   A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 147 HZ2    -0.278    2.978
    2331     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 3HZ  A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 CG      -0.279    2.979
    2332     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CB   A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 CG      -0.280    3.680
    2333     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE2     -0.282    3.462
    2334     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 N     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 CE2    -0.283    3.608
    2335     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CE   A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 CG2     -0.290    3.690
    2336     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 N     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 CZ      -0.296    3.621
    2337     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 CG2   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CD2    -0.297    3.697
    2338     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CG1   A11_APL1_2.pdb #2/A MET 45 CE      -0.300    3.700
    2339     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 9 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A THR 73 CG2     -0.302    3.702
    2340     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 NZ   A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 CG      -0.303    3.628
    2341     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 HA    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CE1    -0.307    3.007
    2342     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 CG1   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 CE2     -0.307    3.707
    2343     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CD   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 123 CD2    -0.308    3.708
    2344     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CG1   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE1     -0.308    3.488
    2345     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 HB    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CE2    -0.310    3.010
    2346     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CE   A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 CD1     -0.311    3.711
    2347     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 N     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 HE2    -0.312    2.937
    2348     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 HA    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CD1    -0.317    3.017
    2349     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 N     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 OH      -0.318    3.043
    2350     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 CB    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 CE1     -0.323    3.723
    2351     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 1HE  A11_APL1_2.pdb #2/A LEU 81 1HD1    -0.325    2.325
    2352     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 1HE  A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 2HB     -0.325    2.325
    2353     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CD   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 123 CE2    -0.325    3.725
    2354     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 7 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A GLN 155 1HE2   -0.330    3.030
    2355     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 1HG  A11_APL1_2.pdb #2/A THR 143 1HG2   -0.332    2.332
    2356     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 9 2HA   A11_APL1_2.pdb #2/A THR 73 3HG2    -0.335    2.335
    2357     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 1H    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 CE2    -0.336    3.036
    2358     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CB     -0.340    3.040
    2359     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CG1   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CZ       -0.340    3.740
    2360     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 2HE  A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 3HG2    -0.342    2.342
    2361     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CE1    -0.345    3.745
    2362     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 CG2   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CG     -0.349    3.749
    2363     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 9 C     A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 OD1     -0.352    3.532
    2364     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 1HB  A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 OD2     -0.355    2.835
    2365     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 4 C     A11_APL1_2.pdb #2/A GLN 70 NE2     -0.358    3.743
    2366     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 N    A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 OD1     -0.359    3.064
    2367     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_2.pdb #2/A MET 45 CE      -0.360    3.060
    2368     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 HE1      -0.364    2.844
    2369     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CA   A11_APL1_2.pdb #2/A THR 143 3HG2   -0.364    3.064
    2370     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 3 N     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 99 CE1     -0.367    3.692
    2371     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CZ       -0.370    3.070
    2372     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_2.pdb #2/A ASN 66 CB      -0.370    3.070
    2373     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CB    A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 167 CG     -0.374    3.774
    2374     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CE1      -0.376    3.776
    2375     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CZ     -0.380    3.560
    2376     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CE   A11_APL1_2.pdb #2/A ILE 95 1HG2    -0.381    3.081
    2377     A11_APL1_2.pdb #2/B GLY 9 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 147 HE1    -0.382    2.462
    2378     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 2H    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 OH       -0.383    2.483
    2379     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CG1   A11_APL1_2.pdb #2/A MET 45 3HE     -0.385    3.085
    2380     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 8 CG2   A11_APL1_2.pdb #2/A ALA 150 2HB    -0.385    3.085
    2381     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 CA    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CZ       -0.387    3.787
    2382     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O     A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CE1      -0.388    3.568
    2383     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CB   A11_APL1_2.pdb #2/A ASP 77 OD2     -0.394    3.574
    2384     A11_APL1_2.pdb #2/B VAL 2 HB    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 9 HH       -0.396    2.396
    2385     A11_APL1_2.pdb #2/B LYS 10 CA   A11_APL1_2.pdb #2/A THR 143 CG2    -0.400    3.800
    2386    
    2387 
    2388  
    2389 150 contacts 
    2390 
    2391 > contacts /B:1 restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    2392 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    2393    
    2394    
    2395     Allowed overlap: -0.4
    2396     H-bond overlap reduction: 0.4
    2397     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    2398     Detect intra-residue contacts: False
    2399     Detect intra-molecule contacts: False
    2400    
    2401     36 contacts
    2402                 atom1                           atom2               overlap  distance
    2403     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 HH    0.246    1.834
    2404     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 HG   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE2    0.179    1.901
    2405     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 HA   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 CD     0.167    2.533
    2406     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 C    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 OH      0.134    3.066
    2407     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 HA   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE1    0.106    2.374
    2408     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 N    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 OH      0.041    2.684
    2409     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CA   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 OH      0.038    3.162
    2410     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 N    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 OH    -0.050    2.775
    2411     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 HA   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE2    -0.104    2.584
    2412     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CB   A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 167 CD1   -0.132    3.532
    2413     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 HG   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 CD     -0.137    2.837
    2414     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 2HB  A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 167 CD1   -0.144    2.844
    2415     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 HE1   -0.169    2.649
    2416     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CA   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE1    -0.170    3.350
    2417     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 C    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CZ      -0.172    3.572
    2418     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 C    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CE1     -0.173    3.573
    2419     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CA   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 CD     -0.185    3.585
    2420     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 3H   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 OH      -0.200    2.300
    2421     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 1H   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 OH    -0.200    2.300
    2422     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 2H   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 OH    -0.201    2.301
    2423     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 OH    -0.207    2.787
    2424     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CB   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE2    -0.218    3.398
    2425     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 1H   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 CZ    -0.248    2.948
    2426     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 C    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 HH    -0.253    2.953
    2427     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CE1   -0.262    3.442
    2428     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 OG   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE2    -0.264    2.844
    2429     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 N    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 CZ    -0.276    3.601
    2430     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CA   A11_APL1_2.pdb #2/A GLU 63 OE2    -0.282    3.462
    2431     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 N    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 CE2   -0.283    3.608
    2432     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 N    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 HE2   -0.312    2.937
    2433     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 1H   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 171 CE2   -0.336    3.036
    2434     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 HE1     -0.364    2.844
    2435     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 CB   A11_APL1_2.pdb #2/A TRP 167 CG    -0.374    3.774
    2436     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 159 CZ    -0.380    3.560
    2437     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 2H   A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 OH      -0.383    2.483
    2438     A11_APL1_2.pdb #2/B SER 1 O    A11_APL1_2.pdb #2/A TYR 7 CE1     -0.388    3.568
    2439    
    2440 
    2441  
    2442 36 contacts 
    2443 
    2444 > hide #!2 models
    2445 
    2446 > show #!3 models
    2447 
    2448 > contacts /B:1 restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    2449 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    2450    
    2451    
    2452     Allowed overlap: -0.4
    2453     H-bond overlap reduction: 0.4
    2454     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    2455     Detect intra-residue contacts: False
    2456     Detect intra-molecule contacts: False
    2457    
    2458     33 contacts
    2459                 atom1                           atom2               overlap  distance
    2460     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 HG   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE2    0.180    1.900
    2461     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 HA   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 CD     0.080    2.620
    2462     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 C    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 OH      0.077    3.123
    2463     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 HA   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE1    0.052    2.428
    2464     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CA   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 OH      0.004    3.196
    2465     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 N    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 OH    -0.001    2.726
    2466     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CB   A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 167 CD1   -0.078    3.478
    2467     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2HB  A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 167 CD1   -0.079    2.779
    2468     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 N    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CE2   -0.098    3.423
    2469     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 N    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 OH      -0.107    2.832
    2470     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 N    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 HE2   -0.122    2.747
    2471     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 1H   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CZ    -0.122    2.822
    2472     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 N    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CZ    -0.144    3.469
    2473     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 1H   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CE2   -0.144    2.844
    2474     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 C    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 CE1     -0.149    3.549
    2475     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 HG   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 CD     -0.151    2.851
    2476     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 HA   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE2    -0.182    2.662
    2477     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 1H   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 OH    -0.199    2.299
    2478     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2H   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 OH    -0.199    2.299
    2479     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CB   A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 167 CG    -0.209    3.609
    2480     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CA   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE1    -0.214    3.394
    2481     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2H   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 HE2   -0.216    2.216
    2482     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 C    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 CZ      -0.221    3.621
    2483     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2H   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CE2   -0.229    2.929
    2484     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CA   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 CD     -0.254    3.654
    2485     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2HB  A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 167 CG    -0.267    2.967
    2486     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 OG   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE2    -0.275    2.855
    2487     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CB   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE2    -0.309    3.489
    2488     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2H   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CZ    -0.312    3.012
    2489     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CA   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE2    -0.332    3.512
    2490     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CA   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 OH    -0.334    3.534
    2491     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 C    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 HE1     -0.339    3.039
    2492     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 O    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 HE1     -0.346    2.826
    2493    
    2494 
    2495  
    2496 33 contacts 
    2497 
    2498 > contacts /B restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    2499 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    2500    
    2501    
    2502     Allowed overlap: -0.4
    2503     H-bond overlap reduction: 0.4
    2504     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    2505     Detect intra-residue contacts: False
    2506     Detect intra-molecule contacts: False
    2507    
    2508     149 contacts
    2509                 atom1                            atom2                overlap  distance
    2510     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 4 H     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CZ     0.281    2.419
    2511     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 O    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 84 HH      0.209    1.871
    2512     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 H     A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE1     0.189    1.891
    2513     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 O    A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 HG1    0.185    1.895
    2514     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 HA    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 OH      0.182    2.318
    2515     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 HG    A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE2     0.180    1.900
    2516     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 H    A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 77 OD1     0.178    1.902
    2517     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 116 OD2    0.163    1.917
    2518     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CG2   A11_APL1_3.pdb #3/A ASN 66 1HB     0.137    2.563
    2519     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 CE2      0.129    2.571
    2520     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE1     0.116    2.364
    2521     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 HA    A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 CD      0.080    2.620
    2522     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 H    A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 77 CG      0.078    2.622
    2523     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 C     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 OH       0.077    3.123
    2524     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 9 HH       0.065    2.635
    2525     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 9 HH       0.064    1.936
    2526     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 116 CG     0.056    2.644
    2527     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 HA    A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE1     0.052    2.428
    2528     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 CE2      0.043    3.357
    2529     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 9 C     A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 HE1    0.017    2.683
    2530     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CA    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 OH      0.006    3.194
    2531     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CA    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 OH       0.004    3.196
    2532     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 H     A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 CD      0.004    2.696
    2533     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 N     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 OH     -0.001    2.726
    2534     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CG2   A11_APL1_3.pdb #3/A ASN 66 CB      -0.002    3.402
    2535     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 2HG2  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 CZ      -0.005    2.705
    2536     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 HA   A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 3HG2   -0.009    2.009
    2537     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 2HB  A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 OG1    -0.014    2.514
    2538     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 9 OH       -0.014    3.214
    2539     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 3HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE1     -0.019    2.499
    2540     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A ALA 150 CB     -0.023    3.423
    2541     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 3HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 CD1    -0.025    2.725
    2542     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 3HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 CE1     -0.028    2.728
    2543     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 4 N     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CZ     -0.036    3.361
    2544     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 CD1    -0.043    3.443
    2545     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 NZ   A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 116 OD2    -0.054    2.759
    2546     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 2HB    -0.061    2.061
    2547     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 C    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 84 HH      -0.064    2.764
    2548     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 HD1    -0.076    2.776
    2549     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CB    A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 167 CD1    -0.078    3.478
    2550     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2HB   A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 167 CD1    -0.079    2.779
    2551     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 C    A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 HG1    -0.080    2.780
    2552     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_3.pdb #3/A ASN 66 1HB     -0.095    2.095
    2553     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 N     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CE2    -0.098    3.423
    2554     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 N     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 OH       -0.107    2.832
    2555     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 OXT  A11_APL1_3.pdb #3/A THR 80 1HG2    -0.108    2.588
    2556     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 2HB    -0.117    2.817
    2557     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 4 O     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CE2    -0.118    3.298
    2558     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 CD2      -0.121    2.821
    2559     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 N     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 HE2    -0.122    2.747
    2560     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 1H    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CZ     -0.122    2.822
    2561     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 4 H     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CE2    -0.136    2.836
    2562     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 2HD  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 123 CE2    -0.143    2.843
    2563     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 N     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CZ     -0.144    3.469
    2564     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 1H    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CE2    -0.144    2.844
    2565     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 4 H     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CE1    -0.146    2.846
    2566     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 9 O     A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 HE1    -0.149    2.229
    2567     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 C     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 CE1      -0.149    3.549
    2568     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 HG    A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 CD      -0.151    2.851
    2569     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 HB    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CD2    -0.154    2.854
    2570     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CG2   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE1     -0.168    3.348
    2571     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 9 OH       -0.181    2.681
    2572     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 1HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A LYS 146 O      -0.182    2.662
    2573     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 HA    A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE2     -0.182    2.662
    2574     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 3HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 HD1    -0.185    2.185
    2575     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A ALA 150 3HB    -0.185    2.885
    2576     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 O    A11_APL1_3.pdb #3/A LYS 146 1HD    -0.185    2.665
    2577     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 N     A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE1     -0.192    2.897
    2578     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 N    A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 77 OD1     -0.197    2.902
    2579     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 1H    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 OH     -0.199    2.299
    2580     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2H    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 OH     -0.199    2.299
    2581     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CB     -0.202    3.602
    2582     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 CZ       -0.205    3.605
    2583     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 CE   A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 116 OD2    -0.207    3.387
    2584     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CB    A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 167 CG     -0.209    3.609
    2585     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 CE1     -0.211    3.611
    2586     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CA    A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE1     -0.214    3.394
    2587     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 CD      -0.215    2.915
    2588     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2H    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 HE2    -0.216    2.216
    2589     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 2HB  A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 HG1    -0.216    2.216
    2590     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 C     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 CZ       -0.221    3.621
    2591     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_3.pdb #3/A ASN 66 CB      -0.223    2.923
    2592     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CB    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 OH      -0.226    3.426
    2593     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 CB   A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 OG1    -0.227    3.427
    2594     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 O    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 84 OH      -0.228    2.808
    2595     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CB     -0.228    2.928
    2596     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2H    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CE2    -0.229    2.929
    2597     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 N     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 CZ       -0.239    3.564
    2598     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 3HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 HE1     -0.242    2.242
    2599     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 4 O     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 HE2    -0.243    2.723
    2600     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 H     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 OH      -0.247    2.347
    2601     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CA    A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 CD      -0.254    3.654
    2602     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE1     -0.263    3.443
    2603     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2HB   A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 167 CG     -0.267    2.967
    2604     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 N    A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 77 CG      -0.267    3.592
    2605     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 O    A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 HA     -0.268    2.748
    2606     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 NZ   A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 116 CG     -0.268    3.593
    2607     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 O    A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 OG1    -0.275    2.855
    2608     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 OG    A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE2     -0.275    2.855
    2609     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 CZ       -0.277    2.977
    2610     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 4 CA    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 OH     -0.281    3.481
    2611     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 HA   A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 CG2    -0.282    2.982
    2612     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 HB    A11_APL1_3.pdb #3/A ALA 150 CB     -0.285    2.985
    2613     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 1HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A ALA 150 CB     -0.285    2.985
    2614     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_3.pdb #3/A ASN 66 CB      -0.296    2.996
    2615     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 CB    A11_APL1_3.pdb #3/A ALA 150 CB     -0.301    3.701
    2616     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CB    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 9 OH       -0.305    3.505
    2617     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CB    A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE2     -0.309    3.489
    2618     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 CA   A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 3HG2   -0.310    3.010
    2619     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 2H    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 CZ     -0.312    3.012
    2620     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 CD   A11_APL1_3.pdb #3/A LEU 81 1HD2    -0.316    3.016
    2621     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 2HG  A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 77 OD2     -0.316    2.796
    2622     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 CA   A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 HG1    -0.322    3.022
    2623     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 CG2   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 CZ      -0.323    3.723
    2624     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 4 N     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CE2    -0.327    3.652
    2625     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CA    A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 OE2     -0.332    3.512
    2626     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 1HG  A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 CZ2    -0.332    3.032
    2627     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 CA    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 171 OH     -0.334    3.534
    2628     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 HB    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 9 OH       -0.334    2.834
    2629     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 CB   A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 HG1    -0.339    3.039
    2630     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 C     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 HE1      -0.339    3.039
    2631     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 N     A11_APL1_3.pdb #3/A GLU 63 CD      -0.341    3.666
    2632     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 H     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 CZ      -0.341    3.041
    2633     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A MET 45 CE      -0.342    3.742
    2634     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 HA   A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 HE1    -0.344    2.344
    2635     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 2HG2  A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 99 CE1     -0.345    3.045
    2636     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 CG   A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 77 CG      -0.346    3.746
    2637     A11_APL1_3.pdb #3/B SER 1 O     A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 7 HE1      -0.346    2.826
    2638     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 1HD  A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 77 2HB     -0.347    2.347
    2639     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 2HG  A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 77 CG      -0.348    3.048
    2640     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 HA   A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 NE1    -0.351    2.976
    2641     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 O    A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 CA     -0.353    3.533
    2642     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 9 C     A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 NE1    -0.354    3.679
    2643     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CG     -0.361    3.761
    2644     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 2HD  A11_APL1_3.pdb #3/A LEU 81 1HD2    -0.365    2.365
    2645     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 3 HB    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 159 CG     -0.369    3.069
    2646     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 CG   A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 HZ2    -0.372    3.072
    2647     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 CD   A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 123 CE2    -0.373    3.773
    2648     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 9 O     A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 CD1    -0.376    3.556
    2649     A11_APL1_3.pdb #3/B GLY 9 O     A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 NE1    -0.376    3.081
    2650     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 1HG  A11_APL1_3.pdb #3/A THR 143 CG2    -0.377    3.077
    2651     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 2HZ  A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 HZ2    -0.380    2.380
    2652     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 8 CG1   A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 HA     -0.387    3.087
    2653     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 1HB  A11_APL1_3.pdb #3/A ASP 77 CG      -0.389    3.089
    2654     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 CG2   A11_APL1_3.pdb #3/A ASN 66 2HD2    -0.392    3.092
    2655     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 C    A11_APL1_3.pdb #3/A TYR 84 OH      -0.393    3.593
    2656     A11_APL1_3.pdb #3/B LYS 10 1HG  A11_APL1_3.pdb #3/A TRP 147 HZ2    -0.397    2.397
    2657     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_3.pdb #3/A MET 45 CE      -0.398    3.098
    2658     A11_APL1_3.pdb #3/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_3.pdb #3/A ASN 66 1HB     -0.399    2.399
    2659    
    2660 
    2661  
    2662 149 contacts 
    2663 
    2664 > hide #!3 models
    2665 
    2666 > show #!4 models
    2667 
    2668 > contacts /B restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    2669 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    2670    
    2671    
    2672     Allowed overlap: -0.4
    2673     H-bond overlap reduction: 0.4
    2674     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    2675     Detect intra-residue contacts: False
    2676     Detect intra-molecule contacts: False
    2677    
    2678     145 contacts
    2679                 atom1                            atom2                overlap  distance
    2680     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 H    A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 OD1     0.194    1.886
    2681     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 H     A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE1     0.191    1.889
    2682     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 O    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 84 HH      0.183    1.897
    2683     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 O    A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 HG1    0.179    1.901
    2684     A11_APL1_4.pdb #4/B GLY 9 O     A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 147 HE1    0.179    1.901
    2685     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 HG    A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE2     0.176    1.904
    2686     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 C     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 OH       0.162    3.038
    2687     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CE2      0.109    2.591
    2688     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CG2   A11_APL1_4.pdb #4/A ASN 66 1HB     0.108    2.592
    2689     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 HA    A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 CD      0.108    2.592
    2690     A11_APL1_4.pdb #4/B GLY 9 C     A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 147 HE1    0.102    2.598
    2691     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 H    A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 CG      0.099    2.601
    2692     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CG1   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 9 HH       0.095    2.605
    2693     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 H     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 OH      0.090    2.010
    2694     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 OH       0.086    3.114
    2695     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE1     0.067    2.413
    2696     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 N     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 OH       0.066    2.659
    2697     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 9 HH       0.065    1.935
    2698     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 HA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 OH      0.060    2.440
    2699     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 HA    A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE1     0.051    2.429
    2700     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 3HG1  A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE1     0.041    2.439
    2701     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 HA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CE1    0.041    2.659
    2702     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 N     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 OH     0.036    2.689
    2703     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CG1   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 9 OH       0.023    3.177
    2704     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 H     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 CZ      0.022    2.678
    2705     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CG2   A11_APL1_4.pdb #4/A ASN 66 CB      -0.003    3.403
    2706     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 O     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 OH     -0.014    2.594
    2707     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 HA   A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 3HG2   -0.018    2.018
    2708     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CG1   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CE2      -0.033    3.433
    2709     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 OH      -0.038    3.238
    2710     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 H     A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 CD      -0.069    2.769
    2711     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_4.pdb #4/A ASN 66 1HB     -0.076    2.076
    2712     A11_APL1_4.pdb #4/B GLY 9 O     A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 147 NE1    -0.079    2.784
    2713     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 C    A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 HG1    -0.088    2.788
    2714     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 HA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CD1    -0.088    2.788
    2715     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CB    A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 167 CD1    -0.092    3.492
    2716     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 N     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 HE2    -0.096    2.721
    2717     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 C    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 84 HH      -0.098    2.798
    2718     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 1H    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 OH     -0.102    2.202
    2719     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 1HG2  A11_APL1_4.pdb #4/A ALA 150 CB     -0.108    2.808
    2720     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 CG2   A11_APL1_4.pdb #4/A ALA 152 2HB    -0.109    2.809
    2721     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 1H    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CE2    -0.113    2.813
    2722     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 OXT  A11_APL1_4.pdb #4/A THR 80 1HG2    -0.117    2.597
    2723     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 CG1   A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 147 CD1    -0.120    3.520
    2724     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 HA    A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE2     -0.120    2.600
    2725     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 N     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CZ       -0.120    3.445
    2726     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 2HB  A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 OG1    -0.121    2.621
    2727     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 2HD  A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 123 CE2    -0.128    2.828
    2728     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 HB    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 9 OH       -0.130    2.630
    2729     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 N     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CE2    -0.131    3.456
    2730     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 1H    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CZ     -0.132    2.832
    2731     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2HB   A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 167 CD1    -0.133    2.833
    2732     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 HA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CZ     -0.142    2.842
    2733     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CD2      -0.147    2.847
    2734     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 1HD  A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 2HB     -0.153    2.153
    2735     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 C     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CZ       -0.154    3.554
    2736     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CB    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 9 OH       -0.156    3.356
    2737     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 C     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CE1      -0.172    3.572
    2738     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_4.pdb #4/A ASN 66 CB      -0.173    2.873
    2739     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 HG    A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 CD      -0.177    2.877
    2740     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 N     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CZ     -0.180    3.505
    2741     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 1HG2  A11_APL1_4.pdb #4/A ALA 152 2HB    -0.182    2.182
    2742     A11_APL1_4.pdb #4/B GLY 9 O     A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 147 CD1    -0.185    3.365
    2743     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 N    A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 OD1     -0.190    2.895
    2744     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 N     A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE1     -0.194    2.899
    2745     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 N    A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 CG      -0.197    3.522
    2746     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 O     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 HE1    -0.197    2.677
    2747     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CG2   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE1     -0.200    3.380
    2748     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2H    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 OH     -0.201    2.301
    2749     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 CA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CE1    -0.203    3.603
    2750     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 9 OH       -0.207    2.707
    2751     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 3H    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 OH       -0.207    2.307
    2752     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CA    A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE1     -0.217    3.397
    2753     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 CG2   A11_APL1_4.pdb #4/A ALA 150 CB     -0.217    3.617
    2754     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CG1   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE1     -0.218    3.398
    2755     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 O     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CE1    -0.224    3.404
    2756     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 CA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CZ     -0.233    3.633
    2757     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CA    A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 CD      -0.238    3.638
    2758     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 2HG  A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 OD2     -0.239    2.719
    2759     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 HA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CE1      -0.241    2.941
    2760     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CB    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 OH      -0.242    3.442
    2761     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 CD   A11_APL1_4.pdb #4/A LEU 81 1HD2    -0.244    2.944
    2762     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 1H    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 HE2    -0.245    2.245
    2763     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 O     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CZ     -0.250    3.430
    2764     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 O    A11_APL1_4.pdb #4/A LYS 146 1HD    -0.251    2.731
    2765     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 O    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 84 OH      -0.256    2.836
    2766     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CG1   A11_APL1_4.pdb #4/A MET 45 CE      -0.261    3.661
    2767     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 2HB  A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 HG1    -0.264    2.264
    2768     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 1HG2  A11_APL1_4.pdb #4/A ALA 150 3HB    -0.268    2.268
    2769     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CB    A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 167 CG     -0.270    3.670
    2770     A11_APL1_4.pdb #4/B GLY 9 C     A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 147 NE1    -0.272    3.597
    2771     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 HA   A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 CG2    -0.275    2.975
    2772     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 OG    A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE2     -0.275    2.855
    2773     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CB    A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE2     -0.277    3.457
    2774     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 N     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 OH      -0.278    3.003
    2775     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 2HG  A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 CG      -0.279    2.979
    2776     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 CG1   A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 147 HD1    -0.279    2.979
    2777     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 CG2   A11_APL1_4.pdb #4/A ALA 152 CB     -0.279    3.679
    2778     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 N     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 CZ      -0.280    3.605
    2779     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 O    A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 OG1    -0.280    2.860
    2780     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 CG   A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 CG      -0.285    3.685
    2781     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 CD   A11_APL1_4.pdb #4/A LEU 81 CD2     -0.291    3.691
    2782     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CA    A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE2     -0.294    3.474
    2783     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 2HG1  A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 147 CD1    -0.303    3.003
    2784     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 H     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 CE1     -0.309    3.009
    2785     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 N     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CZ     -0.311    3.636
    2786     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CG1   A11_APL1_4.pdb #4/A MET 45 3HE     -0.314    3.014
    2787     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 O    A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 HA     -0.316    2.796
    2788     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 CB   A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 OG1    -0.318    3.518
    2789     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 CA   A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 HG1    -0.321    3.021
    2790     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CZ       -0.325    3.725
    2791     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_4.pdb #4/A MET 45 CE      -0.327    3.027
    2792     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 2HD  A11_APL1_4.pdb #4/A LEU 81 1HD2    -0.329    2.329
    2793     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 CA   A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 3HG2   -0.333    3.033
    2794     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 1HG2  A11_APL1_4.pdb #4/A GLN 156 1HE2   -0.342    2.342
    2795     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 OH     -0.342    3.542
    2796     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 O     A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 147 NE1    -0.345    3.050
    2797     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2H    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CE2    -0.346    3.046
    2798     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2H    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 OH       -0.350    2.450
    2799     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 CD      -0.350    3.050
    2800     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 HB    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 CE1     -0.352    3.052
    2801     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 HB    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 OH      -0.364    2.864
    2802     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CE1      -0.366    3.766
    2803     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2H    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CZ     -0.369    3.069
    2804     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 CB   A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 HG1    -0.369    3.069
    2805     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2H    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 HE2    -0.370    2.370
    2806     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 N     A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 CE1     -0.371    3.696
    2807     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 2HB  A11_APL1_4.pdb #4/A LEU 81 1HD1    -0.376    2.376
    2808     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 1HG1  A11_APL1_4.pdb #4/A ALA 150 CB     -0.379    3.079
    2809     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 CB   A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 CG      -0.380    3.780
    2810     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 CB   A11_APL1_4.pdb #4/A LEU 81 CD1     -0.381    3.781
    2811     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 CG2   A11_APL1_4.pdb #4/A ALA 150 1HB    -0.381    3.081
    2812     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2HB   A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 167 CG     -0.383    3.083
    2813     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 CB   A11_APL1_4.pdb #4/A LEU 81 1HD1    -0.385    3.085
    2814     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 HB    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 99 CZ      -0.386    3.086
    2815     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 O    A11_APL1_4.pdb #4/A THR 143 CA     -0.390    3.570
    2816     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 CG1   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CZ       -0.392    3.792
    2817     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 8 CB    A11_APL1_4.pdb #4/A ALA 152 2HB    -0.392    3.092
    2818     A11_APL1_4.pdb #4/B GLY 7 N     A11_APL1_4.pdb #4/A GLN 70 1HE2    -0.393    3.033
    2819     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 1HB  A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 CG      -0.394    3.094
    2820     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 HA    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CG     -0.396    3.096
    2821     A11_APL1_4.pdb #4/B LYS 10 1HD  A11_APL1_4.pdb #4/A ASP 77 CB      -0.396    3.096
    2822     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 N     A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 CD      -0.398    3.723
    2823     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CD2    -0.399    3.099
    2824     A11_APL1_4.pdb #4/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_4.pdb #4/A ASN 66 CB      -0.400    3.100
    2825    
    2826 
    2827  
    2828 145 contacts 
    2829 
    2830 > contacts /B:1 restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    2831 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    2832    
    2833    
    2834     Allowed overlap: -0.4
    2835     H-bond overlap reduction: 0.4
    2836     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    2837     Detect intra-residue contacts: False
    2838     Detect intra-molecule contacts: False
    2839    
    2840     38 contacts
    2841                 atom1                           atom2               overlap  distance
    2842     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 HG   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE2    0.176    1.904
    2843     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 C    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 OH      0.162    3.038
    2844     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 HA   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 CD     0.108    2.592
    2845     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CA   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 OH      0.086    3.114
    2846     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 N    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 OH      0.066    2.659
    2847     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 HA   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE1    0.051    2.429
    2848     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 N    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 OH    0.036    2.689
    2849     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 O    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 OH    -0.014    2.594
    2850     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CB   A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 167 CD1   -0.092    3.492
    2851     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 N    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 HE2   -0.096    2.721
    2852     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 1H   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 OH    -0.102    2.202
    2853     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 1H   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CE2   -0.113    2.813
    2854     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 HA   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE2    -0.120    2.600
    2855     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 N    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CE2   -0.131    3.456
    2856     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 1H   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CZ    -0.132    2.832
    2857     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2HB  A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 167 CD1   -0.133    2.833
    2858     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 C    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CZ      -0.154    3.554
    2859     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 C    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 CE1     -0.172    3.572
    2860     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 HG   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 CD     -0.177    2.877
    2861     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 N    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CZ    -0.180    3.505
    2862     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 O    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 HE1   -0.197    2.677
    2863     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2H   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 OH    -0.201    2.301
    2864     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 3H   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 OH      -0.207    2.307
    2865     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CA   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE1    -0.217    3.397
    2866     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 O    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CE1   -0.224    3.404
    2867     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CA   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 CD     -0.238    3.638
    2868     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 1H   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 HE2   -0.245    2.245
    2869     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 O    A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 159 CZ    -0.250    3.430
    2870     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CB   A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 167 CG    -0.270    3.670
    2871     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 OG   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE2    -0.275    2.855
    2872     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CB   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE2    -0.277    3.457
    2873     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CA   A11_APL1_4.pdb #4/A GLU 63 OE2    -0.294    3.474
    2874     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 CA   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 OH    -0.342    3.542
    2875     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2H   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CE2   -0.346    3.046
    2876     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2H   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 7 OH      -0.350    2.450
    2877     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2H   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 CZ    -0.369    3.069
    2878     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2H   A11_APL1_4.pdb #4/A TYR 171 HE2   -0.370    2.370
    2879     A11_APL1_4.pdb #4/B SER 1 2HB  A11_APL1_4.pdb #4/A TRP 167 CG    -0.383    3.083
    2880    
    2881 
    2882  
    2883 38 contacts 
    2884 
    2885 > hide #!4 models
    2886 
    2887 > show #!5 models
    2888 
    2889 > contacts /B:1 restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    2890 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    2891    
    2892    
    2893     Allowed overlap: -0.4
    2894     H-bond overlap reduction: 0.4
    2895     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    2896     Detect intra-residue contacts: False
    2897     Detect intra-molecule contacts: False
    2898    
    2899     30 contacts
    2900                 atom1                           atom2               overlap  distance
    2901     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 HG   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE2    0.179    1.901
    2902     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 HA   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 CD     0.146    2.554
    2903     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 C    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 OH      0.142    3.058
    2904     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 HA   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE1    0.094    2.386
    2905     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 O    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 OH    0.039    2.541
    2906     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 N    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 OH      0.014    2.711
    2907     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CA   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 OH      0.011    3.189
    2908     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 N    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 OH    -0.019    2.744
    2909     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 O    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 HE1   -0.107    2.587
    2910     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 HA   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE2    -0.111    2.591
    2911     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 2H   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 OH    -0.113    2.213
    2912     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 HG   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 CD     -0.126    2.826
    2913     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 O    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CE1   -0.138    3.318
    2914     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CB   A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 167 CD1   -0.140    3.540
    2915     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 2HB  A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 167 CD1   -0.168    2.868
    2916     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 C    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 CZ      -0.175    3.575
    2917     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 O    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CZ    -0.178    3.358
    2918     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CA   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE1    -0.180    3.360
    2919     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 1H   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 OH    -0.198    2.298
    2920     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 3H   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 OH      -0.200    2.300
    2921     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CA   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 CD     -0.205    3.605
    2922     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CB   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE2    -0.206    3.386
    2923     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 OG   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE2    -0.262    2.842
    2924     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 C    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 CE1     -0.281    3.681
    2925     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CA   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE2    -0.288    3.468
    2926     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 N    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 CZ    -0.307    3.632
    2927     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 N    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 CE2   -0.338    3.663
    2928     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 1H   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 CZ    -0.343    3.043
    2929     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 N    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 HE2   -0.348    2.973
    2930     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 2H   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 CZ    -0.384    3.084
    2931    
    2932 
    2933  
    2934 30 contacts 
    2935 
    2936 > contacts /B restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    2937 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    2938    
    2939    
    2940     Allowed overlap: -0.4
    2941     H-bond overlap reduction: 0.4
    2942     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    2943     Detect intra-residue contacts: False
    2944     Detect intra-molecule contacts: False
    2945    
    2946     140 contacts
    2947                 atom1                            atom2                overlap  distance
    2948     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 O    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 84 HH      0.203    1.877
    2949     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 H    A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 77 OD1     0.183    1.897
    2950     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 O    A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 HG1    0.179    1.901
    2951     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 HG    A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE2     0.179    1.901
    2952     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 116 OD2    0.176    1.904
    2953     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 H     A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE1     0.175    1.905
    2954     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 H     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 OH      0.156    1.944
    2955     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CG2   A11_APL1_5.pdb #5/A ASN 66 1HB     0.149    2.551
    2956     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 HA    A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 CD      0.146    2.554
    2957     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 C     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 OH       0.142    3.058
    2958     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 HA    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 OH      0.124    2.376
    2959     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 HA    A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE1     0.094    2.386
    2960     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 CE2      0.093    2.607
    2961     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 H     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CZ      0.083    2.617
    2962     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CG2   A11_APL1_5.pdb #5/A ASN 66 CB      0.083    3.317
    2963     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 H    A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 77 CG      0.073    2.627
    2964     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE1     0.041    2.439
    2965     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CG     0.039    2.661
    2966     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 O     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 OH     0.039    2.541
    2967     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CA    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 OH      0.031    3.169
    2968     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 HB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CE1     0.031    2.669
    2969     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 9 OH       0.018    3.182
    2970     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 N     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 OH       0.014    2.711
    2971     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CA    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 OH       0.011    3.189
    2972     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 116 CG     0.007    2.693
    2973     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 HB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 9 HH       0.005    1.995
    2974     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 3HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE1     0.003    2.477
    2975     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CD2    -0.007    2.707
    2976     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 2HB  A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 OG1    -0.010    2.510
    2977     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 HB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 9 OH       -0.012    2.512
    2978     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 N     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 OH     -0.019    2.744
    2979     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 147 HD1    -0.026    2.726
    2980     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 C    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 84 HH      -0.040    2.740
    2981     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 NZ   A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 116 OD2    -0.058    2.763
    2982     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 OXT  A11_APL1_5.pdb #5/A THR 80 1HG2    -0.062    2.542
    2983     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 HA   A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 3HG2   -0.062    2.062
    2984     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 CE2      -0.069    3.469
    2985     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 9 OH       -0.076    3.276
    2986     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CZ      -0.085    2.785
    2987     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 C    A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 HG1    -0.101    2.801
    2988     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 H     A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 CD      -0.102    2.802
    2989     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 O     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 HE1    -0.107    2.587
    2990     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 HA    A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE2     -0.111    2.591
    2991     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 147 CD1    -0.112    3.512
    2992     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 2H    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 OH     -0.113    2.213
    2993     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A ALA 150 CB     -0.117    3.517
    2994     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CZ      -0.119    3.519
    2995     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 HG    A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 CD      -0.126    2.826
    2996     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 CD2      -0.128    2.828
    2997     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 O     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CE1    -0.138    3.318
    2998     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CB    A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 167 CD1    -0.140    3.540
    2999     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 O    A11_APL1_5.pdb #5/A LYS 146 1HD    -0.145    2.625
    3000     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_5.pdb #5/A ASN 66 1HB     -0.150    2.150
    3001     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 CE   A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 116 OD2    -0.152    3.332
    3002     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 2HB   A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 167 CD1    -0.168    2.868
    3003     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 N    A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 77 OD1     -0.173    2.878
    3004     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 C     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 CZ       -0.175    3.575
    3005     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 O     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CZ     -0.178    3.358
    3006     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CA    A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE1     -0.180    3.360
    3007     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_5.pdb #5/A ASN 66 CB      -0.181    2.881
    3008     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 OH      -0.188    3.388
    3009     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 2HD  A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 123 CE2    -0.194    2.894
    3010     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 1H    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 OH     -0.198    2.298
    3011     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 3H    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 OH       -0.200    2.300
    3012     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 O     A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 147 NE1    -0.201    2.906
    3013     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 N     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CZ      -0.201    3.526
    3014     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 N     A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE1     -0.201    2.906
    3015     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 N     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 OH      -0.205    2.930
    3016     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CA    A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 CD      -0.205    3.605
    3017     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CE2     -0.206    3.606
    3018     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CB    A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE2     -0.206    3.386
    3019     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 HA    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CE1    -0.209    2.909
    3020     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CE2     -0.212    2.912
    3021     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 CB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CE1     -0.214    3.614
    3022     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 CG2   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CD2    -0.214    3.614
    3023     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 2HB  A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 HG1    -0.221    2.221
    3024     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 1HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A LYS 146 O      -0.229    2.709
    3025     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 O    A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 HA     -0.230    2.710
    3026     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CG2   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE1     -0.232    3.412
    3027     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 9 OH       -0.232    2.732
    3028     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 O    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 84 OH      -0.232    2.812
    3029     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 O     A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 147 HE1    -0.234    2.314
    3030     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 CB   A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 OG1    -0.238    3.438
    3031     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 HA    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CD1    -0.255    2.955
    3032     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE1     -0.259    3.439
    3033     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 9 HH       -0.259    2.959
    3034     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 O     A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 147 CD1    -0.260    3.440
    3035     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 OG    A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE2     -0.262    2.842
    3036     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 3HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 147 CD1    -0.263    2.963
    3037     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A MET 45 CE      -0.266    3.666
    3038     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 3HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 147 HD1    -0.272    2.272
    3039     A11_APL1_5.pdb #5/B GLY 9 C     A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 147 HE1    -0.273    2.973
    3040     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 O    A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 OG1    -0.280    2.860
    3041     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 C     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 CE1      -0.281    3.681
    3042     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 N    A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 77 CG      -0.287    3.612
    3043     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 CA    A11_APL1_5.pdb #5/A GLU 63 OE2     -0.288    3.468
    3044     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 N     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 CZ       -0.292    3.617
    3045     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_5.pdb #5/A ASN 66 CB      -0.295    2.995
    3046     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 CB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CZ      -0.298    3.698
    3047     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 2HZ  A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 147 HZ2    -0.304    2.304
    3048     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 N     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 CZ     -0.307    3.632
    3049     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 1HG2  A11_APL1_5.pdb #5/A GLN 156 OE1    -0.308    2.788
    3050     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 NZ   A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 116 CG     -0.311    3.636
    3051     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 CA    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CE1    -0.312    3.712
    3052     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 HB    A11_APL1_5.pdb #5/A ALA 150 CB     -0.314    3.014
    3053     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A MET 45 CE      -0.315    3.015
    3054     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 2HG  A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 77 OD2     -0.317    2.797
    3055     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 HB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 OH      -0.320    2.820
    3056     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 O    A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 CA     -0.322    3.502
    3057     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 CG   A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 77 CG      -0.325    3.725
    3058     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 H     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CE1     -0.326    3.026
    3059     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 CG2   A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CG     -0.331    3.731
    3060     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 1HD  A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 77 2HB     -0.337    2.337
    3061     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 N     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 CE2    -0.338    3.663
    3062     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 CA   A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 3HG2   -0.339    3.039
    3063     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 1H    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 CZ     -0.343    3.043
    3064     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 2HG  A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 77 CG      -0.343    3.043
    3065     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A MET 45 3HE     -0.347    3.047
    3066     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 N     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 HE2    -0.348    2.973
    3067     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 HA   A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 CG2    -0.349    3.049
    3068     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 OH      -0.350    2.850
    3069     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 1HG  A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 CG2    -0.350    3.050
    3070     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 HB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CZ      -0.354    3.054
    3071     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 HB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CD1     -0.354    3.054
    3072     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 CG1   A11_APL1_5.pdb #5/A ALA 150 3HB    -0.356    3.056
    3073     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 N     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 CE1     -0.356    3.681
    3074     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 C     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 OH      -0.360    3.560
    3075     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 8 CB    A11_APL1_5.pdb #5/A ALA 150 CB     -0.360    3.760
    3076     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 1HG  A11_APL1_5.pdb #5/A TRP 147 CZ2    -0.360    3.060
    3077     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 C    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 84 OH      -0.364    3.564
    3078     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 CB   A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 HG1    -0.364    3.064
    3079     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CB     -0.371    3.071
    3080     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 HA    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 7 CE1      -0.378    3.078
    3081     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 CA   A11_APL1_5.pdb #5/A THR 143 HG1    -0.378    3.078
    3082     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 2 C     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CE1    -0.384    3.784
    3083     A11_APL1_5.pdb #5/B SER 1 2H    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 171 CZ     -0.384    3.084
    3084     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 1HB  A11_APL1_5.pdb #5/A ASP 77 CG      -0.386    3.086
    3085     A11_APL1_5.pdb #5/B LYS 10 CD   A11_APL1_5.pdb #5/A LEU 81 1HD2    -0.390    3.090
    3086     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 H     A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 99 HH      -0.391    2.391
    3087     A11_APL1_5.pdb #5/B VAL 3 HB    A11_APL1_5.pdb #5/A TYR 159 CE2    -0.397    3.097
    3088    
    3089 
    3090  
    3091 140 contacts 
    3092 
    3093 > hide #!5 models
    3094 
    3095 > show #!6 models
    3096 
    3097 > contacts /B restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    3098 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    3099    
    3100    
    3101     Allowed overlap: -0.4
    3102     H-bond overlap reduction: 0.4
    3103     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    3104     Detect intra-residue contacts: False
    3105     Detect intra-molecule contacts: False
    3106    
    3107     143 contacts
    3108                 atom1                            atom2                overlap  distance
    3109     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 H     A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE1     0.255    1.825
    3110     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 O    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 84 HH      0.244    1.836
    3111     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 7 H     A11_APL1_6.pdb #6/A GLN 155 OE1    0.203    1.877
    3112     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 H    A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 OD1     0.200    1.880
    3113     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 H    A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 CG      0.199    2.501
    3114     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 O    A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 HG1    0.194    1.886
    3115     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 HG    A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE2     0.183    1.897
    3116     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 4 H     A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CZ     0.179    2.521
    3117     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 8 O     A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 147 HE1    0.154    1.926
    3118     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 7 H     A11_APL1_6.pdb #6/A GLN 155 CD     0.135    2.565
    3119     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 1HG  A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 CG      0.125    2.575
    3120     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 O     A11_APL1_6.pdb #6/A ASN 66 2HD2    0.113    1.967
    3121     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 HA    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 99 OH      0.087    2.413
    3122     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 H     A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 CD      0.084    2.616
    3123     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 2HZ  A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 147 HZ2    0.071    1.929
    3124     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 3H    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 HE1      0.062    1.938
    3125     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 9 HH       0.056    1.944
    3126     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 C    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 84 HH      0.052    2.648
    3127     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 3HG1  A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 9 OH       0.051    2.449
    3128     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 116 OD2    0.039    2.041
    3129     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 CA    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 OH       0.037    3.163
    3130     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CD   A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 1HG2   0.020    2.680
    3131     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE1     0.010    2.470
    3132     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 8 CG2   A11_APL1_6.pdb #6/A ALA 150 CB     -0.007    3.407
    3133     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CD   A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 CG2    -0.008    3.408
    3134     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 1HD  A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 123 HE2    -0.020    2.020
    3135     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 N     A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 OH       -0.036    2.761
    3136     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 OXT  A11_APL1_6.pdb #6/A THR 80 1HG2    -0.044    2.524
    3137     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CB   A11_APL1_6.pdb #6/A LEU 81 CD1     -0.060    3.460
    3138     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_6.pdb #6/A MET 45 CE      -0.062    2.762
    3139     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 3H    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 CE1      -0.073    2.773
    3140     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_6.pdb #6/A VAL 67 N       -0.076    2.701
    3141     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 CG1   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CG     -0.079    3.479
    3142     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 O    A11_APL1_6.pdb #6/A LYS 146 1HD    -0.081    2.561
    3143     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 2HZ  A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 147 CZ2    -0.085    2.785
    3144     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 9 CA    A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 OD1     -0.087    3.267
    3145     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_6.pdb #6/A VAL 67 CA      -0.087    2.787
    3146     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 CB    A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 167 CD1    -0.089    3.489
    3147     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 C    A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 HG1    -0.090    2.790
    3148     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 NZ   A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 116 OD2    -0.093    2.798
    3149     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CG   A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 CG      -0.093    3.493
    3150     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 7 N     A11_APL1_6.pdb #6/A GLN 155 CD     -0.097    3.437
    3151     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 HB    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CE2    -0.099    2.799
    3152     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 HB    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CD2    -0.099    2.799
    3153     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CG2   A11_APL1_6.pdb #6/A MET 45 3HE     -0.119    2.819
    3154     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CD1    -0.123    2.823
    3155     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 N     A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE1     -0.123    2.828
    3156     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_6.pdb #6/A MET 45 3HE     -0.123    2.123
    3157     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 1HD  A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 1HG2   -0.127    2.127
    3158     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 7 N     A11_APL1_6.pdb #6/A GLN 155 OE1    -0.127    2.847
    3159     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 8 O     A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 147 NE1    -0.128    2.833
    3160     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 1HD  A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 123 CE2    -0.128    2.828
    3161     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 9 OH       -0.132    2.632
    3162     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 8 1HG2  A11_APL1_6.pdb #6/A ALA 150 CB     -0.133    2.833
    3163     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CG2   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 CE2      -0.137    3.537
    3164     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CG2   A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE1     -0.140    3.320
    3165     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 HA    A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE1     -0.143    2.623
    3166     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 1HD  A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 CG2    -0.144    2.844
    3167     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 N    A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 OD1     -0.149    2.854
    3168     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 1HD  A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 OG1    -0.151    2.651
    3169     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 2HB  A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 OG1    -0.156    2.656
    3170     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 9 1HA   A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 OD1     -0.159    2.639
    3171     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 4 N     A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CZ     -0.161    3.486
    3172     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 HG    A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 CD      -0.164    2.864
    3173     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 O    A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 HA     -0.167    2.647
    3174     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 1HG  A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 OD2     -0.175    2.655
    3175     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CB   A11_APL1_6.pdb #6/A LEU 81 1HD1    -0.177    2.877
    3176     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 N    A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 CG      -0.178    3.503
    3177     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 O    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 84 OH      -0.178    2.758
    3178     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CE   A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 116 OD2    -0.181    3.361
    3179     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 2H    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 OH       -0.200    2.300
    3180     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 CG1   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CD1    -0.203    3.603
    3181     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 O     A11_APL1_6.pdb #6/A ASN 66 ND2     -0.206    2.911
    3182     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 2HB  A11_APL1_6.pdb #6/A LEU 81 1HD1    -0.211    2.211
    3183     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 C    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 84 OH      -0.213    3.413
    3184     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 C     A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 OH       -0.213    3.413
    3185     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 4 H     A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 OH     -0.214    2.314
    3186     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 116 CG     -0.214    2.914
    3187     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CG2   A11_APL1_6.pdb #6/A MET 45 CE      -0.215    3.615
    3188     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 3H    A11_APL1_6.pdb #6/A MET 5 CE       -0.219    2.919
    3189     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CG1   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 9 OH       -0.220    3.420
    3190     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 N     A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 CD      -0.221    3.546
    3191     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 N     A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 HE1      -0.222    2.847
    3192     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 N     A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 CE1      -0.225    3.550
    3193     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 HA    A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 CD      -0.232    2.932
    3194     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CG1   A11_APL1_6.pdb #6/A ASN 66 CB      -0.239    3.639
    3195     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 CE2      -0.245    2.945
    3196     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 N     A11_APL1_6.pdb #6/A MET 5 CE       -0.246    3.571
    3197     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 N     A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 CZ       -0.248    3.573
    3198     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_6.pdb #6/A ASN 66 CB      -0.252    2.952
    3199     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 O    A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 CA     -0.257    3.437
    3200     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 7 H     A11_APL1_6.pdb #6/A GLN 155 NE2    -0.259    2.884
    3201     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 HA   A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 3HG2   -0.261    2.261
    3202     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 2HB  A11_APL1_6.pdb #6/A LEU 81 CD1     -0.264    2.964
    3203     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 O    A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 OG1    -0.267    2.847
    3204     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CG2   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 9 HH       -0.270    2.970
    3205     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 8 CG2   A11_APL1_6.pdb #6/A ALA 150 1HB    -0.273    2.973
    3206     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 NZ   A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 147 HZ2    -0.275    2.900
    3207     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 8 1HG2  A11_APL1_6.pdb #6/A ALA 150 2HB    -0.275    2.275
    3208     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 OG    A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE2     -0.276    2.856
    3209     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 CG1   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CB     -0.290    3.690
    3210     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CB    A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE1     -0.293    3.473
    3211     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 2HB  A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 HG1    -0.299    2.299
    3212     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CA    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 99 OH      -0.302    3.502
    3213     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 2HD  A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 CG2    -0.304    3.004
    3214     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 HB    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CZ     -0.306    3.006
    3215     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CG     -0.310    3.010
    3216     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 C    A11_APL1_6.pdb #6/A THR 80 1HG2    -0.313    3.013
    3217     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 CG1   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 2HB    -0.314    3.014
    3218     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 2HB   A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 167 CD1    -0.318    3.018
    3219     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 HB    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CG     -0.321    3.021
    3220     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CG   A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 2HB     -0.328    3.028
    3221     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 8 O     A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 147 CD1    -0.330    3.510
    3222     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 9 C     A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 OD1     -0.331    3.511
    3223     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CD   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 123 HE2    -0.332    3.032
    3224     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_6.pdb #6/A VAL 67 HB      -0.333    2.333
    3225     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 8 3HG2  A11_APL1_6.pdb #6/A ALA 150 CB     -0.336    3.036
    3226     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CB   A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 OG1    -0.336    3.536
    3227     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CD   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 123 CE2    -0.340    3.740
    3228     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CA   A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 HG1    -0.341    3.041
    3229     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_6.pdb #6/A ASN 66 2HB     -0.343    2.343
    3230     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 CB    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CG     -0.343    3.743
    3231     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 4 H     A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CE1    -0.346    3.046
    3232     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 NZ   A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 147 CZ2    -0.347    3.672
    3233     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CG1   A11_APL1_6.pdb #6/A VAL 67 N       -0.349    3.674
    3234     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 CG2   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 9 OH       -0.351    3.551
    3235     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 7 N     A11_APL1_6.pdb #6/A GLN 155 NE2    -0.354    3.619
    3236     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 CB    A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 167 CG     -0.355    3.755
    3237     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CG   A11_APL1_6.pdb #6/A ASP 77 CB      -0.361    3.761
    3238     A11_APL1_6.pdb #6/B GLY 4 CA    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 OH     -0.364    3.564
    3239     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 3 CB    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 159 CD2    -0.366    3.766
    3240     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 CA    A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE1     -0.367    3.547
    3241     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 2HD  A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 147 CZ2    -0.370    3.070
    3242     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 O    A11_APL1_6.pdb #6/A LYS 146 CD     -0.382    3.562
    3243     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 1HB   A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 167 CG     -0.384    3.084
    3244     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 C     A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 CZ       -0.384    3.784
    3245     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 2H    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 171 HE2    -0.386    2.386
    3246     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 O    A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 CB     -0.391    3.571
    3247     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 C    A11_APL1_6.pdb #6/A LYS 146 1HD    -0.393    3.093
    3248     A11_APL1_6.pdb #6/B VAL 2 C     A11_APL1_6.pdb #6/A ASN 66 2HD2    -0.395    3.095
    3249     A11_APL1_6.pdb #6/B LYS 10 CD   A11_APL1_6.pdb #6/A THR 143 OG1    -0.396    3.596
    3250     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 HA    A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE2     -0.397    2.877
    3251     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 1H    A11_APL1_6.pdb #6/A MET 5 CE       -0.399    3.099
    3252    
    3253 
    3254  
    3255 143 contacts 
    3256 
    3257 > contacts /B:1 restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    3258 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    3259    
    3260    
    3261     Allowed overlap: -0.4
    3262     H-bond overlap reduction: 0.4
    3263     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    3264     Detect intra-residue contacts: False
    3265     Detect intra-molecule contacts: False
    3266    
    3267     25 contacts
    3268                 atom1                           atom2               overlap  distance
    3269     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 HG   A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE2    0.183    1.897
    3270     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 3H   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 HE1     0.062    1.938
    3271     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 CA   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 OH      0.037    3.163
    3272     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 N    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 OH      -0.036    2.761
    3273     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 3H   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 CE1     -0.073    2.773
    3274     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 CB   A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 167 CD1   -0.089    3.489
    3275     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 HA   A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE1    -0.143    2.623
    3276     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 HG   A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 CD     -0.164    2.864
    3277     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 2H   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 OH      -0.200    2.300
    3278     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 C    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 OH      -0.213    3.413
    3279     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 3H   A11_APL1_6.pdb #6/A MET 5 CE      -0.219    2.919
    3280     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 N    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 HE1     -0.222    2.847
    3281     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 N    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 CE1     -0.225    3.550
    3282     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 HA   A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 CD     -0.232    2.932
    3283     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 N    A11_APL1_6.pdb #6/A MET 5 CE      -0.246    3.571
    3284     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 N    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 CZ      -0.248    3.573
    3285     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 OG   A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE2    -0.276    2.856
    3286     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 2HB  A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 167 CD1   -0.318    3.018
    3287     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 CB   A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 167 CG    -0.355    3.755
    3288     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 CA   A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE1    -0.367    3.547
    3289     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 1HB  A11_APL1_6.pdb #6/A TRP 167 CG    -0.384    3.084
    3290     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 C    A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 7 CZ      -0.384    3.784
    3291     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 2H   A11_APL1_6.pdb #6/A TYR 171 HE2   -0.386    2.386
    3292     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 HA   A11_APL1_6.pdb #6/A GLU 63 OE2    -0.397    2.877
    3293     A11_APL1_6.pdb #6/B SER 1 1H   A11_APL1_6.pdb #6/A MET 5 CE      -0.399    3.099
    3294    
    3295 
    3296  
    3297 25 contacts 
    3298 
    3299 > hide #!6 models
    3300 
    3301 > show #!7 models
    3302 
    3303 > contacts /B:1 restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    3304 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    3305    
    3306    
    3307     Allowed overlap: -0.4
    3308     H-bond overlap reduction: 0.4
    3309     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    3310     Detect intra-residue contacts: False
    3311     Detect intra-molecule contacts: False
    3312    
    3313     39 contacts
    3314                 atom1                           atom2               overlap  distance
    3315     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 O    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 HH    0.227    1.853
    3316     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 HG   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE2    0.179    1.901
    3317     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 HA   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 CD     0.106    2.594
    3318     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 C    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 OH      0.093    3.107
    3319     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 HA   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE1    0.075    2.405
    3320     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CA   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 OH      0.010    3.190
    3321     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 N    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 OH    -0.008    2.733
    3322     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 N    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 OH      -0.070    2.795
    3323     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CB   A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 167 CD1   -0.083    3.483
    3324     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 N    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CE2   -0.105    3.430
    3325     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2HB  A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 167 CD1   -0.110    2.810
    3326     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 N    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 HE2   -0.116    2.741
    3327     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 1H   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CZ    -0.127    2.827
    3328     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 1H   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CE2   -0.131    2.831
    3329     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 HA   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE2    -0.145    2.625
    3330     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 C    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CE1     -0.148    3.548
    3331     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 HG   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 CD     -0.155    2.855
    3332     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 N    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CZ    -0.157    3.482
    3333     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CA   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE1    -0.189    3.369
    3334     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 1H   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 OH    -0.200    2.300
    3335     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2H   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 OH    -0.205    2.305
    3336     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CB   A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 167 CG    -0.209    3.609
    3337     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 C    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CZ      -0.210    3.610
    3338     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 O    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 OH    -0.227    2.807
    3339     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CA   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 CD     -0.233    3.633
    3340     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 O    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 HE1   -0.244    2.724
    3341     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2H   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 HE2   -0.249    2.249
    3342     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 C    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 HH    -0.259    2.959
    3343     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2H   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CE2   -0.260    2.960
    3344     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 OG   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE2    -0.275    2.855
    3345     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2HB  A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 167 CG    -0.292    2.992
    3346     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CB   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE2    -0.302    3.482
    3347     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CA   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE2    -0.307    3.487
    3348     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 O    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CE1   -0.327    3.507
    3349     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2H   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CZ    -0.333    3.033
    3350     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 C    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 HE1     -0.344    3.044
    3351     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CA   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 OH    -0.349    3.549
    3352     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 1H   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 HE2   -0.368    2.368
    3353     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 3H   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 OH      -0.383    2.483
    3354    
    3355 
    3356  
    3357 39 contacts 
    3358 
    3359 > contacts /B restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    3360 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    3361    
    3362    
    3363     Allowed overlap: -0.4
    3364     H-bond overlap reduction: 0.4
    3365     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    3366     Detect intra-residue contacts: False
    3367     Detect intra-molecule contacts: False
    3368    
    3369     162 contacts
    3370                 atom1                            atom2                overlap  distance
    3371     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 OXT  A11_APL1_7.pdb #7/A THR 80 1HG2    0.263    2.217
    3372     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 O     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 HH     0.227    1.853
    3373     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 H     A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE1     0.220    1.860
    3374     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 HG    A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE2     0.179    1.901
    3375     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 O    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 84 HH      0.160    1.920
    3376     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CE2      0.156    2.544
    3377     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 116 OD2    0.142    1.938
    3378     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 C    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 84 HH      0.132    2.568
    3379     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 O     A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 HE1    0.111    1.969
    3380     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 HA    A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 CD      0.106    2.594
    3381     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 H     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 OH      0.104    1.996
    3382     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 C     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 OH       0.093    3.107
    3383     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE1     0.092    2.388
    3384     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CG2   A11_APL1_7.pdb #7/A ASN 66 1HB     0.084    2.616
    3385     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 OXT  A11_APL1_7.pdb #7/A LYS 146 2HZ    0.083    1.997
    3386     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 HA    A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE1     0.075    2.405
    3387     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 H    A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 77 OD1     0.058    2.022
    3388     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 H     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 CZ      0.045    2.655
    3389     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 HA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CE1    0.045    2.655
    3390     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 3HG1  A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE1     0.039    2.441
    3391     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 2HB  A11_APL1_7.pdb #7/A THR 143 OG1    0.024    2.476
    3392     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 OH       0.010    3.190
    3393     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CG1   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CE2      0.009    3.391
    3394     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 O    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 84 HE2     0.005    2.475
    3395     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 OH     -0.008    2.733
    3396     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 H     A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 CD      -0.018    2.718
    3397     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 CG1   A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 HD1    -0.021    2.721
    3398     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 C    A11_APL1_7.pdb #7/A LYS 146 1HD    -0.044    2.744
    3399     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 3HZ  A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 CZ2    -0.048    2.748
    3400     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CG2   A11_APL1_7.pdb #7/A ASN 66 CB      -0.057    3.457
    3401     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 2HD  A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 123 CE2    -0.058    2.758
    3402     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_7.pdb #7/A ASN 66 1HB     -0.060    2.060
    3403     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 HA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 OH      -0.062    2.562
    3404     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 OH       -0.070    2.795
    3405     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 HB    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 CE1     -0.073    2.773
    3406     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 HA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CD1    -0.078    2.778
    3407     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CB    A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 167 CD1    -0.083    3.483
    3408     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 CG2   A11_APL1_7.pdb #7/A ALA 150 CB     -0.085    3.485
    3409     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 2HG  A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 77 CG      -0.090    2.790
    3410     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 1HG2  A11_APL1_7.pdb #7/A ALA 150 CB     -0.094    2.794
    3411     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 HB    A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 CD1    -0.096    2.796
    3412     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CE2    -0.105    3.430
    3413     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 O    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 84 CE2     -0.107    3.287
    3414     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 CG1   A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 CD1    -0.107    3.507
    3415     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 C    A11_APL1_7.pdb #7/A LYS 146 2HZ    -0.109    2.809
    3416     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 O    A11_APL1_7.pdb #7/A LYS 146 1HD    -0.109    2.589
    3417     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2HB   A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 167 CD1    -0.110    2.810
    3418     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 C    A11_APL1_7.pdb #7/A THR 80 1HG2    -0.114    2.814
    3419     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CD2    -0.114    2.814
    3420     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 OXT  A11_APL1_7.pdb #7/A THR 80 CG2     -0.116    3.296
    3421     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 HE2    -0.116    2.741
    3422     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 3HZ  A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 HZ2    -0.118    2.118
    3423     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CZ       -0.126    3.451
    3424     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 1H    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CZ     -0.127    2.827
    3425     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 1H    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CE2    -0.131    2.831
    3426     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 OH      -0.132    3.332
    3427     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 CB   A11_APL1_7.pdb #7/A THR 143 OG1    -0.135    3.335
    3428     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 HA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CE1      -0.136    2.836
    3429     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 116 CG     -0.139    2.839
    3430     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 HA    A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE2     -0.145    2.625
    3431     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CD2      -0.147    2.847
    3432     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 C     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CE1      -0.148    3.548
    3433     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 HA   A11_APL1_7.pdb #7/A THR 143 3HG2   -0.151    2.151
    3434     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 HB    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 9 OH       -0.153    2.653
    3435     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 HG    A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 CD      -0.155    2.855
    3436     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CZ     -0.157    3.482
    3437     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 N     A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE1     -0.164    2.869
    3438     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 CA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CE1    -0.175    3.575
    3439     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CG2   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE1     -0.180    3.360
    3440     A11_APL1_7.pdb #7/B GLY 4 O     A11_APL1_7.pdb #7/A GLN 70 NE2     -0.182    2.887
    3441     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 CG   A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 77 CG      -0.183    3.583
    3442     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 NZ   A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 116 OD2    -0.184    2.889
    3443     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 O     A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 NE1    -0.187    2.892
    3444     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CA    A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE1     -0.189    3.369
    3445     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_7.pdb #7/A ASN 66 CB      -0.196    2.896
    3446     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 1H    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 OH     -0.200    2.300
    3447     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CG     -0.200    2.900
    3448     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2H    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 OH     -0.205    2.305
    3449     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CB    A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 167 CG     -0.209    3.609
    3450     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 C    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 84 OH      -0.209    3.409
    3451     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 CB    A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 CD1    -0.210    3.610
    3452     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 C     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CZ       -0.210    3.610
    3453     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 O    A11_APL1_7.pdb #7/A THR 143 HA     -0.214    2.694
    3454     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 1HG2  A11_APL1_7.pdb #7/A ALA 150 3HB    -0.214    2.214
    3455     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CG1   A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE1     -0.216    3.396
    3456     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 CD   A11_APL1_7.pdb #7/A LEU 81 1HD1    -0.221    2.921
    3457     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 CA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CZ     -0.221    3.621
    3458     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 H     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 CE1     -0.222    2.922
    3459     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 OXT  A11_APL1_7.pdb #7/A LYS 146 NZ     -0.223    2.928
    3460     A11_APL1_7.pdb #7/B GLY 9 O     A11_APL1_7.pdb #7/A LYS 146 CD     -0.224    3.404
    3461     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 1HD  A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 77 2HB     -0.226    2.226
    3462     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 O     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 OH     -0.227    2.807
    3463     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CA    A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 CD      -0.233    3.633
    3464     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 1HG  A11_APL1_7.pdb #7/A THR 143 CG2    -0.243    2.943
    3465     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 O     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 HE1    -0.244    2.724
    3466     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 HB    A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 NE1    -0.246    2.871
    3467     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 NZ   A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 CZ2    -0.246    3.571
    3468     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 CD   A11_APL1_7.pdb #7/A LEU 81 CD1     -0.247    3.647
    3469     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 OH      -0.248    2.748
    3470     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2H    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 HE2    -0.249    2.249
    3471     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 HA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CZ     -0.252    2.952
    3472     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 CD   A11_APL1_7.pdb #7/A LEU 81 1HD2    -0.256    2.956
    3473     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 C     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 HH     -0.259    2.959
    3474     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2H    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CE2    -0.260    2.960
    3475     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 CD      -0.264    2.964
    3476     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CG1   A11_APL1_7.pdb #7/A MET 45 CE      -0.268    3.668
    3477     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 CZ      -0.270    3.595
    3478     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CE1      -0.270    3.670
    3479     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 CG1   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 CZ      -0.275    3.675
    3480     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 OG    A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE2     -0.275    2.855
    3481     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 OH      -0.276    3.001
    3482     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CG1   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CZ       -0.278    3.678
    3483     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CZ       -0.279    3.679
    3484     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 CD   A11_APL1_7.pdb #7/A LEU 81 CD2     -0.279    3.679
    3485     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 O    A11_APL1_7.pdb #7/A THR 143 CA     -0.282    3.462
    3486     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 O    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 84 OH      -0.283    2.863
    3487     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 CG1   A11_APL1_7.pdb #7/A ALA 150 CB     -0.285    3.685
    3488     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 H    A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 77 CG      -0.291    2.991
    3489     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2HB   A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 167 CG     -0.292    2.992
    3490     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 2HD  A11_APL1_7.pdb #7/A LEU 81 1HD1    -0.292    2.292
    3491     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 1HG2  A11_APL1_7.pdb #7/A ALA 152 2HB    -0.293    2.293
    3492     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 CZ      -0.294    2.994
    3493     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 1HG1  A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 HD1    -0.299    2.299
    3494     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CB    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 OH      -0.299    3.499
    3495     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CB    A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE2     -0.302    3.482
    3496     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 C    A11_APL1_7.pdb #7/A LYS 146 CD     -0.304    3.704
    3497     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CZ     -0.306    3.631
    3498     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CA    A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 OE2     -0.307    3.487
    3499     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 CE1     -0.318    3.643
    3500     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 N    A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 77 OD1     -0.321    3.026
    3501     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 O    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 84 CZ      -0.326    3.506
    3502     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 O     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CE1    -0.327    3.507
    3503     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 CB    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 CE1     -0.327    3.727
    3504     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 HB    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 CZ      -0.330    3.030
    3505     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 2H    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 CZ     -0.333    3.033
    3506     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 CG2   A11_APL1_7.pdb #7/A ALA 150 1HB    -0.336    3.036
    3507     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 1HG1  A11_APL1_7.pdb #7/A ALA 150 CB     -0.336    3.036
    3508     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CB    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 9 OH       -0.338    3.538
    3509     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 N     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CE1      -0.340    3.665
    3510     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_7.pdb #7/A MET 45 CE      -0.343    3.043
    3511     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 CB   A11_APL1_7.pdb #7/A LEU 81 CD1     -0.344    3.744
    3512     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 CZ       -0.344    3.044
    3513     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 C     A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 HE1      -0.344    3.044
    3514     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 CB    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 CZ      -0.346    3.746
    3515     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CG1   A11_APL1_7.pdb #7/A MET 45 3HE     -0.346    3.046
    3516     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 2HG  A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 77 OD2     -0.349    2.829
    3517     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 CA    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 OH     -0.349    3.549
    3518     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 2HG  A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 77 OD1     -0.351    2.831
    3519     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 N     A11_APL1_7.pdb #7/A GLU 63 CD      -0.354    3.679
    3520     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 1H    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 171 HE2    -0.368    2.368
    3521     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 CD   A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 77 CG      -0.373    3.773
    3522     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 C     A11_APL1_7.pdb #7/A TRP 147 HE1    -0.378    3.078
    3523     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 3 CG2   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 159 CD2    -0.380    3.780
    3524     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 CD   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 123 CE2    -0.383    3.783
    3525     A11_APL1_7.pdb #7/B SER 1 3H    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 7 OH       -0.383    2.483
    3526     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 CG1   A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 9 OH       -0.385    3.585
    3527     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 O    A11_APL1_7.pdb #7/A THR 143 OG1    -0.387    2.967
    3528     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 OXT  A11_APL1_7.pdb #7/A LYS 146 CD     -0.390    3.570
    3529     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 CB   A11_APL1_7.pdb #7/A ASP 77 OD1     -0.397    3.577
    3530     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 8 CG2   A11_APL1_7.pdb #7/A ALA 150 3HB    -0.397    3.097
    3531     A11_APL1_7.pdb #7/B VAL 2 HB    A11_APL1_7.pdb #7/A TYR 99 OH      -0.397    2.897
    3532     A11_APL1_7.pdb #7/B LYS 10 OXT  A11_APL1_7.pdb #7/A LYS 146 1HD    -0.400    2.880
    3533    
    3534 
    3535  
    3536 162 contacts 
    3537 
    3538 > hide #!7 models
    3539 
    3540 > hide #11 models
    3541 
    3542 > show #!8 models
    3543 
    3544 > contacts /B restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    3545 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    3546    
    3547    
    3548     Allowed overlap: -0.4
    3549     H-bond overlap reduction: 0.4
    3550     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    3551     Detect intra-residue contacts: False
    3552     Detect intra-molecule contacts: False
    3553    
    3554     136 contacts
    3555                 atom1                            atom2                overlap  distance
    3556     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CG2   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 9 OH       0.385    2.815
    3557     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 H     A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE1     0.271    1.809
    3558     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 O     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 HH     0.230    1.850
    3559     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 HG    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2     0.197    1.883
    3560     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 H    A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 77 OD1     0.187    1.893
    3561     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 O    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 84 HH      0.186    1.894
    3562     A11_APL1_8.pdb #8/B GLY 9 O     A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 147 HE1    0.185    1.895
    3563     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 O    A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 HG1    0.178    1.902
    3564     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 116 OD2    0.176    1.904
    3565     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 O     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 HE1    0.138    2.342
    3566     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 H     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 OH      0.115    1.985
    3567     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 2HG2  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 9 OH       0.112    2.388
    3568     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CB    A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CD1    0.085    3.315
    3569     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 H     A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CD      0.085    2.615
    3570     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 9 OH       0.067    2.433
    3571     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CD      0.063    2.637
    3572     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 1HZ  A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 116 CG     0.059    2.641
    3573     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 HA    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 OH      0.043    2.457
    3574     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 1HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 O       0.036    2.444
    3575     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 H    A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 77 CG      0.022    2.678
    3576     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 O     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 CE1    0.019    3.161
    3577     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 CZ      0.017    2.683
    3578     A11_APL1_8.pdb #8/B GLY 9 C     A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 147 HE1    -0.004    2.704
    3579     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 OXT  A11_APL1_8.pdb #8/A THR 80 1HG2    -0.018    2.498
    3580     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 2HB  A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 OG1    -0.026    2.526
    3581     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 HA    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2     -0.036    2.516
    3582     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 3HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A ASN 66 1HB     -0.039    2.039
    3583     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE1     -0.041    2.521
    3584     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 HA    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CD      -0.043    2.743
    3585     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 C     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 HH     -0.044    2.744
    3586     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 C    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 84 HH      -0.048    2.748
    3587     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 NZ   A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 116 OD2    -0.052    2.757
    3588     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 OH      -0.054    2.554
    3589     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 N     A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE1     -0.060    2.765
    3590     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 HA      -0.066    2.766
    3591     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 2HB   A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CD1    -0.083    2.783
    3592     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 N     A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CD      -0.090    3.415
    3593     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 C    A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 HG1    -0.095    2.795
    3594     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 HA   A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 3HG2   -0.097    2.097
    3595     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 CZ      -0.099    3.499
    3596     A11_APL1_8.pdb #8/B GLY 9 O     A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 147 NE1    -0.100    2.805
    3597     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A ASN 66 1HB     -0.101    2.801
    3598     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 HA    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE1     -0.103    2.583
    3599     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 HA      -0.108    2.108
    3600     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 N     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 7 CZ       -0.122    3.447
    3601     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CA    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2     -0.124    3.304
    3602     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 O       -0.127    3.307
    3603     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 HB    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 CZ     -0.132    2.832
    3604     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 CE2     -0.141    2.841
    3605     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 2HD  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 123 CE2    -0.143    2.843
    3606     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE1     -0.153    3.333
    3607     A11_APL1_8.pdb #8/B GLY 7 N     A11_APL1_8.pdb #8/A GLN 155 1HG    -0.167    2.807
    3608     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 N    A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 77 OD1     -0.171    2.876
    3609     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 CE   A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 116 OD2    -0.176    3.356
    3610     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 O    A11_APL1_8.pdb #8/A LYS 146 1HD    -0.186    2.666
    3611     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CB    A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 NE1    -0.186    3.511
    3612     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 1HB   A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CD1    -0.189    2.889
    3613     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 CD1    -0.195    2.895
    3614     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 2H    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 171 OH     -0.201    2.301
    3615     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 2HB  A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 HG1    -0.202    2.202
    3616     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 O     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 OH     -0.202    2.782
    3617     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 1H    A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CB     -0.203    2.903
    3618     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 N    A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 77 CG      -0.211    3.536
    3619     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CA    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 7 CZ       -0.215    3.615
    3620     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 O     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 CZ     -0.216    3.396
    3621     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CB    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE1     -0.232    3.412
    3622     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 CE2     -0.233    3.633
    3623     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 3HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A ASN 66 CB      -0.235    2.935
    3624     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CA      -0.237    3.637
    3625     A11_APL1_8.pdb #8/B GLY 9 O     A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 147 CD1    -0.247    3.427
    3626     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 OG    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2     -0.250    2.830
    3627     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 O    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 84 OH      -0.252    2.832
    3628     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 O    A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 HA     -0.259    2.739
    3629     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CA    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 OH      -0.260    3.460
    3630     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CD      -0.261    3.661
    3631     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 CB   A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 OG1    -0.261    3.461
    3632     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 2HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 9 HH       -0.263    2.263
    3633     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 N     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 OH      -0.265    2.990
    3634     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 2HG  A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 77 OD2     -0.267    2.747
    3635     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 NZ   A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 116 CG     -0.269    3.594
    3636     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2     -0.271    2.751
    3637     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 8 3HG2  A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 147 CD1    -0.271    2.971
    3638     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CB    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2     -0.276    3.456
    3639     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 C     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 7 OH       -0.277    3.477
    3640     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 8 CG2   A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 147 CD1    -0.278    3.678
    3641     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 7 CD2      -0.279    2.979
    3642     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 8 1HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A ALA 150 CB     -0.279    2.979
    3643     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 8 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A ALA 150 CB     -0.281    3.681
    3644     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 O    A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 OG1    -0.282    2.862
    3645     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 HG    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CD      -0.284    2.984
    3646     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 2H    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 171 CE2    -0.286    2.986
    3647     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 N     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 7 OH       -0.287    3.012
    3648     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 HH      -0.290    2.290
    3649     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 1HB   A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 NE1    -0.290    2.915
    3650     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CB    A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CG     -0.292    3.692
    3651     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 HB    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 CE2    -0.299    2.999
    3652     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 N     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 171 OH     -0.300    3.025
    3653     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 2H    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 171 HE2    -0.302    2.302
    3654     A11_APL1_8.pdb #8/B GLY 4 CA    A11_APL1_8.pdb #8/A ASN 66 2HB     -0.306    3.006
    3655     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CA    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE1     -0.307    3.487
    3656     A11_APL1_8.pdb #8/B GLY 9 CA    A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 77 OD1     -0.312    3.492
    3657     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CA    A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CD      -0.314    3.714
    3658     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 H     A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 CZ      -0.314    3.014
    3659     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 OH      -0.316    3.516
    3660     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 2HG  A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 77 CG      -0.316    3.016
    3661     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 2HG1  A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CA      -0.319    3.019
    3662     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 CD   A11_APL1_8.pdb #8/A LEU 81 1HD2    -0.329    3.029
    3663     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 2H    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 171 CZ     -0.335    3.035
    3664     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CG2   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 99 HH      -0.339    3.039
    3665     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 1HB   A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CG     -0.343    3.043
    3666     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 CB   A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 HG1    -0.346    3.046
    3667     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 O    A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 CA     -0.346    3.526
    3668     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 CB    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 7 CE2      -0.348    3.748
    3669     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 8 CG1   A11_APL1_8.pdb #8/A ALA 150 1HB    -0.352    3.052
    3670     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 CG   A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 77 CG      -0.353    3.753
    3671     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 1HG2  A11_APL1_8.pdb #8/A VAL 67 HB      -0.355    2.355
    3672     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 CG2   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 CG     -0.356    3.756
    3673     A11_APL1_8.pdb #8/B GLY 4 1HA   A11_APL1_8.pdb #8/A ASN 66 2HB     -0.357    2.357
    3674     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 CG2   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 CD1    -0.362    3.762
    3675     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 O     A11_APL1_8.pdb #8/A ASN 66 2HD2    -0.363    2.443
    3676     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 1HD  A11_APL1_8.pdb #8/A ASP 77 2HB     -0.365    2.365
    3677     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 CA   A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 HG1    -0.365    3.065
    3678     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 8 CG2   A11_APL1_8.pdb #8/A ALA 150 CB     -0.365    3.765
    3679     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 CA   A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 3HG2   -0.370    3.070
    3680     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 C    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 84 OH      -0.376    3.576
    3681     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 HA   A11_APL1_8.pdb #8/A THR 143 CG2    -0.377    3.077
    3682     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 1HB   A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CE2    -0.377    3.077
    3683     A11_APL1_8.pdb #8/B GLY 9 C     A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 147 NE1    -0.382    3.707
    3684     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 8 1HG2  A11_APL1_8.pdb #8/A ALA 150 CB     -0.382    3.082
    3685     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 CD   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 123 CE2    -0.384    3.784
    3686     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 3H    A11_APL1_8.pdb #8/A MET 5 CE       -0.387    3.087
    3687     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 2 3HG2  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 7 CE2      -0.391    3.091
    3688     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 1HG  A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 147 CZ2    -0.393    3.093
    3689     A11_APL1_8.pdb #8/B VAL 3 3HG2  A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 CG     -0.396    3.096
    3690     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 OXT  A11_APL1_8.pdb #8/A THR 80 CG2     -0.398    3.578
    3691     A11_APL1_8.pdb #8/B LYS 10 2HD  A11_APL1_8.pdb #8/A LEU 81 1HD2    -0.400    2.400
    3692    
    3693 
    3694  
    3695 136 contacts 
    3696 
    3697 > contacts /B:1 restrict /A interModel false intraMol false ignoreHiddenModels
    3698 > true select true color #ff2600 reveal true log true
    3699    
    3700    
    3701     Allowed overlap: -0.4
    3702     H-bond overlap reduction: 0.4
    3703     Ignore contacts between atoms separated by 4 bonds or less
    3704     Detect intra-residue contacts: False
    3705     Detect intra-molecule contacts: False
    3706    
    3707     32 contacts
    3708                 atom1                           atom2               overlap  distance
    3709     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 O    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 HH    0.230    1.850
    3710     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 HG   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2    0.197    1.883
    3711     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 O    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 HE1   0.138    2.342
    3712     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CB   A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CD1   0.085    3.315
    3713     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 O    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 CE1   0.019    3.161
    3714     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 HA   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2    -0.036    2.516
    3715     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 HA   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CD     -0.043    2.743
    3716     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 C    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 HH    -0.044    2.744
    3717     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 2HB  A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CD1   -0.083    2.783
    3718     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 HA   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE1    -0.103    2.583
    3719     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CA   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2    -0.124    3.304
    3720     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CB   A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 NE1   -0.186    3.511
    3721     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 1HB  A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CD1   -0.189    2.889
    3722     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 2H   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 171 OH    -0.201    2.301
    3723     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 O    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 OH    -0.202    2.782
    3724     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 1H   A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CB    -0.203    2.903
    3725     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 O    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 159 CZ    -0.216    3.396
    3726     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 OG   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2    -0.250    2.830
    3727     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CB   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE2    -0.276    3.456
    3728     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 C    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 7 OH      -0.277    3.477
    3729     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 HG   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CD     -0.284    2.984
    3730     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 2H   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 171 CE2   -0.286    2.986
    3731     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 1HB  A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 NE1   -0.290    2.915
    3732     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CB   A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CG    -0.292    3.692
    3733     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 N    A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 171 OH    -0.300    3.025
    3734     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 2H   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 171 HE2   -0.302    2.302
    3735     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CA   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 OE1    -0.307    3.487
    3736     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 CA   A11_APL1_8.pdb #8/A GLU 63 CD     -0.314    3.714
    3737     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 2H   A11_APL1_8.pdb #8/A TYR 171 CZ    -0.335    3.035
    3738     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 1HB  A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CG    -0.343    3.043
    3739     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 1HB  A11_APL1_8.pdb #8/A TRP 167 CE2   -0.377    3.077
    3740     A11_APL1_8.pdb #8/B SER 1 3H   A11_APL1_8.pdb #8/A MET 5 CE      -0.387    3.087
    3741    
    3742 
    3743  
    3744 32 contacts 
     854[deleted to fit within ticket limits]
    3745855
    3746856> hide #!8 models