| 1449 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1450 | | > Fingerprint_Final/02_mC3a-mC3aR- |
| 1451 | | > Go/cryosparc_P467_J79_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc |
| 1452 | | |
| 1453 | | Opened cryosparc_P467_J79_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as |
| 1454 | | #28, grid size 256,256,256, pixel 1.29, shown at level 0.000993, step 1, |
| 1455 | | values float32 |
| 1456 | | |
| 1457 | | > rename #28 02_Density_mC3a-mC3aR-Go |
| 1458 | | |
| 1459 | | > select add #2 |
| 1460 | | |
| 1461 | | 7975 atoms, 8155 bonds, 5 pseudobonds, 1110 residues, 2 models selected |
| 1462 | | |
| 1463 | | > select add #14 |
| 1464 | | |
| 1465 | | 8072 atoms, 8253 bonds, 5 pseudobonds, 1122 residues, 3 models selected |
| 1466 | | |
| 1467 | | > graphics selection width 0.5 |
| 1468 | | |
| 1469 | | > view position #28 sameAsModels #2 |
| 1470 | | |
| 1471 | | > volume #28 level 0.1983 |
| 1472 | | |
| 1473 | | > hide #!28 models |
| 1474 | | |
| 1475 | | > hide #!2 models |
| 1476 | | |
| 1477 | | > hide #!14 models |
| 1478 | | |
| 1479 | | > select subtract #14 |
| 1480 | | |
| 1481 | | 7975 atoms, 8155 bonds, 5 pseudobonds, 1110 residues, 2 models selected |
| 1482 | | |
| 1483 | | > select subtract #2 |
| 1484 | | |
| 1485 | | Nothing selected |
| 1486 | | |
| 1487 | | > show #!4 models |
| 1488 | | |
| 1489 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1490 | | > Fingerprint_Final/04_mC5a-mC5aR1-Go/cryosparc_P133_J3092_006_volume_map_sharp_deepEMhancer- |
| 1491 | | > sharpened.mrc |
| 1492 | | |
| 1493 | | Opened cryosparc_P133_J3092_006_volume_map_sharp_deepEMhancer-sharpened.mrc as |
| 1494 | | #29, grid size 256,256,256, pixel 1.29, shown at level 0.000387, step 1, |
| 1495 | | values float32 |
| 1496 | | |
| 1497 | | > rename #29 04_Density_mC5a-mC5aR1-Go |
| 1498 | | |
| 1499 | | > view position #29 sameAsModels #4 |
| 1500 | | |
| 1501 | | > volume #29 level 0.1127 |
| 1502 | | |
| 1503 | | > show #!28 models |
| 1504 | | |
| 1505 | | > hide #!28 models |
| 1506 | | |
| 1507 | | > hide #!29 models |
| 1508 | | |
| 1509 | | > show #!29 models |
| 1510 | | |
| 1511 | | > show #!1 models |
| 1512 | | |
| 1513 | | > hide #!1 models |
| 1514 | | |
| 1515 | | > show #!1 models |
| 1516 | | |
| 1517 | | > hide #!1 models |
| 1518 | | |
| 1519 | | > show #!2 models |
| 1520 | | |
| 1521 | | > hide #!29 models |
| 1522 | | |
| 1523 | | > hide #!4 models |
| 1524 | | |
| 1525 | | > hide #!2 models |
| 1526 | | |
| 1527 | | > show #!4 models |
| 1528 | | |
| 1529 | | > show #!2 models |
| 1530 | | |
| 1531 | | > hide #!4 models |
| 1532 | | |
| 1533 | | > hide #!2 models |
| 1534 | | |
| 1535 | | > show #!5 models |
| 1536 | | |
| 1537 | | > hide #!5 models |
| 1538 | | |
| 1539 | | > show #!5 models |
| 1540 | | |
| 1541 | | > show #!29 models |
| 1542 | | |
| 1543 | | > hide #!29 models |
| 1544 | | |
| 1545 | | > show #!29 models |
| 1546 | | |
| 1547 | | > hide #!5 models |
| 1548 | | |
| 1549 | | > show #!4 models |
| 1550 | | |
| 1551 | | > hide #!4 models |
| 1552 | | |
| 1553 | | > show #!5 models |
| 1554 | | |
| 1555 | | > hide #!29 models |
| 1556 | | |
| 1557 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1558 | | > Fingerprint_Final/05_hTLQP-mC3aR- |
| 1559 | | > Go/cryosparc_P133_J4401_007_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1560 | | > sharpened_inverse.mrc |
| 1561 | | |
| 1562 | | Opened cryosparc_P133_J4401_007_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1563 | | sharpened_inverse.mrc as #30, grid size 256,256,256, pixel 1.29, shown at |
| 1564 | | level 0.00314, step 1, values float32 |
| 1565 | | |
| 1566 | | > rename #30 05_Density_hTLQP-mC3aR-Go |
| 1567 | | |
| 1568 | | > hide #!30 models |
| 1569 | | |
| 1570 | | > show #!30 models |
| 1571 | | |
| 1572 | | > volume #30 level 0.1716 |
| 1573 | | |
| 1574 | | > volume #30 level 0.08574 |
| 1575 | | |
| 1576 | | > view position #30 sameAsModels #5 |
| 1577 | | |
| 1578 | | > volume #30 level 0.07582 |
| 1579 | | |
| 1580 | | > hide #!30 models |
| 1581 | | |
| 1582 | | > hide #!5 models |
| 1583 | | |
| 1584 | | > show #!6 models |
| 1585 | | |
| 1586 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1587 | | > Fingerprint_Final/06_mTLQP-mC3aR- |
| 1588 | | > Go/cryosparc_P133_J3925_004_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1589 | | > sharpened_inverse.mrc |
| 1590 | | |
| 1591 | | Opened cryosparc_P133_J3925_004_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1592 | | sharpened_inverse.mrc as #31, grid size 256,256,256, pixel 1.29, shown at |
| 1593 | | level 0.00125, step 1, values float32 |
| 1594 | | |
| 1595 | | > rename #31 06_Density_mTLQP-mC3aR-Go |
| 1596 | | |
| 1597 | | > volume #31 level 0.1492 |
| 1598 | | |
| 1599 | | > view position #31 sameAsModels #6 |
| 1600 | | |
| 1601 | | > hide #!31 models |
| 1602 | | |
| 1603 | | > hide #!6 models |
| 1604 | | |
| 1605 | | > show #!7 models |
| 1606 | | |
| 1607 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1608 | | > Fingerprint_Final/07_EP67-hC5aR1-Go/cryosparc_P13_J141_014_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1609 | | > sharpened.mrc |
| 1610 | | |
| 1611 | | Opened cryosparc_P13_J141_014_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as |
| 1612 | | #32, grid size 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.00354, step 1, values |
| 1613 | | float32 |
| 1614 | | |
| 1615 | | > rename #32 07_Density_EP67-hC5aR1-Go |
| 1616 | | |
| 1617 | | > volume #32 level 0.1542 |
| 1618 | | |
| 1619 | | > view position #32 sameAsModels #7 |
| 1620 | | |
| 1621 | | > hide #!32 models |
| 1622 | | |
| 1623 | | > show #!8 models |
| 1624 | | |
| 1625 | | > hide #!7 models |
| 1626 | | |
| 1627 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1628 | | > Fingerprint_Final/08_EP67-mC5aR1-Go/cryosparc_P4_J487_005_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1629 | | > sharpened.mrc |
| 1630 | | |
| 1631 | | Opened cryosparc_P4_J487_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as |
| 1632 | | #33, grid size 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.000959, step 1, |
| 1633 | | values float32 |
| 1634 | | |
| 1635 | | > volume #33 level 0.173 |
| 1636 | | |
| 1637 | | > rename #33 08_Density_EP67-mC5aR1-Go |
| 1638 | | |
| 1639 | | > view position #33 sameAsModels #8 |
| 1640 | | |
| 1641 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1642 | | > Fingerprint_Final/09_EP67-hC3aR- |
| 1643 | | > Go/cryosparc_P467_J475_004_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc |
| 1644 | | |
| 1645 | | Opened cryosparc_P467_J475_004_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as |
| 1646 | | #34, grid size 256,256,256, pixel 1.28, shown at level 0.000973, step 1, |
| 1647 | | values float32 |
| 1648 | | |
| 1649 | | > hide #!33 models |
| 1650 | | |
| 1651 | | > show #!9 models |
| 1652 | | |
| 1653 | | > hide #!8 models |
| 1654 | | |
| 1655 | | > rename #34 09_Density_EP67-hC3aR-Go |
| 1656 | | |
| 1657 | | > view position #34 sameAsModels #9 |
| 1658 | | |
| 1659 | | > volume #34 level 0.1824 |
| 1660 | | |
| 1661 | | > hide #!34 models |
| 1662 | | |
| 1663 | | > hide #!9 models |
| 1664 | | |
| 1665 | | > show #!10 models |
| 1666 | | |
| 1667 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1668 | | > Fingerprint_Final/10_EP67-mC3aR- |
| 1669 | | > Go/cryosparc_P467_J645_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc |
| 1670 | | |
| 1671 | | Opened cryosparc_P467_J645_005_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as |
| 1672 | | #35, grid size 256,256,256, pixel 1.28, shown at level 0.000834, step 1, |
| 1673 | | values float32 |
| 1674 | | |
| 1675 | | > volume #35 level 0.1993 |
| 1676 | | |
| 1677 | | > rename #10 09_EP67-hC3aR-Go |
| 1678 | | |
| 1679 | | > undo |
| 1680 | | |
| 1681 | | [Repeated 9 time(s)] |
| 1682 | | |
| 1683 | | > rename #10 10_EP67-mC3aR-Go |
| 1684 | | |
| 1685 | | > rename #35 10_EP67-mC3aR-Go |
| 1686 | | |
| 1687 | | > hide #!32 models |
| 1688 | | |
| 1689 | | > hide #!33 models |
| 1690 | | |
| 1691 | | > hide #!34 models |
| 1692 | | |
| 1693 | | > show #!10 models |
| 1694 | | |
| 1695 | | > rename #35 10_Density_EP67-mC3aR-Go |
| 1696 | | |
| 1697 | | > view position #35 sameAsModels #10 |
| 1698 | | |
| 1699 | | > hide #!10 models |
| 1700 | | |
| 1701 | | > hide #!35 models |
| 1702 | | |
| 1703 | | > show #!11 models |
| 1704 | | |
| 1705 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1706 | | > Fingerprint_Final/11_JR14a-hC3aR-Go/J209_004_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1707 | | > sharpened.mrc |
| 1708 | | |
| 1709 | | Opened J209_004_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as #36, grid size |
| 1710 | | 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.00107, step 1, values float32 |
| 1711 | | |
| 1712 | | > volume #36 level 0.2007 |
| 1713 | | |
| 1714 | | > rename #36 11_Density_JR14A-hC3aR-Go |
| 1715 | | |
| 1716 | | > view position #36 sameAsModels #11 |
| 1717 | | |
| 1718 | | > volume #36 level 0.1143 |
| 1719 | | |
| 1720 | | > hide #!36 models |
| 1721 | | |
| 1722 | | > hide #!11 models |
| 1723 | | |
| 1724 | | > show #!12 models |
| 1725 | | |
| 1726 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1727 | | > Fingerprint_Final/12_JR14a-mC3aR- |
| 1728 | | > Go/cryosparc_P5_J435_006_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc |
| 1729 | | |
| 1730 | | Opened cryosparc_P5_J435_006_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as |
| 1731 | | #37, grid size 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.00132, step 1, values |
| 1732 | | float32 |
| 1733 | | |
| 1734 | | > rename #37 12_Density_JR14-mC3aR-Go |
| 1735 | | |
| 1736 | | > view position #37 sameAsModels #12 |
| 1737 | | |
| 1738 | | > volume #37 level 0.09771 |
| 1739 | | |
| 1740 | | > hide #!37 models |
| 1741 | | |
| 1742 | | > hide #!12 models |
| 1743 | | |
| 1744 | | > show #!13 models |
| 1745 | | |
| 1746 | | > hide #!13 models |
| 1747 | | |
| 1748 | | > show #!27 models |
| 1749 | | |
| 1750 | | > hide #!27 models |
| 1751 | | |
| 1752 | | > show #!27 models |
| 1753 | | |
| 1754 | | > show #!28 models |
| 1755 | | |
| 1756 | | > hide #!28 models |
| 1757 | | |
| 1758 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1759 | | > Fingerprint_Final/13_SB219057-hC3aR- |
| 1760 | | > Go/Overall/cryosparc_P32_J111_008_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1761 | | > sharpened.mrc |
| 1762 | | |
| 1763 | | Opened cryosparc_P32_J111_008_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as |
| 1764 | | #38, grid size 220,220,220, pixel 1.06, shown at level 0.00642, step 1, values |
| 1765 | | float32 |
| 1766 | | |
| 1767 | | > rename #38 13_Density_SB-hC3aR-Go_Overall |
| 1768 | | |
| 1769 | | > view position #38 sameAsModels #27 |
| 1770 | | |
| 1771 | | > volume #38 level 0.1714 |
| 1772 | | |
| 1773 | | > hide #!27 models |
| 1774 | | |
| 1775 | | > show #!15 models |
| 1776 | | |
| 1777 | | > hide #!38 models |
| 1778 | | |
| 1779 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1780 | | > Fingerprint_Final/14_mC5a-hC5aR1-Go/cryosparc_P133_J2856_007_volume_map_sharp.mrc |
| 1781 | | |
| 1782 | | Opened cryosparc_P133_J2856_007_volume_map_sharp.mrc as #39, grid size |
| 1783 | | 360,360,360, pixel 0.92, shown at level 0.0281, step 2, values float32 |
| 1784 | | |
| 1785 | | > rename #39 14_Density_mC5a-hC5aR1-Go |
| 1786 | | |
| 1787 | | > view position #39 sameAsModels #15 |
| 1788 | | |
| 1789 | | > volume #39 level 0.1335 |
| 1790 | | |
| 1791 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1792 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 1793 | | |
| 1794 | | > hide #!15 models |
| 1795 | | |
| 1796 | | > show #!16 models |
| 1797 | | |
| 1798 | | > hide #!39 models |
| 1799 | | |
| 1800 | | > volume #39 step 1 |
| 1801 | | |
| 1802 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1803 | | > Fingerprint_Final/17_mC5adesArg- |
| 1804 | | > mC5aR1-Go/cryosparc_P133_J5422_006_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1805 | | > sharpened.mrc |
| 1806 | | |
| 1807 | | Opened cryosparc_P133_J5422_006_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc |
| 1808 | | as #40, grid size 256,256,256, pixel 1.29, shown at level 0.0027, step 1, |
| 1809 | | values float32 |
| 1810 | | |
| 1811 | | > volume #40 level 0.1122 |
| 1812 | | |
| 1813 | | > rename #40 17_Density_mC5adesArg-mC5aR1-Go |
| 1814 | | |
| 1815 | | > show #!18 models |
| 1816 | | |
| 1817 | | > hide #!16 models |
| 1818 | | |
| 1819 | | > view position #40 sameAsModels #18 |
| 1820 | | |
| 1821 | | > hide #!18 models |
| 1822 | | |
| 1823 | | > show #!19 models |
| 1824 | | |
| 1825 | | > hide #!40 models |
| 1826 | | |
| 1827 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1828 | | > Fingerprint_Final/18_hC5adesArg- |
| 1829 | | > mC5aR1-Go/cryosparc_P133_J5081_008_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1830 | | > sharpened_inverse.mrc |
| 1831 | | |
| 1832 | | Opened cryosparc_P133_J5081_008_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 1833 | | sharpened_inverse.mrc as #41, grid size 288,288,288, pixel 1.15, shown at |
| 1834 | | level 0.00435, step 2, values float32 |
| 1835 | | |
| 1836 | | > show #!20 models |
| 1837 | | |
| 1838 | | > hide #!19 models |
| 1839 | | |
| 1840 | | > rename #41 18_Density_hC5adesArg-mC5aR1-Go |
| 1841 | | |
| 1842 | | > volume #41 level 0.1431 |
| 1843 | | |
| 1844 | | > view position #41 sameAsModels #20 |
| 1845 | | |
| 1846 | | > volume #41 level 0.1119 |
| 1847 | | |
| 1848 | | > hide #!20 models |
| 1849 | | |
| 1850 | | > show #!21 models |
| 1851 | | |
| 1852 | | > hide #!41 models |
| 1853 | | |
| 1854 | | > hide #!21 models |
| 1855 | | |
| 1856 | | > show #!20 models |
| 1857 | | |
| 1858 | | > hide #!20 models |
| 1859 | | |
| 1860 | | > show #!20 models |
| 1861 | | |
| 1862 | | > show #!41 models |
| 1863 | | |
| 1864 | | > hide #!41 models |
| 1865 | | |
| 1866 | | > hide #!20 models |
| 1867 | | |
| 1868 | | > show #!28 models |
| 1869 | | |
| 1870 | | > show #!29 models |
| 1871 | | |
| 1872 | | > show #!30 models |
| 1873 | | |
| 1874 | | > show #!31 models |
| 1875 | | |
| 1876 | | > show #!32 models |
| 1877 | | |
| 1878 | | > show #!33 models |
| 1879 | | |
| 1880 | | > show #!34 models |
| 1881 | | |
| 1882 | | > show #!35 models |
| 1883 | | |
| 1884 | | > show #!36 models |
| 1885 | | |
| 1886 | | > show #!37 models |
| 1887 | | |
| 1888 | | > show #!38 models |
| 1889 | | |
| 1890 | | > show #!39 models |
| 1891 | | |
| 1892 | | > show #!40 models |
| 1893 | | |
| 1894 | | > show #!41 models |
| 1895 | | |
| 1896 | | > hide #!41 models |
| 1897 | | |
| 1898 | | > hide #!40 models |
| 1899 | | |
| 1900 | | > hide #!39 models |
| 1901 | | |
| 1902 | | > hide #!38 models |
| 1903 | | |
| 1904 | | > hide #!37 models |
| 1905 | | |
| 1906 | | > hide #!35 models |
| 1907 | | |
| 1908 | | > hide #!36 models |
| 1909 | | |
| 1910 | | > hide #!34 models |
| 1911 | | |
| 1912 | | > hide #!33 models |
| 1913 | | |
| 1914 | | > hide #!32 models |
| 1915 | | |
| 1916 | | > show #!32 models |
| 1917 | | |
| 1918 | | > hide #!31 models |
| 1919 | | |
| 1920 | | > hide #!32 models |
| 1921 | | |
| 1922 | | > hide #!30 models |
| 1923 | | |
| 1924 | | > hide #!29 models |
| 1925 | | |
| 1926 | | > show #!29 models |
| 1927 | | |
| 1928 | | > hide #!28 models |
| 1929 | | |
| 1930 | | > hide #!29 models |
| 1931 | | |
| 1932 | | > show #!28 models |
| 1933 | | |
| 1934 | | > show #!2 models |
| 1935 | | |
| 1936 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 1937 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 1938 | | |
| 1939 | | > ui tool show "Hide Dust" |
| 1940 | | |
| 1941 | | > ui tool show "Color Zone" |
| 1942 | | |
| 1943 | | > surface dust #28 size 7.76 |
| 1944 | | |
| 1945 | | > surface dust #28 size 9.84 |
| 1946 | | |
| 1947 | | > volume #28 level 0.1478 |
| 1948 | | |
| 1949 | | > surface dust #28 size 12.72 |
| 1950 | | |
| 1951 | | > volume #28 level 0.1254 |
| 1952 | | |
| 1953 | | > surface dust #28 size 14.46 |
| 1954 | | |
| 1955 | | > volume #28 level 0.1422 |
| 1956 | | |
| 1957 | | > color #2/E #ca2727 |
| 1958 | | |
| 1959 | | > color #14/D #aeaeae |
| 1960 | | |
| 1961 | | > color zone #28 near #2 distance 7.76 |
| 1962 | | |
| 1963 | | > color zone #28 near #14 distance 7.76 |
| 1964 | | |
| 1965 | | > color zone #28 near #14 distance 1.58 |
| 1966 | | |
| 1967 | | > color single #28 |
| 1968 | | |
| 1969 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 1970 | | |
| 1971 | | > color zone #28 near #14 distance 1.49 |
| 1972 | | |
| 1973 | | > color zone #28 near #2 distance 1.49 |
| 1974 | | |
| 1975 | | > color zone #28 near #2 distance 5.14 |
| 1976 | | |
| 1977 | | > color zone #28 near #2 distance 3.93 |
| 1978 | | |
| 1979 | | > color zone #28 near #2 distance 12.82 |
| 1980 | | |
| 1981 | | > color zone #28 near #14 distance 20.68 |
| 1982 | | |
| 1983 | | > undo |
| 1984 | | |
| 1985 | | [Repeated 2 time(s)] |
| 1986 | | |
| 1987 | | > color zone #28 near #2 distance 20.68 |
| 1988 | | |
| 1989 | | > color zone #28 near #2 distance 15.17 |
| 1990 | | |
| 1991 | | > color zone #28 near #2 distance 14.96 |
| 1992 | | |
| 1993 | | > color zone #28 near #14 distance 14.96 |
| 1994 | | |
| 1995 | | > color zone #28 near #2 distance 14.96 |
| 1996 | | |
| 1997 | | > color zone #28 near #2 distance 10.09 |
| 1998 | | |
| 1999 | | > color zone #28 near #2 distance 10.02 |
| 2000 | | |
| 2001 | | > color zone #28 near #2 distance 9.95 |
| 2002 | | |
| 2003 | | > color zone #28 near #2 distance 6.34 |
| 2004 | | |
| 2005 | | > hide #!28 models |
| 2006 | | |
| 2007 | | > hide #!2 models |
| 2008 | | |
| 2009 | | > show #!4 models |
| 2010 | | |
| 2011 | | > show #!29 models |
| 2012 | | |
| 2013 | | > color zone #29 near #4 distance 7.76 |
| 2014 | | |
| 2015 | | > volume #29 level 0.1242 |
| 2016 | | |
| 2017 | | > surface dust #29 size 3.18 |
| 2018 | | |
| 2019 | | > surface dust #29 size 2.39 |
| 2020 | | |
| 2021 | | > surface dust #29 size 2.41 |
| 2022 | | |
| 2023 | | > surface dust #29 size 2.43 |
| 2024 | | |
| 2025 | | > surface dust #29 size 2.45 |
| 2026 | | |
| 2027 | | > surface dust #29 size 2.47 |
| 2028 | | |
| 2029 | | > surface dust #29 size 2.49 |
| 2030 | | |
| 2031 | | > surface dust #29 size 2.51 |
| 2032 | | |
| 2033 | | > surface dust #29 size 2.53 |
| 2034 | | |
| 2035 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 2036 | | |
| 2037 | | > surface dust #29 size 4.07 |
| 2038 | | |
| 2039 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 2040 | | |
| 2041 | | > surface dust #29 size 4.35 |
| 2042 | | |
| 2043 | | > surface dust #29 size 6.18 |
| 2044 | | |
| 2045 | | > color #4/F #f277b5 |
| 2046 | | |
| 2047 | | > color zone #29 near #4 distance 7.76 |
| 2048 | | |
| 2049 | | > hide #!29 models |
| 2050 | | |
| 2051 | | > show #!30 models |
| 2052 | | |
| 2053 | | > show #!5 models |
| 2054 | | |
| 2055 | | > hide #!4 models |
| 2056 | | |
| 2057 | | > volume #30 level 0.08985 |
| 2058 | | |
| 2059 | | > surface dust #30 size 7.76 |
| 2060 | | |
| 2061 | | > volume #30 level 0.04497 |
| 2062 | | |
| 2063 | | > volume #30 level 0.08985 |
| 2064 | | |
| 2065 | | > volume #30 level 0.08704 |
| 2066 | | |
| 2067 | | > surface dust #30 size 26.61 |
| 2068 | | |
| 2069 | | > surface dust #30 size 40.92 |
| 2070 | | |
| 2071 | | > hide #!30 models |
| 2072 | | |
| 2073 | | > show #!30 models |
| 2074 | | |
| 2075 | | > show #!31 models |
| 2076 | | |
| 2077 | | > hide #!30 models |
| 2078 | | |
| 2079 | | > show #!30 models |
| 2080 | | |
| 2081 | | > hide #!31 models |
| 2082 | | |
| 2083 | | > volume #30 level 0.06741 |
| 2084 | | |
| 2085 | | > surface dust #30 size 39.86 |
| 2086 | | |
| 2087 | | > volume #30 level 0.08985 |
| 2088 | | |
| 2089 | | > color zone #30 near #5 distance 7.76 |
| 2090 | | |
| 2091 | | > select ~sel & ##selected |
| 2092 | | |
| 2093 | | Nothing selected |
| 2094 | | |
| 2095 | | > color #5/D #e76c95 |
| 2096 | | |
| 2097 | | > color zone #30 near #5 distance 7.76 |
| 2098 | | |
| 2099 | | > hide #!5 models |
| 2100 | | |
| 2101 | | > hide #!30 models |
| 2102 | | |
| 2103 | | > show #!31 models |
| 2104 | | |
| 2105 | | > show #!6 models |
| 2106 | | |
| 2107 | | > surface dust #31 size 7.76 |
| 2108 | | |
| 2109 | | > volume #31 level 0.1083 |
| 2110 | | |
| 2111 | | > volume #31 level 0.0792 |
| 2112 | | |
| 2113 | | > surface dust #31 size 25.6 |
| 2114 | | |
| 2115 | | > volume #31 level 0.08211 |
| 2116 | | |
| 2117 | | > color zone #31 near #6 distance 7.76 |
| 2118 | | |
| 2119 | | > color #6/B #ffff00 |
| 2120 | | |
| 2121 | | > color zone #31 near #6 distance 7.76 |
| 2122 | | |
| 2123 | | > color #6/D #e103e1 |
| 2124 | | |
| 2125 | | > color zone #31 near #6 distance 7.76 |
| 2126 | | |
| 2127 | | > hide #!6 models |
| 2128 | | |
| 2129 | | > show #!7 models |
| 2130 | | |
| 2131 | | > hide #!31 models |
| 2132 | | |
| 2133 | | > show #!32 models |
| 2134 | | |
| 2135 | | > volume #32 level 0.1137 |
| 2136 | | |
| 2137 | | > volume #32 level 0.2041 |
| 2138 | | |
| 2139 | | > surface dust #32 size 7.26 |
| 2140 | | |
| 2141 | | > volume #32 level 0.1729 |
| 2142 | | |
| 2143 | | > volume #32 level 0.1168 |
| 2144 | | |
| 2145 | | > volume #32 level 0.09186 |
| 2146 | | |
| 2147 | | > surface dust #32 size 11.68 |
| 2148 | | |
| 2149 | | > volume #32 level 0.08874 |
| 2150 | | |
| 2151 | | > color zone #32 near #7 distance 7.26 |
| 2152 | | |
| 2153 | | > color #7/A #b366ff |
| 2154 | | |
| 2155 | | > color zone #32 near #7 distance 7.26 |
| 2156 | | |
| 2157 | | > color #7,8,9,10/D #bf9000 |
| 2158 | | |
| 2159 | | > color zone #32 near #7 distance 7.26 |
| 2160 | | |
| 2161 | | > select clear |
| 2162 | | |
| 2163 | | > hide #!7 models |
| 2164 | | |
| 2165 | | > show #!8 models |
| 2166 | | |
| 2167 | | > show #!33 models |
| 2168 | | |
| 2169 | | > hide #!32 models |
| 2170 | | |
| 2171 | | > volume #33 level 0.1276 |
| 2172 | | |
| 2173 | | > volume #33 level 0.1087 |
| 2174 | | |
| 2175 | | > surface dust #33 size 7.26 |
| 2176 | | |
| 2177 | | > volume #33 level 0.08222 |
| 2178 | | |
| 2179 | | > color zone #32 near #7 distance 7.26 |
| 2180 | | |
| 2181 | | > color zone #33 near #8 distance 7.26 |
| 2182 | | |
| 2183 | | > color #8/A #4c19f8 |
| 2184 | | |
| 2185 | | > color zone #33 near #8 distance 7.26 |
| 2186 | | |
| 2187 | | > hide #!33 models |
| 2188 | | |
| 2189 | | > show #!34 models |
| 2190 | | |
| 2191 | | > show #!9 models |
| 2192 | | |
| 2193 | | > hide #!8 models |
| 2194 | | |
| 2195 | | > volume #34 level 0.1263 |
| 2196 | | |
| 2197 | | > surface dust #34 size 7.67 |
| 2198 | | |
| 2199 | | > volume #34 level 0.08776 |
| 2200 | | |
| 2201 | | > surface dust #34 size 9.76 |
| 2202 | | |
| 2203 | | > color zone #33 near #8 distance 7.26 |
| 2204 | | |
| 2205 | | > color zone #34 near #9 distance 7.67 |
| 2206 | | |
| 2207 | | > color #9/C #e56666 |
| 2208 | | |
| 2209 | | > color zone #34 near #9 distance 7.67 |
| 2210 | | |
| 2211 | | > hide #!34 models |
| 2212 | | |
| 2213 | | > show #!35 models |
| 2214 | | |
| 2215 | | > hide #!9 models |
| 2216 | | |
| 2217 | | > show #!10 models |
| 2218 | | |
| 2219 | | > color zone #35 near #10 distance 7.67 |
| 2220 | | |
| 2221 | | > color #10/C #ccccff |
| 2222 | | |
| 2223 | | > color zone #35 near #10 distance 7.67 |
| 2224 | | |
| 2225 | | > select #10/D |
| 2226 | | |
| 2227 | | 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected |
| 2228 | | |
| 2229 | | > hide sel atoms |
| 2230 | | |
| 2231 | | > surface dust #35 size 7.67 |
| 2232 | | |
| 2233 | | > surface dust #35 size 6.86 |
| 2234 | | |
| 2235 | | > volume #35 level 0.1427 |
| 2236 | | |
| 2237 | | > surface dust #35 size 11.75 |
| 2238 | | |
| 2239 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2240 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 2241 | | |
| 2242 | | > hide #!10 models |
| 2243 | | |
| 2244 | | > show #!11 models |
| 2245 | | |
| 2246 | | > select add #10 |
| 2247 | | |
| 2248 | | 8173 atoms, 8359 bonds, 6 pseudobonds, 1122 residues, 2 models selected |
| 2249 | | |
| 2250 | | > select subtract #10 |
| 2251 | | |
| 2252 | | Nothing selected |
| 2253 | | |
| 2254 | | > show #!36 models |
| 2255 | | |
| 2256 | | > hide #!35 models |
| 2257 | | |
| 2258 | | > volume #36 level 0.06639 |
| 2259 | | |
| 2260 | | > surface dust #36 size 7.26 |
| 2261 | | |
| 2262 | | > surface dust #36 size 18.1 |
| 2263 | | |
| 2264 | | > volume #36 level 0.05534 |
| 2265 | | |
| 2266 | | > surface dust #36 size 30.49 |
| 2267 | | |
| 2268 | | > color zone #35 near #10 distance 7.67 |
| 2269 | | |
| 2270 | | > color zone #36 near #11 distance 7.26 |
| 2271 | | |
| 2272 | | > surface dust #36 size 30.7 |
| 2273 | | |
| 2274 | | > surface dust #36 size 59.71 |
| 2275 | | |
| 2276 | | > surface dust #36 size 21.42 |
| 2277 | | |
| 2278 | | > volume #36 level 0.0627 |
| 2279 | | |
| 2280 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 2281 | | |
| 2282 | | > color zone #36 near #11 distance 34.22 |
| 2283 | | |
| 2284 | | > volume #36 level 0.0848 |
| 2285 | | |
| 2286 | | > volume #36 level 0.04429 |
| 2287 | | |
| 2288 | | > surface dust #36 size 31.52 |
| 2289 | | |
| 2290 | | > color 11/C:JR1 #7030a0 |
| 2291 | | |
| 2292 | | Expected a color or one of 'byatom', 'bychain', 'byelement', 'byhetero', |
| 2293 | | 'byidentity', 'bymodel', 'bynucleotide', 'bypolymer', 'fromatoms', |
| 2294 | | 'fromcartoons', 'fromribbons', or 'random' or a keyword |
| 2295 | | |
| 2296 | | > color #11/C:JR1 #7030a0 |
| 2297 | | |
| 2298 | | > color zone #36 near #11 distance 34.22 |
| 2299 | | |
| 2300 | | > color #11/C #831616 |
| 2301 | | |
| 2302 | | > color zone #36 near #11 distance 34.22 |
| 2303 | | |
| 2304 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 2305 | | |
| 2306 | | > hide #!36 models |
| 2307 | | |
| 2308 | | > show #!37 models |
| 2309 | | |
| 2310 | | > show #!12 models |
| 2311 | | |
| 2312 | | > hide #!11 models |
| 2313 | | |
| 2314 | | > volume #37 level 0.1089 |
| 2315 | | |
| 2316 | | > surface dust #37 size 7.26 |
| 2317 | | |
| 2318 | | > volume #37 level 0.1573 |
| 2319 | | |
| 2320 | | > surface dust #37 size 7.26 |
| 2321 | | |
| 2322 | | > surface dust #37 size 10.22 |
| 2323 | | |
| 2324 | | > volume #37 level 0.1312 |
| 2325 | | |
| 2326 | | > color zone #37 near #12 distance 7.26 |
| 2327 | | |
| 2328 | | > hide #!12 models |
| 2329 | | |
| 2330 | | > show #!13 models |
| 2331 | | |
| 2332 | | > hide #!37 models |
| 2333 | | |
| 2334 | | > show #!38 models |
| 2335 | | |
| 2336 | | > color zone #38 near #27 distance 6.34 |
| 2337 | | |
| 2338 | | > color #12/E #99ccff |
| 2339 | | |
| 2340 | | > color zone #38 near #27 distance 6.34 |
| 2341 | | |
| 2342 | | > color #13/C #993366 |
| 2343 | | |
| 2344 | | > color zone #38 near #27 distance 6.34 |
| 2345 | | |
| 2346 | | > color #27/C #993366 |
| 2347 | | |
| 2348 | | > color zone #38 near #27 distance 6.34 |
| 2349 | | |
| 2350 | | > volume #38 level 0.1243 |
| 2351 | | |
| 2352 | | > volume #38 level 0.07444 |
| 2353 | | |
| 2354 | | > surface dust #38 size 11.19 |
| 2355 | | |
| 2356 | | > hide #!38 models |
| 2357 | | |
| 2358 | | > show #!38 models |
| 2359 | | |
| 2360 | | > hide #!13 models |
| 2361 | | |
| 2362 | | > hide #!38 models |
| 2363 | | |
| 2364 | | > show #!39 models |
| 2365 | | |
| 2366 | | > show #!15 models |
| 2367 | | |
| 2368 | | > volume #39 level 0.1134 |
| 2369 | | |
| 2370 | | > surface dust #39 size 5.52 |
| 2371 | | |
| 2372 | | > volume #39 level 0.1295 |
| 2373 | | |
| 2374 | | > surface dust #39 size 9.1 |
| 2375 | | |
| 2376 | | > volume #39 level 0.09735 |
| 2377 | | |
| 2378 | | > surface dust #39 size 13.84 |
| 2379 | | |
| 2380 | | > surface dust #39 size 21.01 |
| 2381 | | |
| 2382 | | > volume #39 level 0.1134 |
| 2383 | | |
| 2384 | | > color zone #39 near #15 distance 5.52 |
| 2385 | | |
| 2386 | | > select #15/F |
| 2387 | | |
| 2388 | | 492 atoms, 497 bonds, 2 pseudobonds, 71 residues, 2 models selected |
| 2389 | | |
| 2390 | | > hide sel atoms |
| 2391 | | |
| 2392 | | > volume #39 level 0.09333 |
| 2393 | | |
| 2394 | | > color zone #39 near #15 distance 5.52 |
| 2395 | | |
| 2396 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 2397 | | |
| 2398 | | > color #15/F #f277b5 |
| 2399 | | |
| 2400 | | > color zone #39 near #15 distance 5.52 |
| 2401 | | |
| 2402 | | > volume #39 level 0.1174 |
| 2403 | | |
| 2404 | | > hide #!15 models |
| 2405 | | |
| 2406 | | > hide #!39 models |
| 2407 | | |
| 2408 | | > show #!40 models |
| 2409 | | |
| 2410 | | > show #!16 models |
| 2411 | | |
| 2412 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2413 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 2414 | | |
| 2415 | | ——— End of log from Mon Feb 3 23:49:44 2025 ——— |
| 2416 | | |
| 2417 | | opened ChimeraX session |
| 2418 | | |
| 2419 | | > ui tool show "Color Zone" |
| 2420 | | |
| 2421 | | > ui tool show "Hide Dust" |
| 2422 | | |
| 2423 | | > color zone #40 near #18 distance 7.76 |
| 2424 | | |
| 2425 | | > surface dust #40 size 7.76 |
| 2426 | | |
| 2427 | | > surface dust #40 size 15.22 |
| 2428 | | |
| 2429 | | > volume #40 level 0.1931 |
| 2430 | | |
| 2431 | | > hide #!16 models |
| 2432 | | |
| 2433 | | > show #!18 models |
| 2434 | | |
| 2435 | | > volume #40 level 0.08 |
| 2436 | | |
| 2437 | | > volume #40 level 0.0283 |
| 2438 | | |
| 2439 | | > color zone #40 near #18 distance 7.78 |
| 2440 | | |
| 2441 | | > surface dust #40 size 84.98 |
| 2442 | | |
| 2443 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 2444 | | |
| 2445 | | > surface dust #40 size 134.44 |
| 2446 | | |
| 2447 | | > color zone #40 near #18 distance 7.08 |
| 2448 | | |
| 2449 | | > volume #40 level 0.04769 |
| 2450 | | |
| 2451 | | > color zone #40 near #18 distance 16.18 |
| 2452 | | |
| 2453 | | > volume #40 level 0.04769 |
| 2454 | | |
| 2455 | | > color #15/F #ff33ff |
| 2456 | | |
| 2457 | | > color zone #40 near #18 distance 16.18 |
| 2458 | | |
| 2459 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 2460 | | |
| 2461 | | > color #18/F #ff33ff |
| 2462 | | |
| 2463 | | > color zone #40 near #18 distance 16.18 |
| 2464 | | |
| 2465 | | > hide #!40 models |
| 2466 | | |
| 2467 | | > show #!41 models |
| 2468 | | |
| 2469 | | > show #!20 models |
| 2470 | | |
| 2471 | | > hide #!18 models |
| 2472 | | |
| 2473 | | > volume #41 step 1 |
| 2474 | | |
| 2475 | | > volume #41 level 0.2282 |
| 2476 | | |
| 2477 | | > surface dust #40 size 134.44 |
| 2478 | | |
| 2479 | | > color zone #41 near #20 distance 6.9 |
| 2480 | | |
| 2481 | | > color #20/D #99ff33 |
| 2482 | | |
| 2483 | | > color zone #41 near #20 distance 6.9 |
| 2484 | | |
| 2485 | | > volume #41 level 0.1141 |
| 2486 | | |
| 2487 | | > volume #41 level 0.0883 |
| 2488 | | |
| 2489 | | > surface dust #41 size 6.9 |
| 2490 | | |
| 2491 | | > surface dust #41 size 16.8 |
| 2492 | | |
| 2493 | | > volume #41 level 0.06621 |
| 2494 | | |
| 2495 | | > surface dust #41 size 64.22 |
| 2496 | | |
| 2497 | | > surface dust #41 size 129.21 |
| 2498 | | |
| 2499 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 2500 | | |
| 2501 | | > surface dust #41 size 127.34 |
| 2502 | | |
| 2503 | | > volume #41 level 0.09934 |
| 2504 | | |
| 2505 | | > color zone #41 near #20 distance 16.05 |
| 2506 | | |
| 2507 | | > volume #41 level 0.09566 |
| 2508 | | |
| 2509 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2510 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 2511 | | |
| 2512 | | > hide #!20 models |
| 2513 | | |
| 2514 | | > select add #15 |
| 2515 | | |
| 2516 | | 8623 atoms, 8799 bonds, 7 pseudobonds, 1199 residues, 2 models selected |
| 2517 | | |
| 2518 | | > select subtract #15 |
| 2519 | | |
| 2520 | | Nothing selected |
| 2521 | | |
| 2522 | | > show #!40 models |
| 2523 | | |
| 2524 | | > show #!39 models |
| 2525 | | |
| 2526 | | > show #!38 models |
| 2527 | | |
| 2528 | | > show #!37 models |
| 2529 | | |
| 2530 | | > show #!36 models |
| 2531 | | |
| 2532 | | > show #!35 models |
| 2533 | | |
| 2534 | | > show #!34 models |
| 2535 | | |
| 2536 | | > show #!33 models |
| 2537 | | |
| 2538 | | > show #!32 models |
| 2539 | | |
| 2540 | | > show #!31 models |
| 2541 | | |
| 2542 | | > show #!30 models |
| 2543 | | |
| 2544 | | > show #!29 models |
| 2545 | | |
| 2546 | | > show #!28 models |
| 2547 | | |
| 2548 | | > hide #!28 models |
| 2549 | | |
| 2550 | | > hide #!29 models |
| 2551 | | |
| 2552 | | > hide #!30 models |
| 2553 | | |
| 2554 | | > hide #!31 models |
| 2555 | | |
| 2556 | | > hide #!32 models |
| 2557 | | |
| 2558 | | > hide #!33 models |
| 2559 | | |
| 2560 | | > hide #!40 models |
| 2561 | | |
| 2562 | | > hide #!39 models |
| 2563 | | |
| 2564 | | > hide #!41 models |
| 2565 | | |
| 2566 | | > hide #!38 models |
| 2567 | | |
| 2568 | | > hide #!37 models |
| 2569 | | |
| 2570 | | > hide #!36 models |
| 2571 | | |
| 2572 | | > hide #!35 models |
| 2573 | | |
| 2574 | | > hide #!34 models |
| 2575 | | |
| 2576 | | > show #!28 models |
| 2577 | | |
| 2578 | | > volume #28 level 0.1391 |
| 2579 | | |
| 2580 | | > show #!29 models |
| 2581 | | |
| 2582 | | > show #!30 models |
| 2583 | | |
| 2584 | | > show #!31 models |
| 2585 | | |
| 2586 | | > show #!32 models |
| 2587 | | |
| 2588 | | > show #!34 models |
| 2589 | | |
| 2590 | | > show #!33 models |
| 2591 | | |
| 2592 | | > show #!35 models |
| 2593 | | |
| 2594 | | > show #!36 models |
| 2595 | | |
| 2596 | | > show #!37 models |
| 2597 | | |
| 2598 | | > show #!38 models |
| 2599 | | |
| 2600 | | > show #!39 models |
| 2601 | | |
| 2602 | | > show #!40 models |
| 2603 | | |
| 2604 | | > show #!41 models |
| 2605 | | |
| 2606 | | > hide #!41 models |
| 2607 | | |
| 2608 | | > hide #!40 models |
| 2609 | | |
| 2610 | | > hide #!39 models |
| 2611 | | |
| 2612 | | > hide #!38 models |
| 2613 | | |
| 2614 | | > hide #!37 models |
| 2615 | | |
| 2616 | | > hide #!36 models |
| 2617 | | |
| 2618 | | > hide #!35 models |
| 2619 | | |
| 2620 | | > hide #!34 models |
| 2621 | | |
| 2622 | | > hide #!33 models |
| 2623 | | |
| 2624 | | > hide #!32 models |
| 2625 | | |
| 2626 | | > hide #!31 models |
| 2627 | | |
| 2628 | | > hide #!30 models |
| 2629 | | |
| 2630 | | > hide #!29 models |
| 2631 | | |
| 2632 | | > hide #!28 models |
| 2633 | | |
| 2634 | | > show #!28 models |
| 2635 | | |
| 2636 | | > view name fig2_density |
| 2637 | | |
| 2638 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2639 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 height |
| 2640 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2641 | | |
| 2642 | | > hide #!28 models |
| 2643 | | |
| 2644 | | > show #!29 models |
| 2645 | | |
| 2646 | | > rename #29 "nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2647 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 height |
| 2648 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true" |
| 2649 | | |
| 2650 | | > rename #29 04_Density_mC5a-mC5aR1-Go |
| 2651 | | |
| 2652 | | > show #!29 models |
| 2653 | | |
| 2654 | | > hide #!28 models |
| 2655 | | |
| 2656 | | > show #!28 models |
| 2657 | | |
| 2658 | | > hide #!28 models |
| 2659 | | |
| 2660 | | > nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2661 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 |
| 2662 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2663 | | |
| 2664 | | Unknown command: nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2665 | | Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 height |
| 2666 | | 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2667 | | |
| 2668 | | > save nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2669 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 |
| 2670 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2671 | | |
| 2672 | | Directory "nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2673 | | Fingerprint_Final/Fig2_Images" does not exist |
| 2674 | | |
| 2675 | | > cd nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2676 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/ |
| 2677 | | |
| 2678 | | Expected name of a folder to open/read; a name of 'browse' will bring up a |
| 2679 | | file browser or a keyword |
| 2680 | | |
| 2681 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2682 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 |
| 2683 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2684 | | |
| 2685 | | > hide #!29 models |
| 2686 | | |
| 2687 | | > show #!30 models |
| 2688 | | |
| 2689 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2690 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/05_Density_hTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 |
| 2691 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2692 | | |
| 2693 | | > show #!31 models |
| 2694 | | |
| 2695 | | > hide #!30 models |
| 2696 | | |
| 2697 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2698 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/06_Density_mTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 |
| 2699 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2700 | | |
| 2701 | | > hide #!31 models |
| 2702 | | |
| 2703 | | > show #!32 models |
| 2704 | | |
| 2705 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2706 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/07_Density_EP67-hC5aR1-Go.png width 2000 |
| 2707 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2708 | | |
| 2709 | | > show #!33 models |
| 2710 | | |
| 2711 | | > hide #!32 models |
| 2712 | | |
| 2713 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2714 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/08_Density_EP67-mC5aR1-Go.png width 2000 |
| 2715 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2716 | | |
| 2717 | | > show #!34 models |
| 2718 | | |
| 2719 | | > hide #!33 models |
| 2720 | | |
| 2721 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2722 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/09_Density_EP67-hC3aR-Go.png width 2000 height |
| 2723 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2724 | | |
| 2725 | | > show #!35 models |
| 2726 | | |
| 2727 | | > hide #!34 models |
| 2728 | | |
| 2729 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2730 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/10_Density_EP67-mC3aR-Go.png width 2000 height |
| 2731 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2732 | | |
| 2733 | | > show #!36 models |
| 2734 | | |
| 2735 | | > hide #!35 models |
| 2736 | | |
| 2737 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2738 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/11_Density_JR14A-hC3aR-Go.png width 2000 |
| 2739 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2740 | | |
| 2741 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2742 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_Density_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 height |
| 2743 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2744 | | |
| 2745 | | > show #!37 models |
| 2746 | | |
| 2747 | | > hide #!36 models |
| 2748 | | |
| 2749 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2750 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_Density_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 height |
| 2751 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2752 | | |
| 2753 | | > show #!38 models |
| 2754 | | |
| 2755 | | > hide #!37 models |
| 2756 | | |
| 2757 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2758 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/13_Density_SB-hC3aR-Go_Overall.png width 2000 |
| 2759 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2760 | | |
| 2761 | | > show #!39 models |
| 2762 | | |
| 2763 | | > hide #!38 models |
| 2764 | | |
| 2765 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2766 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/14_Density_mC5a-hC5aR1-Go.png width 2000 |
| 2767 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2768 | | |
| 2769 | | > show #!40 models |
| 2770 | | |
| 2771 | | > hide #!39 models |
| 2772 | | |
| 2773 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2774 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/17_Density_mC5adesArg-mC5aR1-Go.png width 2000 |
| 2775 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2776 | | |
| 2777 | | > show #!41 models |
| 2778 | | |
| 2779 | | > hide #!40 models |
| 2780 | | |
| 2781 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2782 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/18_Density_hC5adesArg-mC5aR1-Go.png width 2000 |
| 2783 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2784 | | |
| 2785 | | > view fig2_density |
| 2786 | | |
| 2787 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2788 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 2789 | | |
| 2790 | | > hide #!41 models |
| 2791 | | |
| 2792 | | > show #!28 models |
| 2793 | | |
| 2794 | | > show #!29 models |
| 2795 | | |
| 2796 | | > hide #!28 models |
| 2797 | | |
| 2798 | | > show #!30 models |
| 2799 | | |
| 2800 | | > hide #!29 models |
| 2801 | | |
| 2802 | | > select ~sel & ##selected |
| 2803 | | |
| 2804 | | Nothing selected |
| 2805 | | |
| 2806 | | > show #!31 models |
| 2807 | | |
| 2808 | | > hide #!30 models |
| 2809 | | |
| 2810 | | > show #!32 models |
| 2811 | | |
| 2812 | | > hide #!31 models |
| 2813 | | |
| 2814 | | > show #!33 models |
| 2815 | | |
| 2816 | | > hide #!32 models |
| 2817 | | |
| 2818 | | > show #!34 models |
| 2819 | | |
| 2820 | | > hide #!33 models |
| 2821 | | |
| 2822 | | > show #!35 models |
| 2823 | | |
| 2824 | | > hide #!34 models |
| 2825 | | |
| 2826 | | > show #!36 models |
| 2827 | | |
| 2828 | | > hide #!35 models |
| 2829 | | |
| 2830 | | > show #!37 models |
| 2831 | | |
| 2832 | | > hide #!36 models |
| 2833 | | |
| 2834 | | > show #!38 models |
| 2835 | | |
| 2836 | | > hide #!37 models |
| 2837 | | |
| 2838 | | > show #!39 models |
| 2839 | | |
| 2840 | | > hide #!38 models |
| 2841 | | |
| 2842 | | > color #15/F #f277b5 |
| 2843 | | |
| 2844 | | > color zone #39 near #15 distance 5.52 |
| 2845 | | |
| 2846 | | > view fig2_density |
| 2847 | | |
| 2848 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2849 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/14_Density_mC5a-hC5aR1-Go.png width 2000 |
| 2850 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2851 | | |
| 2852 | | > show #!40 models |
| 2853 | | |
| 2854 | | > hide #!39 models |
| 2855 | | |
| 2856 | | > hide #!40 models |
| 2857 | | |
| 2858 | | > show #!40 models |
| 2859 | | |
| 2860 | | > show #!39 models |
| 2861 | | |
| 2862 | | > hide #!40 models |
| 2863 | | |
| 2864 | | > show #!41 models |
| 2865 | | |
| 2866 | | > show #!40 models |
| 2867 | | |
| 2868 | | > hide #!39 models |
| 2869 | | |
| 2870 | | > hide #!40 models |
| 2871 | | |
| 2872 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2873 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 2874 | | |
| 2875 | | > hide #!41 models |
| 2876 | | |
| 2877 | | > show #!28 models |
| 2878 | | |
| 2879 | | > hide #!28 models |
| 2880 | | |
| 2881 | | > show #!28 models |
| 2882 | | |
| 2883 | | > hide #!28 models |
| 2884 | | |
| 2885 | | > show #!28 models |
| 2886 | | |
| 2887 | | > show #!14 models |
| 2888 | | |
| 2889 | | > help help:user |
| 2890 | | |
| 2891 | | > select #6/D |
| 2892 | | |
| 2893 | | 100 atoms, 105 bonds, 13 residues, 1 model selected |
| 2894 | | |
| 2895 | | > hide #!28 models |
| 2896 | | |
| 2897 | | > show #!2 models |
| 2898 | | |
| 2899 | | > show #!28 models |
| 2900 | | |
| 2901 | | > hide #!28 models |
| 2902 | | |
| 2903 | | > view fig2_density |
| 2904 | | |
| 2905 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2906 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 height |
| 2907 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 2908 | | |
| 2909 | | > hide #!14 models |
| 2910 | | |
| 2911 | | > hide #!2 models |
| 2912 | | |
| 2913 | | > show #!4 models |
| 2914 | | |
| 2915 | | > show #!1 models |
| 2916 | | |
| 2917 | | > hide #!1 models |
| 2918 | | |
| 2919 | | > show #!1 models |
| 2920 | | |
| 2921 | | > hide #!1 models |
| 2922 | | |
| 2923 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2924 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 height 1245 |
| 2925 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 2926 | | |
| 2927 | | > show #!5 models |
| 2928 | | |
| 2929 | | > hide #!4 models |
| 2930 | | |
| 2931 | | > select add #6 |
| 2932 | | |
| 2933 | | 8164 atoms, 8351 bonds, 5 pseudobonds, 1126 residues, 2 models selected |
| 2934 | | |
| 2935 | | > select subtract #6 |
| 2936 | | |
| 2937 | | Nothing selected |
| 2938 | | |
| 2939 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2940 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/05_hTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 2941 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 2942 | | |
| 2943 | | > show #!6 models |
| 2944 | | |
| 2945 | | > hide #!5 models |
| 2946 | | |
| 2947 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2948 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/06_mTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 2949 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 2950 | | |
| 2951 | | > show #!7 models |
| 2952 | | |
| 2953 | | > hide #!6 models |
| 2954 | | |
| 2955 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2956 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/07_EP67-hC5aR1-Go.png width 2000 height 1245 |
| 2957 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 2958 | | |
| 2959 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2960 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/08_EP67-mC5aR1-Go.png width 2000 height 1245 |
| 2961 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 2962 | | |
| 2963 | | > hide #!7 models |
| 2964 | | |
| 2965 | | > show #!7 models |
| 2966 | | |
| 2967 | | > show #!8 models |
| 2968 | | |
| 2969 | | > hide #!7 models |
| 2970 | | |
| 2971 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 2972 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/08_EP67-mC5aR1-Go.png width 2000 height 1245 |
| 2973 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 2974 | | |
| 2975 | | > show #!9 models |
| 2976 | | |
| 2977 | | > hide #!8 models |
| 2978 | | |
| 2979 | | > show #!8 models |
| 2980 | | |
| 2981 | | > hide #!8 models |
| 2982 | | |
| 2983 | | > hide #!9 models |
| 2984 | | |
| 2985 | | > show #!7 models |
| 2986 | | |
| 2987 | | > hide #!7 models |
| 2988 | | |
| 2989 | | > show #!8 models |
| 2990 | | |
| 2991 | | > hide #!8 models |
| 2992 | | |
| 2993 | | > show #!9 models |
| 2994 | | |
| 2995 | | > hide #!9 models |
| 2996 | | |
| 2997 | | > show #!10 models |
| 2998 | | |
| 2999 | | > select #10/D |
| 3000 | | |
| 3001 | | 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected |
| 3002 | | |
| 3003 | | > show sel atoms |
| 3004 | | |
| 3005 | | > select clear |
| 3006 | | |
| 3007 | | > hide #!10 models |
| 3008 | | |
| 3009 | | > show #!10 models |
| 3010 | | |
| 3011 | | > hide #!10 models |
| 3012 | | |
| 3013 | | > show #!10 models |
| 3014 | | |
| 3015 | | > hide #!10 models |
| 3016 | | |
| 3017 | | > show #!9 models |
| 3018 | | |
| 3019 | | > view fig2_density |
| 3020 | | |
| 3021 | | > show #!10 models |
| 3022 | | |
| 3023 | | > hide #!9 models |
| 3024 | | |
| 3025 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3026 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/10_EP67-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3027 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3028 | | |
| 3029 | | > show #!11 models |
| 3030 | | |
| 3031 | | > hide #!10 models |
| 3032 | | |
| 3033 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3034 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/11_JR14A-hC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3035 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3036 | | |
| 3037 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3038 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3039 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3040 | | |
| 3041 | | > show #!12 models |
| 3042 | | |
| 3043 | | > hide #!11 models |
| 3044 | | |
| 3045 | | > show #!11 models |
| 3046 | | |
| 3047 | | > hide #!12 models |
| 3048 | | |
| 3049 | | > show #!12 models |
| 3050 | | |
| 3051 | | > hide #!11 models |
| 3052 | | |
| 3053 | | > hide #!12 models |
| 3054 | | |
| 3055 | | > show #!11 models |
| 3056 | | |
| 3057 | | > color #11/C:JR1 #7030a0 |
| 3058 | | |
| 3059 | | > color #11 byhetero |
| 3060 | | |
| 3061 | | > show #!12 models |
| 3062 | | |
| 3063 | | > hide #!12 models |
| 3064 | | |
| 3065 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3066 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/11_JR14A-hC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3067 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3068 | | |
| 3069 | | > show #!12 models |
| 3070 | | |
| 3071 | | > hide #!11 models |
| 3072 | | |
| 3073 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3074 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3075 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3076 | | |
| 3077 | | > show #!13 models |
| 3078 | | |
| 3079 | | > hide #!12 models |
| 3080 | | |
| 3081 | | > hide #!13 models |
| 3082 | | |
| 3083 | | > show #!27 models |
| 3084 | | |
| 3085 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3086 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/13_SB-hC3aR-Go_Overall.png width 2000 height |
| 3087 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3088 | | |
| 3089 | | > hide #!27 models |
| 3090 | | |
| 3091 | | > show #!15 models |
| 3092 | | |
| 3093 | | > show #!28 models |
| 3094 | | |
| 3095 | | > hide #!15 models |
| 3096 | | |
| 3097 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3098 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 height |
| 3099 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3100 | | |
| 3101 | | > hide #!28 models |
| 3102 | | |
| 3103 | | > show #!1 models |
| 3104 | | |
| 3105 | | > hide #!1 models |
| 3106 | | |
| 3107 | | > show #!2 models |
| 3108 | | |
| 3109 | | > show #!4 models |
| 3110 | | |
| 3111 | | > show #!5 models |
| 3112 | | |
| 3113 | | > show #!6 models |
| 3114 | | |
| 3115 | | > show #!7 models |
| 3116 | | |
| 3117 | | > show #!8 models |
| 3118 | | |
| 3119 | | > show #!9 models |
| 3120 | | |
| 3121 | | > show #!10 models |
| 3122 | | |
| 3123 | | > show #!11 models |
| 3124 | | |
| 3125 | | > show #!12 models |
| 3126 | | |
| 3127 | | > show #!15 models |
| 3128 | | |
| 3129 | | > show #!16 models |
| 3130 | | |
| 3131 | | > show #!17 models |
| 3132 | | |
| 3133 | | > show #!18 models |
| 3134 | | |
| 3135 | | > hide #!17 models |
| 3136 | | |
| 3137 | | > hide #!16 models |
| 3138 | | |
| 3139 | | > show #!19 models |
| 3140 | | |
| 3141 | | > hide #!19 models |
| 3142 | | |
| 3143 | | > show #!20 models |
| 3144 | | |
| 3145 | | > hide #!20 models |
| 3146 | | |
| 3147 | | > show #!20 models |
| 3148 | | |
| 3149 | | > hide #!20 models |
| 3150 | | |
| 3151 | | > show #!20 models |
| 3152 | | |
| 3153 | | > show #!27 models |
| 3154 | | |
| 3155 | | > cartoon style width 1 |
| 3156 | | |
| 3157 | | > cartoon style helix width 1 |
| 3158 | | |
| 3159 | | Drag select of 15955 residues, 62 pseudobonds, 432 atoms, 393 bonds |
| 3160 | | |
| 3161 | | > help help:user |
| 3162 | | |
| 3163 | | > cartoon style helix width 2 |
| 3164 | | |
| 3165 | | > hide #!2 models |
| 3166 | | |
| 3167 | | > select add #2 |
| 3168 | | |
| 3169 | | 116251 atoms, 8548 bonds, 62 pseudobonds, 15958 residues, 26 models selected |
| 3170 | | |
| 3171 | | > select add #4 |
| 3172 | | |
| 3173 | | 116251 atoms, 17507 bonds, 62 pseudobonds, 15958 residues, 26 models selected |
| 3174 | | |
| 3175 | | > select subtract #2 |
| 3176 | | |
| 3177 | | 108276 atoms, 9352 bonds, 57 pseudobonds, 14848 residues, 24 models selected |
| 3178 | | |
| 3179 | | > hide #!4 models |
| 3180 | | |
| 3181 | | > select add #5 |
| 3182 | | |
| 3183 | | 108276 atoms, 17742 bonds, 57 pseudobonds, 14848 residues, 24 models selected |
| 3184 | | |
| 3185 | | > select subtract #4 |
| 3186 | | |
| 3187 | | 99502 atoms, 8783 bonds, 52 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected |
| 3188 | | |
| 3189 | | > hide #!6 models |
| 3190 | | |
| 3191 | | > hide #!5 models |
| 3192 | | |
| 3193 | | > select add #6 |
| 3194 | | |
| 3195 | | 99502 atoms, 17134 bonds, 52 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected |
| 3196 | | |
| 3197 | | > select add #7 |
| 3198 | | |
| 3199 | | 99502 atoms, 25514 bonds, 52 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected |
| 3200 | | |
| 3201 | | > hide #!8 models |
| 3202 | | |
| 3203 | | > hide #!7 models |
| 3204 | | |
| 3205 | | > hide #!18 models |
| 3206 | | |
| 3207 | | > hide #!20 models |
| 3208 | | |
| 3209 | | > hide #!15 models |
| 3210 | | |
| 3211 | | > select add #15 |
| 3212 | | |
| 3213 | | 99502 atoms, 34313 bonds, 53 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected |
| 3214 | | |
| 3215 | | > select add #20 |
| 3216 | | |
| 3217 | | 99502 atoms, 43083 bonds, 53 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected |
| 3218 | | |
| 3219 | | > select add #18 |
| 3220 | | |
| 3221 | | 99502 atoms, 51919 bonds, 53 pseudobonds, 13650 residues, 22 models selected |
| 3222 | | |
| 3223 | | > select subtract #15 |
| 3224 | | |
| 3225 | | 90879 atoms, 43120 bonds, 46 pseudobonds, 12451 residues, 20 models selected |
| 3226 | | |
| 3227 | | > select subtract #18 |
| 3228 | | |
| 3229 | | 82193 atoms, 34248 bonds, 40 pseudobonds, 11259 residues, 18 models selected |
| 3230 | | |
| 3231 | | > select subtract #20 |
| 3232 | | |
| 3233 | | 73570 atoms, 25447 bonds, 36 pseudobonds, 10064 residues, 16 models selected |
| 3234 | | |
| 3235 | | > hide #!27 models |
| 3236 | | |
| 3237 | | > select add #27 |
| 3238 | | |
| 3239 | | 73570 atoms, 33767 bonds, 36 pseudobonds, 10064 residues, 16 models selected |
| 3240 | | |
| 3241 | | > select subtract #27 |
| 3242 | | |
| 3243 | | 65400 atoms, 25416 bonds, 30 pseudobonds, 8959 residues, 14 models selected |
| 3244 | | |
| 3245 | | > hide #!12 models |
| 3246 | | |
| 3247 | | > hide #!11 models |
| 3248 | | |
| 3249 | | > hide #!10 models |
| 3250 | | |
| 3251 | | > hide #!9 models |
| 3252 | | |
| 3253 | | > select add #12 |
| 3254 | | |
| 3255 | | 65400 atoms, 33653 bonds, 30 pseudobonds, 8959 residues, 14 models selected |
| 3256 | | |
| 3257 | | > select add #11 |
| 3258 | | |
| 3259 | | 65400 atoms, 41906 bonds, 30 pseudobonds, 8959 residues, 14 models selected |
| 3260 | | |
| 3261 | | > select add #10 |
| 3262 | | |
| 3263 | | 65400 atoms, 50214 bonds, 36 pseudobonds, 8959 residues, 15 models selected |
| 3264 | | |
| 3265 | | > select subtract #11 |
| 3266 | | |
| 3267 | | 57266 atoms, 41898 bonds, 30 pseudobonds, 7858 residues, 13 models selected |
| 3268 | | |
| 3269 | | > select subtract #12 |
| 3270 | | |
| 3271 | | 49174 atoms, 33624 bonds, 24 pseudobonds, 6746 residues, 11 models selected |
| 3272 | | |
| 3273 | | > select subtract #10 |
| 3274 | | |
| 3275 | | 41001 atoms, 25265 bonds, 18 pseudobonds, 5624 residues, 9 models selected |
| 3276 | | |
| 3277 | | > select add #9 |
| 3278 | | |
| 3279 | | 41001 atoms, 33632 bonds, 22 pseudobonds, 5624 residues, 10 models selected |
| 3280 | | |
| 3281 | | > select subtract #9 |
| 3282 | | |
| 3283 | | 32766 atoms, 25214 bonds, 18 pseudobonds, 4501 residues, 8 models selected |
| 3284 | | |
| 3285 | | > select add #8 |
| 3286 | | |
| 3287 | | 32766 atoms, 33502 bonds, 18 pseudobonds, 4501 residues, 8 models selected |
| 3288 | | |
| 3289 | | > select subtract #8 |
| 3290 | | |
| 3291 | | 24613 atoms, 25172 bonds, 13 pseudobonds, 3382 residues, 6 models selected |
| 3292 | | |
| 3293 | | > select subtract #7 |
| 3294 | | |
| 3295 | | 16365 atoms, 16741 bonds, 10 pseudobonds, 2254 residues, 4 models selected |
| 3296 | | |
| 3297 | | > select subtract #6 |
| 3298 | | |
| 3299 | | 8201 atoms, 8390 bonds, 5 pseudobonds, 1128 residues, 2 models selected |
| 3300 | | |
| 3301 | | > select subtract #5 |
| 3302 | | |
| 3303 | | Nothing selected |
| 3304 | | |
| 3305 | | > show #!2 models |
| 3306 | | |
| 3307 | | > show #!14 models |
| 3308 | | |
| 3309 | | > view list |
| 3310 | | |
| 3311 | | Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 3312 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 3313 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 3314 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, fig2_density, |
| 3315 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 3316 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 3317 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 3318 | | |
| 3319 | | > view fig2_density |
| 3320 | | |
| 3321 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3322 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3323 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3324 | | |
| 3325 | | > hide #!2 models |
| 3326 | | |
| 3327 | | > show #!4 models |
| 3328 | | |
| 3329 | | > hide #!14 models |
| 3330 | | |
| 3331 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3332 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3333 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3334 | | |
| 3335 | | > show #!5 models |
| 3336 | | |
| 3337 | | > hide #!4 models |
| 3338 | | |
| 3339 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3340 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/05_hTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3341 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3342 | | |
| 3343 | | > show #!6 models |
| 3344 | | |
| 3345 | | > hide #!5 models |
| 3346 | | |
| 3347 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3348 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/06_mTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3349 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3350 | | |
| 3351 | | > show #!7 models |
| 3352 | | |
| 3353 | | > hide #!6 models |
| 3354 | | |
| 3355 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3356 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/07_EP67-hC5aR1-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3357 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3358 | | |
| 3359 | | > show #!8 models |
| 3360 | | |
| 3361 | | > hide #!7 models |
| 3362 | | |
| 3363 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3364 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/08_EP67-mC5aR1-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3365 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3366 | | |
| 3367 | | > hide #!8 models |
| 3368 | | |
| 3369 | | > show #!9 models |
| 3370 | | |
| 3371 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3372 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/09_EP67-hC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3373 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3374 | | |
| 3375 | | > show #!10 models |
| 3376 | | |
| 3377 | | > hide #!9 models |
| 3378 | | |
| 3379 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3380 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/10_EP67-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3381 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3382 | | |
| 3383 | | > show #!11 models |
| 3384 | | |
| 3385 | | > hide #!10 models |
| 3386 | | |
| 3387 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3388 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/11_JR14A-hC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3389 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3390 | | |
| 3391 | | > show #!12 models |
| 3392 | | |
| 3393 | | > hide #!11 models |
| 3394 | | |
| 3395 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3396 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3397 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3398 | | |
| 3399 | | > show #!27 models |
| 3400 | | |
| 3401 | | > hide #!12 models |
| 3402 | | |
| 3403 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3404 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/13_SB-hC3aR-Go_Overall.png width 2000 height |
| 3405 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3406 | | |
| 3407 | | > hide #!27 models |
| 3408 | | |
| 3409 | | > show #!15 models |
| 3410 | | |
| 3411 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3412 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/14_mC5a-hC5aR1-Go.png width 2000 height 1245 |
| 3413 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 3414 | | |
| 3415 | | > hide #!15 models |
| 3416 | | |
| 3417 | | > show #!18 models |
| 3418 | | |
| 3419 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3420 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/17_mC5adesArg-mC5aR1-Go.png width 2000 height |
| 3421 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3422 | | |
| 3423 | | > hide #!18 models |
| 3424 | | |
| 3425 | | > show #!20 models |
| 3426 | | |
| 3427 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3428 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/18_hC5adesArg-mC5aR1-Go.png width 2000 height |
| 3429 | | > 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3430 | | |
| 3431 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3432 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 3433 | | |
| 3434 | | > show #!2 models |
| 3435 | | |
| 3436 | | > hide #!2 models |
| 3437 | | |
| 3438 | | > hide #!20 models |
| 3439 | | |
| 3440 | | > show #!14 models |
| 3441 | | |
| 3442 | | > show #!28 models |
| 3443 | | |
| 3444 | | > view list |
| 3445 | | |
| 3446 | | Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 3447 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 3448 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 3449 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, fig2_density, |
| 3450 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 3451 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 3452 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 3453 | | |
| 3454 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3455 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 3456 | | |
| 3457 | | > select #14/D |
| 3458 | | |
| 3459 | | 97 atoms, 98 bonds, 12 residues, 1 model selected |
| 3460 | | |
| 3461 | | > show sel atoms |
| 3462 | | |
| 3463 | | > color sel byhetero |
| 3464 | | |
| 3465 | | > volume zone #28 nearAtoms sel |
| 3466 | | |
| 3467 | | > cofr sel |
| 3468 | | |
| 3469 | | > volume #28 level 0.08012 |
| 3470 | | |
| 3471 | | > surface dust #28 size 7.76 |
| 3472 | | |
| 3473 | | > volume #28 level 0.1329 |
| 3474 | | |
| 3475 | | > volume zone #28 nearAtoms sel |
| 3476 | | |
| 3477 | | > volume #28 style mesh |
| 3478 | | |
| 3479 | | > color zone #28 near sel distance 6.34 |
| 3480 | | |
| 3481 | | > volume #28 level 0.008701 |
| 3482 | | |
| 3483 | | > volume #28 level 0.01802 |
| 3484 | | |
| 3485 | | > show #!29 models |
| 3486 | | |
| 3487 | | > hide #!29 models |
| 3488 | | |
| 3489 | | > volume #28 level 0.002491 |
| 3490 | | |
| 3491 | | > color single #28 |
| 3492 | | |
| 3493 | | > volume #29 color #b2b2b2 |
| 3494 | | |
| 3495 | | > volume #30 color #b2b2b2 |
| 3496 | | |
| 3497 | | > volume #31 color #b2b2b2 |
| 3498 | | |
| 3499 | | > volume #32 color #b2b2b2 |
| 3500 | | |
| 3501 | | > volume #33 color #b2b2b2 |
| 3502 | | |
| 3503 | | > volume #34 color #b2b2b2 |
| 3504 | | |
| 3505 | | > volume #35 color #888a85 |
| 3506 | | |
| 3507 | | > volume #35 color #babdb6 |
| 3508 | | |
| 3509 | | > volume #28 level 0.002491 |
| 3510 | | |
| 3511 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3512 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_Lig_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 |
| 3513 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3514 | | |
| 3515 | | > view C3a-angle_03_EP67 |
| 3516 | | |
| 3517 | | > view C3a_angle_01 |
| 3518 | | |
| 3519 | | > view C3a_angle_02 |
| 3520 | | |
| 3521 | | > view C3a_angle_01 |
| 3522 | | |
| 3523 | | > view C3a_angle_02 |
| 3524 | | |
| 3525 | | > view list |
| 3526 | | |
| 3527 | | Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 3528 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 3529 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 3530 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, fig2_density, |
| 3531 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 3532 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 3533 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 3534 | | |
| 3535 | | > view fig2_density |
| 3536 | | |
| 3537 | | > hide #!28 models |
| 3538 | | |
| 3539 | | > show #!28 models |
| 3540 | | |
| 3541 | | > volume #28 level 0.002491 |
| 3542 | | |
| 3543 | | > volume #28 level 0.02052 |
| 3544 | | |
| 3545 | | > volume #28 level 0.03915 |
| 3546 | | |
| 3547 | | > volume #28 level 0.001889 |
| 3548 | | |
| 3549 | | > surface dust #28 size 2.42 |
| 3550 | | |
| 3551 | | > volume zone #28 nearAtoms sel |
| 3552 | | |
| 3553 | | > view name Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go |
| 3554 | | |
| 3555 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3556 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/02_Density_Lig_mC3a-mC3aR-Go.png width 2000 |
| 3557 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3558 | | |
| 3559 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 3560 | | |
| 3561 | | > view name Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go |
| 3562 | | |
| 3563 | | > show #!29 models |
| 3564 | | |
| 3565 | | > hide #!28 models |
| 3566 | | |
| 3567 | | > volume #29 style mesh |
| 3568 | | |
| 3569 | | > show #!4 models |
| 3570 | | |
| 3571 | | > hide #!14 models |
| 3572 | | |
| 3573 | | > select #4/F |
| 3574 | | |
| 3575 | | 507 atoms, 514 bonds, 1 pseudobond, 73 residues, 2 models selected |
| 3576 | | |
| 3577 | | > select ~sel & ##selected |
| 3578 | | |
| 3579 | | 8267 atoms, 8445 bonds, 4 pseudobonds, 1125 residues, 2 models selected |
| 3580 | | |
| 3581 | | > hide sel cartoons |
| 3582 | | |
| 3583 | | > select ~sel & ##selected |
| 3584 | | |
| 3585 | | 507 atoms, 514 bonds, 1 pseudobond, 73 residues, 2 models selected |
| 3586 | | |
| 3587 | | > volume zone #29 nearAtoms sel |
| 3588 | | |
| 3589 | | > cofr sel |
| 3590 | | |
| 3591 | | > volume #29 level 0.08317 |
| 3592 | | |
| 3593 | | > view name Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3594 | | |
| 3595 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3596 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_Lig_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 |
| 3597 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3598 | | |
| 3599 | | > hide #!29 models |
| 3600 | | |
| 3601 | | > show #!30 models |
| 3602 | | |
| 3603 | | > show #!5 models |
| 3604 | | |
| 3605 | | > hide #!4 models |
| 3606 | | |
| 3607 | | > select add #4 |
| 3608 | | |
| 3609 | | 8774 atoms, 8959 bonds, 5 pseudobonds, 1198 residues, 2 models selected |
| 3610 | | |
| 3611 | | > select subtract #4 |
| 3612 | | |
| 3613 | | Nothing selected |
| 3614 | | |
| 3615 | | > volume #30 style mesh |
| 3616 | | |
| 3617 | | > select #5/D |
| 3618 | | |
| 3619 | | 95 atoms, 99 bonds, 13 residues, 1 model selected |
| 3620 | | |
| 3621 | | > select ~sel & ##selected |
| 3622 | | |
| 3623 | | 8106 atoms, 8291 bonds, 5 pseudobonds, 1115 residues, 2 models selected |
| 3624 | | |
| 3625 | | > volume zone #30 nearAtoms sel |
| 3626 | | |
| 3627 | | > hide sel cartoons |
| 3628 | | |
| 3629 | | > select ~sel & ##selected |
| 3630 | | |
| 3631 | | 95 atoms, 99 bonds, 13 residues, 1 model selected |
| 3632 | | |
| 3633 | | > volume zone #30 nearAtoms sel |
| 3634 | | |
| 3635 | | > cofr sel |
| 3636 | | |
| 3637 | | > show sel atoms |
| 3638 | | |
| 3639 | | > color sel byhetero |
| 3640 | | |
| 3641 | | > volume #30 level 0.02238 |
| 3642 | | |
| 3643 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 3644 | | |
| 3645 | | > view name Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go |
| 3646 | | |
| 3647 | | > hide #!30 models |
| 3648 | | |
| 3649 | | > show #!29 models |
| 3650 | | |
| 3651 | | > hide #!5 models |
| 3652 | | |
| 3653 | | > show #!4 models |
| 3654 | | |
| 3655 | | > select #4/F |
| 3656 | | |
| 3657 | | 507 atoms, 514 bonds, 1 pseudobond, 73 residues, 2 models selected |
| 3658 | | |
| 3659 | | > cofr sel |
| 3660 | | |
| 3661 | | > show sel atoms |
| 3662 | | |
| 3663 | | > color (#!4 & sel) byhetero |
| 3664 | | |
| 3665 | | > hide sel atoms |
| 3666 | | |
| 3667 | | > show sel atoms |
| 3668 | | |
| 3669 | | > color (#!4 & sel) byhetero |
| 3670 | | |
| 3671 | | > view name Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3672 | | |
| 3673 | | > view list |
| 3674 | | |
| 3675 | | Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 3676 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 3677 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 3678 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, |
| 3679 | | Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, |
| 3680 | | Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, fig2_density, |
| 3681 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 3682 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 3683 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 3684 | | |
| 3685 | | > view Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go |
| 3686 | | |
| 3687 | | > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3688 | | |
| 3689 | | > view Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3690 | | |
| 3691 | | > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3692 | | |
| 3693 | | > view Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3694 | | |
| 3695 | | > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3696 | | |
| 3697 | | > view Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3698 | | |
| 3699 | | [Repeated 2 time(s)] |
| 3700 | | |
| 3701 | | > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3702 | | |
| 3703 | | > help help:user |
| 3704 | | |
| 3705 | | > name delete Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3706 | | |
| 3707 | | deregistering unregistered selector "Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go" |
| 3708 | | |
| 3709 | | > name list |
| 3710 | | |
| 3711 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8 #7/A:272-315 #9/C:408-450 |
| 3712 | | GBeta_2025 #2,5,9,10,11,12,27/B #4,7,8,15,16,18,20/C |
| 3713 | | GGamma_2025 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/G |
| 3714 | | GRK2_Helix #26/G:2-20 |
| 3715 | | Go_2025 #2,5,6,9,10,11,12,27/A #4,7,8,15,16,18,20/B |
| 3716 | | JR-SB_PIF #1,11,13/C:348,110,386 |
| 3717 | | JR14-SB_CWxP #1,11,13/C:389,390,392 |
| 3718 | | JR14-SB_NPxxY #1,11,13/C:431,432,435 |
| 3719 | | NTSR1-GRK #26/G:2-20 #26/R |
| 3720 | | ScFv_2014 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/H |
| 3721 | | all_lig #1/D #14/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1 |
| 3722 | | #12/C:JR1 #13/A:LIG |
| 3723 | | all_lig_recep #1/D #2/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1 |
| 3724 | | #12/C:JR1 #13/A:LIG #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C |
| 3725 | | #12/E #13/C |
| 3726 | | all_recep #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C #12/E #13/C |
| 3727 | | hC3a-JR14-SB_TM6 #1,11,13/C:371-404 |
| 3728 | | hC3a-JR14-SB_TM7 #1,11,13/C:406-439 |
| 3729 | | panchMukhi5ptSwitch #1/C:78,102,340,393,417 #11/C:78,102,340,393,417 |
| 3730 | | #13/C:78,102,340,393,417 |
| 3731 | | |
| 3732 | | > view list |
| 3733 | | |
| 3734 | | Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 3735 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 3736 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 3737 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, |
| 3738 | | Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, |
| 3739 | | Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, fig2_density, |
| 3740 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 3741 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 3742 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 3743 | | |
| 3744 | | > view Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3745 | | |
| 3746 | | > view list |
| 3747 | | |
| 3748 | | Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 3749 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 3750 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 3751 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, |
| 3752 | | Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, |
| 3753 | | Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, fig2_density, |
| 3754 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 3755 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 3756 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 3757 | | |
| 3758 | | > help help:user |
| 3759 | | |
| 3760 | | > view Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3761 | | |
| 3762 | | > view delete Lig_04_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3763 | | |
| 3764 | | > view list |
| 3765 | | |
| 3766 | | Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 3767 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 3768 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 3769 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, |
| 3770 | | Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, |
| 3771 | | Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, fig2_density, hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, |
| 3772 | | hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg- |
| 3773 | | hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, |
| 3774 | | view_01, view_02 |
| 3775 | | |
| 3776 | | > view Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go |
| 3777 | | |
| 3778 | | > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go |
| 3779 | | |
| 3780 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3781 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/04_Density_Lig_mC5a-mC5aR1-Go.png width 2000 |
| 3782 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3783 | | |
| 3784 | | > hide #!4 models |
| 3785 | | |
| 3786 | | > show #!5 models |
| 3787 | | |
| 3788 | | > hide #!29 models |
| 3789 | | |
| 3790 | | > show #!30 models |
| 3791 | | |
| 3792 | | > volume #30 level 0.02238 |
| 3793 | | |
| 3794 | | > view name Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go |
| 3795 | | |
| 3796 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3797 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/05_Density_Lig_hTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 |
| 3798 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3799 | | |
| 3800 | | > hide #!30 models |
| 3801 | | |
| 3802 | | > show #!31 models |
| 3803 | | |
| 3804 | | > show #!6 models |
| 3805 | | |
| 3806 | | > hide #!5 models |
| 3807 | | |
| 3808 | | > select add #4 |
| 3809 | | |
| 3810 | | 8774 atoms, 8959 bonds, 5 pseudobonds, 1198 residues, 2 models selected |
| 3811 | | |
| 3812 | | > select subtract #4 |
| 3813 | | |
| 3814 | | Nothing selected |
| 3815 | | |
| 3816 | | > select add #6 |
| 3817 | | |
| 3818 | | 8164 atoms, 8351 bonds, 5 pseudobonds, 1126 residues, 2 models selected |
| 3819 | | |
| 3820 | | > hide #!6 models |
| 3821 | | |
| 3822 | | > show #!6 models |
| 3823 | | |
| 3824 | | > select subtract #6 |
| 3825 | | |
| 3826 | | Nothing selected |
| 3827 | | |
| 3828 | | > select add #6 |
| 3829 | | |
| 3830 | | 8164 atoms, 8351 bonds, 5 pseudobonds, 1126 residues, 2 models selected |
| 3831 | | |
| 3832 | | > select subtract #6 |
| 3833 | | |
| 3834 | | Nothing selected |
| 3835 | | |
| 3836 | | > select add #6 |
| 3837 | | |
| 3838 | | 8164 atoms, 8351 bonds, 5 pseudobonds, 1126 residues, 2 models selected |
| 3839 | | |
| 3840 | | > hide #!6 models |
| 3841 | | |
| 3842 | | > show #!6 models |
| 3843 | | |
| 3844 | | > select subtract #6 |
| 3845 | | |
| 3846 | | Nothing selected |
| 3847 | | |
| 3848 | | > volume #31 style mesh |
| 3849 | | |
| 3850 | | > select #6/D |
| 3851 | | |
| 3852 | | 100 atoms, 105 bonds, 13 residues, 1 model selected |
| 3853 | | |
| 3854 | | > select #6/D |
| 3855 | | |
| 3856 | | 100 atoms, 105 bonds, 13 residues, 1 model selected |
| 3857 | | |
| 3858 | | > volume zone #30 nearAtoms #6/D |
| 3859 | | |
| 3860 | | > volume zone #31 nearAtoms #6/D |
| 3861 | | |
| 3862 | | > hide sel atoms |
| 3863 | | |
| 3864 | | > show sel atoms |
| 3865 | | |
| 3866 | | > color sel byhetero |
| 3867 | | |
| 3868 | | > volume #31 level 0.03112 |
| 3869 | | |
| 3870 | | > select ~sel & ##selected |
| 3871 | | |
| 3872 | | 8064 atoms, 8246 bonds, 5 pseudobonds, 1113 residues, 2 models selected |
| 3873 | | |
| 3874 | | > hide sel cartoons |
| 3875 | | |
| 3876 | | > select #6/D |
| 3877 | | |
| 3878 | | 100 atoms, 105 bonds, 13 residues, 1 model selected |
| 3879 | | |
| 3880 | | > cofr sel |
| 3881 | | |
| 3882 | | > volume #31 level 0.008813 |
| 3883 | | |
| 3884 | | > view name Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go |
| 3885 | | |
| 3886 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3887 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/06_Lig_Density_mTLQP-mC3aR-Go.png width 2000 |
| 3888 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3889 | | |
| 3890 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3891 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 3892 | | |
| 3893 | | > show #!32 models |
| 3894 | | |
| 3895 | | > hide #!31 models |
| 3896 | | |
| 3897 | | > show #!7 models |
| 3898 | | |
| 3899 | | > hide #!6 models |
| 3900 | | |
| 3901 | | > select add #6 |
| 3902 | | |
| 3903 | | 8164 atoms, 8351 bonds, 5 pseudobonds, 1126 residues, 2 models selected |
| 3904 | | |
| 3905 | | > select subtract #6 |
| 3906 | | |
| 3907 | | Nothing selected |
| 3908 | | |
| 3909 | | > select #7/D |
| 3910 | | |
| 3911 | | 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected |
| 3912 | | |
| 3913 | | > volume zone #32 nearAtoms sel |
| 3914 | | |
| 3915 | | > show sel atoms |
| 3916 | | |
| 3917 | | > color sel byhetero |
| 3918 | | |
| 3919 | | > select ~sel & ##selected |
| 3920 | | |
| 3921 | | 8161 atoms, 8342 bonds, 3 pseudobonds, 1118 residues, 2 models selected |
| 3922 | | |
| 3923 | | > hide sel cartoons |
| 3924 | | |
| 3925 | | > volume #32 style mesh |
| 3926 | | |
| 3927 | | > select ~sel & ##selected |
| 3928 | | |
| 3929 | | 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected |
| 3930 | | |
| 3931 | | > cofr sel |
| 3932 | | |
| 3933 | | > volume #32 level 0.01033 |
| 3934 | | |
| 3935 | | > select up |
| 3936 | | |
| 3937 | | 8248 atoms, 8431 bonds, 1128 residues, 1 model selected |
| 3938 | | |
| 3939 | | > select up |
| 3940 | | |
| 3941 | | 197971 atoms, 202307 bonds, 3 pseudobonds, 27084 residues, 55 models selected |
| 3942 | | |
| 3943 | | > select down |
| 3944 | | |
| 3945 | | 8248 atoms, 8431 bonds, 1128 residues, 1 model selected |
| 3946 | | |
| 3947 | | > view name Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go |
| 3948 | | |
| 3949 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 3950 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/07_Density_Lig_EP67-hC5aR1-Go.png width 2000 |
| 3951 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 3952 | | |
| 3953 | | > hide #!32 models |
| 3954 | | |
| 3955 | | > show #!33 models |
| 3956 | | |
| 3957 | | > show #!8 models |
| 3958 | | |
| 3959 | | > hide #!7 models |
| 3960 | | |
| 3961 | | > select add #7 |
| 3962 | | |
| 3963 | | 8248 atoms, 8431 bonds, 3 pseudobonds, 1128 residues, 2 models selected |
| 3964 | | |
| 3965 | | > select subtract #7 |
| 3966 | | |
| 3967 | | Nothing selected |
| 3968 | | |
| 3969 | | > select #8/D |
| 3970 | | |
| 3971 | | 75 atoms, 76 bonds, 9 residues, 1 model selected |
| 3972 | | |
| 3973 | | > color sel byhetero |
| 3974 | | |
| 3975 | | > volume zone #33 nearAtoms sel |
| 3976 | | |
| 3977 | | > select ~sel & ##selected |
| 3978 | | |
| 3979 | | 8078 atoms, 8254 bonds, 5 pseudobonds, 1110 residues, 2 models selected |
| 3980 | | |
| 3981 | | > hide sel cartoons |
| 3982 | | |
| 3983 | | > select ~sel & ##selected |
| 3984 | | |
| 3985 | | 75 atoms, 76 bonds, 9 residues, 1 model selected |
| 3986 | | |
| 3987 | | > volume #33 style mesh |
| 3988 | | |
| 3989 | | > view list |
| 3990 | | |
| 3991 | | Named views: C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 3992 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 3993 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 3994 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, |
| 3995 | | Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, |
| 3996 | | Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, |
| 3997 | | Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, |
| 3998 | | hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg- |
| 3999 | | hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, |
| 4000 | | view_01, view_02 |
| 4001 | | |
| 4002 | | > view Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go |
| 4003 | | |
| 4004 | | > volume #33 level 0.01116 |
| 4005 | | |
| 4006 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4007 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/08_Density_Lig_EP67-mC5aR1-Go.png width 2000 |
| 4008 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 4009 | | |
| 4010 | | > hide #!33 models |
| 4011 | | |
| 4012 | | > show #!34 models |
| 4013 | | |
| 4014 | | > hide #!8 models |
| 4015 | | |
| 4016 | | > show #!9 models |
| 4017 | | |
| 4018 | | > select #9/D |
| 4019 | | |
| 4020 | | 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected |
| 4021 | | |
| 4022 | | > color sel byhetero |
| 4023 | | |
| 4024 | | > volume zone #34 nearAtoms sel |
| 4025 | | |
| 4026 | | > volume #34 style mesh |
| 4027 | | |
| 4028 | | > cofr sel |
| 4029 | | |
| 4030 | | > view Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go |
| 4031 | | |
| 4032 | | > select ~sel & ##selected |
| 4033 | | |
| 4034 | | 8148 atoms, 8329 bonds, 4 pseudobonds, 1113 residues, 2 models selected |
| 4035 | | |
| 4036 | | > hide sel cartoons |
| 4037 | | |
| 4038 | | > volume #34 level 0.03756 |
| 4039 | | |
| 4040 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4041 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/09_Lig_Density_EP67-hC3aR-Go.png width 2000 |
| 4042 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 4043 | | |
| 4044 | | > show #!35 models |
| 4045 | | |
| 4046 | | > hide #!34 models |
| 4047 | | |
| 4048 | | > hide #!9 models |
| 4049 | | |
| 4050 | | > show #!10 models |
| 4051 | | |
| 4052 | | > select #10/D |
| 4053 | | |
| 4054 | | 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected |
| 4055 | | |
| 4056 | | > color sel byhetero |
| 4057 | | |
| 4058 | | > volume zone #35 nearAtoms sel |
| 4059 | | |
| 4060 | | > volume #35 |
| 4061 | | |
| 4062 | | > volume #35 style mesh |
| 4063 | | |
| 4064 | | > select ~sel |
| 4065 | | |
| 4066 | | 197884 atoms, 202218 bonds, 120 pseudobonds, 27074 residues, 84 models |
| 4067 | | selected |
| 4068 | | |
| 4069 | | > select clear |
| 4070 | | |
| 4071 | | > select #10/D |
| 4072 | | |
| 4073 | | 87 atoms, 89 bonds, 10 residues, 1 model selected |
| 4074 | | |
| 4075 | | > select ~sel & ##selected |
| 4076 | | |
| 4077 | | 8086 atoms, 8270 bonds, 6 pseudobonds, 1112 residues, 2 models selected |
| 4078 | | |
| 4079 | | > hide sel cartoons |
| 4080 | | |
| 4081 | | > view Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go |
| 4082 | | |
| 4083 | | > volume #35 level 0.007509 |
| 4084 | | |
| 4085 | | > show #!34 models |
| 4086 | | |
| 4087 | | > hide #!34 models |
| 4088 | | |
| 4089 | | > show #!34 models |
| 4090 | | |
| 4091 | | > hide #!34 models |
| 4092 | | |
| 4093 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4094 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/10_Lig_Density_EP67-mC3aR-Go.png width 2000 |
| 4095 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 4096 | | |
| 4097 | | > hide #!35 models |
| 4098 | | |
| 4099 | | > show #!36 models |
| 4100 | | |
| 4101 | | > hide #!10 models |
| 4102 | | |
| 4103 | | > show #!11 models |
| 4104 | | |
| 4105 | | > volume #36 color #babdb6 |
| 4106 | | |
| 4107 | | > select #11/C:JR1 |
| 4108 | | |
| 4109 | | 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4110 | | |
| 4111 | | > color sel byhetero |
| 4112 | | |
| 4113 | | > volume zone #36 nearAtoms sel |
| 4114 | | |
| 4115 | | > select ~sel & ##selected |
| 4116 | | |
| 4117 | | 8099 atoms, 8279 bonds, 6 pseudobonds, 1100 residues, 2 models selected |
| 4118 | | |
| 4119 | | > hide sel cartoons |
| 4120 | | |
| 4121 | | > select ~sel & ##selected |
| 4122 | | |
| 4123 | | 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4124 | | |
| 4125 | | > show sel cartoons |
| 4126 | | |
| 4127 | | > show sel atoms |
| 4128 | | |
| 4129 | | > hide #!36 models |
| 4130 | | |
| 4131 | | > show #!36 models |
| 4132 | | |
| 4133 | | > hide sel atoms |
| 4134 | | |
| 4135 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 4136 | | |
| 4137 | | > show sel atoms |
| 4138 | | |
| 4139 | | > select #11/C:JR1 |
| 4140 | | |
| 4141 | | 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4142 | | |
| 4143 | | > select ~sel & ##selected |
| 4144 | | |
| 4145 | | 8099 atoms, 8279 bonds, 6 pseudobonds, 1100 residues, 2 models selected |
| 4146 | | |
| 4147 | | > hide sel atoms |
| 4148 | | |
| 4149 | | > volume #36 style mesh |
| 4150 | | |
| 4151 | | > select ~sel & ##selected |
| 4152 | | |
| 4153 | | 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4154 | | |
| 4155 | | > cofr sel |
| 4156 | | |
| 4157 | | > select ~sel & ##selected |
| 4158 | | |
| 4159 | | 8099 atoms, 8279 bonds, 6 pseudobonds, 1100 residues, 2 models selected |
| 4160 | | |
| 4161 | | > show sel cartoons |
| 4162 | | |
| 4163 | | > hide sel cartoons |
| 4164 | | |
| 4165 | | > select ~sel & ##selected |
| 4166 | | |
| 4167 | | 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4168 | | |
| 4169 | | > volume #36 level 0.0278 |
| 4170 | | |
| 4171 | | > view name 11_Density_JR14A-hC3aR-Go |
| 4172 | | |
| 4173 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 4174 | | |
| 4175 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4176 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/11_Lig_Density_JR14A-hC3aR-Go.png width 2000 |
| 4177 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 4178 | | |
| 4179 | | > show #!37 models |
| 4180 | | |
| 4181 | | > hide #!36 models |
| 4182 | | |
| 4183 | | > show #!12 models |
| 4184 | | |
| 4185 | | > hide #!11 models |
| 4186 | | |
| 4187 | | > select add #11 |
| 4188 | | |
| 4189 | | 8134 atoms, 8316 bonds, 6 pseudobonds, 1101 residues, 2 models selected |
| 4190 | | |
| 4191 | | > select subtract #11 |
| 4192 | | |
| 4193 | | Nothing selected |
| 4194 | | |
| 4195 | | > volume #37 color #babdb6 |
| 4196 | | |
| 4197 | | > select #12/C:JR1 |
| 4198 | | |
| 4199 | | 35 atoms, 37 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4200 | | |
| 4201 | | > volume zone #37 nearAtoms sel |
| 4202 | | |
| 4203 | | > volume #37 style mesh |
| 4204 | | |
| 4205 | | > select ~sel & ##selected |
| 4206 | | |
| 4207 | | 8057 atoms, 8237 bonds, 6 pseudobonds, 1111 residues, 2 models selected |
| 4208 | | |
| 4209 | | > hide sel cartoons |
| 4210 | | |
| 4211 | | > view list |
| 4212 | | |
| 4213 | | Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, |
| 4214 | | C3a_angle_02, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, |
| 4215 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, |
| 4216 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, |
| 4217 | | JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, |
| 4218 | | Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, |
| 4219 | | Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, |
| 4220 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 4221 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 4222 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 4223 | | |
| 4224 | | > view 11_Density_JR14A-hC3aR-Go |
| 4225 | | |
| 4226 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 4227 | | |
| 4228 | | > show #!11 models |
| 4229 | | |
| 4230 | | > hide #!11 models |
| 4231 | | |
| 4232 | | > volume #37 level 0.04456 |
| 4233 | | |
| 4234 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4235 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/12_Lig_Density_JR14-mC3aR-Go.png width 2000 |
| 4236 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 4237 | | |
| 4238 | | > show #!38 models |
| 4239 | | |
| 4240 | | > hide #!37 models |
| 4241 | | |
| 4242 | | > show #!27 models |
| 4243 | | |
| 4244 | | > hide #!12 models |
| 4245 | | |
| 4246 | | > volume #38 color #babdb6 |
| 4247 | | |
| 4248 | | > select add #12 |
| 4249 | | |
| 4250 | | 8092 atoms, 8274 bonds, 6 pseudobonds, 1112 residues, 2 models selected |
| 4251 | | |
| 4252 | | > select subtract #12 |
| 4253 | | |
| 4254 | | Nothing selected |
| 4255 | | |
| 4256 | | > select #27/Z:LIG |
| 4257 | | |
| 4258 | | 30 atoms, 31 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4259 | | |
| 4260 | | > volume zone #38 nearAtoms sel |
| 4261 | | |
| 4262 | | > volume #38 style mesh |
| 4263 | | |
| 4264 | | > select ~sel & ##selected |
| 4265 | | |
| 4266 | | 8140 atoms, 8320 bonds, 6 pseudobonds, 1104 residues, 2 models selected |
| 4267 | | |
| 4268 | | > hide sel cartoons |
| 4269 | | |
| 4270 | | > view list |
| 4271 | | |
| 4272 | | Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, |
| 4273 | | C3a_angle_02, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, |
| 4274 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, |
| 4275 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, |
| 4276 | | JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, |
| 4277 | | Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, |
| 4278 | | Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, |
| 4279 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 4280 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 4281 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 4282 | | |
| 4283 | | > view 11_Density_JR14A-hC3aR-Go |
| 4284 | | |
| 4285 | | > volume #38 level 0.01968 |
| 4286 | | |
| 4287 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4288 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/13_Lig_Density_SB-hC3aR-Go_Overall.png width |
| 4289 | | > 2000 height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 4290 | | |
| 4291 | | > hide #!38 models |
| 4292 | | |
| 4293 | | > show #!39 models |
| 4294 | | |
| 4295 | | > hide #!27 models |
| 4296 | | |
| 4297 | | > show #!15 models |
| 4298 | | |
| 4299 | | > select #15/F |
| 4300 | | |
| 4301 | | 492 atoms, 497 bonds, 2 pseudobonds, 71 residues, 2 models selected |
| 4302 | | |
| 4303 | | > show sel atoms |
| 4304 | | |
| 4305 | | > color (#!15 & sel) byhetero |
| 4306 | | |
| 4307 | | > volume zone #39 nearAtoms sel |
| 4308 | | |
| 4309 | | > volume #39 color #babdb6 |
| 4310 | | |
| 4311 | | > volume #39 style mesh |
| 4312 | | |
| 4313 | | > cofr sel |
| 4314 | | |
| 4315 | | > select ~sel & ##selected |
| 4316 | | |
| 4317 | | 8131 atoms, 8302 bonds, 5 pseudobonds, 1128 residues, 2 models selected |
| 4318 | | |
| 4319 | | > hide sel cartoons |
| 4320 | | |
| 4321 | | > volume #39 level 0.07583 |
| 4322 | | |
| 4323 | | > view Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go |
| 4324 | | |
| 4325 | | > view name 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go |
| 4326 | | |
| 4327 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4328 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 4329 | | |
| 4330 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4331 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go.png width 2000 |
| 4332 | | > height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 4333 | | |
| 4334 | | > show #!40 models |
| 4335 | | |
| 4336 | | > hide #!39 models |
| 4337 | | |
| 4338 | | > show #!18 models |
| 4339 | | |
| 4340 | | > hide #!15 models |
| 4341 | | |
| 4342 | | > volume #40 color #babdb6 |
| 4343 | | |
| 4344 | | > volume #40 style mesh |
| 4345 | | |
| 4346 | | > select #18/F |
| 4347 | | |
| 4348 | | 419 atoms, 424 bonds, 2 pseudobonds, 67 residues, 2 models selected |
| 4349 | | |
| 4350 | | > select ~sel & ##selected |
| 4351 | | |
| 4352 | | 8267 atoms, 8448 bonds, 4 pseudobonds, 1125 residues, 2 models selected |
| 4353 | | |
| 4354 | | > hide sel cartoons |
| 4355 | | |
| 4356 | | > select ~sel & ##selected |
| 4357 | | |
| 4358 | | 419 atoms, 424 bonds, 2 pseudobonds, 67 residues, 2 models selected |
| 4359 | | |
| 4360 | | > show sel atoms |
| 4361 | | |
| 4362 | | > style sel stick |
| 4363 | | |
| 4364 | | Changed 419 atom styles |
| 4365 | | |
| 4366 | | > color (#!18 & sel) byhetero |
| 4367 | | |
| 4368 | | > volume zone #40 nearAtoms sel |
| 4369 | | |
| 4370 | | > volume #40 level 0.01494 |
| 4371 | | |
| 4372 | | > view list |
| 4373 | | |
| 4374 | | Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go, |
| 4375 | | C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 4376 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 4377 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 4378 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, |
| 4379 | | Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, |
| 4380 | | Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, |
| 4381 | | Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, |
| 4382 | | hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg- |
| 4383 | | hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, |
| 4384 | | view_01, view_02 |
| 4385 | | |
| 4386 | | > view 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go |
| 4387 | | |
| 4388 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4389 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/17_Lig_Density_mC5adesArg-mC5aR1-Go.png width |
| 4390 | | > 2000 height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 4391 | | |
| 4392 | | > hide #!40 models |
| 4393 | | |
| 4394 | | > show #!39 models |
| 4395 | | |
| 4396 | | > hide #!18 models |
| 4397 | | |
| 4398 | | > show #!17 models |
| 4399 | | |
| 4400 | | > hide #!17 models |
| 4401 | | |
| 4402 | | > show #!18 models |
| 4403 | | |
| 4404 | | > hide #!18 models |
| 4405 | | |
| 4406 | | > show #!16 models |
| 4407 | | |
| 4408 | | > hide #!16 models |
| 4409 | | |
| 4410 | | > show #!15 models |
| 4411 | | |
| 4412 | | > select add #18 |
| 4413 | | |
| 4414 | | 8686 atoms, 8872 bonds, 6 pseudobonds, 1192 residues, 2 models selected |
| 4415 | | |
| 4416 | | > select #15/F |
| 4417 | | |
| 4418 | | 492 atoms, 497 bonds, 2 pseudobonds, 71 residues, 2 models selected |
| 4419 | | |
| 4420 | | > hide #!15 models |
| 4421 | | |
| 4422 | | > select add #15 |
| 4423 | | |
| 4424 | | 8623 atoms, 8799 bonds, 7 pseudobonds, 1199 residues, 2 models selected |
| 4425 | | |
| 4426 | | > select subtract #15 |
| 4427 | | |
| 4428 | | Nothing selected |
| 4429 | | |
| 4430 | | > hide #!39 models |
| 4431 | | |
| 4432 | | > show #!40 models |
| 4433 | | |
| 4434 | | > show #!18 models |
| 4435 | | |
| 4436 | | > show #!41 models |
| 4437 | | |
| 4438 | | > hide #!40 models |
| 4439 | | |
| 4440 | | > volume #41 color #babdb6 |
| 4441 | | |
| 4442 | | > select #20/D |
| 4443 | | |
| 4444 | | 444 atoms, 448 bonds, 73 residues, 1 model selected |
| 4445 | | |
| 4446 | | > show #!20 models |
| 4447 | | |
| 4448 | | > hide #!18 models |
| 4449 | | |
| 4450 | | > volume zone #41 nearAtoms sel |
| 4451 | | |
| 4452 | | > volume #41 style mesh |
| 4453 | | |
| 4454 | | > select ~sel & ##selected |
| 4455 | | |
| 4456 | | 8179 atoms, 8353 bonds, 4 pseudobonds, 1122 residues, 2 models selected |
| 4457 | | |
| 4458 | | > hide sel cartoons |
| 4459 | | |
| 4460 | | > select ~sel & ##selected |
| 4461 | | |
| 4462 | | 444 atoms, 448 bonds, 73 residues, 1 model selected |
| 4463 | | |
| 4464 | | > show sel atoms |
| 4465 | | |
| 4466 | | > style sel stick |
| 4467 | | |
| 4468 | | Changed 444 atom styles |
| 4469 | | |
| 4470 | | > color sel byhetero |
| 4471 | | |
| 4472 | | > volume #41 level 0.05885 |
| 4473 | | |
| 4474 | | > view 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go |
| 4475 | | |
| 4476 | | > volume #41 level 0.0294 |
| 4477 | | |
| 4478 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4479 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/18_Lig_Density_hC5adesArg-mC5aR1-Go.png width |
| 4480 | | > 2000 height 1245 supersample 4 transparentBackground true |
| 4481 | | |
| 4482 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4483 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect.cxs |
| 4484 | | |
| 4485 | | ——— End of log from Tue Feb 4 13:08:16 2025 ——— |
| 4486 | | |
| 4487 | | opened ChimeraX session |
| 4488 | | |
| 4489 | | > hide #!20 models |
| 4490 | | |
| 4491 | | > hide #!41 models |
| 4492 | | |
| 4493 | | > show #!20 models |
| 4494 | | |
| 4495 | | > hide #!20 models |
| 4496 | | |
| 4497 | | > show #!2 models |
| 4498 | | |
| 4499 | | > show #!14 models |
| 4500 | | |
| 4501 | | Drag select of 504 residues, 2 pseudobonds |
| 4502 | | |
| 4503 | | > select up |
| 4504 | | |
| 4505 | | 4259 atoms, 4328 bonds, 2 pseudobonds, 601 residues, 2 models selected |
| 4506 | | |
| 4507 | | > select up |
| 4508 | | |
| 4509 | | 5913 atoms, 6036 bonds, 2 pseudobonds, 831 residues, 2 models selected |
| 4510 | | |
| 4511 | | > hide sel cartoons |
| 4512 | | |
| 4513 | | Drag select of 291 residues, 1 pseudobonds, 59 atoms, 50 bonds |
| 4514 | | |
| 4515 | | > select clear |
| 4516 | | |
| 4517 | | > show #!6 models |
| 4518 | | |
| 4519 | | > hide #!2,6,14 cartoons |
| 4520 | | |
| 4521 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 4522 | | |
| 4523 | | > show #!2,6,14 cartoons |
| 4524 | | |
| 4525 | | Drag select of 567 residues, 4 pseudobonds |
| 4526 | | |
| 4527 | | > select up |
| 4528 | | |
| 4529 | | 4988 atoms, 5049 bonds, 4 pseudobonds, 706 residues, 4 models selected |
| 4530 | | |
| 4531 | | > select up |
| 4532 | | |
| 4533 | | 10252 atoms, 10458 bonds, 4 pseudobonds, 1436 residues, 4 models selected |
| 4534 | | |
| 4535 | | > select up |
| 4536 | | |
| 4537 | | 10456 atoms, 10662 bonds, 4 pseudobonds, 1467 residues, 4 models selected |
| 4538 | | |
| 4539 | | > hide sel cartoons |
| 4540 | | |
| 4541 | | Drag select of 88 residues |
| 4542 | | |
| 4543 | | > select up |
| 4544 | | |
| 4545 | | 825 atoms, 831 bonds, 124 residues, 2 models selected |
| 4546 | | |
| 4547 | | > select up |
| 4548 | | |
| 4549 | | 1579 atoms, 1619 bonds, 227 residues, 2 models selected |
| 4550 | | |
| 4551 | | > select up |
| 4552 | | |
| 4553 | | 1605 atoms, 1643 bonds, 231 residues, 2 models selected |
| 4554 | | |
| 4555 | | > hide sel cartoons |
| 4556 | | |
| 4557 | | Drag select of 585 residues, 2 pseudobonds, 121 atoms, 105 bonds |
| 4558 | | |
| 4559 | | > cofr sel |
| 4560 | | |
| 4561 | | > select clear |
| 4562 | | |
| 4563 | | > select sequence FICWTPYHLVG |
| 4564 | | |
| 4565 | | 470 atoms, 495 bonds, 55 residues, 5 models selected |
| 4566 | | |
| 4567 | | > select sequence FICWTPYHLVG |
| 4568 | | |
| 4569 | | 470 atoms, 495 bonds, 55 residues, 5 models selected |
| 4570 | | |
| 4571 | | > ui tool show "Show Sequence Viewer" |
| 4572 | | |
| 4573 | | > sequence chain #2/E |
| 4574 | | |
| 4575 | | Alignment identifier is 2/E |
| 4576 | | |
| 4577 | | > select #2/E:380-381 |
| 4578 | | |
| 4579 | | 19 atoms, 19 bonds, 2 residues, 1 model selected |
| 4580 | | |
| 4581 | | > select #2/E:380-390 |
| 4582 | | |
| 4583 | | 94 atoms, 99 bonds, 11 residues, 1 model selected |
| 4584 | | |
| 4585 | | > save "/nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4586 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect (copy).cxs" includeMaps |
| 4587 | | > true |
| 4588 | | |
| 4589 | | > graphics selection width 2 color lime green |
| 4590 | | |
| 4591 | | > hide #!6 models |
| 4592 | | |
| 4593 | | > select |
| 4594 | | > #2/E:21-51,58-84,92-125,127-133,136-160,324-356,367-395,401-427,433-442 |
| 4595 | | |
| 4596 | | 1639 atoms, 1677 bonds, 223 residues, 1 model selected |
| 4597 | | |
| 4598 | | > select #2/E:380 |
| 4599 | | |
| 4600 | | 11 atoms, 11 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4601 | | |
| 4602 | | > select #2/E:380-390 |
| 4603 | | |
| 4604 | | 94 atoms, 99 bonds, 11 residues, 1 model selected |
| 4605 | | |
| 4606 | | > select sequence AVMSWDHMSIA |
| 4607 | | |
| 4608 | | 409 atoms, 419 bonds, 55 residues, 5 models selected |
| 4609 | | |
| 4610 | | > select #2/E:405 |
| 4611 | | |
| 4612 | | 5 atoms, 4 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4613 | | |
| 4614 | | > select #2/E:405-415 |
| 4615 | | |
| 4616 | | 81 atoms, 83 bonds, 11 residues, 1 model selected |
| 4617 | | |
| 4618 | | > select sequence ASANSCFNPFL |
| 4619 | | |
| 4620 | | 971 atoms, 995 bonds, 132 residues, 12 models selected |
| 4621 | | |
| 4622 | | > select #2/E:417 |
| 4623 | | |
| 4624 | | 5 atoms, 4 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4625 | | |
| 4626 | | > select #2/E:417-427 |
| 4627 | | |
| 4628 | | 81 atoms, 83 bonds, 11 residues, 1 model selected |
| 4629 | | |
| 4630 | | > select clear |
| 4631 | | |
| 4632 | | > select #2/E:414,D:77,78 |
| 4633 | | |
| 4634 | | 25 atoms, 24 bonds, 3 residues, 1 model selected |
| 4635 | | |
| 4636 | | > select #2/E:414,/D:77,78 |
| 4637 | | |
| 4638 | | Expected an objects specifier or a keyword |
| 4639 | | |
| 4640 | | > select #2/E:414 #2/D:77,78 |
| 4641 | | |
| 4642 | | 8 atoms, 7 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 4643 | | |
| 4644 | | > select clear |
| 4645 | | |
| 4646 | | > select #2/D:77 |
| 4647 | | |
| 4648 | | Nothing selected |
| 4649 | | |
| 4650 | | > select #2/E:414 #14/D:77,78 |
| 4651 | | |
| 4652 | | 25 atoms, 23 bonds, 3 residues, 2 models selected |
| 4653 | | |
| 4654 | | > save "/nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4655 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect (copy).cxs" includeMaps |
| 4656 | | > true |
| 4657 | | |
| 4658 | | ——— End of log from Tue Feb 11 12:29:50 2025 ——— |
| 4659 | | |
| 4660 | | opened ChimeraX session |
| 4661 | | |
| 4662 | | > view list |
| 4663 | | |
| 4664 | | Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go, |
| 4665 | | C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 4666 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 4667 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 4668 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, |
| 4669 | | Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, |
| 4670 | | Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, |
| 4671 | | Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, |
| 4672 | | hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg- |
| 4673 | | hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, |
| 4674 | | view_01, view_02 |
| 4675 | | |
| 4676 | | > view H8_overall |
| 4677 | | |
| 4678 | | > view H8_zoomed |
| 4679 | | |
| 4680 | | > show #!4 models |
| 4681 | | |
| 4682 | | > hide #!2 models |
| 4683 | | |
| 4684 | | > show sel & #!14 cartoons |
| 4685 | | |
| 4686 | | > hide #!4 models |
| 4687 | | |
| 4688 | | > show #!4 models |
| 4689 | | |
| 4690 | | > hide #!4 models |
| 4691 | | |
| 4692 | | > show #!4 models |
| 4693 | | |
| 4694 | | > show sel & #!14 cartoons |
| 4695 | | |
| 4696 | | > hide #!14 models |
| 4697 | | |
| 4698 | | > show #!4 atoms |
| 4699 | | |
| 4700 | | > show #!4 cartoons |
| 4701 | | |
| 4702 | | > hide #!4 atoms |
| 4703 | | |
| 4704 | | Drag select of 320 residues, 2 pseudobonds |
| 4705 | | |
| 4706 | | > select up |
| 4707 | | |
| 4708 | | 2787 atoms, 2827 bonds, 2 pseudobonds, 384 residues, 2 models selected |
| 4709 | | |
| 4710 | | > select up |
| 4711 | | |
| 4712 | | 4409 atoms, 4489 bonds, 2 pseudobonds, 603 residues, 2 models selected |
| 4713 | | |
| 4714 | | > hide sel cartoons |
| 4715 | | |
| 4716 | | Drag select of 186 residues |
| 4717 | | |
| 4718 | | > select up |
| 4719 | | |
| 4720 | | 1535 atoms, 1568 bonds, 213 residues, 1 model selected |
| 4721 | | |
| 4722 | | > select up |
| 4723 | | |
| 4724 | | 1656 atoms, 1695 bonds, 230 residues, 1 model selected |
| 4725 | | |
| 4726 | | > select up |
| 4727 | | |
| 4728 | | 8774 atoms, 8959 bonds, 1198 residues, 1 model selected |
| 4729 | | |
| 4730 | | > select down |
| 4731 | | |
| 4732 | | 1656 atoms, 1695 bonds, 230 residues, 1 model selected |
| 4733 | | |
| 4734 | | > hide sel cartoons |
| 4735 | | |
| 4736 | | > show #!18 models |
| 4737 | | |
| 4738 | | > show sel cartoons |
| 4739 | | |
| 4740 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 4741 | | |
| 4742 | | > hide sel cartoons |
| 4743 | | |
| 4744 | | > select clear |
| 4745 | | |
| 4746 | | > select add #18 |
| 4747 | | |
| 4748 | | 8686 atoms, 8872 bonds, 6 pseudobonds, 1192 residues, 2 models selected |
| 4749 | | |
| 4750 | | > hide sel atoms |
| 4751 | | |
| 4752 | | Drag select of 8 residues |
| 4753 | | |
| 4754 | | > select clear |
| 4755 | | |
| 4756 | | > show #!25 models |
| 4757 | | |
| 4758 | | > select #18/A |
| 4759 | | |
| 4760 | | 2199 atoms, 2259 bonds, 292 residues, 1 model selected |
| 4761 | | |
| 4762 | | > show sel cartoons |
| 4763 | | |
| 4764 | | > select clear |
| 4765 | | |
| 4766 | | > cartoon style modeHelix tube |
| 4767 | | |
| 4768 | | > view list |
| 4769 | | |
| 4770 | | Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go, |
| 4771 | | C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 4772 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 4773 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 4774 | | H8_overall, H8_zoomed, JR-SB_PIF, JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, |
| 4775 | | Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, |
| 4776 | | Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, |
| 4777 | | Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, |
| 4778 | | hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg- |
| 4779 | | hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, |
| 4780 | | view_01, view_02 |
| 4781 | | |
| 4782 | | > view H8_zoomed |
| 4783 | | |
| 4784 | | [Repeated 2 time(s)] |
| 4785 | | |
| 4786 | | > color #4/A #4cfff8 |
| 4787 | | |
| 4788 | | > color #18/A #007399 |
| 4789 | | |
| 4790 | | > view H8_overall |
| 4791 | | |
| 4792 | | [Repeated 2 time(s)] |
| 4793 | | |
| 4794 | | > view name H8_overall_mC5aR1 |
| 4795 | | |
| 4796 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4797 | | > Fingerprint_Final/Fig5_Images/03A_mC5a-mC5aR1+mC5adesArg- |
| 4798 | | > mC5aR1_overall_binding_pose.png width 2000 height 1129 supersample 4 |
| 4799 | | > transparentBackground true |
| 4800 | | |
| 4801 | | > view H8_zoomed |
| 4802 | | |
| 4803 | | > ui tool show "Side View" |
| 4804 | | |
| 4805 | | > view H8_zoomed |
| 4806 | | |
| 4807 | | > view name H8_zoomed_mC5aR1 |
| 4808 | | |
| 4809 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4810 | | > Fingerprint_Final/Fig5_Images/03A_mC5a-mC5aR1+mC5adesArg-mC5aR1_zoomed.png |
| 4811 | | > width 2000 height 1129 supersample 4 transparentBackground true |
| 4812 | | |
| 4813 | | > save "/nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4814 | | > Fingerprint_Final/combined_session_Fig2_moreCorrect (copy).cxs" includeMaps |
| 4815 | | > true |
| 4816 | | |
| 4817 | | ——— End of log from Sat Mar 15 15:38:25 2025 ——— |
| 4818 | | |
| 4819 | | opened ChimeraX session |
| 4820 | | |
| 4821 | | > name list |
| 4822 | | |
| 4823 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8 #7/A:272-315 #9/C:408-450 |
| 4824 | | GBeta_2025 #2,5,9,10,11,12,27/B #4,7,8,15,16,18,20/C |
| 4825 | | GGamma_2025 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/G |
| 4826 | | GRK2_Helix #26/G:2-20 |
| 4827 | | Go_2025 #2,5,6,9,10,11,12,27/A #4,7,8,15,16,18,20/B |
| 4828 | | JR-SB_PIF #1,11,13/C:348,110,386 |
| 4829 | | JR14-SB_CWxP #1,11,13/C:389,390,392 |
| 4830 | | JR14-SB_NPxxY #1,11,13/C:431,432,435 |
| 4831 | | NTSR1-GRK #26/G:2-20 #26/R |
| 4832 | | ScFv_2014 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/H |
| 4833 | | all_lig #1/D #14/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1 |
| 4834 | | #12/C:JR1 #13/A:LIG |
| 4835 | | all_lig_recep #1/D #2/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1 |
| 4836 | | #12/C:JR1 #13/A:LIG #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C |
| 4837 | | #12/E #13/C |
| 4838 | | all_recep #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C #12/E #13/C |
| 4839 | | hC3a-JR14-SB_TM6 #1,11,13/C:371-404 |
| 4840 | | hC3a-JR14-SB_TM7 #1,11,13/C:406-439 |
| 4841 | | panchMukhi5ptSwitch #1/C:78,102,340,393,417 #11/C:78,102,340,393,417 |
| 4842 | | #13/C:78,102,340,393,417 |
| 4843 | | |
| 4844 | | > name delete JR-SB_PI(V)F |
| 4845 | | |
| 4846 | | deregistering unregistered selector "JR-SB_PI(V)F" |
| 4847 | | |
| 4848 | | > ls |
| 4849 | | |
| 4850 | | Unknown command: ls |
| 4851 | | |
| 4852 | | > pwd |
| 4853 | | |
| 4854 | | Current working directory is: /home/dell |
| 4855 | | |
| 4856 | | > hide #!4 models |
| 4857 | | |
| 4858 | | > hide #!18 models |
| 4859 | | |
| 4860 | | > hide #!25 models |
| 4861 | | |
| 4862 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4863 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/C5apep-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb |
| 4864 | | |
| 4865 | | Summary of feedback from opening /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models- |
| 4866 | | Maps-Complement-Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/C5apep-hC5aR1-Go- |
| 4867 | | DEPOSIT.pdb |
| 4868 | | --- |
| 4869 | | warning | Ignored bad PDB record found on line 23 |
| 4870 | | REMARK [No title given] |
| 4871 | | |
| 4872 | | Chain information for C5apep-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb #42 |
| 4873 | | --- |
| 4874 | | Chain | Description |
| 4875 | | B | No description available |
| 4876 | | C | No description available |
| 4877 | | D | No description available |
| 4878 | | G | No description available |
| 4879 | | H | No description available |
| 4880 | | L | No description available |
| 4881 | | |
| 4882 | | |
| 4883 | | > show #!1 models |
| 4884 | | |
| 4885 | | > hide #!1 models |
| 4886 | | |
| 4887 | | > show #!1 models |
| 4888 | | |
| 4889 | | > hide #!1,42 atoms |
| 4890 | | |
| 4891 | | > show #!1,42 cartoons |
| 4892 | | |
| 4893 | | > rename #42 24_C5aPep-hC5aR1-Go |
| 4894 | | |
| 4895 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4896 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep- |
| 4897 | | > hC5aR1-Go/cryosparc_P26_J70_009_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened- |
| 4898 | | > inverse.mrc |
| 4899 | | |
| 4900 | | Opened cryosparc_P26_J70_009_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened- |
| 4901 | | inverse.mrc as #43, grid size 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.00321, |
| 4902 | | step 1, values float32 |
| 4903 | | |
| 4904 | | > rename #43 24_Density_C5aPep-hC5aR1-Go |
| 4905 | | |
| 4906 | | > hide #!43 models |
| 4907 | | |
| 4908 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4909 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/C5apep-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb |
| 4910 | | |
| 4911 | | Summary of feedback from opening /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models- |
| 4912 | | Maps-Complement-Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/C5apep-hC5aR1-Go- |
| 4913 | | DEPOSIT.pdb |
| 4914 | | --- |
| 4915 | | warning | Ignored bad PDB record found on line 23 |
| 4916 | | REMARK [No title given] |
| 4917 | | |
| 4918 | | Chain information for C5apep-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb #44 |
| 4919 | | --- |
| 4920 | | Chain | Description |
| 4921 | | B | No description available |
| 4922 | | C | No description available |
| 4923 | | D | No description available |
| 4924 | | G | No description available |
| 4925 | | H | No description available |
| 4926 | | L | No description available |
| 4927 | | |
| 4928 | | |
| 4929 | | > hide #!1,42,44 atoms |
| 4930 | | |
| 4931 | | > show #!1,42,44 cartoons |
| 4932 | | |
| 4933 | | > rename #44 25_EP54-hC5aR1-Go |
| 4934 | | |
| 4935 | | > hide #!42 models |
| 4936 | | |
| 4937 | | > show #!42 models |
| 4938 | | |
| 4939 | | > hide #!44 models |
| 4940 | | |
| 4941 | | > show #!44 models |
| 4942 | | |
| 4943 | | > select add #44 |
| 4944 | | |
| 4945 | | 8235 atoms, 8411 bonds, 4 pseudobonds, 1124 residues, 2 models selected |
| 4946 | | |
| 4947 | | > select subtract #44 |
| 4948 | | |
| 4949 | | Nothing selected |
| 4950 | | |
| 4951 | | > select add #42 |
| 4952 | | |
| 4953 | | 8235 atoms, 8411 bonds, 4 pseudobonds, 1124 residues, 2 models selected |
| 4954 | | |
| 4955 | | > select subtract #42 |
| 4956 | | |
| 4957 | | Nothing selected |
| 4958 | | |
| 4959 | | > close #44 |
| 4960 | | |
| 4961 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4962 | | > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/EP54-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb |
| 4963 | | |
| 4964 | | Summary of feedback from opening /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models- |
| 4965 | | Maps-Complement-Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/EP54-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb |
| 4966 | | --- |
| 4967 | | warning | Ignored bad PDB record found on line 23 |
| 4968 | | REMARK [No title given] |
| 4969 | | |
| 4970 | | Chain information for EP54-hC5aR1-Go-DEPOSIT.pdb #44 |
| 4971 | | --- |
| 4972 | | Chain | Description |
| 4973 | | A | No description available |
| 4974 | | B | No description available |
| 4975 | | C | No description available |
| 4976 | | D | No description available |
| 4977 | | G | No description available |
| 4978 | | H | No description available |
| 4979 | | |
| 4980 | | |
| 4981 | | > select add #44 |
| 4982 | | |
| 4983 | | 8224 atoms, 8397 bonds, 4 pseudobonds, 1128 residues, 2 models selected |
| 4984 | | |
| 4985 | | > hide sel atoms |
| 4986 | | |
| 4987 | | > show sel cartoons |
| 4988 | | |
| 4989 | | > select clear |
| 4990 | | |
| 4991 | | > rename #44 25_EP54-hC5aR1-Go |
| 4992 | | |
| 4993 | | > open /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 4994 | | > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/cryosparc_P70_J115_010_volume_map_half_A_deepEMhancer- |
| 4995 | | > sharpened.mrc |
| 4996 | | |
| 4997 | | Opened cryosparc_P70_J115_010_volume_map_half_A_deepEMhancer-sharpened.mrc as |
| 4998 | | #45, grid size 256,256,256, pixel 1.21, shown at level 0.00297, step 1, values |
| 4999 | | float32 |
| 5000 | | |
| 5001 | | > hide #!45 models |
| 5002 | | |
| 5003 | | > show #!45 models |
| 5004 | | |
| 5005 | | > hide #!45 models |
| 5006 | | |
| 5007 | | > show #!45 models |
| 5008 | | |
| 5009 | | > rename #45 25_Density_EP54-hC5aR1-Go |
| 5010 | | |
| 5011 | | > hide #!45 models |
| 5012 | | |
| 5013 | | > show #!45 models |
| 5014 | | |
| 5015 | | > hide #!45 models |
| 5016 | | |
| 5017 | | > hide #!42 models |
| 5018 | | |
| 5019 | | > hide #!44 models |
| 5020 | | |
| 5021 | | > show #!42 models |
| 5022 | | |
| 5023 | | > show #!44 models |
| 5024 | | |
| 5025 | | > hide #!42 models |
| 5026 | | |
| 5027 | | > ui tool show Matchmaker |
| 5028 | | |
| 5029 | | > matchmaker #42/D to #1/C pairing ss |
| 5030 | | |
| 5031 | | Computing secondary structure |
| 5032 | | Parameters |
| 5033 | | --- |
| 5034 | | Chain pairing | ss |
| 5035 | | Alignment algorithm | Needleman-Wunsch |
| 5036 | | Similarity matrix | BLOSUM-62 |
| 5037 | | SS fraction | 0.3 |
| 5038 | | Gap open (HH/SS/other) | 18/18/6 |
| 5039 | | Gap extend | 1 |
| 5040 | | SS matrix | | | H | S | O |
| 5041 | | ---|---|---|--- |
| 5042 | | H | 6 | -9 | -6 |
| 5043 | | S | | 6 | -6 |
| 5044 | | O | | | 4 |
| 5045 | | Iteration cutoff | 2 |
| 5046 | | |
| 5047 | | Matchmaker 01_hC3a-hC3aR-Go_2023, chain C (#1) with 24_C5aPep-hC5aR1-Go, chain |
| 5048 | | D (#42), sequence alignment score = 674.9 |
| 5049 | | RMSD between 217 pruned atom pairs is 1.072 angstroms; (across all 261 pairs: |
| 5050 | | 1.902) |
| 5051 | | |
| 5052 | | |
| 5053 | | > matchmaker #44/A to #1/C pairing ss |
| 5054 | | |
| 5055 | | Computing secondary structure |
| 5056 | | Parameters |
| 5057 | | --- |
| 5058 | | Chain pairing | ss |
| 5059 | | Alignment algorithm | Needleman-Wunsch |
| 5060 | | Similarity matrix | BLOSUM-62 |
| 5061 | | SS fraction | 0.3 |
| 5062 | | Gap open (HH/SS/other) | 18/18/6 |
| 5063 | | Gap extend | 1 |
| 5064 | | SS matrix | | | H | S | O |
| 5065 | | ---|---|---|--- |
| 5066 | | H | 6 | -9 | -6 |
| 5067 | | S | | 6 | -6 |
| 5068 | | O | | | 4 |
| 5069 | | Iteration cutoff | 2 |
| 5070 | | |
| 5071 | | Matchmaker 01_hC3a-hC3aR-Go_2023, chain C (#1) with 25_EP54-hC5aR1-Go, chain A |
| 5072 | | (#44), sequence alignment score = 631.7 |
| 5073 | | RMSD between 208 pruned atom pairs is 1.028 angstroms; (across all 258 pairs: |
| 5074 | | 2.013) |
| 5075 | | |
| 5076 | | |
| 5077 | | > show #!42 models |
| 5078 | | |
| 5079 | | > show #!43 models |
| 5080 | | |
| 5081 | | > hide #!42 models |
| 5082 | | |
| 5083 | | > hide #!44 models |
| 5084 | | |
| 5085 | | > view #43 same as #42 |
| 5086 | | |
| 5087 | | Expected an integer >= 1 or a keyword |
| 5088 | | |
| 5089 | | > view #43 sameas #42 |
| 5090 | | |
| 5091 | | Expected an integer >= 1 or a keyword |
| 5092 | | |
| 5093 | | > view position #43 sameAsModels #42 |
| 5094 | | |
| 5095 | | > hide #!43 models |
| 5096 | | |
| 5097 | | > view position #45 sameAsModels #44 |
| 5098 | | |
| 5099 | | > show #!45 models |
| 5100 | | |
| 5101 | | > show #!44 models |
| 5102 | | |
| 5103 | | > hide #!1 models |
| 5104 | | |
| 5105 | | > volume #45 level 0.1269 |
| 5106 | | |
| 5107 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5108 | | > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250410.cxs |
| 5109 | | > includeMaps true |
| 5110 | | |
| 5111 | | > view list |
| 5112 | | |
| 5113 | | Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go, |
| 5114 | | C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 5115 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 5116 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 5117 | | H8_overall, H8_overall_mC5aR1, H8_zoomed, H8_zoomed_mC5aR1, JR-SB_PIF, |
| 5118 | | JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, |
| 5119 | | Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, |
| 5120 | | Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, |
| 5121 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 5122 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 5123 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 5124 | | |
| 5125 | | > view fig2_density |
| 5126 | | |
| 5127 | | > volume #45 level 0.05608 |
| 5128 | | |
| 5129 | | > view fig2_density |
| 5130 | | |
| 5131 | | > ui tool show "Map Eraser" |
| 5132 | | |
| 5133 | | > ui tool show "Hide Dust" |
| 5134 | | |
| 5135 | | > hide #!44 models |
| 5136 | | |
| 5137 | | > show #!44 models |
| 5138 | | |
| 5139 | | > hide #!44 models |
| 5140 | | |
| 5141 | | > hide #!45 models |
| 5142 | | |
| 5143 | | > show #!43 models |
| 5144 | | |
| 5145 | | > show #!42 models |
| 5146 | | |
| 5147 | | > surface dust #43 size 7.26 |
| 5148 | | |
| 5149 | | > volume #43 level 0.1165 |
| 5150 | | |
| 5151 | | > surface dust #43 size 7.26 |
| 5152 | | |
| 5153 | | > surface dust #43 size 13.41 |
| 5154 | | |
| 5155 | | > volume #43 level 0.1199 |
| 5156 | | |
| 5157 | | > view fig2_density |
| 5158 | | |
| 5159 | | > hide #!43 models |
| 5160 | | |
| 5161 | | > hide #!42 models |
| 5162 | | |
| 5163 | | > show #!45 models |
| 5164 | | |
| 5165 | | > show #!44 models |
| 5166 | | |
| 5167 | | > volume #45 level 0.1871 |
| 5168 | | |
| 5169 | | > surface dust #45 size 7.26 |
| 5170 | | |
| 5171 | | > volume #45 level 0.1163 |
| 5172 | | |
| 5173 | | > surface dust #45 size 5.14 |
| 5174 | | |
| 5175 | | > volume #45 level 0.1481 |
| 5176 | | |
| 5177 | | > volume #45 level 0.08087 |
| 5178 | | |
| 5179 | | > surface dust #45 size 10.74 |
| 5180 | | |
| 5181 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5182 | | > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250410.cxs |
| 5183 | | > includeMaps true |
| 5184 | | |
| 5185 | | ——— End of log from Thu Apr 10 17:11:05 2025 ——— |
| 5186 | | |
| 5187 | | opened ChimeraX session |
| 5188 | | |
| 5189 | | > hide #!44 models |
| 5190 | | |
| 5191 | | > hide #!45 models |
| 5192 | | |
| 5193 | | > show #!43 models |
| 5194 | | |
| 5195 | | > show #!42 models |
| 5196 | | |
| 5197 | | > hide #!43 models |
| 5198 | | |
| 5199 | | > show #!43 models |
| 5200 | | |
| 5201 | | > hide #!43 models |
| 5202 | | |
| 5203 | | > show #!43 models |
| 5204 | | |
| 5205 | | > hide #!43 models |
| 5206 | | |
| 5207 | | > color #42/D #b366ff |
| 5208 | | |
| 5209 | | > color #42,44/D #b366ff |
| 5210 | | |
| 5211 | | > show #!44 models |
| 5212 | | |
| 5213 | | > color #44/A #b366ff |
| 5214 | | |
| 5215 | | > color #44,42/B #40bf40 |
| 5216 | | |
| 5217 | | Drag select of 153 residues |
| 5218 | | |
| 5219 | | > select up |
| 5220 | | |
| 5221 | | 1610 atoms, 1634 bonds, 238 residues, 2 models selected |
| 5222 | | |
| 5223 | | > select up |
| 5224 | | |
| 5225 | | 3226 atoms, 3296 bonds, 464 residues, 2 models selected |
| 5226 | | |
| 5227 | | > select up |
| 5228 | | |
| 5229 | | 16459 atoms, 16808 bonds, 2252 residues, 2 models selected |
| 5230 | | |
| 5231 | | > select down |
| 5232 | | |
| 5233 | | 3226 atoms, 3296 bonds, 464 residues, 2 models selected |
| 5234 | | |
| 5235 | | > color sel #c2c2d6 |
| 5236 | | |
| 5237 | | > select clear |
| 5238 | | |
| 5239 | | Drag select of 10 residues |
| 5240 | | |
| 5241 | | > select up |
| 5242 | | |
| 5243 | | 296 atoms, 294 bonds, 46 residues, 2 models selected |
| 5244 | | |
| 5245 | | > select up |
| 5246 | | |
| 5247 | | 4870 atoms, 4958 bonds, 676 residues, 2 models selected |
| 5248 | | |
| 5249 | | > select up |
| 5250 | | |
| 5251 | | 16459 atoms, 16808 bonds, 2252 residues, 2 models selected |
| 5252 | | |
| 5253 | | > select down |
| 5254 | | |
| 5255 | | 4870 atoms, 4958 bonds, 676 residues, 2 models selected |
| 5256 | | |
| 5257 | | > color sel #ffff00 |
| 5258 | | |
| 5259 | | > select clear |
| 5260 | | |
| 5261 | | Drag select of 12 residues |
| 5262 | | |
| 5263 | | > select up |
| 5264 | | |
| 5265 | | 302 atoms, 300 bonds, 43 residues, 2 models selected |
| 5266 | | |
| 5267 | | > select up |
| 5268 | | |
| 5269 | | 764 atoms, 774 bonds, 112 residues, 2 models selected |
| 5270 | | |
| 5271 | | > color sel #1a1aff |
| 5272 | | |
| 5273 | | > select clear |
| 5274 | | |
| 5275 | | > color #42/L #000099 |
| 5276 | | |
| 5277 | | > color #44/D #ffcc33 |
| 5278 | | |
| 5279 | | > select clear |
| 5280 | | |
| 5281 | | > hide #!44 models |
| 5282 | | |
| 5283 | | > show #!43 models |
| 5284 | | |
| 5285 | | > ui tool show "Color Zone" |
| 5286 | | |
| 5287 | | > color zone #43 near #42 distance 7.26 |
| 5288 | | |
| 5289 | | > show #!44 models |
| 5290 | | |
| 5291 | | > show #!45 models |
| 5292 | | |
| 5293 | | > hide #!43 models |
| 5294 | | |
| 5295 | | > hide #!42 models |
| 5296 | | |
| 5297 | | > color zone #45 near #44 distance 7.26 |
| 5298 | | |
| 5299 | | > color zone #45 near #44 distance 16.21 |
| 5300 | | |
| 5301 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5302 | | > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250410.cxs |
| 5303 | | > includeMaps true |
| 5304 | | |
| 5305 | | > view list |
| 5306 | | |
| 5307 | | Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go, |
| 5308 | | C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 5309 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 5310 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 5311 | | H8_overall, H8_overall_mC5aR1, H8_zoomed, H8_zoomed_mC5aR1, JR-SB_PIF, |
| 5312 | | JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, |
| 5313 | | Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, |
| 5314 | | Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, |
| 5315 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 5316 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 5317 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 5318 | | |
| 5319 | | > hide #!44 models |
| 5320 | | |
| 5321 | | > hide #!45 models |
| 5322 | | |
| 5323 | | > show #!43 models |
| 5324 | | |
| 5325 | | > show #!42 models |
| 5326 | | |
| 5327 | | > hide #!42 models |
| 5328 | | |
| 5329 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5330 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/24_Density_C5aPep-hC5aR1-Go.png width 2000 |
| 5331 | | > height 1129 supersample 4 transparentBackground true |
| 5332 | | |
| 5333 | | > show #!42 models |
| 5334 | | |
| 5335 | | > hide #!43 models |
| 5336 | | |
| 5337 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5338 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/24_C5aPep-hC5aR1-Go.png width 2000 height 1129 |
| 5339 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 5340 | | |
| 5341 | | > view 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go |
| 5342 | | |
| 5343 | | > view Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go |
| 5344 | | |
| 5345 | | > select #42/L |
| 5346 | | |
| 5347 | | 62 atoms, 65 bonds, 6 residues, 1 model selected |
| 5348 | | |
| 5349 | | > show sel atoms |
| 5350 | | |
| 5351 | | > color sel byhetero |
| 5352 | | |
| 5353 | | > select ~sel & ##selected |
| 5354 | | |
| 5355 | | 8173 atoms, 8346 bonds, 4 pseudobonds, 1118 residues, 2 models selected |
| 5356 | | |
| 5357 | | > hide sel cartoons |
| 5358 | | |
| 5359 | | Drag select of 45 atoms, 6 residues, 43 bonds |
| 5360 | | |
| 5361 | | > cofr sel |
| 5362 | | |
| 5363 | | > view list |
| 5364 | | |
| 5365 | | Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go, |
| 5366 | | C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 5367 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 5368 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 5369 | | H8_overall, H8_overall_mC5aR1, H8_zoomed, H8_zoomed_mC5aR1, JR-SB_PIF, |
| 5370 | | JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, |
| 5371 | | Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, |
| 5372 | | Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, |
| 5373 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 5374 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 5375 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 5376 | | |
| 5377 | | > view Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go |
| 5378 | | |
| 5379 | | > ui tool show "Surface Zone" |
| 5380 | | |
| 5381 | | > surface zone #28 nearAtoms #42 distance 1.29 |
| 5382 | | |
| 5383 | | > surface zone #43 nearAtoms #42 distance 7.26 |
| 5384 | | |
| 5385 | | > show #!43 models |
| 5386 | | |
| 5387 | | > surface zone #43 nearAtoms #42 distance 7.26 |
| 5388 | | |
| 5389 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 7.26 |
| 5390 | | |
| 5391 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.83 |
| 5392 | | |
| 5393 | | > volume #43 style mesh |
| 5394 | | |
| 5395 | | > volume #43 color #d3d7cf |
| 5396 | | |
| 5397 | | > volume #43 color #babdb6 |
| 5398 | | |
| 5399 | | > volume #43 color #888a85 |
| 5400 | | |
| 5401 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.19 |
| 5402 | | |
| 5403 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5404 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/24_Lig_Density_C5aPep-hC5aR1-Go.png width 2000 |
| 5405 | | > height 1129 supersample 4 transparentBackground true |
| 5406 | | |
| 5407 | | > hide #!43 models |
| 5408 | | |
| 5409 | | > hide #!42 models |
| 5410 | | |
| 5411 | | > show #!44 models |
| 5412 | | |
| 5413 | | > show #!45 models |
| 5414 | | |
| 5415 | | > view list |
| 5416 | | |
| 5417 | | Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go, |
| 5418 | | C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 5419 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 5420 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 5421 | | H8_overall, H8_overall_mC5aR1, H8_zoomed, H8_zoomed_mC5aR1, JR-SB_PIF, |
| 5422 | | JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, |
| 5423 | | Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, |
| 5424 | | Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, |
| 5425 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 5426 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 5427 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 5428 | | |
| 5429 | | > view hTLQP_angle_01 |
| 5430 | | |
| 5431 | | > view fig2_density |
| 5432 | | |
| 5433 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5434 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/25_Density_EP54-hC5aR1-Go.png width 2000 |
| 5435 | | > height 1129 supersample 4 transparentBackground true |
| 5436 | | |
| 5437 | | > hide #!44 models |
| 5438 | | |
| 5439 | | > show #!44 models |
| 5440 | | |
| 5441 | | > hide #!44 models |
| 5442 | | |
| 5443 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5444 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/25_Density_EP54-hC5aR1-Go.png width 2000 |
| 5445 | | > height 1129 supersample 4 transparentBackground true |
| 5446 | | |
| 5447 | | > hide #!45 models |
| 5448 | | |
| 5449 | | > show #!44 models |
| 5450 | | |
| 5451 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5452 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/25_EP54-hC5aR1-Go.png width 2000 height 1129 |
| 5453 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 5454 | | |
| 5455 | | > view Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-G |
| 5456 | | |
| 5457 | | Expected an objects specifier or a view name or a keyword |
| 5458 | | |
| 5459 | | > view Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go |
| 5460 | | |
| 5461 | | > select #44/D |
| 5462 | | |
| 5463 | | 85 atoms, 88 bonds, 10 residues, 1 model selected |
| 5464 | | |
| 5465 | | > show sel atoms |
| 5466 | | |
| 5467 | | > style sel stick |
| 5468 | | |
| 5469 | | Changed 85 atom styles |
| 5470 | | |
| 5471 | | > color sel byhetero |
| 5472 | | |
| 5473 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 7.26 |
| 5474 | | |
| 5475 | | > show #!45 models |
| 5476 | | |
| 5477 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.61 |
| 5478 | | |
| 5479 | | > volume #45 style mesh |
| 5480 | | |
| 5481 | | > volume #45 color #b2b2b2 |
| 5482 | | |
| 5483 | | > select ~sel & ##selected |
| 5484 | | |
| 5485 | | 8139 atoms, 8309 bonds, 4 pseudobonds, 1118 residues, 2 models selected |
| 5486 | | |
| 5487 | | > hide sel cartoons |
| 5488 | | |
| 5489 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 3.16 |
| 5490 | | |
| 5491 | | > select ~sel & ##selected |
| 5492 | | |
| 5493 | | 85 atoms, 88 bonds, 10 residues, 1 model selected |
| 5494 | | |
| 5495 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.61 |
| 5496 | | |
| 5497 | | > select clear |
| 5498 | | |
| 5499 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5500 | | > Fingerprint_Final/Fig2_Images/25_Lig_Density_EP54-hC5aR1-Go.png width 2000 |
| 5501 | | > height 1129 supersample 4 transparentBackground true |
| 5502 | | |
| 5503 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5504 | | > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250410.cxs |
| 5505 | | > includeMaps true |
| 5506 | | |
| 5507 | | ——— End of log from Thu Apr 10 18:17:16 2025 ——— |
| 5508 | | |
| 5509 | | opened ChimeraX session |
| 5510 | | |
| 5511 | | > hide #!44 models |
| 5512 | | |
| 5513 | | > hide #!45 models |
| 5514 | | |
| 5515 | | > show #!41 models |
| 5516 | | |
| 5517 | | > show #!42 models |
| 5518 | | |
| 5519 | | > hide #!41 models |
| 5520 | | |
| 5521 | | > show #!43 models |
| 5522 | | |
| 5523 | | > color #!42 byhetero |
| 5524 | | |
| 5525 | | > show #!41 models |
| 5526 | | |
| 5527 | | > hide #!41 models |
| 5528 | | |
| 5529 | | > volume #41 color black |
| 5530 | | |
| 5531 | | > ui tool show CliX |
| 5532 | | |
| 5533 | | > transparency #41 0 target s |
| 5534 | | |
| 5535 | | > ui tool show "Show Sequence Viewer" |
| 5536 | | |
| 5537 | | > show #42 cartoons |
| 5538 | | |
| 5539 | | > cartoon style width 1.2 |
| 5540 | | |
| 5541 | | > cartoon style width 1.5 |
| 5542 | | |
| 5543 | | > hide cartoons |
| 5544 | | |
| 5545 | | > show #42/L cartoons |
| 5546 | | |
| 5547 | | > name list |
| 5548 | | |
| 5549 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8 #7/A:272-315 #9/C:408-450 |
| 5550 | | GBeta_2025 #2,5,9,10,11,12,27/B #4,7,8,15,16,18,20/C |
| 5551 | | GGamma_2025 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/G |
| 5552 | | GRK2_Helix #26/G:2-20 |
| 5553 | | Go_2025 #2,5,6,9,10,11,12,27/A #4,7,8,15,16,18,20/B |
| 5554 | | JR-SB_PIF #1,11,13/C:348,110,386 |
| 5555 | | JR14-SB_CWxP #1,11,13/C:389,390,392 |
| 5556 | | JR14-SB_NPxxY #1,11,13/C:431,432,435 |
| 5557 | | NTSR1-GRK #26/G:2-20 #26/R |
| 5558 | | ScFv_2014 #2,4,5,6,7,8,9,10,11,12,15,16,18,20,27/H |
| 5559 | | all_lig #1/D #14/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1 |
| 5560 | | #12/C:JR1 #13/A:LIG |
| 5561 | | all_lig_recep #1/D #2/D #3/D #4/F #5/D #6/D #7/D #8/D #9/D #10/D #11/C:JR1 |
| 5562 | | #12/C:JR1 #13/A:LIG #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C |
| 5563 | | #12/E #13/C |
| 5564 | | all_recep #1/C #2/E #3/A #4/A #5/C #6/E #7/A #8/A #9/C #10/C #11/C #12/E #13/C |
| 5565 | | hC3a-JR14-SB_TM6 #1,11,13/C:371-404 |
| 5566 | | hC3a-JR14-SB_TM7 #1,11,13/C:406-439 |
| 5567 | | panchMukhi5ptSwitch #1/C:78,102,340,393,417 #11/C:78,102,340,393,417 |
| 5568 | | #13/C:78,102,340,393,417 |
| 5569 | | |
| 5570 | | > show #!44 models |
| 5571 | | |
| 5572 | | > hide #!44 models |
| 5573 | | |
| 5574 | | > ui tool show "Show Sequence Viewer" |
| 5575 | | |
| 5576 | | > sequence chain #42/D #44/A |
| 5577 | | |
| 5578 | | Alignment identifier is 1 |
| 5579 | | |
| 5580 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5581 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 5582 | | > hC5aR1-Go_LIG.png width 2000 height 1155 supersample 4 transparentBackground |
| 5583 | | > true |
| 5584 | | |
| 5585 | | > show #42/D cartoons |
| 5586 | | |
| 5587 | | > ui tool show "Surface Zone" |
| 5588 | | |
| 5589 | | > surface zone #43 nearAtoms #42 distance 1.21 |
| 5590 | | |
| 5591 | | No atoms selected for zoning |
| 5592 | | |
| 5593 | | > select clear |
| 5594 | | |
| 5595 | | > surface unzone #43 |
| 5596 | | |
| 5597 | | > select #42/D:35 #44/A:35 |
| 5598 | | |
| 5599 | | 14 atoms, 12 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5600 | | |
| 5601 | | > select #42/D:35-65 #44/A:35-65 |
| 5602 | | |
| 5603 | | 466 atoms, 476 bonds, 62 residues, 2 models selected |
| 5604 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [4-34] RMSD: 0.885 |
| 5605 | | |
| 5606 | | |
| 5607 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.12 |
| 5608 | | |
| 5609 | | > cofr sel |
| 5610 | | |
| 5611 | | > hide atoms |
| 5612 | | |
| 5613 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 5614 | | |
| 5615 | | > hide ribbons |
| 5616 | | |
| 5617 | | > hide atoms |
| 5618 | | |
| 5619 | | > hide ribbons |
| 5620 | | |
| 5621 | | > cofr sel |
| 5622 | | |
| 5623 | | No displayed objects specified. |
| 5624 | | |
| 5625 | | > hide atoms |
| 5626 | | |
| 5627 | | > hide ribbons |
| 5628 | | |
| 5629 | | > cofr sel |
| 5630 | | |
| 5631 | | No displayed objects specified. |
| 5632 | | |
| 5633 | | > hide atoms |
| 5634 | | |
| 5635 | | > hide ribbons |
| 5636 | | |
| 5637 | | > show sel atoms |
| 5638 | | |
| 5639 | | > show sel ribbons |
| 5640 | | |
| 5641 | | > cofr sel |
| 5642 | | |
| 5643 | | > hide atoms |
| 5644 | | |
| 5645 | | > hide ribbons |
| 5646 | | |
| 5647 | | > show sel atoms |
| 5648 | | |
| 5649 | | > style sel stick |
| 5650 | | |
| 5651 | | Changed 466 atom styles |
| 5652 | | |
| 5653 | | > show sel ribbons |
| 5654 | | |
| 5655 | | > cofr sel |
| 5656 | | |
| 5657 | | > show #42/D cartoons |
| 5658 | | |
| 5659 | | > hide atoms |
| 5660 | | |
| 5661 | | > hide ribbons |
| 5662 | | |
| 5663 | | > show sel atoms |
| 5664 | | |
| 5665 | | > style sel stick |
| 5666 | | |
| 5667 | | Changed 466 atom styles |
| 5668 | | |
| 5669 | | > show sel ribbons |
| 5670 | | |
| 5671 | | > cofr sel |
| 5672 | | |
| 5673 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 1.99 |
| 5674 | | |
| 5675 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.67 |
| 5676 | | |
| 5677 | | > graphics selection color black |
| 5678 | | |
| 5679 | | > graphics selection width 2 |
| 5680 | | |
| 5681 | | > volume #43 step 2 |
| 5682 | | |
| 5683 | | > volume #43 step 1 |
| 5684 | | |
| 5685 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5686 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 5687 | | > hC5aR1-Go_TM1.png width 2000 height 1177 supersample 4 transparentBackground |
| 5688 | | > true |
| 5689 | | |
| 5690 | | > select #42/D:70 #44/A:70 |
| 5691 | | |
| 5692 | | 16 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5693 | | |
| 5694 | | > select #42/D:70-97 #44/A:70-97 |
| 5695 | | |
| 5696 | | 431 atoms, 441 bonds, 56 residues, 2 models selected |
| 5697 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [39-66] RMSD: 0.419 |
| 5698 | | |
| 5699 | | |
| 5700 | | > hide atoms |
| 5701 | | |
| 5702 | | > hide ribbons |
| 5703 | | |
| 5704 | | > show sel atoms |
| 5705 | | |
| 5706 | | > style sel stick |
| 5707 | | |
| 5708 | | Changed 431 atom styles |
| 5709 | | |
| 5710 | | > show sel ribbons |
| 5711 | | |
| 5712 | | > cofr sel |
| 5713 | | |
| 5714 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.67 |
| 5715 | | |
| 5716 | | > select #42/D:35-36 #44/A:35-36 |
| 5717 | | |
| 5718 | | 28 atoms, 28 bonds, 4 residues, 2 models selected |
| 5719 | | |
| 5720 | | > select #42/D:36-65 #44/A:36-65 |
| 5721 | | |
| 5722 | | 452 atoms, 462 bonds, 60 residues, 2 models selected |
| 5723 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [5-34] RMSD: 0.894 |
| 5724 | | |
| 5725 | | |
| 5726 | | > select clear |
| 5727 | | |
| 5728 | | > select #42/D:39 #44/A:39 |
| 5729 | | |
| 5730 | | 16 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5731 | | |
| 5732 | | > select #42/D:39-42 #44/A:39-42 |
| 5733 | | |
| 5734 | | 56 atoms, 54 bonds, 8 residues, 2 models selected |
| 5735 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [8-11] RMSD: 0.261 |
| 5736 | | |
| 5737 | | |
| 5738 | | > select #42/D:35 #44/A:35 |
| 5739 | | |
| 5740 | | 14 atoms, 12 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5741 | | |
| 5742 | | > select #42/D:35-65 #44/A:35-65 |
| 5743 | | |
| 5744 | | 466 atoms, 476 bonds, 62 residues, 2 models selected |
| 5745 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [4-34] RMSD: 0.885 |
| 5746 | | |
| 5747 | | |
| 5748 | | > hide atoms |
| 5749 | | |
| 5750 | | > hide ribbons |
| 5751 | | |
| 5752 | | > show sel atoms |
| 5753 | | |
| 5754 | | > style sel stick |
| 5755 | | |
| 5756 | | Changed 466 atom styles |
| 5757 | | |
| 5758 | | > show sel ribbons |
| 5759 | | |
| 5760 | | > cofr sel |
| 5761 | | |
| 5762 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.67 |
| 5763 | | |
| 5764 | | > volume #45 level 0.1437 |
| 5765 | | |
| 5766 | | > volume #43 level 0.06976 |
| 5767 | | |
| 5768 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 5769 | | |
| 5770 | | > graphics silhouettes true |
| 5771 | | |
| 5772 | | > graphics silhouettes false |
| 5773 | | |
| 5774 | | > graphics silhouettes true |
| 5775 | | |
| 5776 | | > graphics silhouettes false |
| 5777 | | |
| 5778 | | > graphics silhouettes true |
| 5779 | | |
| 5780 | | > graphics silhouettes false |
| 5781 | | |
| 5782 | | > graphics silhouettes true |
| 5783 | | |
| 5784 | | > graphics silhouettes false |
| 5785 | | |
| 5786 | | > graphics silhouettes true |
| 5787 | | |
| 5788 | | > graphics silhouettes false |
| 5789 | | |
| 5790 | | > graphics silhouettes true |
| 5791 | | |
| 5792 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5793 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 5794 | | > hC5aR1-Go_TM1_sigma-0.0698_zoneR-2.32_silht.png width 2000 height 1177 |
| 5795 | | > supersample 4 transparentBackground true |
| 5796 | | |
| 5797 | | > transparency #42 0 target s |
| 5798 | | |
| 5799 | | > transparency #43 0 target s |
| 5800 | | |
| 5801 | | > graphics silhouettes false |
| 5802 | | |
| 5803 | | > transparency #43 60 target s |
| 5804 | | |
| 5805 | | > graphics silhouettes true |
| 5806 | | |
| 5807 | | > transparency #43 30 target s |
| 5808 | | |
| 5809 | | > transparency #43 90 target s |
| 5810 | | |
| 5811 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5812 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 5813 | | > hC5aR1-Go_TM1_sigma-0.0698_zoneR-2.32_silht_trans90.png width 2000 height |
| 5814 | | > 1177 supersample 4 transparentBackground true |
| 5815 | | |
| 5816 | | > select #42/D:70 #44/A:70 |
| 5817 | | |
| 5818 | | 16 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5819 | | |
| 5820 | | > select #42/D:70-97 #44/A:70-97 |
| 5821 | | |
| 5822 | | 431 atoms, 441 bonds, 56 residues, 2 models selected |
| 5823 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [39-66] RMSD: 0.419 |
| 5824 | | |
| 5825 | | |
| 5826 | | > hide atoms |
| 5827 | | |
| 5828 | | > hide ribbons |
| 5829 | | |
| 5830 | | > show sel atoms |
| 5831 | | |
| 5832 | | > style sel stick |
| 5833 | | |
| 5834 | | Changed 431 atom styles |
| 5835 | | |
| 5836 | | > show sel ribbons |
| 5837 | | |
| 5838 | | > cofr sel |
| 5839 | | |
| 5840 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 5841 | | |
| 5842 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM2 |
| 5843 | | |
| 5844 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5845 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 5846 | | > hC5aR1-Go_TM2_sigma-0.0698_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 5847 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 5848 | | |
| 5849 | | > select #42/D:105 #44/A:105 |
| 5850 | | |
| 5851 | | 8 atoms, 6 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5852 | | |
| 5853 | | > select #42/D:105-139 #44/A:105-139 |
| 5854 | | |
| 5855 | | 513 atoms, 519 bonds, 70 residues, 2 models selected |
| 5856 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [74-108] RMSD: 0.559 |
| 5857 | | |
| 5858 | | |
| 5859 | | > hide atoms |
| 5860 | | |
| 5861 | | > hide ribbons |
| 5862 | | |
| 5863 | | > show sel atoms |
| 5864 | | |
| 5865 | | > style sel stick |
| 5866 | | |
| 5867 | | Changed 513 atom styles |
| 5868 | | |
| 5869 | | > show sel ribbons |
| 5870 | | |
| 5871 | | > cofr sel |
| 5872 | | |
| 5873 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 5874 | | |
| 5875 | | > volume #43 level 0.1343 |
| 5876 | | |
| 5877 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM3 |
| 5878 | | |
| 5879 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5880 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 5881 | | > hC5aR1-Go_TM3_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 5882 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 5883 | | |
| 5884 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM3 |
| 5885 | | |
| 5886 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5887 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 5888 | | > hC5aR1-Go_TM3_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 5889 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 5890 | | |
| 5891 | | > select #42/D:141 #44/A:141 |
| 5892 | | |
| 5893 | | 14 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5894 | | |
| 5895 | | > select #42/D:141-174 #44/A:141-174 |
| 5896 | | |
| 5897 | | 528 atoms, 548 bonds, 68 residues, 2 models selected |
| 5898 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [110-143] RMSD: 0.755 |
| 5899 | | |
| 5900 | | |
| 5901 | | > hide atoms |
| 5902 | | |
| 5903 | | > hide ribbons |
| 5904 | | |
| 5905 | | > show sel atoms |
| 5906 | | |
| 5907 | | > style sel stick |
| 5908 | | |
| 5909 | | Changed 528 atom styles |
| 5910 | | |
| 5911 | | > show sel ribbons |
| 5912 | | |
| 5913 | | > cofr sel |
| 5914 | | |
| 5915 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 5916 | | |
| 5917 | | > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM3 |
| 5918 | | |
| 5919 | | > select #42/D:141 #44/A:141 |
| 5920 | | |
| 5921 | | 14 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5922 | | |
| 5923 | | > select #42/D:141-153 #44/A:141-153 |
| 5924 | | |
| 5925 | | 200 atoms, 206 bonds, 26 residues, 2 models selected |
| 5926 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [110-122] RMSD: 0.679 |
| 5927 | | |
| 5928 | | |
| 5929 | | > select clear |
| 5930 | | |
| 5931 | | > select #42/D:141 #44/A:141 |
| 5932 | | |
| 5933 | | 14 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5934 | | |
| 5935 | | > select #42/D:141-166 #44/A:141-166 |
| 5936 | | |
| 5937 | | 394 atoms, 408 bonds, 52 residues, 2 models selected |
| 5938 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [110-135] RMSD: 0.778 |
| 5939 | | |
| 5940 | | |
| 5941 | | > select clear |
| 5942 | | |
| 5943 | | > select #42/D:174 #44/A:174 |
| 5944 | | |
| 5945 | | 24 atoms, 24 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5946 | | |
| 5947 | | > select #42/D:150-174 #44/A:150-174 |
| 5948 | | |
| 5949 | | 372 atoms, 384 bonds, 50 residues, 2 models selected |
| 5950 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [119-143] RMSD: 0.784 |
| 5951 | | |
| 5952 | | |
| 5953 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 5954 | | |
| 5955 | | > hide atoms |
| 5956 | | |
| 5957 | | > hide ribbons |
| 5958 | | |
| 5959 | | > show sel atoms |
| 5960 | | |
| 5961 | | > style sel stick |
| 5962 | | |
| 5963 | | Changed 372 atom styles |
| 5964 | | |
| 5965 | | > show sel ribbons |
| 5966 | | |
| 5967 | | > cofr sel |
| 5968 | | |
| 5969 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM4 |
| 5970 | | |
| 5971 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 5972 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 5973 | | > hC5aR1-Go_TM4_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 5974 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 5975 | | |
| 5976 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 5977 | | |
| 5978 | | > select #42/D:196 #44/A:196 |
| 5979 | | |
| 5980 | | 14 atoms, 12 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 5981 | | |
| 5982 | | > select #42/D:196-231 #44/A:196-231 |
| 5983 | | |
| 5984 | | 600 atoms, 614 bonds, 72 residues, 2 models selected |
| 5985 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [165-200] RMSD: 0.962 |
| 5986 | | |
| 5987 | | |
| 5988 | | > hide atoms |
| 5989 | | |
| 5990 | | > hide ribbons |
| 5991 | | |
| 5992 | | > show sel atoms |
| 5993 | | |
| 5994 | | > style sel stick |
| 5995 | | |
| 5996 | | Changed 600 atom styles |
| 5997 | | |
| 5998 | | > show sel ribbons |
| 5999 | | |
| 6000 | | > cofr sel |
| 6001 | | |
| 6002 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 6003 | | |
| 6004 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM5 |
| 6005 | | |
| 6006 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6007 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 6008 | | > hC5aR1-Go_TM5_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 6009 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6010 | | |
| 6011 | | > select #42/D:239 #44/A:239 |
| 6012 | | |
| 6013 | | 18 atoms, 16 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 6014 | | |
| 6015 | | > select #42/D:239-267 #44/A:239-267 |
| 6016 | | |
| 6017 | | 468 atoms, 482 bonds, 58 residues, 2 models selected |
| 6018 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [208-236] RMSD: 0.392 |
| 6019 | | |
| 6020 | | |
| 6021 | | > hide atoms |
| 6022 | | |
| 6023 | | > hide ribbons |
| 6024 | | |
| 6025 | | > show sel atoms |
| 6026 | | |
| 6027 | | > style sel stick |
| 6028 | | |
| 6029 | | Changed 468 atom styles |
| 6030 | | |
| 6031 | | > show sel ribbons |
| 6032 | | |
| 6033 | | > cofr sel |
| 6034 | | |
| 6035 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 6036 | | |
| 6037 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM6 |
| 6038 | | |
| 6039 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6040 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 6041 | | > hC5aR1-Go_TM6_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 6042 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6043 | | |
| 6044 | | > select #42/D:272 #44/A:272 |
| 6045 | | |
| 6046 | | 12 atoms, 10 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 6047 | | |
| 6048 | | > select #42/D:272-303 #44/A:272-303 |
| 6049 | | |
| 6050 | | 494 atoms, 504 bonds, 64 residues, 2 models selected |
| 6051 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [241-272] RMSD: 0.602 |
| 6052 | | |
| 6053 | | |
| 6054 | | > hide atoms |
| 6055 | | |
| 6056 | | > hide ribbons |
| 6057 | | |
| 6058 | | > show sel atoms |
| 6059 | | |
| 6060 | | > style sel stick |
| 6061 | | |
| 6062 | | Changed 494 atom styles |
| 6063 | | |
| 6064 | | > show sel ribbons |
| 6065 | | |
| 6066 | | > cofr sel |
| 6067 | | |
| 6068 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 6069 | | |
| 6070 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM7 |
| 6071 | | |
| 6072 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6073 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 6074 | | > hC5aR1-Go_TM7_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 6075 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6076 | | |
| 6077 | | > select #42/D:305 #44/A:305 |
| 6078 | | |
| 6079 | | 18 atoms, 16 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 6080 | | |
| 6081 | | > select #42/D:305-313 #44/A:305-313 |
| 6082 | | |
| 6083 | | 152 atoms, 152 bonds, 18 residues, 2 models selected |
| 6084 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [274-282] RMSD: 1.994 |
| 6085 | | |
| 6086 | | |
| 6087 | | > hide atoms |
| 6088 | | |
| 6089 | | > hide ribbons |
| 6090 | | |
| 6091 | | > show sel atoms |
| 6092 | | |
| 6093 | | > style sel stick |
| 6094 | | |
| 6095 | | Changed 152 atom styles |
| 6096 | | |
| 6097 | | > show sel ribbons |
| 6098 | | |
| 6099 | | > cofr sel |
| 6100 | | |
| 6101 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 6102 | | |
| 6103 | | > volume #43 level 0.01242 |
| 6104 | | |
| 6105 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.22 |
| 6106 | | |
| 6107 | | > volume #43 level 0.00525 |
| 6108 | | |
| 6109 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.15 |
| 6110 | | |
| 6111 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-H8 |
| 6112 | | |
| 6113 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6114 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 6115 | | > hC5aR1-Go_H8_sigma-0.00525_zoneR-2.15_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 6116 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6117 | | |
| 6118 | | > show #42 cartoons |
| 6119 | | |
| 6120 | | > select #42/B:350 |
| 6121 | | |
| 6122 | | 4 atoms, 3 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 6123 | | |
| 6124 | | > select up |
| 6125 | | |
| 6126 | | 156 atoms, 156 bonds, 21 residues, 1 model selected |
| 6127 | | |
| 6128 | | > hide atoms |
| 6129 | | |
| 6130 | | > hide ribbons |
| 6131 | | |
| 6132 | | > show sel atoms |
| 6133 | | |
| 6134 | | > style sel stick |
| 6135 | | |
| 6136 | | Changed 156 atom styles |
| 6137 | | |
| 6138 | | > show sel ribbons |
| 6139 | | |
| 6140 | | > cofr sel |
| 6141 | | |
| 6142 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.15 |
| 6143 | | |
| 6144 | | > volume #43 level 0.1522 |
| 6145 | | |
| 6146 | | > volume #43 level 0.134 |
| 6147 | | |
| 6148 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.1 |
| 6149 | | |
| 6150 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2 |
| 6151 | | |
| 6152 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.3 |
| 6153 | | |
| 6154 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 6155 | | |
| 6156 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 6157 | | |
| 6158 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6159 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 6160 | | > hC5aR1-Go_a5_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 height |
| 6161 | | > 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6162 | | |
| 6163 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-a5 |
| 6164 | | |
| 6165 | | > show #42 cartoons |
| 6166 | | |
| 6167 | | > select #42/B:30 |
| 6168 | | |
| 6169 | | 5 atoms, 4 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 6170 | | |
| 6171 | | > select up |
| 6172 | | |
| 6173 | | 145 atoms, 144 bonds, 23 residues, 1 model selected |
| 6174 | | |
| 6175 | | > hide atoms |
| 6176 | | |
| 6177 | | > hide ribbons |
| 6178 | | |
| 6179 | | > show sel atoms |
| 6180 | | |
| 6181 | | > style sel stick |
| 6182 | | |
| 6183 | | Changed 145 atom styles |
| 6184 | | |
| 6185 | | > show sel ribbons |
| 6186 | | |
| 6187 | | > cofr sel |
| 6188 | | |
| 6189 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 6190 | | |
| 6191 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-aN |
| 6192 | | |
| 6193 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6194 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 6195 | | > hC5aR1-Go_aN_sigma-0.134_zoneR-2.32_mesh_trans90_silht.png width 2000 height |
| 6196 | | > 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6197 | | |
| 6198 | | > show #42 cartoons |
| 6199 | | |
| 6200 | | > select #42/L:4 |
| 6201 | | |
| 6202 | | 11 atoms, 11 bonds, 1 residue, 1 model selected |
| 6203 | | |
| 6204 | | > select up |
| 6205 | | |
| 6206 | | 62 atoms, 65 bonds, 6 residues, 1 model selected |
| 6207 | | |
| 6208 | | > hide atoms |
| 6209 | | |
| 6210 | | > hide ribbons |
| 6211 | | |
| 6212 | | > show sel atoms |
| 6213 | | |
| 6214 | | > style sel stick |
| 6215 | | |
| 6216 | | Changed 62 atom styles |
| 6217 | | |
| 6218 | | > show sel ribbons |
| 6219 | | |
| 6220 | | > cofr sel |
| 6221 | | |
| 6222 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.32 |
| 6223 | | |
| 6224 | | > surface zone #43 nearAtoms sel distance 2.15 |
| 6225 | | |
| 6226 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6227 | | > Fingerprint_Final/24_C5aPep-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 6228 | | > hC5aR1-Go_LIG_sigma-0.134_zoneR-2.15_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 6229 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6230 | | |
| 6231 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-LIG |
| 6232 | | |
| 6233 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6234 | | > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250427.cxs |
| 6235 | | > includeMaps true |
| 6236 | | |
| 6237 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6238 | | > Fingerprint_Final/complement_receptors_combined_session_includeMap_20250410.cxs |
| 6239 | | > includeMaps true |
| 6240 | | |
| 6241 | | > hide #!43 models |
| 6242 | | |
| 6243 | | > hide #!42 models |
| 6244 | | |
| 6245 | | > show #!44 models |
| 6246 | | |
| 6247 | | > show #!45 models |
| 6248 | | |
| 6249 | | > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM7 |
| 6250 | | |
| 6251 | | > show #44 atoms |
| 6252 | | |
| 6253 | | > hide #44 atoms |
| 6254 | | |
| 6255 | | > show #44 cartoons |
| 6256 | | |
| 6257 | | > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM7 |
| 6258 | | |
| 6259 | | > view list |
| 6260 | | |
| 6261 | | Named views: 11_Density_JR14A-hC3aR-Go, 14_Lig_Density_mC5a-hC5aR1-Go, |
| 6262 | | 24_C5aPep-hC5aR1-Go-H8, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-LIG, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM2, |
| 6263 | | 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM3, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM4, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM5, |
| 6264 | | 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM6, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM7, 24_C5aPep-hC5aR1-Go-a5, |
| 6265 | | 24_C5aPep-hC5aR1-Go-aN, C3a-angle_03_EP67, C3a_angle_01, C3a_angle_02, |
| 6266 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_01_zoomOut, |
| 6267 | | EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomIn, EP67_hC3aR_hC5aR_H7_H8_02_zoomOut, |
| 6268 | | H8_overall, H8_overall_mC5aR1, H8_zoomed, H8_zoomed_mC5aR1, JR-SB_PIF, |
| 6269 | | JR14-SB_CWxP, JR14-SB_NPxxY, Lig_02_Density_mC3a-mC3aR-Go, |
| 6270 | | Lig_04_Density_mC5a-mC5aR1-Go, Lig_05_Density_hTLQP-mC3aR-Go, |
| 6271 | | Lig_06_Density_mTLQP-mC3aR-Go, Lig_07_Density_EP67-hC5aR1-Go, fig2_density, |
| 6272 | | hC3a-JR14-SB_DR(C)Y, hC3a-JR14-SB_TM6, hC3a-JR14-SB_TM7, |
| 6273 | | hC5a-hC5aR1-simulation, hC5adesArg-hC5aR1-simulation, hTLQP_angle_01, |
| 6274 | | hTLQP_angle_02, hook_01, hook_02, topview, view_01, view_02 |
| 6275 | | |
| 6276 | | > select #42/D:35 #44/A:35 |
| 6277 | | |
| 6278 | | 14 atoms, 12 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 6279 | | |
| 6280 | | > select #42/D:35-65 #44/A:35-65 |
| 6281 | | |
| 6282 | | 466 atoms, 476 bonds, 62 residues, 2 models selected |
| 6283 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [4-34] RMSD: 0.885 |
| 6284 | | |
| 6285 | | |
| 6286 | | > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM1 |
| 6287 | | |
| 6288 | | Expected an objects specifier or a view name or a keyword |
| 6289 | | |
| 6290 | | > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM1 |
| 6291 | | |
| 6292 | | Expected an objects specifier or a view name or a keyword |
| 6293 | | |
| 6294 | | > hide atoms |
| 6295 | | |
| 6296 | | > hide ribbons |
| 6297 | | |
| 6298 | | > show sel atoms |
| 6299 | | |
| 6300 | | > style sel stick |
| 6301 | | |
| 6302 | | Changed 466 atom styles |
| 6303 | | |
| 6304 | | > show sel ribbons |
| 6305 | | |
| 6306 | | > cofr sel |
| 6307 | | |
| 6308 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.61 |
| 6309 | | |
| 6310 | | > color sel & #!44 byhetero |
| 6311 | | |
| 6312 | | > volume #45 level 0.1289 |
| 6313 | | |
| 6314 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 1.78 |
| 6315 | | |
| 6316 | | > volume #45 level 0.1215 |
| 6317 | | |
| 6318 | | > view name 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM1 |
| 6319 | | |
| 6320 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2 |
| 6321 | | |
| 6322 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.1 |
| 6323 | | |
| 6324 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.15 |
| 6325 | | |
| 6326 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 6327 | | |
| 6328 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 1.87 |
| 6329 | | |
| 6330 | | > view name 25_EP54-hC5aR1-Go-TM1 |
| 6331 | | |
| 6332 | | [Repeated 1 time(s)] |
| 6333 | | |
| 6334 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6335 | | > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 6336 | | > hC5aR1-Go_LIG_sigma-0.122_zoneR-1.87_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 6337 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6338 | | |
| 6339 | | > transparency #45 90 target s |
| 6340 | | |
| 6341 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6342 | | > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/supplementary_densities/24_C5aPep- |
| 6343 | | > hC5aR1-Go_LIG_sigma-0.122_zoneR-1.87_mesh_trans90_silht.png width 2000 |
| 6344 | | > height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6345 | | |
| 6346 | | > select #42/D:70 #44/A:70 |
| 6347 | | |
| 6348 | | 16 atoms, 14 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 6349 | | |
| 6350 | | > select #42/D:70-97 #44/A:70-97 |
| 6351 | | |
| 6352 | | 431 atoms, 441 bonds, 56 residues, 2 models selected |
| 6353 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [39-66] RMSD: 0.419 |
| 6354 | | |
| 6355 | | |
| 6356 | | > hide atoms |
| 6357 | | |
| 6358 | | > hide ribbons |
| 6359 | | |
| 6360 | | > show sel atoms |
| 6361 | | |
| 6362 | | > style sel stick |
| 6363 | | |
| 6364 | | Changed 431 atom styles |
| 6365 | | |
| 6366 | | > show sel ribbons |
| 6367 | | |
| 6368 | | > cofr sel |
| 6369 | | |
| 6370 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 1.87 |
| 6371 | | |
| 6372 | | > color #44 by |
| 6373 | | |
| 6374 | | Expected a color or one of 'byatom', 'bychain', 'byelement', 'byhetero', |
| 6375 | | 'byidentity', 'bymodel', 'bynucleotide', 'bypolymer', 'fromatoms', |
| 6376 | | 'fromcartoons', 'fromribbons', or 'random' or a keyword |
| 6377 | | |
| 6378 | | > color #44 byhetero |
| 6379 | | |
| 6380 | | > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM2 |
| 6381 | | |
| 6382 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6383 | | > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/supplementary_densities/25_EP54-hC5aR1-Go_TM2_sigma-0.122_zoneR-1.87_mesh_trans90_silht.png |
| 6384 | | > width 2000 height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6385 | | |
| 6386 | | > select #42/D:105 #44/A:105 |
| 6387 | | |
| 6388 | | 8 atoms, 6 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 6389 | | |
| 6390 | | > select #42/D:105-139 #44/A:105-139 |
| 6391 | | |
| 6392 | | 513 atoms, 519 bonds, 70 residues, 2 models selected |
| 6393 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [74-108] RMSD: 0.559 |
| 6394 | | |
| 6395 | | |
| 6396 | | > select #42/D:108 #44/A:108 |
| 6397 | | |
| 6398 | | 10 atoms, 8 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 6399 | | |
| 6400 | | > select #42/D:108-109 #44/A:108-109 |
| 6401 | | |
| 6402 | | 22 atoms, 20 bonds, 4 residues, 2 models selected |
| 6403 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [77-78] RMSD: 0.526 |
| 6404 | | |
| 6405 | | |
| 6406 | | > select #42/D:105 #44/A:105 |
| 6407 | | |
| 6408 | | 8 atoms, 6 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 6409 | | |
| 6410 | | > select #42/D:105-139 #44/A:105-139 |
| 6411 | | |
| 6412 | | 513 atoms, 519 bonds, 70 residues, 2 models selected |
| 6413 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [74-108] RMSD: 0.559 |
| 6414 | | |
| 6415 | | |
| 6416 | | > hide atoms |
| 6417 | | |
| 6418 | | > hide ribbons |
| 6419 | | |
| 6420 | | > show sel atoms |
| 6421 | | |
| 6422 | | > style sel stick |
| 6423 | | |
| 6424 | | Changed 513 atom styles |
| 6425 | | |
| 6426 | | > show sel ribbons |
| 6427 | | |
| 6428 | | > cofr sel |
| 6429 | | |
| 6430 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 1.87 |
| 6431 | | |
| 6432 | | > view 24_C5aPep-hC5aR1-Go-TM3 |
| 6433 | | |
| 6434 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.94 |
| 6435 | | |
| 6436 | | > volume #45 level 0.1844 |
| 6437 | | |
| 6438 | | > surface zone #45 nearAtoms sel distance 2.05 |
| 6439 | | |
| 6440 | | > volume #45 level 0.1844 |
| 6441 | | |
| 6442 | | > save /nfs_storage/figures_prep/Version_1/Models-Maps-Complement- |
| 6443 | | > Fingerprint_Final/25_EP54-hC5aR1-Go/supplementary_densities/25_EP54-hC5aR1-Go_TM3_sigma-0.184_zoneR-2.05_mesh_trans90_silht.png |
| 6444 | | > width 2000 height 1147 supersample 4 transparentBackground true |
| 6445 | | |
| 6446 | | > select #42/D:150 #44/A:150 |
| 6447 | | |
| 6448 | | 10 atoms, 8 bonds, 2 residues, 2 models selected |
| 6449 | | |
| 6450 | | > select #42/D:150-174 #44/A:150-174 |
| 6451 | | |
| 6452 | | 372 atoms, 384 bonds, 50 residues, 2 models selected |
| 6453 | | 1 [ID: 1] region chains A,D [119-143] RMSD: 0.784 |
| 6454 | | |
| | 1449 | [deleted to fit within ticket limits] |
| | 1450 | |
| 9824 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 9825 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 9826 | | |
| 9827 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 9828 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 9829 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9830 | | |
| 9831 | | See log for complete Python traceback. |
| 9832 | | |
| 9833 | | Traceback (most recent call last): |
| 9834 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9835 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 9836 | | self._update_completion_state(False) |
| 9837 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9838 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 9839 | | _update_completion_state |
| 9840 | | self._current_completion_state = |
| 9841 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 9842 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9843 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9844 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 9845 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 9846 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9847 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9848 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 9849 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 9850 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9851 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9852 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 9853 | | _complete_path_impl |
| 9854 | | if _maybe_path.exists(): |
| 9855 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9856 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 9857 | | self.stat() |
| 9858 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 9859 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 9860 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9861 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 9862 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 9863 | | |
| 9864 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 9865 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 9866 | | |
| 9867 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 9868 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 9869 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9870 | | |
| 9871 | | See log for complete Python traceback. |
| 9872 | | |
| 9873 | | Traceback (most recent call last): |
| 9874 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9875 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 9876 | | self._update_completion_state(False) |
| 9877 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9878 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 9879 | | _update_completion_state |
| 9880 | | self._current_completion_state = |
| 9881 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 9882 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9883 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9884 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 9885 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 9886 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9887 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9888 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 9889 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 9890 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9891 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9892 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 9893 | | _complete_path_impl |
| 9894 | | if _maybe_path.exists(): |
| 9895 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9896 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 9897 | | self.stat() |
| 9898 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 9899 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 9900 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9901 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 9902 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 9903 | | |
| 9904 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 9905 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 9906 | | |
| 9907 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 9908 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 9909 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9910 | | |
| 9911 | | See log for complete Python traceback. |
| 9912 | | |
| 9913 | | Traceback (most recent call last): |
| 9914 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9915 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 9916 | | self._update_completion_state(False) |
| 9917 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9918 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 9919 | | _update_completion_state |
| 9920 | | self._current_completion_state = |
| 9921 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 9922 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9923 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9924 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 9925 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 9926 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9927 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9928 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 9929 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 9930 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9931 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9932 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 9933 | | _complete_path_impl |
| 9934 | | if _maybe_path.exists(): |
| 9935 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9936 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 9937 | | self.stat() |
| 9938 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 9939 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 9940 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9941 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 9942 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 9943 | | |
| 9944 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 9945 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 9946 | | |
| 9947 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 9948 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 9949 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9950 | | |
| 9951 | | See log for complete Python traceback. |
| 9952 | | |
| 9953 | | Traceback (most recent call last): |
| 9954 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9955 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 9956 | | self._update_completion_state(False) |
| 9957 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9958 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 9959 | | _update_completion_state |
| 9960 | | self._current_completion_state = |
| 9961 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 9962 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9963 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9964 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 9965 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 9966 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9967 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9968 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 9969 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 9970 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9971 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9972 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 9973 | | _complete_path_impl |
| 9974 | | if _maybe_path.exists(): |
| 9975 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9976 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 9977 | | self.stat() |
| 9978 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 9979 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 9980 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9981 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 9982 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 9983 | | |
| 9984 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 9985 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 9986 | | |
| 9987 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 9988 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 9989 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 9990 | | |
| 9991 | | See log for complete Python traceback. |
| 9992 | | |
| 9993 | | Traceback (most recent call last): |
| 9994 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9995 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 9996 | | self._update_completion_state(False) |
| 9997 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 9998 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 9999 | | _update_completion_state |
| 10000 | | self._current_completion_state = |
| 10001 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10002 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10003 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10004 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10005 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10006 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10007 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10008 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10009 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10010 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10011 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10012 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10013 | | _complete_path_impl |
| 10014 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10015 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10016 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10017 | | self.stat() |
| 10018 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10019 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10020 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10021 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10022 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10023 | | |
| 10024 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10025 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10026 | | |
| 10027 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10028 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10029 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10030 | | |
| 10031 | | See log for complete Python traceback. |
| 10032 | | |
| 10033 | | Traceback (most recent call last): |
| 10034 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10035 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10036 | | self._update_completion_state(False) |
| 10037 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10038 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10039 | | _update_completion_state |
| 10040 | | self._current_completion_state = |
| 10041 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10042 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10043 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10044 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10045 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10046 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10047 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10048 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10049 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10050 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10051 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10052 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10053 | | _complete_path_impl |
| 10054 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10055 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10056 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10057 | | self.stat() |
| 10058 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10059 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10060 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10061 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10062 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10063 | | |
| 10064 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10065 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10066 | | |
| 10067 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10068 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10069 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10070 | | |
| 10071 | | See log for complete Python traceback. |
| 10072 | | |
| 10073 | | Traceback (most recent call last): |
| 10074 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10075 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10076 | | self._update_completion_state(False) |
| 10077 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10078 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10079 | | _update_completion_state |
| 10080 | | self._current_completion_state = |
| 10081 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10082 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10083 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10084 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10085 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10086 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10087 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10088 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10089 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10090 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10091 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10092 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10093 | | _complete_path_impl |
| 10094 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10095 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10096 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10097 | | self.stat() |
| 10098 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10099 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10100 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10101 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10102 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10103 | | |
| 10104 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10105 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10106 | | |
| 10107 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10108 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10109 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10110 | | |
| 10111 | | See log for complete Python traceback. |
| 10112 | | |
| 10113 | | Traceback (most recent call last): |
| 10114 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10115 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10116 | | self._update_completion_state(False) |
| 10117 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10118 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10119 | | _update_completion_state |
| 10120 | | self._current_completion_state = |
| 10121 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10122 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10123 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10124 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10125 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10126 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10127 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10128 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10129 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10130 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10131 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10132 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10133 | | _complete_path_impl |
| 10134 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10135 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10136 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10137 | | self.stat() |
| 10138 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10139 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10140 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10141 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10142 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10143 | | |
| 10144 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10145 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10146 | | |
| 10147 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10148 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10149 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10150 | | |
| 10151 | | See log for complete Python traceback. |
| 10152 | | |
| 10153 | | Traceback (most recent call last): |
| 10154 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10155 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10156 | | self._update_completion_state(False) |
| 10157 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10158 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10159 | | _update_completion_state |
| 10160 | | self._current_completion_state = |
| 10161 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10162 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10163 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10164 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10165 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10166 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10167 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10168 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10169 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10170 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10171 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10172 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10173 | | _complete_path_impl |
| 10174 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10175 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10176 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10177 | | self.stat() |
| 10178 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10179 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10180 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10181 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10182 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10183 | | |
| 10184 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10185 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10186 | | |
| 10187 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10188 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10189 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10190 | | |
| 10191 | | See log for complete Python traceback. |
| 10192 | | |
| 10193 | | Traceback (most recent call last): |
| 10194 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10195 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10196 | | self._update_completion_state(False) |
| 10197 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10198 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10199 | | _update_completion_state |
| 10200 | | self._current_completion_state = |
| 10201 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10202 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10203 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10204 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10205 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10206 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10207 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10208 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10209 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10210 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10211 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10212 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10213 | | _complete_path_impl |
| 10214 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10215 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10216 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10217 | | self.stat() |
| 10218 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10219 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10220 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10221 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10222 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10223 | | |
| 10224 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10225 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10226 | | |
| 10227 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10228 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10229 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10230 | | |
| 10231 | | See log for complete Python traceback. |
| 10232 | | |
| 10233 | | Traceback (most recent call last): |
| 10234 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10235 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10236 | | self._update_completion_state(False) |
| 10237 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10238 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10239 | | _update_completion_state |
| 10240 | | self._current_completion_state = |
| 10241 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10242 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10243 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10244 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10245 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10246 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10247 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10248 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10249 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10250 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10251 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10252 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10253 | | _complete_path_impl |
| 10254 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10255 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10256 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10257 | | self.stat() |
| 10258 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10259 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10260 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10261 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10262 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10263 | | |
| 10264 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10265 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10266 | | |
| 10267 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10268 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10269 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10270 | | |
| 10271 | | See log for complete Python traceback. |
| 10272 | | |
| 10273 | | Traceback (most recent call last): |
| 10274 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10275 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10276 | | self._update_completion_state(False) |
| 10277 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10278 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10279 | | _update_completion_state |
| 10280 | | self._current_completion_state = |
| 10281 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10282 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10283 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10284 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10285 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10286 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10287 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10288 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10289 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10290 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10291 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10292 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10293 | | _complete_path_impl |
| 10294 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10295 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10296 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10297 | | self.stat() |
| 10298 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10299 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10300 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10301 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10302 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10303 | | |
| 10304 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10305 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10306 | | |
| 10307 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10308 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10309 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10310 | | |
| 10311 | | See log for complete Python traceback. |
| 10312 | | |
| 10313 | | Traceback (most recent call last): |
| 10314 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10315 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10316 | | self._update_completion_state(False) |
| 10317 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10318 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10319 | | _update_completion_state |
| 10320 | | self._current_completion_state = |
| 10321 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10322 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10323 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10324 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10325 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10326 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10327 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10328 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10329 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10330 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10331 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10332 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10333 | | _complete_path_impl |
| 10334 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10335 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10336 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10337 | | self.stat() |
| 10338 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10339 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10340 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10341 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10342 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10343 | | |
| 10344 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10345 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10346 | | |
| 10347 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10348 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10349 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10350 | | |
| 10351 | | See log for complete Python traceback. |
| 10352 | | |
| 10353 | | Traceback (most recent call last): |
| 10354 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10355 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10356 | | self._update_completion_state(False) |
| 10357 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10358 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10359 | | _update_completion_state |
| 10360 | | self._current_completion_state = |
| 10361 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10362 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10363 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10364 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10365 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10366 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10367 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10368 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10369 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10370 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10371 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10372 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10373 | | _complete_path_impl |
| 10374 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10375 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10376 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10377 | | self.stat() |
| 10378 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10379 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10380 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10381 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10382 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10383 | | |
| 10384 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10385 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10386 | | |
| 10387 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10388 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10389 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10390 | | |
| 10391 | | See log for complete Python traceback. |
| 10392 | | |
| 10393 | | Traceback (most recent call last): |
| 10394 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10395 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10396 | | self._update_completion_state(False) |
| 10397 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10398 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10399 | | _update_completion_state |
| 10400 | | self._current_completion_state = |
| 10401 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10402 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10403 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10404 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10405 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10406 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10407 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10408 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10409 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10410 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10411 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10412 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10413 | | _complete_path_impl |
| 10414 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10415 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10416 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10417 | | self.stat() |
| 10418 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10419 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10420 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10421 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10422 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10423 | | |
| 10424 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10425 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10426 | | |
| 10427 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10428 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10429 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10430 | | |
| 10431 | | See log for complete Python traceback. |
| 10432 | | |
| 10433 | | Traceback (most recent call last): |
| 10434 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10435 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10436 | | self._update_completion_state(False) |
| 10437 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10438 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10439 | | _update_completion_state |
| 10440 | | self._current_completion_state = |
| 10441 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10442 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10443 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10444 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10445 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10446 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10447 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10448 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10449 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10450 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10451 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10452 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10453 | | _complete_path_impl |
| 10454 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10455 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10456 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10457 | | self.stat() |
| 10458 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10459 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10460 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10461 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10462 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10463 | | |
| 10464 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10465 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10466 | | |
| 10467 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10468 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10469 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10470 | | |
| 10471 | | See log for complete Python traceback. |
| 10472 | | |
| 10473 | | Traceback (most recent call last): |
| 10474 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10475 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10476 | | self._update_completion_state(False) |
| 10477 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10478 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10479 | | _update_completion_state |
| 10480 | | self._current_completion_state = |
| 10481 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10482 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10483 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10484 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10485 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10486 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10487 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10488 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10489 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10490 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10491 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10492 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10493 | | _complete_path_impl |
| 10494 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10495 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10496 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10497 | | self.stat() |
| 10498 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10499 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10500 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10501 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10502 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10503 | | |
| 10504 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10505 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10506 | | |
| 10507 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10508 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10509 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10510 | | |
| 10511 | | See log for complete Python traceback. |
| 10512 | | |
| 10513 | | Traceback (most recent call last): |
| 10514 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10515 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10516 | | self._update_completion_state(False) |
| 10517 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10518 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10519 | | _update_completion_state |
| 10520 | | self._current_completion_state = |
| 10521 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10522 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10523 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10524 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10525 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10526 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10527 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10528 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10529 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10530 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10531 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10532 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10533 | | _complete_path_impl |
| 10534 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10535 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10536 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10537 | | self.stat() |
| 10538 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10539 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10540 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10541 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10542 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10543 | | |
| 10544 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10545 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10546 | | |
| 10547 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10548 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10549 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10550 | | |
| 10551 | | See log for complete Python traceback. |
| 10552 | | |
| 10553 | | Traceback (most recent call last): |
| 10554 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10555 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10556 | | self._update_completion_state(False) |
| 10557 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10558 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10559 | | _update_completion_state |
| 10560 | | self._current_completion_state = |
| 10561 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10562 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10563 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10564 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10565 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10566 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10567 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10568 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10569 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10570 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10571 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10572 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10573 | | _complete_path_impl |
| 10574 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10575 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10576 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10577 | | self.stat() |
| 10578 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10579 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10580 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10581 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10582 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10583 | | |
| 10584 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10585 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10586 | | |
| 10587 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10588 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10589 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10590 | | |
| 10591 | | See log for complete Python traceback. |
| 10592 | | |
| 10593 | | Traceback (most recent call last): |
| 10594 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10595 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10596 | | self._update_completion_state(False) |
| 10597 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10598 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10599 | | _update_completion_state |
| 10600 | | self._current_completion_state = |
| 10601 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10602 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10603 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10604 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10605 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10606 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10607 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10608 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10609 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10610 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10611 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10612 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10613 | | _complete_path_impl |
| 10614 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10615 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10616 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10617 | | self.stat() |
| 10618 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10619 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10620 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10621 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10622 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10623 | | |
| 10624 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10625 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10626 | | |
| 10627 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10628 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10629 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10630 | | |
| 10631 | | See log for complete Python traceback. |
| 10632 | | |
| 10633 | | Traceback (most recent call last): |
| 10634 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10635 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10636 | | self._update_completion_state(False) |
| 10637 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10638 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10639 | | _update_completion_state |
| 10640 | | self._current_completion_state = |
| 10641 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10642 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10643 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10644 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10645 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10646 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10647 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10648 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10649 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10650 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10651 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10652 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10653 | | _complete_path_impl |
| 10654 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10655 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10656 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10657 | | self.stat() |
| 10658 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10659 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10660 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10661 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10662 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10663 | | |
| 10664 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10665 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10666 | | |
| 10667 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10668 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10669 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10670 | | |
| 10671 | | See log for complete Python traceback. |
| 10672 | | |
| 10673 | | Traceback (most recent call last): |
| 10674 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10675 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10676 | | self._update_completion_state(False) |
| 10677 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10678 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10679 | | _update_completion_state |
| 10680 | | self._current_completion_state = |
| 10681 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10682 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10683 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10684 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10685 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10686 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10687 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10688 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10689 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10690 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10691 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10692 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10693 | | _complete_path_impl |
| 10694 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10695 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10696 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10697 | | self.stat() |
| 10698 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10699 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10700 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10701 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10702 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10703 | | |
| 10704 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10705 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10706 | | |
| 10707 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10708 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10709 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10710 | | |
| 10711 | | See log for complete Python traceback. |
| 10712 | | |
| 10713 | | Traceback (most recent call last): |
| 10714 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10715 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10716 | | self._update_completion_state(False) |
| 10717 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10718 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10719 | | _update_completion_state |
| 10720 | | self._current_completion_state = |
| 10721 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10722 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10723 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10724 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10725 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10726 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10727 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10728 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10729 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10730 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10731 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10732 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10733 | | _complete_path_impl |
| 10734 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10735 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10736 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10737 | | self.stat() |
| 10738 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10739 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10740 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10741 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10742 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10743 | | |
| 10744 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10745 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10746 | | |
| 10747 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10748 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10749 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10750 | | |
| 10751 | | See log for complete Python traceback. |
| 10752 | | |
| 10753 | | Traceback (most recent call last): |
| 10754 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10755 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10756 | | self._update_completion_state(False) |
| 10757 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10758 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10759 | | _update_completion_state |
| 10760 | | self._current_completion_state = |
| 10761 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10762 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10763 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10764 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10765 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10766 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10767 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10768 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10769 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10770 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10771 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10772 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10773 | | _complete_path_impl |
| 10774 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10775 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10776 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10777 | | self.stat() |
| 10778 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10779 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10780 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10781 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10782 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10783 | | |
| 10784 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10785 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10786 | | |
| 10787 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10788 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10789 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10790 | | |
| 10791 | | See log for complete Python traceback. |
| 10792 | | |
| 10793 | | Traceback (most recent call last): |
| 10794 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10795 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10796 | | self._update_completion_state(False) |
| 10797 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10798 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10799 | | _update_completion_state |
| 10800 | | self._current_completion_state = |
| 10801 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10802 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10803 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10804 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10805 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10806 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10807 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10808 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10809 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10810 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10811 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10812 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10813 | | _complete_path_impl |
| 10814 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10815 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10816 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10817 | | self.stat() |
| 10818 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10819 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10820 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10821 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10822 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10823 | | |
| 10824 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10825 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10826 | | |
| 10827 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10828 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10829 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10830 | | |
| 10831 | | See log for complete Python traceback. |
| 10832 | | |
| 10833 | | Traceback (most recent call last): |
| 10834 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10835 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10836 | | self._update_completion_state(False) |
| 10837 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10838 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10839 | | _update_completion_state |
| 10840 | | self._current_completion_state = |
| 10841 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10842 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10843 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10844 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10845 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10846 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10847 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10848 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10849 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10850 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10851 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10852 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10853 | | _complete_path_impl |
| 10854 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10855 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10856 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10857 | | self.stat() |
| 10858 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10859 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10860 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10861 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10862 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10863 | | |
| 10864 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10865 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10866 | | |
| 10867 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10868 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10869 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10870 | | |
| 10871 | | See log for complete Python traceback. |
| 10872 | | |
| 10873 | | Traceback (most recent call last): |
| 10874 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10875 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10876 | | self._update_completion_state(False) |
| 10877 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10878 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10879 | | _update_completion_state |
| 10880 | | self._current_completion_state = |
| 10881 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10882 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10883 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10884 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10885 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10886 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10887 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10888 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10889 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10890 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10891 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10892 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10893 | | _complete_path_impl |
| 10894 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10895 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10896 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10897 | | self.stat() |
| 10898 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10899 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10900 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10901 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10902 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10903 | | |
| 10904 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10905 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10906 | | |
| 10907 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10908 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10909 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10910 | | |
| 10911 | | See log for complete Python traceback. |
| 10912 | | |
| 10913 | | Traceback (most recent call last): |
| 10914 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10915 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10916 | | self._update_completion_state(False) |
| 10917 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10918 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10919 | | _update_completion_state |
| 10920 | | self._current_completion_state = |
| 10921 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10922 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10923 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10924 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10925 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10926 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10927 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10928 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10929 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10930 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10931 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10932 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10933 | | _complete_path_impl |
| 10934 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10935 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10936 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10937 | | self.stat() |
| 10938 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10939 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10940 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10941 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10942 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10943 | | |
| 10944 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10945 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10946 | | |
| 10947 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10948 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10949 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10950 | | |
| 10951 | | See log for complete Python traceback. |
| 10952 | | |
| 10953 | | Traceback (most recent call last): |
| 10954 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10955 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10956 | | self._update_completion_state(False) |
| 10957 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10958 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10959 | | _update_completion_state |
| 10960 | | self._current_completion_state = |
| 10961 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 10962 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10963 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10964 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 10965 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 10966 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10967 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10968 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 10969 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 10970 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10971 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10972 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 10973 | | _complete_path_impl |
| 10974 | | if _maybe_path.exists(): |
| 10975 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10976 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 10977 | | self.stat() |
| 10978 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10979 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10980 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10981 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10982 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10983 | | |
| 10984 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 10985 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 10986 | | |
| 10987 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 10988 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 10989 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 10990 | | |
| 10991 | | See log for complete Python traceback. |
| 10992 | | |
| 10993 | | Traceback (most recent call last): |
| 10994 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10995 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 10996 | | self._update_completion_state(False) |
| 10997 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 10998 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 10999 | | _update_completion_state |
| 11000 | | self._current_completion_state = |
| 11001 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11002 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11003 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11004 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11005 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11006 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11007 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11008 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11009 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11010 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11011 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11012 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11013 | | _complete_path_impl |
| 11014 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11015 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11016 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11017 | | self.stat() |
| 11018 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11019 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11020 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11021 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11022 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11023 | | |
| 11024 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11025 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11026 | | |
| 11027 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11028 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11029 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11030 | | |
| 11031 | | See log for complete Python traceback. |
| 11032 | | |
| 11033 | | Traceback (most recent call last): |
| 11034 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11035 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11036 | | self._update_completion_state(False) |
| 11037 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11038 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11039 | | _update_completion_state |
| 11040 | | self._current_completion_state = |
| 11041 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11042 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11043 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11044 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11045 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11046 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11047 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11048 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11049 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11050 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11051 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11052 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11053 | | _complete_path_impl |
| 11054 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11055 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11056 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11057 | | self.stat() |
| 11058 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11059 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11060 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11061 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11062 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11063 | | |
| 11064 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11065 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11066 | | |
| 11067 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11068 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11069 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11070 | | |
| 11071 | | See log for complete Python traceback. |
| 11072 | | |
| 11073 | | Traceback (most recent call last): |
| 11074 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11075 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11076 | | self._update_completion_state(False) |
| 11077 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11078 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11079 | | _update_completion_state |
| 11080 | | self._current_completion_state = |
| 11081 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11082 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11083 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11084 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11085 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11086 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11087 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11088 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11089 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11090 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11091 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11092 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11093 | | _complete_path_impl |
| 11094 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11095 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11096 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11097 | | self.stat() |
| 11098 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11099 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11100 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11101 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11102 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11103 | | |
| 11104 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11105 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11106 | | |
| 11107 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11108 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11109 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11110 | | |
| 11111 | | See log for complete Python traceback. |
| 11112 | | |
| 11113 | | Traceback (most recent call last): |
| 11114 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11115 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11116 | | self._update_completion_state(False) |
| 11117 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11118 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11119 | | _update_completion_state |
| 11120 | | self._current_completion_state = |
| 11121 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11122 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11123 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11124 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11125 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11126 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11127 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11128 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11129 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11130 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11131 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11132 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11133 | | _complete_path_impl |
| 11134 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11135 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11136 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11137 | | self.stat() |
| 11138 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11139 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11140 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11141 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11142 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11143 | | |
| 11144 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11145 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11146 | | |
| 11147 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11148 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11149 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11150 | | |
| 11151 | | See log for complete Python traceback. |
| 11152 | | |
| 11153 | | Traceback (most recent call last): |
| 11154 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11155 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11156 | | self._update_completion_state(False) |
| 11157 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11158 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11159 | | _update_completion_state |
| 11160 | | self._current_completion_state = |
| 11161 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11162 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11163 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11164 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11165 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11166 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11167 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11168 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11169 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11170 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11171 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11172 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11173 | | _complete_path_impl |
| 11174 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11175 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11176 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11177 | | self.stat() |
| 11178 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11179 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11180 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11181 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11182 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11183 | | |
| 11184 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11185 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11186 | | |
| 11187 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11188 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11189 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11190 | | |
| 11191 | | See log for complete Python traceback. |
| 11192 | | |
| 11193 | | Traceback (most recent call last): |
| 11194 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11195 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11196 | | self._update_completion_state(False) |
| 11197 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11198 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11199 | | _update_completion_state |
| 11200 | | self._current_completion_state = |
| 11201 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11202 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11203 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11204 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11205 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11206 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11207 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11208 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11209 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11210 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11211 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11212 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11213 | | _complete_path_impl |
| 11214 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11215 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11216 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11217 | | self.stat() |
| 11218 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11219 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11220 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11221 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11222 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11223 | | |
| 11224 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11225 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11226 | | |
| 11227 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11228 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11229 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11230 | | |
| 11231 | | See log for complete Python traceback. |
| 11232 | | |
| 11233 | | Traceback (most recent call last): |
| 11234 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11235 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11236 | | self._update_completion_state(False) |
| 11237 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11238 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11239 | | _update_completion_state |
| 11240 | | self._current_completion_state = |
| 11241 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11242 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11243 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11244 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11245 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11246 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11247 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11248 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11249 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11250 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11251 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11252 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11253 | | _complete_path_impl |
| 11254 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11255 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11256 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11257 | | self.stat() |
| 11258 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11259 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11260 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11261 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11262 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11263 | | |
| 11264 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11265 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11266 | | |
| 11267 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11268 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11269 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11270 | | |
| 11271 | | See log for complete Python traceback. |
| 11272 | | |
| 11273 | | Traceback (most recent call last): |
| 11274 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11275 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11276 | | self._update_completion_state(False) |
| 11277 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11278 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11279 | | _update_completion_state |
| 11280 | | self._current_completion_state = |
| 11281 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11282 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11283 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11284 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11285 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11286 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11287 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11288 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11289 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11290 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11291 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11292 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11293 | | _complete_path_impl |
| 11294 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11295 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11296 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11297 | | self.stat() |
| 11298 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11299 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11300 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11301 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11302 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11303 | | |
| 11304 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11305 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11306 | | |
| 11307 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11308 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11309 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11310 | | |
| 11311 | | See log for complete Python traceback. |
| 11312 | | |
| 11313 | | Traceback (most recent call last): |
| 11314 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11315 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11316 | | self._update_completion_state(False) |
| 11317 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11318 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11319 | | _update_completion_state |
| 11320 | | self._current_completion_state = |
| 11321 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11322 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11323 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11324 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11325 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11326 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11327 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11328 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11329 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11330 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11331 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11332 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11333 | | _complete_path_impl |
| 11334 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11335 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11336 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11337 | | self.stat() |
| 11338 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11339 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11340 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11341 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11342 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11343 | | |
| 11344 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11345 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11346 | | |
| 11347 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11348 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11349 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11350 | | |
| 11351 | | See log for complete Python traceback. |
| 11352 | | |
| 11353 | | Traceback (most recent call last): |
| 11354 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11355 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11356 | | self._update_completion_state(False) |
| 11357 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11358 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11359 | | _update_completion_state |
| 11360 | | self._current_completion_state = |
| 11361 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11362 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11363 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11364 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11365 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11366 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11367 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11368 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11369 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11370 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11371 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11372 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11373 | | _complete_path_impl |
| 11374 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11375 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11376 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11377 | | self.stat() |
| 11378 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11379 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11380 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11381 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11382 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11383 | | |
| 11384 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11385 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11386 | | |
| 11387 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11388 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11389 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11390 | | |
| 11391 | | See log for complete Python traceback. |
| 11392 | | |
| 11393 | | Traceback (most recent call last): |
| 11394 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11395 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11396 | | self._update_completion_state(False) |
| 11397 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11398 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11399 | | _update_completion_state |
| 11400 | | self._current_completion_state = |
| 11401 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11402 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11403 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11404 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11405 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11406 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11407 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11408 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11409 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11410 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11411 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11412 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11413 | | _complete_path_impl |
| 11414 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11415 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11416 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11417 | | self.stat() |
| 11418 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11419 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11420 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11421 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11422 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11423 | | |
| 11424 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11425 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11426 | | |
| 11427 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11428 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11429 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11430 | | |
| 11431 | | See log for complete Python traceback. |
| 11432 | | |
| 11433 | | Traceback (most recent call last): |
| 11434 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11435 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11436 | | self._update_completion_state(False) |
| 11437 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11438 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11439 | | _update_completion_state |
| 11440 | | self._current_completion_state = |
| 11441 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11442 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11443 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11444 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11445 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11446 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11447 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11448 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11449 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11450 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11451 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11452 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11453 | | _complete_path_impl |
| 11454 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11455 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11456 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11457 | | self.stat() |
| 11458 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11459 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11460 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11461 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11462 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11463 | | |
| 11464 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11465 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11466 | | |
| 11467 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11468 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11469 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11470 | | |
| 11471 | | See log for complete Python traceback. |
| 11472 | | |
| 11473 | | Traceback (most recent call last): |
| 11474 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11475 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11476 | | self._update_completion_state(False) |
| 11477 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11478 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11479 | | _update_completion_state |
| 11480 | | self._current_completion_state = |
| 11481 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11482 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11483 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11484 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11485 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11486 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11487 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11488 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11489 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11490 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11491 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11492 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11493 | | _complete_path_impl |
| 11494 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11495 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11496 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11497 | | self.stat() |
| 11498 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11499 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11500 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11501 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11502 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11503 | | |
| 11504 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11505 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11506 | | |
| 11507 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11508 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11509 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11510 | | |
| 11511 | | See log for complete Python traceback. |
| 11512 | | |
| 11513 | | Traceback (most recent call last): |
| 11514 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11515 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11516 | | self._update_completion_state(False) |
| 11517 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11518 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11519 | | _update_completion_state |
| 11520 | | self._current_completion_state = |
| 11521 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11522 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11523 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11524 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11525 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11526 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11527 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11528 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11529 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11530 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11531 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11532 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11533 | | _complete_path_impl |
| 11534 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11535 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11536 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11537 | | self.stat() |
| 11538 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11539 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11540 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11541 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11542 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11543 | | |
| 11544 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11545 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11546 | | |
| 11547 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11548 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11549 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11550 | | |
| 11551 | | See log for complete Python traceback. |
| 11552 | | |
| 11553 | | Traceback (most recent call last): |
| 11554 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11555 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11556 | | self._update_completion_state(False) |
| 11557 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11558 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11559 | | _update_completion_state |
| 11560 | | self._current_completion_state = |
| 11561 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11562 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11563 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11564 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11565 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11566 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11567 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11568 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11569 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11570 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11571 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11572 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11573 | | _complete_path_impl |
| 11574 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11575 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11576 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11577 | | self.stat() |
| 11578 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11579 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11580 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11581 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11582 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11583 | | |
| 11584 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11585 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11586 | | |
| 11587 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11588 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11589 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11590 | | |
| 11591 | | See log for complete Python traceback. |
| 11592 | | |
| 11593 | | Traceback (most recent call last): |
| 11594 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11595 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11596 | | self._update_completion_state(False) |
| 11597 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11598 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11599 | | _update_completion_state |
| 11600 | | self._current_completion_state = |
| 11601 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11602 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11603 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11604 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11605 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11606 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11607 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11608 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11609 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11610 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11611 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11612 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11613 | | _complete_path_impl |
| 11614 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11615 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11616 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11617 | | self.stat() |
| 11618 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11619 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11620 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11621 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11622 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11623 | | |
| 11624 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11625 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11626 | | |
| 11627 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11628 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11629 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11630 | | |
| 11631 | | See log for complete Python traceback. |
| 11632 | | |
| 11633 | | Traceback (most recent call last): |
| 11634 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11635 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11636 | | self._update_completion_state(False) |
| 11637 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11638 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11639 | | _update_completion_state |
| 11640 | | self._current_completion_state = |
| 11641 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11642 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11643 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11644 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11645 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11646 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11647 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11648 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11649 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11650 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11651 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11652 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11653 | | _complete_path_impl |
| 11654 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11655 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11656 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11657 | | self.stat() |
| 11658 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11659 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11660 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11661 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11662 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11663 | | |
| 11664 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11665 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11666 | | |
| 11667 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11668 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11669 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11670 | | |
| 11671 | | See log for complete Python traceback. |
| 11672 | | |
| 11673 | | Traceback (most recent call last): |
| 11674 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11675 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11676 | | self._update_completion_state(False) |
| 11677 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11678 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11679 | | _update_completion_state |
| 11680 | | self._current_completion_state = |
| 11681 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11682 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11683 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11684 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11685 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11686 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11687 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11688 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11689 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11690 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11691 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11692 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11693 | | _complete_path_impl |
| 11694 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11695 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11696 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11697 | | self.stat() |
| 11698 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11699 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11700 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11701 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11702 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11703 | | |
| 11704 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11705 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11706 | | |
| 11707 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11708 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11709 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11710 | | |
| 11711 | | See log for complete Python traceback. |
| 11712 | | |
| 11713 | | Traceback (most recent call last): |
| 11714 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11715 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11716 | | self._update_completion_state(False) |
| 11717 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11718 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11719 | | _update_completion_state |
| 11720 | | self._current_completion_state = |
| 11721 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11722 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11723 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11724 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11725 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11726 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11727 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11728 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11729 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11730 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11731 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11732 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11733 | | _complete_path_impl |
| 11734 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11735 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11736 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11737 | | self.stat() |
| 11738 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11739 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11740 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11741 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11742 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11743 | | |
| 11744 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11745 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11746 | | |
| 11747 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11748 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11749 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11750 | | |
| 11751 | | See log for complete Python traceback. |
| 11752 | | |
| 11753 | | Traceback (most recent call last): |
| 11754 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11755 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11756 | | self._update_completion_state(False) |
| 11757 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11758 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11759 | | _update_completion_state |
| 11760 | | self._current_completion_state = |
| 11761 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11762 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11763 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11764 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11765 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11766 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11767 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11768 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11769 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11770 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11771 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11772 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11773 | | _complete_path_impl |
| 11774 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11775 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11776 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11777 | | self.stat() |
| 11778 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11779 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11780 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11781 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11782 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11783 | | |
| 11784 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11785 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11786 | | |
| 11787 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11788 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11789 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11790 | | |
| 11791 | | See log for complete Python traceback. |
| 11792 | | |
| 11793 | | Traceback (most recent call last): |
| 11794 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11795 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11796 | | self._update_completion_state(False) |
| 11797 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11798 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11799 | | _update_completion_state |
| 11800 | | self._current_completion_state = |
| 11801 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11802 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11803 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11804 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11805 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11806 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11807 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11808 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11809 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11810 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11811 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11812 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11813 | | _complete_path_impl |
| 11814 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11815 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11816 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11817 | | self.stat() |
| 11818 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11819 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11820 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11821 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11822 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11823 | | |
| 11824 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11825 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11826 | | |
| 11827 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11828 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11829 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11830 | | |
| 11831 | | See log for complete Python traceback. |
| 11832 | | |
| 11833 | | Traceback (most recent call last): |
| 11834 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11835 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11836 | | self._update_completion_state(False) |
| 11837 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11838 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11839 | | _update_completion_state |
| 11840 | | self._current_completion_state = |
| 11841 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11842 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11843 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11844 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11845 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11846 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11847 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11848 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11849 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11850 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11851 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11852 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11853 | | _complete_path_impl |
| 11854 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11855 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11856 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11857 | | self.stat() |
| 11858 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11859 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11860 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11861 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11862 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11863 | | |
| 11864 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11865 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11866 | | |
| 11867 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11868 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11869 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11870 | | |
| 11871 | | See log for complete Python traceback. |
| 11872 | | |
| 11873 | | Traceback (most recent call last): |
| 11874 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11875 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11876 | | self._update_completion_state(False) |
| 11877 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11878 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11879 | | _update_completion_state |
| 11880 | | self._current_completion_state = |
| 11881 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11882 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11883 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11884 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11885 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11886 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11887 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11888 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11889 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11890 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11891 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11892 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11893 | | _complete_path_impl |
| 11894 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11895 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11896 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11897 | | self.stat() |
| 11898 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11899 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11900 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11901 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11902 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11903 | | |
| 11904 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11905 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11906 | | |
| 11907 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11908 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11909 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11910 | | |
| 11911 | | See log for complete Python traceback. |
| 11912 | | |
| 11913 | | Traceback (most recent call last): |
| 11914 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11915 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11916 | | self._update_completion_state(False) |
| 11917 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11918 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11919 | | _update_completion_state |
| 11920 | | self._current_completion_state = |
| 11921 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11922 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11923 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11924 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11925 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11926 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11927 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11928 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11929 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11930 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11931 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11932 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11933 | | _complete_path_impl |
| 11934 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11935 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11936 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11937 | | self.stat() |
| 11938 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11939 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11940 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11941 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11942 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11943 | | |
| 11944 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11945 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11946 | | |
| 11947 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11948 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11949 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11950 | | |
| 11951 | | See log for complete Python traceback. |
| 11952 | | |
| 11953 | | Traceback (most recent call last): |
| 11954 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11955 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11956 | | self._update_completion_state(False) |
| 11957 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11958 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11959 | | _update_completion_state |
| 11960 | | self._current_completion_state = |
| 11961 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 11962 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11963 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11964 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 11965 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 11966 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11967 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11968 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 11969 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 11970 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11971 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11972 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 11973 | | _complete_path_impl |
| 11974 | | if _maybe_path.exists(): |
| 11975 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11976 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 11977 | | self.stat() |
| 11978 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11979 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11980 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11981 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11982 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11983 | | |
| 11984 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 11985 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 11986 | | |
| 11987 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 11988 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 11989 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 11990 | | |
| 11991 | | See log for complete Python traceback. |
| 11992 | | |
| 11993 | | Traceback (most recent call last): |
| 11994 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11995 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 11996 | | self._update_completion_state(False) |
| 11997 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 11998 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 11999 | | _update_completion_state |
| 12000 | | self._current_completion_state = |
| 12001 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12002 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12003 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12004 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12005 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12006 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12007 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12008 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12009 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12010 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12011 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12012 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12013 | | _complete_path_impl |
| 12014 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12015 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12016 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12017 | | self.stat() |
| 12018 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12019 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12020 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12021 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12022 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12023 | | |
| 12024 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12025 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12026 | | |
| 12027 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12028 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12029 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12030 | | |
| 12031 | | See log for complete Python traceback. |
| 12032 | | |
| 12033 | | Traceback (most recent call last): |
| 12034 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12035 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12036 | | self._update_completion_state(False) |
| 12037 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12038 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12039 | | _update_completion_state |
| 12040 | | self._current_completion_state = |
| 12041 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12042 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12043 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12044 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12045 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12046 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12047 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12048 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12049 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12050 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12051 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12052 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12053 | | _complete_path_impl |
| 12054 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12055 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12056 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12057 | | self.stat() |
| 12058 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12059 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12060 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12061 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12062 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12063 | | |
| 12064 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12065 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12066 | | |
| 12067 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12068 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12069 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12070 | | |
| 12071 | | See log for complete Python traceback. |
| 12072 | | |
| 12073 | | Traceback (most recent call last): |
| 12074 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12075 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12076 | | self._update_completion_state(False) |
| 12077 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12078 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12079 | | _update_completion_state |
| 12080 | | self._current_completion_state = |
| 12081 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12082 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12083 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12084 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12085 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12086 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12087 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12088 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12089 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12090 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12091 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12092 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12093 | | _complete_path_impl |
| 12094 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12095 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12096 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12097 | | self.stat() |
| 12098 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12099 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12100 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12101 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12102 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12103 | | |
| 12104 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12105 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12106 | | |
| 12107 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12108 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12109 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12110 | | |
| 12111 | | See log for complete Python traceback. |
| 12112 | | |
| 12113 | | Traceback (most recent call last): |
| 12114 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12115 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12116 | | self._update_completion_state(False) |
| 12117 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12118 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12119 | | _update_completion_state |
| 12120 | | self._current_completion_state = |
| 12121 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12122 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12123 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12124 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12125 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12126 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12127 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12128 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12129 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12130 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12131 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12132 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12133 | | _complete_path_impl |
| 12134 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12135 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12136 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12137 | | self.stat() |
| 12138 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12139 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12140 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12141 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12142 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12143 | | |
| 12144 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12145 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12146 | | |
| 12147 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12148 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12149 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12150 | | |
| 12151 | | See log for complete Python traceback. |
| 12152 | | |
| 12153 | | Traceback (most recent call last): |
| 12154 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12155 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12156 | | self._update_completion_state(False) |
| 12157 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12158 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12159 | | _update_completion_state |
| 12160 | | self._current_completion_state = |
| 12161 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12162 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12163 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12164 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12165 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12166 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12167 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12168 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12169 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12170 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12171 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12172 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12173 | | _complete_path_impl |
| 12174 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12175 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12176 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12177 | | self.stat() |
| 12178 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12179 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12180 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12181 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12182 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12183 | | |
| 12184 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12185 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12186 | | |
| 12187 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12188 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12189 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12190 | | |
| 12191 | | See log for complete Python traceback. |
| 12192 | | |
| 12193 | | Traceback (most recent call last): |
| 12194 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12195 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12196 | | self._update_completion_state(False) |
| 12197 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12198 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12199 | | _update_completion_state |
| 12200 | | self._current_completion_state = |
| 12201 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12202 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12203 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12204 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12205 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12206 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12207 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12208 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12209 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12210 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12211 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12212 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12213 | | _complete_path_impl |
| 12214 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12215 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12216 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12217 | | self.stat() |
| 12218 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12219 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12220 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12221 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12222 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12223 | | |
| 12224 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12225 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12226 | | |
| 12227 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12228 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12229 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12230 | | |
| 12231 | | See log for complete Python traceback. |
| 12232 | | |
| 12233 | | Traceback (most recent call last): |
| 12234 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12235 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12236 | | self._update_completion_state(False) |
| 12237 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12238 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12239 | | _update_completion_state |
| 12240 | | self._current_completion_state = |
| 12241 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12242 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12243 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12244 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12245 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12246 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12247 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12248 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12249 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12250 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12251 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12252 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12253 | | _complete_path_impl |
| 12254 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12255 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12256 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12257 | | self.stat() |
| 12258 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12259 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12260 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12261 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12262 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12263 | | |
| 12264 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12265 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12266 | | |
| 12267 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12268 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12269 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12270 | | |
| 12271 | | See log for complete Python traceback. |
| 12272 | | |
| 12273 | | Traceback (most recent call last): |
| 12274 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12275 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12276 | | self._update_completion_state(False) |
| 12277 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12278 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12279 | | _update_completion_state |
| 12280 | | self._current_completion_state = |
| 12281 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12282 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12283 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12284 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12285 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12286 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12287 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12288 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12289 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12290 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12291 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12292 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12293 | | _complete_path_impl |
| 12294 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12295 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12296 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12297 | | self.stat() |
| 12298 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12299 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12300 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12301 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12302 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12303 | | |
| 12304 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12305 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12306 | | |
| 12307 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12308 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12309 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12310 | | |
| 12311 | | See log for complete Python traceback. |
| 12312 | | |
| 12313 | | Traceback (most recent call last): |
| 12314 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12315 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12316 | | self._update_completion_state(False) |
| 12317 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12318 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12319 | | _update_completion_state |
| 12320 | | self._current_completion_state = |
| 12321 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12322 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12323 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12324 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12325 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12326 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12327 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12328 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12329 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12330 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12331 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12332 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12333 | | _complete_path_impl |
| 12334 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12335 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12336 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12337 | | self.stat() |
| 12338 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12339 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12340 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12341 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12342 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12343 | | |
| 12344 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12345 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12346 | | |
| 12347 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12348 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12349 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12350 | | |
| 12351 | | See log for complete Python traceback. |
| 12352 | | |
| 12353 | | Traceback (most recent call last): |
| 12354 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12355 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12356 | | self._update_completion_state(False) |
| 12357 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12358 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12359 | | _update_completion_state |
| 12360 | | self._current_completion_state = |
| 12361 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12362 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12363 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12364 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12365 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12366 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12367 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12368 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12369 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12370 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12371 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12372 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12373 | | _complete_path_impl |
| 12374 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12375 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12376 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12377 | | self.stat() |
| 12378 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12379 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12380 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12381 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12382 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12383 | | |
| 12384 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12385 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12386 | | |
| 12387 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12388 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12389 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12390 | | |
| 12391 | | See log for complete Python traceback. |
| 12392 | | |
| 12393 | | Traceback (most recent call last): |
| 12394 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12395 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12396 | | self._update_completion_state(False) |
| 12397 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12398 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12399 | | _update_completion_state |
| 12400 | | self._current_completion_state = |
| 12401 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12402 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12403 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12404 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12405 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12406 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12407 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12408 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12409 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12410 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12411 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12412 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12413 | | _complete_path_impl |
| 12414 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12415 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12416 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12417 | | self.stat() |
| 12418 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12419 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12420 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12421 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12422 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12423 | | |
| 12424 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12425 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12426 | | |
| 12427 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12428 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12429 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12430 | | |
| 12431 | | See log for complete Python traceback. |
| 12432 | | |
| 12433 | | Traceback (most recent call last): |
| 12434 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12435 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12436 | | self._update_completion_state(False) |
| 12437 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12438 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12439 | | _update_completion_state |
| 12440 | | self._current_completion_state = |
| 12441 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12442 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12443 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12444 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12445 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12446 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12447 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12448 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12449 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12450 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12451 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12452 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12453 | | _complete_path_impl |
| 12454 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12455 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12456 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12457 | | self.stat() |
| 12458 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12459 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12460 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12461 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12462 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12463 | | |
| 12464 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12465 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12466 | | |
| 12467 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12468 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12469 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12470 | | |
| 12471 | | See log for complete Python traceback. |
| 12472 | | |
| 12473 | | Traceback (most recent call last): |
| 12474 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12475 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12476 | | self._update_completion_state(False) |
| 12477 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12478 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12479 | | _update_completion_state |
| 12480 | | self._current_completion_state = |
| 12481 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12482 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12483 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12484 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12485 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12486 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12487 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12488 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12489 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12490 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12491 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12492 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12493 | | _complete_path_impl |
| 12494 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12495 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12496 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12497 | | self.stat() |
| 12498 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12499 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12500 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12501 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12502 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12503 | | |
| 12504 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12505 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12506 | | |
| 12507 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12508 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12509 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12510 | | |
| 12511 | | See log for complete Python traceback. |
| 12512 | | |
| 12513 | | Traceback (most recent call last): |
| 12514 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12515 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12516 | | self._update_completion_state(False) |
| 12517 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12518 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12519 | | _update_completion_state |
| 12520 | | self._current_completion_state = |
| 12521 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12522 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12523 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12524 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12525 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12526 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12527 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12528 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12529 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12530 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12531 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12532 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12533 | | _complete_path_impl |
| 12534 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12535 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12536 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12537 | | self.stat() |
| 12538 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12539 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12540 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12541 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12542 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12543 | | |
| 12544 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12545 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12546 | | |
| 12547 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12548 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12549 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12550 | | |
| 12551 | | See log for complete Python traceback. |
| 12552 | | |
| 12553 | | Traceback (most recent call last): |
| 12554 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12555 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12556 | | self._update_completion_state(False) |
| 12557 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12558 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12559 | | _update_completion_state |
| 12560 | | self._current_completion_state = |
| 12561 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12562 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12563 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12564 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12565 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12566 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12567 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12568 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12569 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12570 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12571 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12572 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12573 | | _complete_path_impl |
| 12574 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12575 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12576 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12577 | | self.stat() |
| 12578 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12579 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12580 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12581 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12582 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12583 | | |
| 12584 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12585 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12586 | | |
| 12587 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12588 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12589 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12590 | | |
| 12591 | | See log for complete Python traceback. |
| 12592 | | |
| 12593 | | Traceback (most recent call last): |
| 12594 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12595 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12596 | | self._update_completion_state(False) |
| 12597 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12598 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12599 | | _update_completion_state |
| 12600 | | self._current_completion_state = |
| 12601 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12602 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12603 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12604 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12605 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12606 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12607 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12608 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12609 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12610 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12611 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12612 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12613 | | _complete_path_impl |
| 12614 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12615 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12616 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12617 | | self.stat() |
| 12618 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12619 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12620 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12621 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12622 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12623 | | |
| 12624 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12625 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12626 | | |
| 12627 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12628 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12629 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12630 | | |
| 12631 | | See log for complete Python traceback. |
| 12632 | | |
| 12633 | | Traceback (most recent call last): |
| 12634 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12635 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12636 | | self._update_completion_state(False) |
| 12637 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12638 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12639 | | _update_completion_state |
| 12640 | | self._current_completion_state = |
| 12641 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12642 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12643 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12644 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12645 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12646 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12647 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12648 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12649 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12650 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12651 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12652 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12653 | | _complete_path_impl |
| 12654 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12655 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12656 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12657 | | self.stat() |
| 12658 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12659 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12660 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12661 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12662 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12663 | | |
| 12664 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12665 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12666 | | |
| 12667 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12668 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12669 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12670 | | |
| 12671 | | See log for complete Python traceback. |
| 12672 | | |
| 12673 | | Traceback (most recent call last): |
| 12674 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12675 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12676 | | self._update_completion_state(False) |
| 12677 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12678 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12679 | | _update_completion_state |
| 12680 | | self._current_completion_state = |
| 12681 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12682 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12683 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12684 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12685 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12686 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12687 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12688 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12689 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12690 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12691 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12692 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12693 | | _complete_path_impl |
| 12694 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12695 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12696 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12697 | | self.stat() |
| 12698 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12699 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12700 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12701 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12702 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12703 | | |
| 12704 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12705 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12706 | | |
| 12707 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12708 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12709 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12710 | | |
| 12711 | | See log for complete Python traceback. |
| 12712 | | |
| 12713 | | Traceback (most recent call last): |
| 12714 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12715 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12716 | | self._update_completion_state(False) |
| 12717 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12718 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12719 | | _update_completion_state |
| 12720 | | self._current_completion_state = |
| 12721 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12722 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12723 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12724 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12725 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12726 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12727 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12728 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12729 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12730 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12731 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12732 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12733 | | _complete_path_impl |
| 12734 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12735 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12736 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12737 | | self.stat() |
| 12738 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12739 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12740 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12741 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12742 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12743 | | |
| 12744 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12745 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12746 | | |
| 12747 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12748 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12749 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12750 | | |
| 12751 | | See log for complete Python traceback. |
| 12752 | | |
| 12753 | | Traceback (most recent call last): |
| 12754 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12755 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12756 | | self._update_completion_state(False) |
| 12757 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12758 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12759 | | _update_completion_state |
| 12760 | | self._current_completion_state = |
| 12761 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12762 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12763 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12764 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12765 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12766 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12767 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12768 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12769 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12770 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12771 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12772 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12773 | | _complete_path_impl |
| 12774 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12775 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12776 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12777 | | self.stat() |
| 12778 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12779 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12780 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12781 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12782 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12783 | | |
| 12784 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12785 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12786 | | |
| 12787 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12788 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12789 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12790 | | |
| 12791 | | See log for complete Python traceback. |
| 12792 | | |
| 12793 | | Traceback (most recent call last): |
| 12794 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12795 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12796 | | self._update_completion_state(False) |
| 12797 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12798 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12799 | | _update_completion_state |
| 12800 | | self._current_completion_state = |
| 12801 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12802 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12803 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12804 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12805 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12806 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12807 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12808 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12809 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12810 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12811 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12812 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12813 | | _complete_path_impl |
| 12814 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12815 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12816 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12817 | | self.stat() |
| 12818 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12819 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12820 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12821 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12822 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12823 | | |
| 12824 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12825 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12826 | | |
| 12827 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12828 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12829 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12830 | | |
| 12831 | | See log for complete Python traceback. |
| 12832 | | |
| 12833 | | Traceback (most recent call last): |
| 12834 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12835 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12836 | | self._update_completion_state(False) |
| 12837 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12838 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12839 | | _update_completion_state |
| 12840 | | self._current_completion_state = |
| 12841 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12842 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12843 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12844 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12845 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12846 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12847 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12848 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12849 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12850 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12851 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12852 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12853 | | _complete_path_impl |
| 12854 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12855 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12856 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12857 | | self.stat() |
| 12858 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12859 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12860 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12861 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12862 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12863 | | |
| 12864 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12865 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12866 | | |
| 12867 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12868 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12869 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12870 | | |
| 12871 | | See log for complete Python traceback. |
| 12872 | | |
| 12873 | | Traceback (most recent call last): |
| 12874 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12875 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12876 | | self._update_completion_state(False) |
| 12877 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12878 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12879 | | _update_completion_state |
| 12880 | | self._current_completion_state = |
| 12881 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12882 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12883 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12884 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12885 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12886 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12887 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12888 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12889 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12890 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12891 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12892 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12893 | | _complete_path_impl |
| 12894 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12895 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12896 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12897 | | self.stat() |
| 12898 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12899 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12900 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12901 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12902 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12903 | | |
| 12904 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12905 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12906 | | |
| 12907 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12908 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12909 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12910 | | |
| 12911 | | See log for complete Python traceback. |
| 12912 | | |
| 12913 | | Traceback (most recent call last): |
| 12914 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12915 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12916 | | self._update_completion_state(False) |
| 12917 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12918 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12919 | | _update_completion_state |
| 12920 | | self._current_completion_state = |
| 12921 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12922 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12923 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12924 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12925 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12926 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12927 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12928 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12929 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12930 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12931 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12932 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12933 | | _complete_path_impl |
| 12934 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12935 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12936 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12937 | | self.stat() |
| 12938 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12939 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12940 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12941 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12942 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12943 | | |
| 12944 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12945 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12946 | | |
| 12947 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12948 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12949 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12950 | | |
| 12951 | | See log for complete Python traceback. |
| 12952 | | |
| 12953 | | Traceback (most recent call last): |
| 12954 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12955 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12956 | | self._update_completion_state(False) |
| 12957 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12958 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12959 | | _update_completion_state |
| 12960 | | self._current_completion_state = |
| 12961 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 12962 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12963 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12964 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 12965 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 12966 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12967 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12968 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 12969 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 12970 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12971 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12972 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 12973 | | _complete_path_impl |
| 12974 | | if _maybe_path.exists(): |
| 12975 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12976 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 12977 | | self.stat() |
| 12978 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12979 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12980 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12981 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12982 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12983 | | |
| 12984 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 12985 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 12986 | | |
| 12987 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 12988 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 12989 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 12990 | | |
| 12991 | | See log for complete Python traceback. |
| 12992 | | |
| 12993 | | Traceback (most recent call last): |
| 12994 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12995 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 12996 | | self._update_completion_state(False) |
| 12997 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 12998 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 12999 | | _update_completion_state |
| 13000 | | self._current_completion_state = |
| 13001 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13002 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13003 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13004 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13005 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13006 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13007 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13008 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13009 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13010 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13011 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13012 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13013 | | _complete_path_impl |
| 13014 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13015 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13016 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13017 | | self.stat() |
| 13018 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13019 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13020 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13021 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13022 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13023 | | |
| 13024 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13025 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13026 | | |
| 13027 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13028 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13029 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13030 | | |
| 13031 | | See log for complete Python traceback. |
| 13032 | | |
| 13033 | | Traceback (most recent call last): |
| 13034 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13035 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13036 | | self._update_completion_state(False) |
| 13037 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13038 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13039 | | _update_completion_state |
| 13040 | | self._current_completion_state = |
| 13041 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13042 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13043 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13044 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13045 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13046 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13047 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13048 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13049 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13050 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13051 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13052 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13053 | | _complete_path_impl |
| 13054 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13055 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13056 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13057 | | self.stat() |
| 13058 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13059 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13060 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13061 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13062 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13063 | | |
| 13064 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13065 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13066 | | |
| 13067 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13068 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13069 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13070 | | |
| 13071 | | See log for complete Python traceback. |
| 13072 | | |
| 13073 | | Traceback (most recent call last): |
| 13074 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13075 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13076 | | self._update_completion_state(False) |
| 13077 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13078 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13079 | | _update_completion_state |
| 13080 | | self._current_completion_state = |
| 13081 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13082 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13083 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13084 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13085 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13086 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13087 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13088 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13089 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13090 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13091 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13092 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13093 | | _complete_path_impl |
| 13094 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13095 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13096 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13097 | | self.stat() |
| 13098 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13099 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13100 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13101 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13102 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13103 | | |
| 13104 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13105 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13106 | | |
| 13107 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13108 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13109 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13110 | | |
| 13111 | | See log for complete Python traceback. |
| 13112 | | |
| 13113 | | Traceback (most recent call last): |
| 13114 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13115 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13116 | | self._update_completion_state(False) |
| 13117 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13118 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13119 | | _update_completion_state |
| 13120 | | self._current_completion_state = |
| 13121 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13122 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13123 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13124 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13125 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13126 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13127 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13128 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13129 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13130 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13131 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13132 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13133 | | _complete_path_impl |
| 13134 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13135 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13136 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13137 | | self.stat() |
| 13138 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13139 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13140 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13141 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13142 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13143 | | |
| 13144 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13145 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13146 | | |
| 13147 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13148 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13149 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13150 | | |
| 13151 | | See log for complete Python traceback. |
| 13152 | | |
| 13153 | | Traceback (most recent call last): |
| 13154 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13155 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13156 | | self._update_completion_state(False) |
| 13157 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13158 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13159 | | _update_completion_state |
| 13160 | | self._current_completion_state = |
| 13161 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13162 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13163 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13164 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13165 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13166 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13167 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13168 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13169 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13170 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13171 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13172 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13173 | | _complete_path_impl |
| 13174 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13175 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13176 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13177 | | self.stat() |
| 13178 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13179 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13180 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13181 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13182 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13183 | | |
| 13184 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13185 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13186 | | |
| 13187 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13188 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13189 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13190 | | |
| 13191 | | See log for complete Python traceback. |
| 13192 | | |
| 13193 | | Traceback (most recent call last): |
| 13194 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13195 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13196 | | self._update_completion_state(False) |
| 13197 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13198 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13199 | | _update_completion_state |
| 13200 | | self._current_completion_state = |
| 13201 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13202 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13203 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13204 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13205 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13206 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13207 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13208 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13209 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13210 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13211 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13212 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13213 | | _complete_path_impl |
| 13214 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13215 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13216 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13217 | | self.stat() |
| 13218 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13219 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13220 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13221 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13222 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13223 | | |
| 13224 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13225 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13226 | | |
| 13227 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13228 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13229 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13230 | | |
| 13231 | | See log for complete Python traceback. |
| 13232 | | |
| 13233 | | Traceback (most recent call last): |
| 13234 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13235 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13236 | | self._update_completion_state(False) |
| 13237 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13238 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13239 | | _update_completion_state |
| 13240 | | self._current_completion_state = |
| 13241 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13242 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13243 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13244 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13245 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13246 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13247 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13248 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13249 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13250 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13251 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13252 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13253 | | _complete_path_impl |
| 13254 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13255 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13256 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13257 | | self.stat() |
| 13258 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13259 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13260 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13261 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13262 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13263 | | |
| 13264 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13265 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13266 | | |
| 13267 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13268 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13269 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13270 | | |
| 13271 | | See log for complete Python traceback. |
| 13272 | | |
| 13273 | | Traceback (most recent call last): |
| 13274 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13275 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13276 | | self._update_completion_state(False) |
| 13277 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13278 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13279 | | _update_completion_state |
| 13280 | | self._current_completion_state = |
| 13281 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13282 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13283 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13284 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13285 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13286 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13287 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13288 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13289 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13290 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13291 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13292 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13293 | | _complete_path_impl |
| 13294 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13295 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13296 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13297 | | self.stat() |
| 13298 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13299 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13300 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13301 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13302 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13303 | | |
| 13304 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13305 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13306 | | |
| 13307 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13308 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13309 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13310 | | |
| 13311 | | See log for complete Python traceback. |
| 13312 | | |
| 13313 | | Traceback (most recent call last): |
| 13314 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13315 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13316 | | self._update_completion_state(False) |
| 13317 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13318 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13319 | | _update_completion_state |
| 13320 | | self._current_completion_state = |
| 13321 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13322 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13323 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13324 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13325 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13326 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13327 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13328 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13329 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13330 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13331 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13332 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13333 | | _complete_path_impl |
| 13334 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13335 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13336 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13337 | | self.stat() |
| 13338 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13339 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13340 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13341 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13342 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13343 | | |
| 13344 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13345 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13346 | | |
| 13347 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13348 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13349 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13350 | | |
| 13351 | | See log for complete Python traceback. |
| 13352 | | |
| 13353 | | Traceback (most recent call last): |
| 13354 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13355 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13356 | | self._update_completion_state(False) |
| 13357 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13358 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13359 | | _update_completion_state |
| 13360 | | self._current_completion_state = |
| 13361 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13362 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13363 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13364 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13365 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13366 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13367 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13368 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13369 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13370 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13371 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13372 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13373 | | _complete_path_impl |
| 13374 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13375 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13376 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13377 | | self.stat() |
| 13378 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13379 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13380 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13381 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13382 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13383 | | |
| 13384 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13385 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13386 | | |
| 13387 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13388 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13389 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13390 | | |
| 13391 | | See log for complete Python traceback. |
| 13392 | | |
| 13393 | | Traceback (most recent call last): |
| 13394 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13395 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13396 | | self._update_completion_state(False) |
| 13397 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13398 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13399 | | _update_completion_state |
| 13400 | | self._current_completion_state = |
| 13401 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13402 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13403 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13404 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13405 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13406 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13407 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13408 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13409 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13410 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13411 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13412 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13413 | | _complete_path_impl |
| 13414 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13415 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13416 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13417 | | self.stat() |
| 13418 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13419 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13420 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13421 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13422 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13423 | | |
| 13424 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13425 | | '/home/nr/#33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13426 | | |
| 13427 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13428 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13429 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13430 | | |
| 13431 | | See log for complete Python traceback. |
| 13432 | | |
| 13433 | | Traceback (most recent call last): |
| 13434 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13435 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13436 | | self._update_completion_state(False) |
| 13437 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13438 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13439 | | _update_completion_state |
| 13440 | | self._current_completion_state = |
| 13441 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13442 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13443 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13444 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13445 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13446 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13447 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13448 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13449 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13450 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13451 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13452 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13453 | | _complete_path_impl |
| 13454 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13455 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13456 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13457 | | self.stat() |
| 13458 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13459 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13460 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13461 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13462 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13463 | | |
| 13464 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13465 | | '/home/nr/#333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| 13466 | | |
| 13467 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13468 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13469 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13470 | | |
| 13471 | | See log for complete Python traceback. |
| 13472 | | |
| 13473 | | Traceback (most recent call last): |
| 13474 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13475 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 169, in _on_text_changed |
| 13476 | | self._update_completion_state(False) |
| 13477 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13478 | | packages/chimerax/clix/widgets/cli_widget.py", line 94, in |
| 13479 | | _update_completion_state |
| 13480 | | self._current_completion_state = |
| 13481 | | list_widget._get_completion_list(cursor.selectedText()) |
| 13482 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13483 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13484 | | packages/chimerax/clix/widgets/popups.py", line 170, in _get_completion_list |
| 13485 | | if state := complete_path(last_word, current_command): |
| 13486 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13487 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13488 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 8, in complete_path |
| 13489 | | if completions := _complete_path_impl(last_word): |
| 13490 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13491 | | File "/home/nr/.local/share/ChimeraX/1.10/lib/python3.11/site- |
| 13492 | | packages/chimerax/clix/algorithms/filepath.py", line 27, in |
| 13493 | | _complete_path_impl |
| 13494 | | if _maybe_path.exists(): |
| 13495 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13496 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1235, in exists |
| 13497 | | self.stat() |
| 13498 | | File "/usr/lib/ucsf-chimerax/lib/python3.11/pathlib.py", line 1013, in stat |
| 13499 | | return os.stat(self, follow_symlinks=follow_symlinks) |
| 13500 | | ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ |
| 13501 | | OSError: [Errno 36] File name too long: |
| 13502 | | '/home/nr/#3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333' |
| | 4820 | [deleted to fit within ticket limits] |
| | 4821 | |