Changes between Initial Version and Version 1 of Ticket #4967


Ignore:
Timestamp:
Jul 28, 2021, 10:08:02 AM (4 years ago)
Author:
Eric Pettersen
Comment:

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified

  • Ticket #4967

    • Property Cc Tom Goddard added
    • Property Component Unassigned → Core
    • Property Owner set to Eric Pettersen
    • Property Platform → all
    • Property Project → ChimeraX
    • Property Status new → accepted
    • Property Summary ChimeraX bug report submission → Unknown crash

  • Ticket #4967 – Description

    initial v1  
    66Last time you used ChimeraX it crashed.
    77Please describe steps that led to the crash here.
     8
     9
     10Process:               ChimeraX [1750]
     11Path:                  /private/var/folders/*/ChimeraX-1.2.5.app/Contents/MacOS/ChimeraX
     12Identifier:            edu.ucsf.cgl.ChimeraX
     13Version:               1.2.5 (1.2.5.0)
     14Code Type:             X86-64 (Translated)
     15Parent Process:        ??? [1]
     16Responsible:           ChimeraX [1750]
     17User ID:               501
     18
     19Date/Time:             2021-07-28 10:32:10.857 -0600
     20OS Version:            macOS 11.4 (20F71)
     21Report Version:        12
     22Anonymous UUID:        16741D9A-3E1D-526C-BF17-26BEEBFD5D09
     23
     24Sleep/Wake UUID:       3BE5806C-7FA7-4CFE-9E6A-079316B86361
     25
     26Time Awake Since Boot: 16000 seconds
     27Time Since Wake:       2700 seconds
     28
     29System Integrity Protection: enabled
     30
     31Crashed Thread:        0  CrBrowserMain  Dispatch queue: com.apple.main-thread
     32
     33Exception Type:        EXC_BAD_ACCESS (SIGBUS)
     34Exception Codes:       KERN_MEMORY_ERROR at 0x0000000108f95950
     35Exception Note:        EXC_CORPSE_NOTIFY
     36
     37Termination Signal:    Bus error: 10
     38Termination Reason:    Namespace SIGNAL, Code 0xa
     39Terminating Process:   exc handler [1750]
     40
     41VM Regions Near 0x108f95950:
     42    Rosetta Generic             108dc6000-108dc7000    [    4K] rw-/rwx SM=PRV 
     43--> mapped file                 108dc7000-108ffe000    [ 2268K] r-x/rwx SM=COW  Object_id=16364fcb
     44    mapped file                 108ffe000-109038000    [  232K] rw-/rwx SM=COW  Object_id=1638accb
     45
     46Thread 0 Crashed:: CrBrowserMain  Dispatch queue: com.apple.main-thread
     470   libsystem_platform.dylib            0x00007fff2036d552 _platform_strlen + 18
     481   ???                                 0x0000000108f6c667 ???
     492   libsystem_platform.dylib            0x00007fff2036fd7d _sigtramp + 29
     503   select.cpython-38-darwin.so         000000000000000000 0 + 0
     514   com.apple.CoreFoundation            0x00007fff203ed79b __CFRepositionTimerInMode + 135
     525   ???                                 0x0000600001d600c0 ???
     536   ???                                 0x0000002100002b80 ???
     54
     55Thread 1:: com.apple.rosetta.exceptionserver
     560   runtime                             0x00007ffdffcb9858 0x7ffdffcb8000 + 6232
     571   runtime                             0x00007ffdffcc3d50 0x7ffdffcb8000 + 48464
     582   runtime                             0x00007ffdffcc4a20 0x7ffdffcb8000 + 51744
     59
     60Thread 2:
     610   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     621   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f7cde __psynch_cvwait + 10
     632   ???                                 0x000000010aec427b ???
     643   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     654   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     66
     67Thread 3:
     680   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     691   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f7cde __psynch_cvwait + 10
     702   ???                                 0x000000010aec427b ???
     713   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     724   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     73
     74Thread 4:
     750   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     761   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f7cde __psynch_cvwait + 10
     772   ???                                 0x000000010aec427b ???
     783   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     794   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     80
     81Thread 5:
     820   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     831   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f7cde __psynch_cvwait + 10
     842   ???                                 0x000000010aec427b ???
     853   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     864   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     87
     88Thread 6:
     890   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     901   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f7cde __psynch_cvwait + 10
     912   ???                                 0x000000010aec427b ???
     923   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     934   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     94
     95Thread 7:
     960   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     971   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f7cde __psynch_cvwait + 10
     982   ???                                 0x000000010aec427b ???
     993   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     1004   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     101
     102Thread 8:
     1030   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     1041   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f7cde __psynch_cvwait + 10
     1052   ???                                 0x000000010aec427b ???
     1063   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     1074   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     108
     109Thread 9:: ThreadPoolServiceThread
     1100   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     1111   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202fe1d2 kevent64 + 10
     1122   ???                                 0x000000012ac19cc7 ???
     1133   ???                                 0x000000012aba262b ???
     1144   ???                                 0x000000012ab667cb ???
     1155   ???                                 0x000000012abada94 ???
     1166   ???                                 0x000000012abc1a7d ???
     1177   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     1188   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     1199   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     120
     121Thread 10:: ThreadPoolBackgroundWorker
     1220   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     1231   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     1242   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     1253   ???                                 0x000000012abb7778 ???
     1264   ???                                 0x000000012abb8150 ???
     1275   ???                                 0x000000012abb7c44 ???
     1286   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     1297   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     1308   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     131
     132Thread 11:: Chrome_IOThread
     1330   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     1341   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202fe1d2 kevent64 + 10
     1352   ???                                 0x000000012ac19cc7 ???
     1363   ???                                 0x000000012aba262b ???
     1374   ???                                 0x000000012ab667cb ???
     1385   ???                                 0x000000012eae6f06 ???
     1396   ???                                 0x000000012abc1a7d ???
     1407   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     1418   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     1429   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     143
     144Thread 12:: NetworkConfigWatcher
     1450   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     1461   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     1472   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     1483   ???                                 0x000000012ac0f2cf ???
     1494   ???                                 0x000000012ab371db ???
     1505   ???                                 0x000000012aba262b ???
     1516   ???                                 0x000000012ab667cb ???
     1527   ???                                 0x000000012abc1a7d ???
     1538   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     1549   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     15510  libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     156
     157Thread 13:: CompositorTileWorker1
     1580   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     1591   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f7cde __psynch_cvwait + 10
     1602   ???                                 0x000000012ac06e18 ???
     1613   ???                                 0x000000012bebe5f8 ???
     1624   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     1635   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     1646   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     165
     166Thread 14:: Chrome_InProcGpuThread
     1670   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     1681   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     1692   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     1703   ???                                 0x000000012ab3720f ???
     1714   ???                                 0x000000012aba262b ???
     1725   ???                                 0x000000012ab667cb ???
     1736   ???                                 0x000000012abc1a7d ???
     1747   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     1758   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     1769   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     177
     178Thread 15:: Chrome_ChildIOThread
     1790   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     1801   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202fe1d2 kevent64 + 10
     1812   ???                                 0x000000012ac19cc7 ???
     1823   ???                                 0x000000012aba262b ???
     1834   ???                                 0x000000012ab667cb ???
     1845   ???                                 0x000000012abc1a7d ???
     1856   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     1867   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     1878   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     188
     189Thread 16:: VizCompositorThread
     1900   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     1911   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     1922   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     1933   ???                                 0x000000012ac0f2cf ???
     1944   ???                                 0x000000012ab371db ???
     1955   ???                                 0x000000012aba262b ???
     1966   ???                                 0x000000012ab667cb ???
     1977   ???                                 0x000000012abc1a7d ???
     1988   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     1999   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     20010  libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     201
     202Thread 17:: NetworkConfigWatcher
     2030   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     2041   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     2052   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     2063   ???                                 0x000000012ac0f2cf ???
     2074   ???                                 0x000000012ab371db ???
     2085   ???                                 0x000000012aba262b ???
     2096   ???                                 0x000000012ab667cb ???
     2107   ???                                 0x000000012abc1a7d ???
     2118   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     2129   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     21310  libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     214
     215Thread 18:: NetworkConfigWatcher
     2160   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     2171   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     2182   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     2193   ???                                 0x000000012ac0f2cf ???
     2204   ???                                 0x000000012ab371db ???
     2215   ???                                 0x000000012aba262b ???
     2226   ???                                 0x000000012ab667cb ???
     2237   ???                                 0x000000012abc1a7d ???
     2248   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     2259   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     22610  libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     227
     228Thread 19:: ThreadPoolSingleThreadForegroundBlocking0
     2290   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     2301   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     2312   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     2323   ???                                 0x000000012ac0f2cf ???
     2334   ???                                 0x000000012abb776a ???
     2345   ???                                 0x000000012abb8150 ???
     2356   ???                                 0x000000012abb7d34 ???
     2367   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     2378   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     2389   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     239
     240Thread 20:: MemoryInfra
     2410   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     2421   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     2432   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     2443   ???                                 0x000000012ac0f2cf ???
     2454   ???                                 0x000000012ab371db ???
     2465   ???                                 0x000000012aba262b ???
     2476   ???                                 0x000000012ab667cb ???
     2487   ???                                 0x000000012abc1a7d ???
     2498   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     2509   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     25110  libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     252
     253Thread 21:: NetworkConfigWatcher
     2540   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     2551   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     2562   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     2573   ???                                 0x000000012ac0f2cf ???
     2584   ???                                 0x000000012ab371db ???
     2595   ???                                 0x000000012aba262b ???
     2606   ???                                 0x000000012ab667cb ???
     2617   ???                                 0x000000012abc1a7d ???
     2628   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     2639   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     26410  libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     265
     266Thread 22:: com.apple.NSEventThread
     2670   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     2681   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     2692   com.apple.CoreFoundation            0x00007fff204238c5 __CFRunLoopServiceMachPort + 316
     2703   com.apple.CoreFoundation            0x00007fff20421f7b __CFRunLoopRun + 1332
     2714   com.apple.CoreFoundation            0x00007fff20421380 CFRunLoopRunSpecific + 567
     2725   ???                                 0x00007fff22cd268a ???
     2736   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     2747   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     275
     276Thread 23:: ThreadPoolSingleThreadSharedBackgroundBlocking1
     2770   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     2781   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     2792   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     2803   ???                                 0x000000012ac0f2cf ???
     2814   ???                                 0x000000012abb776a ???
     2825   ???                                 0x000000012abb7e3d ???
     2836   ???                                 0x000000012abb7c74 ???
     2847   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     2858   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     2869   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     287
     288Thread 24:: ThreadPoolForegroundWorker
     2890   ???                                 0x00007ffe942e6ab8 ???
     2901   libsystem_kernel.dylib              0x00007fff202f52ba mach_msg_trap + 10
     2912   ???                                 0x000000012ac0f492 ???
     2923   ???                                 0x000000012abb7778 ???
     2934   ???                                 0x000000012abb8150 ???
     2945   ???                                 0x000000012abb7cd4 ???
     2956   ???                                 0x000000012ac0ae07 ???
     2967   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff2032a8fc _pthread_start + 224
     2978   libsystem_pthread.dylib             0x00007fff20326443 thread_start + 15
     298
     299Thread 25:
     3000   runtime                             0x00007ffdffd1299c 0x7ffdffcb8000 + 371100
     301
     302Thread 26:
     3030   runtime                             0x00007ffdffd1299c 0x7ffdffcb8000 + 371100
     304
     305Thread 27:
     3060   runtime                             0x00007ffdffd1299c 0x7ffdffcb8000 + 371100
     307
     308Thread 28:
     3090   runtime                             0x00007ffdffd1299c 0x7ffdffcb8000 + 371100
     310
     311Thread 29:
     3120   runtime                             0x00007ffdffd1299c 0x7ffdffcb8000 + 371100
     313
     314Thread 30:
     3150   runtime                             0x00007ffdffd1299c 0x7ffdffcb8000 + 371100
     316
     317Thread 31:
     3180   runtime                             0x00007ffdffd1299c 0x7ffdffcb8000 + 371100
     319
     320Thread 32:
     3210   runtime                             0x00007ffdffd1299c 0x7ffdffcb8000 + 371100
     322
     323Thread 33:
     3240   runtime                             0x00007ffdffd1299c 0x7ffdffcb8000 + 371100
     325
     326Thread 0 crashed with X86 Thread State (64-bit):
     327  rax: 0xffffffffffffffff  rbx: 0x0000000109036620  rcx: 0x0000000108f9595c  rdx: 0x0000000108f9595c
     328  rdi: 0x0000000108f95950  rsi: 0x0000000108f8acc3  rbp: 0x00007fe6e0047fa0  rsp: 0x00007fe6e0047fa0
     329   r8: 0x000000014d2f3088   r9: 0x5efc2610ff856f57  r10: 0x0000000200c97eac  r11: 0x00007fff203e2694
     330  r12: 0x0000000000000002  r13: 0x000000000000000a  r14: 0x000000000000000d  r15: 0x0000000108f9595c
     331  rip: 0x00007fff2036d552  rfl: 0x0000000000000202
     332
     333
     334Binary Images:
     335                 0 - 0xffffffffffffffff +select.cpython-38-darwin.so (???) /private/var/folders/*/ChimeraX-1.2.5.app/Contents/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.8/lib/python3.8/lib-dynload/select.cpython-38-darwin.so
     336       0x200bc0000 -        0x200c5bfff  dyld (852)  /usr/lib/dyld
     337    0x7ffdffcb8000 -     0x7ffdffd2bfff +runtime (203.46)  /Library/Apple/*/runtime
     338    0x7fff20062000 -     0x7fff20063fff  libsystem_blocks.dylib (79)  /usr/lib/system/libsystem_blocks.dylib
     339    0x7fff20064000 -     0x7fff20099fff  libxpc.dylib (2038.120.1)  /usr/lib/system/libxpc.dylib
     340    0x7fff2009a000 -     0x7fff200b1fff  libsystem_trace.dylib (1277.120.1)  /usr/lib/system/libsystem_trace.dylib
     341    0x7fff200b2000 -     0x7fff2014ffff  libcorecrypto.dylib (1000.120.2)  /usr/lib/system/libcorecrypto.dylib
     342    0x7fff20150000 -     0x7fff2017cfff  libsystem_malloc.dylib (317.121.1)  /usr/lib/system/libsystem_malloc.dylib
     343    0x7fff2017d000 -     0x7fff201c1fff  libdispatch.dylib (1271.120.2)  /usr/lib/system/libdispatch.dylib
     344    0x7fff201c2000 -     0x7fff201fbfff  libobjc.A.dylib (824)  /usr/lib/libobjc.A.dylib
     345    0x7fff201fc000 -     0x7fff201fefff  libsystem_featureflags.dylib (28.60.1)  /usr/lib/system/libsystem_featureflags.dylib
     346    0x7fff201ff000 -     0x7fff20287fff  libsystem_c.dylib (1439.100.3)  /usr/lib/system/libsystem_c.dylib
     347    0x7fff20288000 -     0x7fff202ddfff  libc++.1.dylib (905.6)  /usr/lib/libc++.1.dylib
     348    0x7fff202de000 -     0x7fff202f3fff  libc++abi.dylib (905.6)  /usr/lib/libc++abi.dylib
     349    0x7fff202f4000 -     0x7fff20323fff  libsystem_kernel.dylib (7195.121.3)  /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib
     350    0x7fff20324000 -     0x7fff2032ffff  libsystem_pthread.dylib (454.120.2)  /usr/lib/system/libsystem_pthread.dylib
     351    0x7fff20330000 -     0x7fff2036bfff  libdyld.dylib (852)  /usr/lib/system/libdyld.dylib
     352    0x7fff2036c000 -     0x7fff20375fff  libsystem_platform.dylib (254.80.2)  /usr/lib/system/libsystem_platform.dylib
     353    0x7fff20376000 -     0x7fff203a1fff  libsystem_info.dylib (542.40.3)  /usr/lib/system/libsystem_info.dylib
     354    0x7fff203a2000 -     0x7fff2083ffff  com.apple.CoreFoundation (6.9 - 1776.103)  /System/Library/Frameworks/CoreFoundation.framework/Versions/A/CoreFoundation
     355    0x7fff22435000 -     0x7fff22694fff  libicucore.A.dylib (66112)  /usr/lib/libicucore.A.dylib
     356    0x7fff22695000 -     0x7fff2269efff  libsystem_darwin.dylib (1439.100.3)  /usr/lib/system/libsystem_darwin.dylib
     357    0x7fff22ab4000 -     0x7fff22abffff  libsystem_notify.dylib (279.40.4)  /usr/lib/system/libsystem_notify.dylib
     358    0x7fff24a49000 -     0x7fff24a57fff  libsystem_networkextension.dylib (1295.120.5)  /usr/lib/system/libsystem_networkextension.dylib
     359    0x7fff24ab6000 -     0x7fff24accfff  libsystem_asl.dylib (385)  /usr/lib/system/libsystem_asl.dylib
     360    0x7fff261c5000 -     0x7fff261ccfff  libsystem_symptoms.dylib (1431.120.1)  /usr/lib/system/libsystem_symptoms.dylib
     361    0x7fff284d7000 -     0x7fff284e7fff  libsystem_containermanager.dylib (318.100.4)  /usr/lib/system/libsystem_containermanager.dylib
     362    0x7fff291f3000 -     0x7fff291f6fff  libsystem_configuration.dylib (1109.120.1)  /usr/lib/system/libsystem_configuration.dylib
     363    0x7fff291f7000 -     0x7fff291fbfff  libsystem_sandbox.dylib (1441.120.5)  /usr/lib/system/libsystem_sandbox.dylib
     364    0x7fff29dfb000 -     0x7fff29dfdfff  libquarantine.dylib (119.40.2)  /usr/lib/system/libquarantine.dylib
     365    0x7fff2a399000 -     0x7fff2a3a5fff  libbz2.1.0.dylib (44)  /usr/lib/libbz2.1.0.dylib
     366    0x7fff2a3a6000 -     0x7fff2a3aafff  libsystem_coreservices.dylib (127.1)  /usr/lib/system/libsystem_coreservices.dylib
     367    0x7fff2a5a7000 -     0x7fff2a5b9fff  libz.1.dylib (76)  /usr/lib/libz.1.dylib
     368    0x7fff2a5ba000 -     0x7fff2a605fff  libsystem_m.dylib (3186.100.3)  /usr/lib/system/libsystem_m.dylib
     369    0x7fff2a607000 -     0x7fff2a60cfff  libmacho.dylib (980)  /usr/lib/system/libmacho.dylib
     370    0x7fff2a629000 -     0x7fff2a634fff  libcommonCrypto.dylib (60178.120.3)  /usr/lib/system/libcommonCrypto.dylib
     371    0x7fff2a635000 -     0x7fff2a63ffff  libunwind.dylib (201)  /usr/lib/system/libunwind.dylib
     372    0x7fff2a640000 -     0x7fff2a647fff  liboah.dylib (203.46)  /usr/lib/liboah.dylib
     373    0x7fff2a648000 -     0x7fff2a652fff  libcopyfile.dylib (173.40.2)  /usr/lib/system/libcopyfile.dylib
     374    0x7fff2a653000 -     0x7fff2a65afff  libcompiler_rt.dylib (102.2)  /usr/lib/system/libcompiler_rt.dylib
     375    0x7fff2a65b000 -     0x7fff2a65dfff  libsystem_collections.dylib (1439.100.3)  /usr/lib/system/libsystem_collections.dylib
     376    0x7fff2a65e000 -     0x7fff2a660fff  libsystem_secinit.dylib (87.60.1)  /usr/lib/system/libsystem_secinit.dylib
     377    0x7fff2a661000 -     0x7fff2a663fff  libremovefile.dylib (49.120.1)  /usr/lib/system/libremovefile.dylib
     378    0x7fff2a664000 -     0x7fff2a664fff  libkeymgr.dylib (31)  /usr/lib/system/libkeymgr.dylib
     379    0x7fff2a665000 -     0x7fff2a66cfff  libsystem_dnssd.dylib (1310.120.71)  /usr/lib/system/libsystem_dnssd.dylib
     380    0x7fff2a66d000 -     0x7fff2a672fff  libcache.dylib (83)  /usr/lib/system/libcache.dylib
     381    0x7fff2a673000 -     0x7fff2a674fff  libSystem.B.dylib (1292.120.1)  /usr/lib/libSystem.B.dylib
     382    0x7fff2a675000 -     0x7fff2a678fff  libfakelink.dylib (3)  /usr/lib/libfakelink.dylib
     383    0x7fff2a679000 -     0x7fff2a679fff  com.apple.SoftLinking (1.0 - 1)  /System/Library/PrivateFrameworks/SoftLinking.framework/Versions/A/SoftLinking
     384    0x7fff2dbcf000 -     0x7fff2dbcffff  liblaunch.dylib (2038.120.1)  /usr/lib/system/liblaunch.dylib
     385    0x7fff3005e000 -     0x7fff3005efff  libsystem_product_info_filter.dylib (8.40.1)  /usr/lib/system/libsystem_product_info_filter.dylib
     386
     387Translated Code Information:
     388  tmp0: 0x00007ffe946fb4e4 tmp1: 0x00000001093d5e40 tmp2: 0x00007fff2036d540
     389
     390
     391External Modification Summary:
     392  Calls made by other processes targeting this process:
     393    task_for_pid: 0
     394    thread_create: 0
     395    thread_set_state: 0
     396  Calls made by this process:
     397    task_for_pid: 0
     398    thread_create: 0
     399    thread_set_state: 0
     400  Calls made by all processes on this machine:
     401    task_for_pid: 0
     402    thread_create: 0
     403    thread_set_state: 0
     404
     405VM Region Summary:
     406ReadOnly portion of Libraries: Total=518.8M resident=0K(0%) swapped_out_or_unallocated=518.8M(100%)
     407Writable regions: Total=2.2G written=0K(0%) resident=0K(0%) swapped_out=0K(0%) unallocated=2.2G(100%)
     408 
     409                                VIRTUAL   REGION
     410REGION TYPE                        SIZE    COUNT (non-coalesced)
     411===========                     =======  =======
     412Accelerate framework               384K        3
     413Activity Tracing                   256K        1
     414CG backing stores                 5088K        6
     415CG image                            44K        5
     416CoreAnimation                       80K       11
     417CoreGraphics                        12K        2
     418CoreUI image data                 1916K       15
     419Foundation                          16K        1
     420Kernel Alloc Once                 1384K        5
     421MALLOC                           416.1M       78
     422MALLOC guard page                  192K        8
     423MALLOC_MEDIUM (reserved)         880.0M        8         reserved VM address space (unallocated)
     424MALLOC_NANO (reserved)           384.0M        1         reserved VM address space (unallocated)
     425Mach message                        24K        6
     426OpenGL GLSL                        384K        5
     427Rosetta Arena                     2048K        1
     428Rosetta Generic                   1592K      395
     429Rosetta IndirectBranch            1024K        1
     430Rosetta JIT                      128.0M        1
     431Rosetta Return Stack               660K       66
     432Rosetta Thread Context             660K       66
     433STACK GUARD                         36K        9
     434Stack                            136.6M       33
     435Stack Guard                       56.1M       24
     436VM_ALLOCATE                      101.0M      173
     437VM_ALLOCATE (reserved)           160.1M       16         reserved VM address space (unallocated)
     438__DATA                             500K       50
     439__DATA_CONST                      2984K       40
     440__DATA_DIRTY                        95K       24
     441__LINKEDIT                       506.4M        5
     442__OBJC_RO                         70.2M        1
     443__OBJC_RW                         2480K        2
     444__TEXT                            12.5M       50
     445__UNICODE                          588K        1
     446dylib                             2088K       23
     447dylib (reserved)                    92K        7         reserved VM address space (unallocated)
     448mapped file                        5.3G      933
     449shared memory                     3280K       33
     450unshared pmap                     10.5M        6
     451===========                     =======  =======
     452TOTAL                              8.1G     2115
     453TOTAL, minus reserved VM space     6.7G     2115
     454
     455
     456
     457Log:
     458UCSF ChimeraX version: 1.2.5 (2021-05-24) 
     459© 2016-2021 Regents of the University of California. All rights reserved. 
     460How to cite UCSF ChimeraX 
     461
     462
     463
     464
     465OpenGL version: 4.1 Metal - 71.6.4
     466OpenGL renderer: Apple M1
     467OpenGL vendor: AppleHardware:
     468
     469    Hardware Overview:
     470
     471      Model Name: iMac
     472      Model Identifier: iMac21,1
     473      Processor Name: Unknown
     474      Processor Speed: 2.4 GHz
     475      Number of Processors: 1
     476      Total Number of Cores: 8
     477      L2 Cache (per Core): 4 MB
     478      Memory: 16 GB
     479
     480Software:
     481
     482    System Software Overview:
     483
     484      System Version: macOS 11.4 (20F71)
     485      Kernel Version: Darwin 20.5.0
     486      Time since boot: 11 minutes
     487
     488Graphics/Displays:
     489
     490    Apple M1:
     491
     492      Chipset Model: Apple M1
     493      Type: GPU
     494      Bus: Built-In
     495      Total Number of Cores: 8
     496      Vendor: Apple (0x106b)
     497      Metal Family: Supported, Metal GPUFamily Apple 7
     498      Displays:
     499        iMac:
     500          Display Type: Built-In Retina LCD
     501          Resolution: Retina 4.5K (4480 x 2520)
     502          Main Display: Yes
     503          Mirror: Off
     504          Online: Yes
     505          Automatically Adjust Brightness: No
     506          Connection Type: Internal
     507
     508Locale: (None, 'UTF-8')
     509PyQt5 5.15.2, Qt 5.15.2
     510Installed Packages:
     511    alabaster: 0.7.12
     512    appdirs: 1.4.4
     513    appnope: 0.1.2
     514    Babel: 2.9.1
     515    backcall: 0.2.0
     516    blockdiag: 2.0.1
     517    certifi: 2020.12.5
     518    cftime: 1.5.0
     519    chardet: 3.0.4
     520    ChimeraX-AddCharge: 1.0.1
     521    ChimeraX-AddH: 2.1.6
     522    ChimeraX-AlignmentAlgorithms: 2.0
     523    ChimeraX-AlignmentHdrs: 3.2
     524    ChimeraX-AlignmentMatrices: 2.0
     525    ChimeraX-Alignments: 2.1
     526    ChimeraX-AmberInfo: 1.0
     527    ChimeraX-Arrays: 1.0
     528    ChimeraX-Atomic: 1.13.2
     529    ChimeraX-AtomicLibrary: 3.1.3
     530    ChimeraX-AtomSearch: 2.0
     531    ChimeraX-AtomSearchLibrary: 1.0
     532    ChimeraX-AxesPlanes: 2.0
     533    ChimeraX-BasicActions: 1.1
     534    ChimeraX-BILD: 1.0
     535    ChimeraX-BlastProtein: 1.1
     536    ChimeraX-BondRot: 2.0
     537    ChimeraX-BugReporter: 1.0
     538    ChimeraX-BuildStructure: 2.5.2
     539    ChimeraX-Bumps: 1.0
     540    ChimeraX-BundleBuilder: 1.1
     541    ChimeraX-ButtonPanel: 1.0
     542    ChimeraX-CageBuilder: 1.0
     543    ChimeraX-CellPack: 1.0
     544    ChimeraX-Centroids: 1.1
     545    ChimeraX-ChemGroup: 2.0
     546    ChimeraX-Clashes: 2.1
     547    ChimeraX-ColorActions: 1.0
     548    ChimeraX-ColorGlobe: 1.0
     549    ChimeraX-ColorKey: 1.2.1
     550    ChimeraX-CommandLine: 1.1.4
     551    ChimeraX-ConnectStructure: 2.0
     552    ChimeraX-Contacts: 1.0
     553    ChimeraX-Core: 1.2.5
     554    ChimeraX-CoreFormats: 1.0
     555    ChimeraX-coulombic: 1.1.1
     556    ChimeraX-Crosslinks: 1.0
     557    ChimeraX-Crystal: 1.0
     558    ChimeraX-CrystalContacts: 1.0
     559    ChimeraX-DataFormats: 1.1
     560    ChimeraX-Dicom: 1.0
     561    ChimeraX-DistMonitor: 1.1.3
     562    ChimeraX-DistUI: 1.0
     563    ChimeraX-Dssp: 2.0
     564    ChimeraX-EMDB-SFF: 1.0
     565    ChimeraX-ExperimentalCommands: 1.0
     566    ChimeraX-FileHistory: 1.0
     567    ChimeraX-FunctionKey: 1.0
     568    ChimeraX-Geometry: 1.1
     569    ChimeraX-gltf: 1.0
     570    ChimeraX-Graphics: 1.0
     571    ChimeraX-Hbonds: 2.1
     572    ChimeraX-Help: 1.1
     573    ChimeraX-HKCage: 1.3
     574    ChimeraX-IHM: 1.0
     575    ChimeraX-ImageFormats: 1.1
     576    ChimeraX-IMOD: 1.0
     577    ChimeraX-IO: 1.0.1
     578    ChimeraX-Label: 1.0
     579    ChimeraX-ListInfo: 1.1.1
     580    ChimeraX-Log: 1.1.2
     581    ChimeraX-LookingGlass: 1.1
     582    ChimeraX-Maestro: 1.8.1
     583    ChimeraX-Map: 1.0.2
     584    ChimeraX-MapData: 2.0
     585    ChimeraX-MapEraser: 1.0
     586    ChimeraX-MapFilter: 2.0
     587    ChimeraX-MapFit: 2.0
     588    ChimeraX-MapSeries: 2.0
     589    ChimeraX-Markers: 1.0
     590    ChimeraX-Mask: 1.0
     591    ChimeraX-MatchMaker: 1.2.1
     592    ChimeraX-MDcrds: 2.2
     593    ChimeraX-MedicalToolbar: 1.0.1
     594    ChimeraX-Meeting: 1.0
     595    ChimeraX-MLP: 1.1
     596    ChimeraX-mmCIF: 2.3
     597    ChimeraX-MMTF: 2.1
     598    ChimeraX-Modeller: 1.0.1
     599    ChimeraX-ModelPanel: 1.0.1
     600    ChimeraX-ModelSeries: 1.0
     601    ChimeraX-Mol2: 2.0
     602    ChimeraX-Morph: 1.0
     603    ChimeraX-MouseModes: 1.1
     604    ChimeraX-Movie: 1.0
     605    ChimeraX-Neuron: 1.0
     606    ChimeraX-Nucleotides: 2.0.1
     607    ChimeraX-OpenCommand: 1.5
     608    ChimeraX-PDB: 2.4.1
     609    ChimeraX-PDBBio: 1.0
     610    ChimeraX-PDBLibrary: 1.0.1
     611    ChimeraX-PDBMatrices: 1.0
     612    ChimeraX-PickBlobs: 1.0
     613    ChimeraX-Positions: 1.0
     614    ChimeraX-PresetMgr: 1.0.1
     615    ChimeraX-PubChem: 2.0.1
     616    ChimeraX-ReadPbonds: 1.0
     617    ChimeraX-Registration: 1.1
     618    ChimeraX-RemoteControl: 1.0
     619    ChimeraX-ResidueFit: 1.0
     620    ChimeraX-RestServer: 1.1
     621    ChimeraX-RNALayout: 1.0
     622    ChimeraX-RotamerLibMgr: 2.0
     623    ChimeraX-RotamerLibsDunbrack: 2.0
     624    ChimeraX-RotamerLibsDynameomics: 2.0
     625    ChimeraX-RotamerLibsRichardson: 2.0
     626    ChimeraX-SaveCommand: 1.4
     627    ChimeraX-SchemeMgr: 1.0
     628    ChimeraX-SDF: 2.0
     629    ChimeraX-Segger: 1.0
     630    ChimeraX-Segment: 1.0
     631    ChimeraX-SeqView: 2.3
     632    ChimeraX-Shape: 1.0.1
     633    ChimeraX-Shell: 1.0
     634    ChimeraX-Shortcuts: 1.0
     635    ChimeraX-ShowAttr: 1.0
     636    ChimeraX-ShowSequences: 1.0
     637    ChimeraX-SideView: 1.0
     638    ChimeraX-Smiles: 2.0.1
     639    ChimeraX-SmoothLines: 1.0
     640    ChimeraX-SpaceNavigator: 1.0
     641    ChimeraX-StdCommands: 1.3.1
     642    ChimeraX-STL: 1.0
     643    ChimeraX-Storm: 1.0
     644    ChimeraX-Struts: 1.0
     645    ChimeraX-Surface: 1.0
     646    ChimeraX-SwapAA: 2.0
     647    ChimeraX-SwapRes: 2.1
     648    ChimeraX-TapeMeasure: 1.0
     649    ChimeraX-Test: 1.0
     650    ChimeraX-Toolbar: 1.0.1
     651    ChimeraX-ToolshedUtils: 1.2
     652    ChimeraX-Tug: 1.0
     653    ChimeraX-UI: 1.7.6
     654    ChimeraX-uniprot: 2.1
     655    ChimeraX-UnitCell: 1.0
     656    ChimeraX-ViewDockX: 1.0
     657    ChimeraX-Vive: 1.1
     658    ChimeraX-VolumeMenu: 1.0
     659    ChimeraX-VTK: 1.0
     660    ChimeraX-WavefrontOBJ: 1.0
     661    ChimeraX-WebCam: 1.0
     662    ChimeraX-WebServices: 1.0
     663    ChimeraX-Zone: 1.0
     664    colorama: 0.4.3
     665    comtypes: 1.1.7
     666    cxservices: 1.0
     667    cycler: 0.10.0
     668    Cython: 0.29.21
     669    decorator: 5.0.9
     670    distlib: 0.3.1
     671    docutils: 0.16
     672    filelock: 3.0.12
     673    funcparserlib: 0.3.6
     674    grako: 3.16.5
     675    h5py: 2.10.0
     676    html2text: 2020.1.16
     677    idna: 2.10
     678    ihm: 0.17
     679    imagecodecs: 2020.5.30
     680    imagesize: 1.2.0
     681    ipykernel: 5.3.4
     682    ipython: 7.18.1
     683    ipython-genutils: 0.2.0
     684    jedi: 0.17.2
     685    Jinja2: 2.11.2
     686    jupyter-client: 6.1.7
     687    jupyter-core: 4.7.1
     688    kiwisolver: 1.3.1
     689    line-profiler: 2.1.2
     690    lxml: 4.6.2
     691    lz4: 3.1.0
     692    MarkupSafe: 2.0.1
     693    matplotlib: 3.3.2
     694    matplotlib-inline: 0.1.2
     695    msgpack: 1.0.0
     696    netCDF4: 1.5.4
     697    networkx: 2.5
     698    numexpr: 2.7.3
     699    numpy: 1.19.2
     700    numpydoc: 1.1.0
     701    openvr: 1.14.1501
     702    packaging: 20.9
     703    ParmEd: 3.2.0
     704    parso: 0.7.1
     705    pexpect: 4.8.0
     706    pickleshare: 0.7.5
     707    Pillow: 7.2.0
     708    pip: 21.0.1
     709    pkginfo: 1.5.0.1
     710    prompt-toolkit: 3.0.18
     711    psutil: 5.7.2
     712    ptyprocess: 0.7.0
     713    pycollada: 0.7.1
     714    pydicom: 2.0.0
     715    Pygments: 2.7.1
     716    PyOpenGL: 3.1.5
     717    PyOpenGL-accelerate: 3.1.5
     718    pyparsing: 2.4.7
     719    PyQt5-commercial: 5.15.2
     720    PyQt5-sip: 12.8.1
     721    PyQtWebEngine-commercial: 5.15.2
     722    python-dateutil: 2.8.1
     723    pytz: 2021.1
     724    pyzmq: 22.0.3
     725    qtconsole: 4.7.7
     726    QtPy: 1.9.0
     727    RandomWords: 0.3.0
     728    requests: 2.24.0
     729    scipy: 1.5.2
     730    setuptools: 50.3.2
     731    sfftk-rw: 0.6.7.dev1
     732    six: 1.15.0
     733    snowballstemmer: 2.1.0
     734    sortedcontainers: 2.2.2
     735    Sphinx: 3.2.1
     736    sphinxcontrib-applehelp: 1.0.2
     737    sphinxcontrib-blockdiag: 2.0.0
     738    sphinxcontrib-devhelp: 1.0.2
     739    sphinxcontrib-htmlhelp: 2.0.0
     740    sphinxcontrib-jsmath: 1.0.1
     741    sphinxcontrib-qthelp: 1.0.3
     742    sphinxcontrib-serializinghtml: 1.1.5
     743    suds-jurko: 0.6
     744    tables: 3.6.1
     745    tifffile: 2020.9.3
     746    tinyarray: 1.2.3
     747    tornado: 6.1
     748    traitlets: 5.0.5
     749    urllib3: 1.25.11
     750    wcwidth: 0.2.5
     751    webcolors: 1.11.1
     752    wheel: 0.36.0
     753    wheel-filename: 1.3.0
     754
     755}}}